1、Image j对SDS-PAGE灰度分析定量蛋白浓度,朱伟伟 20180319,每个泳道对应的数值为点样体积( l ),制备所有样品的时候蛋白溶液和2*loading buffer的体积比均为1:1,SDS-PAGE图像,可以用相机或光密度扫描仪成像,作为标准样品的蛋白最好和待测蛋白的条带大小一致,用Bradford的方法测得标样的浓度,然后把标样的浓度调成300g/ml。,注意事项: 一般用SDS-PAGE灰度分析的方法检测蛋白浓度,其上样量不宜过大,条带太黑容易过曝,导致定量结果不准确,检测结果会小于实际的蛋白浓度。,1、打开image j 把SDS-PAGE图片拖到红色箭头所指区域。,2
2、、单击imageType8-bit转换成灰度图像。,3、单击processsubtract background会出现左图的界面,勾选light background和preview,选择合适的像素值,在此一30.0pixels为例,单击OK。,4、方框工具选择并画出第一条永道,单击analyzegelsselect first lane也可以用快捷键(Ctrl+1),4、方框工具选择并画出第一条永道。单击analyzegelsselect first lane也可以用快捷键(Ctrl+1),会出现左图界面,点击OK,并在图上画出第一条条带。,5、单击analyzeset measuremen
3、ts出现 下图界面,勾选Area和mean gray value单击OK。,7、选好条带以后按住Ctrl+m出现一个文本,如上图所示;然后把鼠标移到黄色方框的中心,按住鼠标,把方框拖到下一个条带,然后按Ctrl+m,文本中出现第二条带的面积和平均灰度值;以此类推。,8、新建一个Excel,把文本框内的数据复制到表格,计算绝对灰度=255-灰度平均值,同时标出点样体积。理论上,标样的绝对灰度值的比值和点样体积比值是相等的,我们可以选择绝对灰度比值和体积比最接近的一对数据,如红色框内数据。,9、选待测样品条带的绝对灰度值在6.534-10.409之间的数值如蓝框内三个值,标样蛋白浓度标 绝对灰度值(标) = 待测蛋白浓度待 绝对灰度(待) 选择两个绝对灰度值接近的条带计算,比如: 3004 6.534 = 待测蛋白浓度6 6.69 算出待测样品浓度=204.77g/ml。,