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实验二、转座子随机突变及目标表型的筛选.ppt

上传人:rav7596 文档编号:6423662 上传时间:2019-04-12 格式:PPT 页数:24 大小:2.28MB
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1、马玉超 北京林业大学生物科学与技术学院 办公地点:生物楼117;电话:62336016; Email:,现代微生物学实验技术,实 验 内 容, 染色体步移法克隆已知序列的侧翼序列 转座子随机突变及目的表型的筛选 大肠杆菌-半乳糖苷酶的诱导 利用SDS-PAGE分析融合蛋白的可溶性 绿色糖单胞菌的发酵及孢外酶的提取,转座子随机突变及目的表型的筛选 李丽萍,实验目的,1.了解细菌常见转座子Tn5的结构及转座机理 2. 学习利用转座子进行随机插入突变的实验过程 3. 掌握双亲接合实验的原理及过程,实验原理,转座子: 转座因子或跳跃因子,它可以从遗传物质的一部分跳跃到另一部分,从而引起遗传变异。 转座

2、子的发现: 20世纪50年代初期,美国冷泉港实验室遗传育种学家McClintock 通过对玉米籽粒色斑不稳定现象的研究而发现转座现象,首次发现了能在基因组内不同区域转移的控制成分。,实验原理,细菌转座子的类型: 插入序列 (Insertion sequence); 复合转座子 (Composite transposons); Tn5 TnA 转座子家族 (TnA family); 可移动噬菌体 (Mu phage).,实验原理,Tn5:发现于E.coli,序列全长5818bp。 核心序列:编码三个抗生素(新霉素、博莱霉素、链霉素);两个倒置的IS50:IS50R编码53KD的Tnp和48KD的

3、转座阻遏蛋白(Inh),两者使用同一阅读框,但启动子不同。IS50L的第1442碱基处存在一个赭石突变,IS50具有19bp的倒置末端,二者有7个碱基不相同,是转座酶(Tnp)的作用位点。,Tn5的转座机理,实验原理,实验原理,DNA sequencing,实验原理,非转移性质粒: 转移性质粒:能自动地从一个细胞转移到另一个细胞,甚至还能 带动供体细胞的染色体DNA向受体细胞转移; 接合作用:质粒在细菌间的转移,需要供体和受体细胞间的直接接触才能进行.,实验原理,植物生长激素, 由植物根系细菌合成,对植物的生长及一些发育阶段的调控起关键作用,细菌中IAA合成的几种途径,A-B:吲哚乙酰胺途径;

4、 E-F-D:吲哚丙酮酸途径; C-D:色氨酸侧链途径,实验材料,菌株E. coli S17-1/pPRL1063a; 巴西固氮螺菌sp7 2. 培养基及试剂 (1). 细菌丰富培养基,(2).用于IAA摇瓶培养的培养基(MAZ培养基),(3).抗生素,3. 主要仪器小型离心机,实验步骤,第一天: 中午12:3013:30接种sp7 至5ml LD 液体培养基中,30振荡培养约20小时。 晚5:30,接种供体菌pRL1063a/E.coil S17-1 至5ml LB+Km液体培养基中,37振荡培养约16小时。 第二天: 上午9:00,用同一个1.5 ml 离心管收集适量供体菌和受体菌。120

5、00rpm 离心30 sec,弃上清,用移液器将菌泥悬浮混匀后移入LD平板中央,尽量减少气泡的产生。 30正置培养过夜。注意:事先准备好LD平板,第三天: 用液体LD培养基洗下菌泥,铺于同时含有Km、Ap、Nx的LD平板上,30培养,筛选接合子。 第四天: 挑取接合子在含有上述三种抗生素的LD培养基平板上划线分离,保证得到的为单菌落。 第五天: 挑单菌落分别接种于5ml MAZ培养基中30摇瓶培养(野生菌对照).,第六天: 用比色法测定菌液中的IAA含量。 比色试剂:含12g/L FeCl3 的H2SO4 注意安全 取1ml 测量OD600; 取1ml 菌液12000rpm 离心 5min后取上清与比色试剂等量混合,摇匀后在暗处放置30 min,然后测OD540nm 注:空白对照,未接菌的培养基与比色用试剂的混合液。,标准曲线,实验结果,表 巴西固氮螺菌 Yu62 野生型及突变体的IAA产量,下次实验,大肠杆菌-半乳糖苷酶的诱导,

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