1、PCR 扩增反应一、实验原理PCR:是一种选择性扩增 DNA 或 RNA 的方法,其基本原理是依据体内细胞分裂中的DNA 半保留复制机理,以及在体外 dNTP 分子于不同温度下双链和单链可以互相转变的性质,人为地控制体外合成系统的温度,以促使双链 DNA 变成单链 DNA;单链 DNA 与人工合成的引物退火,以及在 dNTP 存在下,耐高温的 DNA 聚合酶使引物沿单链模板延伸成为双链 DNA。PCR 反应分 3 步:变性:通过加热使 DNA 双螺旋的氢键断裂,双链解离形成单链DNA; 退火:当温度突然降低时,由于模板分子结构较引物要复杂得多,而且反应体系中引物 DNA 量大大多于模板 DNA
2、,使引物和其互补的模板在局部形成杂交链,而模板DNA 双链之间互补的机会较少。延伸:在 DNA 聚合酶和 4 种 dNTP 底物及 Mg2+存在的条件下,53的聚合酶催化以引物为起始点的 DNA 链延伸反应,以上 3 步为一个循环,每一循环的产物可以作为下一个循环的模板,数小时之后,介于两个引物之间的特异性DNA 片段得到了大量复制,数量可达 21067 拷贝。图 反应历程变性退火延伸二、实验材料 1模板:细菌 DNA 2 TsgDNA 聚合酶 3dNTP 混合液410 倍浓度 PCR 缓冲液 52.5mmol/LMgCl2 6RAPD 引物:S14 S15 S18 S66 S74 S88 S
3、97 S103 S110 S115 7提取细菌 DNA 的相关试剂 三、操作步骤 1细菌染色体 DNA 的提取(见上一组)2RAPD 反应体系的配置试剂 浓度 加入量10 倍浓度 PCR 缓冲液 2.5ul氯化镁溶液 2.5mmol/L 2.5uldNTP 混合液 各 2.5mmol/L 2.5ul上游引物 2.5umol/L 2.5ul下游引物 2.5umol/L 2.5ul细菌 DNA 2550ng 2.5ulTsgDNA 聚合酶 2.5U超纯水 10ul加 样 顺 序 总体积 25ul3反应程序:将 RAPD 反应试剂加入 EP 管中轻混后用100ul石蜡油覆盖于反应混合液之上,防止样品
4、在反复加热-冷却的过程中蒸发,盖好盖子打开 PCR 反应仪输入以下反应数据 94 摄氏度预变性 5min 94 摄氏度变性 40s 40 摄氏度退火 40s 72 摄氏度延伸 1min将 EP 管放入仪器开始扩增,循环 35 次;72 摄氏度延伸 10min 仪器为 Model MyGene 25 Plus 三、注意事项1、PCR 反应体系中 DNA 样品及各种试剂的用量都极少,必须严格注意吸样量的准确性及全部放入反应体系中。2、为避免污染凡是用在 PCR 反应中的 Tip 尖、离心管、蒸馏水都要灭菌;吸每种试剂时都要换新的灭菌 Tip 尖。3、加试剂时先加消毒三蒸水,最后加 DNA 模板和 Taq DNA 聚合酶。4、置 PCR 仪进行 PCR 反应前,PCR 管要盖紧,否则使液体蒸发影响 PCR 反应。5.引物条件 首先引物与模板的序列要紧密互补,其次引物与引物之间避免形成稳定二聚体或发夹结构,再次引物不能在模板的非目的位点引发 DNA 聚合反应(即错配) 。