1、提取细胞 RNA 的步骤:1) 六孔板每孔细胞中加入 1ml Trizol,冰上放置 5min,枪头吹打。2) 将各孔裂解液吸到 1.5 ml EP 管中,加入氯仿 0.2ml/管,用力振摇 15s。1530下孵育2-3min,离心(4,12,000g,15min)。3) 离心后液体分为三层(上层无色水样层为 RNA,中层白色为 DNA 和底层红色为蛋白质),小心吸取上层无色液体移入一新的 EP 管中。4) 加入等体积异丙醇,0.40.5ml,混匀,15-30下孵育 1030min,离心(4,12,000g,10min)。其中如果加入等体积异丙醇后,置于试管架上用 PE 手套密封后,放于4冰箱
2、中,沉淀 30min 效果更好。5) 去上清,沉淀加入 75乙醇 1ml,漩涡振荡 30s,离心(4,7,500g,5min)。6) 小心去上清,管内沉淀在超净台中鼓风静置干燥 3-5min。最好是用枪头吸取上清,尽量除去。7) 加入 20ul DEPC 水溶解,分装 5ul/管,-70冰箱保存。8) 细胞总 RNA 的鉴定:0.9-1.2琼脂糖电泳鉴定细胞总 RNA,观察出现条带及各条带亮度。紫外分光光度计测定:分别测定细胞总 RNA 在 260nm 和 280nm 处的光密度值(OD),并计算 RNA 的含量和纯度。1、实验目的提取人体细胞的总 RNA 和 mRNA。2、本实验所需试剂1)
3、、CNE-2 细胞及培养细胞的一系列条件,2)、PBS 缓冲液, TRIZOL 试剂,3)、DEPC 处理过的水、大、中、小 Tip 及 1.5 ml EP 管,4)、新的氯仿、异丙醇和乙醇,5)、mRNA 分离试剂盒:Oligotex mRNA Mini Kit,Cat.no.:70022, QIAGEN。6)、新配的电泳缓冲液,专跑 RNA 的琼脂糖(Agarose)。3、实验流程3.1 细胞总 RNA 的提取1)、6 孔板细胞(CNE-2)汇合度为 90-100%时,取出无菌室,去其上清,用 PBS 洗两次后,每孔加 TRIZOL 试剂(Gibco 公司) 1 ml,摇匀,无菌罩内消化
4、3-5 分钟(观察:液体变粘稠,细胞脱壁)。2)、将各孔内消化好的细胞裂解液吸到一 DEPC 处理过的 1.5 ml EP 管中,加新开的氯仿0.2 ml,轻摇 15 秒。3)、室温静置 2-3 分钟后,12000 rpm,15 min,4,离心。然后取上清无色水相(约0.6 ml)到 EP 管(DEPC 处理过),加 0.5 ml 新开的异丙醇,室温下静置 10 分钟。4)、12000 rpm,10 分钟,4,离心。观察总 RNA 在管底的白色沉淀,弃去上清(小心别丢了沉淀),75%乙醇 1.0 ml 洗涤(用 DEPC 水新配制)后,7500 rpm,5 min,4离心。5)、去上清,点离
5、,用小 Tip 吸干液体。气干沉淀 5-10 分钟, DEPC 处理水 20-30 ul 加入,中枪打匀,55-60水浴 10 分钟溶解总 RNA,测 OD 值。6)、电泳。3.2 从总 RNA 中分离 mRNA(Oligotex mRNA Mini Kit,Cat.no.:70022, QIAGEN)1)、取上述提取的总 RNA 若干(少于 0.25 mg)到一个新的无 RNase 的 EP 管中,用无RNase 的水定容到 250 ul。2)、加入 Buffer OBB 250 ul, Oligotex Suspension 15 ul。用 Tip 打匀或用手弹匀。3)、70水浴,3 分钟
6、(裂解 RNA 的二级结构)。4)、20-30条件下,静置 10 分钟(让 Oligotex 与 mRNA 结合)。5)、高速离心 2 分钟,小心吸走上清(该上清要保留),留下约 50 ul 的上清在原管里。6)、用 Buffer OW2 400 ul 重悬含 Oligotex/mRNA 复合物的沉淀,然后将这些加到套有1.5 ml EP 管的 SPIN 柱子上,高速离心 1 分钟。7)、将 SPIN 柱子移到一个新的 EP 管上,加 Buffer OW2 400 ul 到柱子,高速离心 1 分钟,丢掉滤过液。8)、将 SPIN 柱子移到一个新的 EP 管上,加 20-100 ul 热的(70
7、)Buffer OEB 到柱子上,用 Tip 来回吸打 3-4 次,高速离心 1 分钟。9)、为保证最大的 mRNA 产量,可再次重复第 8 步。10)、电泳。4、mRNA 的应用:RT-PCR, Northern 杂交,cDNA 文库构建, mRNA 末端快速扩增(RACE),差异表达(DDRT-PCR),引物延伸反应(Primer Extension),体外转录(In Vitro RNA Transcription), RNA 标记(RNA labeling),RNA 酶保护试验(RNase and S1 Nuclease Protection Assay),RNA 微注射(RNA Microinjection)