1、第一次作业1. 生物信息学定义（ NIH 版）2. 生物信息学研究意义及主要研究内容3. 人类基因组计划开始及结束日期，我国参与的内容，有什么意义； 4. 什么是功能基因组学，其研究内容有哪些？5. 检索至少两个在线翻译工具，将http:/ 序列（23001450）;c.P32 序列（24002450）;d.EcoRI 位点（2462），L 序列（24623962）；XbaI 位点（3962）；e.T 序列（4400-4450）。4.将上述序列翻译成氨基酸，并分析其等电点，分子量；5.试分子该序列被 CNBr 作用后的片段大小与分子量；6.预测该蛋白序列可能的抗原肽7.在 http:/www.
2、jcat.de/网站(学号单数)或http:/genomes.urv.cat/OPTIMIZER/网站（学号偶数）上分别将下载的 L2 基因的碱基序列按照宿主细胞（Escherichia coli K12）最适密码子进行优化，上交相应的优化序列；序列中避免出现因子依赖性的终止子、原核生物核糖体结合位点和 EcoRI 位点。8.用 DNAMAN 软件比较优化后核酸序列的区别。第六次作业请到教学材料上机实验中调取 AC_000160.1 序列请分析该序列中可能包含的开放阅读框；将预测的开放阅读框序列在 Genbank 中比对，推测该开放阅读框编码什么基因，可能具有什么功能；试预测该基因的上游调控序列、CpG 岛与 polyA 的结合位点的位置；查找该基因最相似的另外两个物种的 mRNA 序列，多重比对后输出可能的系统进化树；试分析该序列中基因编码的蛋白质的基本理化性质；试预测该序列中基因编码的蛋白质的跨膜区；试预测该序列中基因编码的蛋白质的二级结构及可能的 motif 位点；试分析该序列中基因编码的蛋白质的结构域；试预测该序列中基因编码的蛋白质的三维结构。
