1、实时荧光定量反转录 PCRReal-Time Reverse Transcription PCR(RT-PCR)1 材料 1. 1 仪器756 型紫外分光光度计 国产上海ABI 7300 Real-Time PCR System 美国 ABI 公司RS-28 高速低温离心机 德国贺利氏公司超低温冰箱 德国贺利氏公司UVP 凝胶扫描系统 美国 UVP 公司微量移液器 德国 Gilson 公司DYZ-22A 型双恒定时电泳仪 北京市六一仪器厂DYY-桥式电泳仪 北京市六一仪器厂1. 2 试剂RNA 提取试剂 Trizol Reagent 为 Invitrogen 公司产品;逆转录酶(M-MLV )
2、 ,核糖核酸酶抑制剂(RNasin) ,dNTP,Taq DNA 聚合酶(Taq DNA polymerase ) ,随机引物( Random primers) ,琼脂糖(agarose)均为美国 Promega 公司产品;荧光定量试剂盒:Hot Start Fluorescent PCR Core Reagent Kits(SYBR Green I) , BBI 公司RNA 提取:取约 100mg 组织于冰浴匀浆器中,加入 1ml Trizol (Invitrogen,USA),迅速研磨成匀浆液,加入 200l 氯仿,震荡 30S,冰上放置 5 min。4,12000 rpm,离心 10 m
3、in,取上层水相转移至另一 1.5ml 离心管中,加入等体积的异丙醇,颠倒混匀,-20静置 2h。然后 4,12000 rpm,离心 20 min,弃上清,加入 1ml 75%乙醇,轻轻混匀,4,12000 rpm,离心 10min,吸净上清液,于室温下晾干,加入 20l DEPC 处理的去离子水溶解沉淀,-80保存备用。反转录(RT):(试剂盒: Promega,USA)反转录反应液组成如下表:Table 1 Mixed components for synthesis of cDNA first chainComponent Volume(l) Concentration5R.T.buff
4、er* 5 1dNTP 2.5 10M/lRNasin 2 20U/lRNA 5.3 gRandom Primer 1 0.1ug/lM-MLV 6 5 U/lNucleasr-Free Water 3.2Total 2542反转录 50min,95 5min 灭活反转录酶。Syber Green 荧光定量 PCR 检测:(Hot Start Fluorescent PCR Core Reagent Kits(SYBR Green I) , BBI)仪器型号:ABI 7300 Real-Time PCR System, 美国 ABI 公司PCR 反应液组成如下表:Table 2 Mixed c
5、omponents for polymerase chain reactionComponent Volume ( ul)R.T.product 12Master Mix 10Primer 1+1H2O 7Total 20PCR 热循环参数:96 4min,然后三步反应:94 30S,58 30s,72 30s,进行 40 个循环,于每个循环的第三步即: 72 30s 收集荧光信号。实时荧光定量 PCR 结果分析:扩增完毕后,进入结果分析界面,以 GAPDH 为内参照基因,与对照组相比,得到目的基因表达的相对定量值(RQ 值) ,将 RQ 值用于统计分析。引物序列:GAPDH 上游引物:5- TGAACGGGAAGCTCACTGG -3下游引物: 3-GCTTCACCACCTTCTTGATGTC -3