1、cDNA 文库和基因组文库比较cDNA 文库: 以 mRNA 为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成 cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段 cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部 mRNA 信息的 cDNA 克隆集合称为该组织细胞的 cDNA 文库。基因组文库: 一个生物体的基因组 DNA 用限制性内切酶部分酶切后,将酶切片段插入到载体 DNA 分子中,所有这些插入了基因组 DNA 片段的载体分子的集合体,将包含这个生物体的整个基因组,也就是构成了这个生物体的基因文库。 基因组 DNA 文库与 cDNA 文库的比较: 1 基因组 DNA 文库的
2、优点 相对于 cDNA 文库,基因组文库的优点: cDNA 克隆只能反映着mRNA 的分子结构,没有包括基因组的间隔序列, cDNA 文库中,不同克隆的分布状态总是反映着 mRNA 的分布状态,即: 高丰度 mRNA 的 cDNA 克隆,所占比例较高,分离基因容易; 低丰度 mRNA 的 cDNA 克隆,所占比例较低,分离基因困难; 从 cDNA 克隆中,不能克隆到基因组DNA 中的非转录区段序列,不能用于研究基因编码区外侧调控序列的结构与功能. 2 cDNA 文库的主要优点:cDNA 文库以 mRNA 为材料 ,特别适用于某些 RNA 病毒等的基因组结构研究及有关基因的克隆分离. cDNA
3、文库的筛选比较简单易行 . 每一个 cDNA 文库都含有一种 mRNA 序列,这样在目的基因的选择中出现假阳性的概率就会比较低,因此阳性杂交信号一般都是有意义的,由此选择出来的阳性克隆将会含有目的基因.cDNA 文库可用于在细菌中能进行表达的基因的克隆 ,直接应用于基因工程操作. cDNA 克隆还可用于真核细胞 mRNA 的结构和功能研究.3 cDNA 克隆的主要的缺点:cDNA 文库所包含的遗传信息要远远少于基因组 DNA 文库 ,并且受细胞来源或发育时期的影响. cDNA 文库虽能反映 mRNA 的分子结构和功能信息,但不能直接获得基因内含子序列和基因编码区外大量调控序列的结构与功能方面信息. 在 cDNA 文库中,相应于高丰度mRNA 的 cDNA 克隆所占的比例比较高,分离起来比较容易,而相应于低丰度 mRNA 的cDNA 克隆所占的比例则比较低,因此分离也就比较困难.