1、gephi 简要教程 邱 喆 2012-11-6 网络科学导论 Gephi 是一款开源免费跨平台基于 JVM 的复杂网络分析软件 , 其主要用于各种网络和复杂系统 。 Gephi 软件可以从官方网站 http:/www.gephi.org/免费获得。 gephi 软件使用前需要安装 Java Runtime Environment（ 简称 JRE，可以从天空软件园http:/ 下载获得 ） 。 用 Gephi 处理网络的主要步骤： 1. 收集现有网络，得到 用 边 两边节点 表示的 CSV 文件。 如果 得到 excel 文件， 可以 用 另存为 获得 csv 文件。 得到例如 ： 1,2 2
2、,3 3,4 4,5 5,6 1,6 1,3 2. 运行 gephi 软件。如图。选择 File-Open。将 File Type 改为 CSV，选择对应的 csv 文件，点击 Open 打开。 3. 出现如图的导入对话框。可以修改 Directed/Undirected 等。确认无误点击 Ok。 4. 导入后出现如图界面。中间是图的一个可视化表示。 5. 右手边的 Statistics 栏目中可以计算度分部、模块度、社团划分、 PageRank 等。 6. 如果需要分析随机图，在第二步时点击 File-Generate-Random Network。即可生成 ER 随机图。 7. 以此图为例
3、，先到 Statistics 栏计算 Average Degree和 Modular。点击 run 后获得结果。 8. 回到左手边的 Partition 窗口。点击 Nodes 下面的刷新按钮，再从下 拉 菜单选择Modularity class。后选择 Apply。即可根据社团结构染色。 9. 在 左手边的 Ranking 窗口，选择第一栏第四个图标，下面标准选择 Degree。点击 Apply即可按照度大 小改变节点大小可视化。10. 左下角的 Layout可以调整可视化图的布局。 Choose a layout的下拉栏选择 ForceAtlas，在下面的 Adjust by size 右边勾选 . 点击 Run 即可开始。得到合适的布局时点击 Stop。 11. 完成后选择 file-export-PNG file 即可输出图形文件。 如有更多问题请发送 email 到 phoeagon_AT_
