1、李蓓蓓 04211957 生化与分子生物学一、细胞色素 C1. 酵母(1) Saccharomyces cerevisiae CYC7ACCNUM: J01320 M17753 M30712ATGGCTAAAGAAAGTACGGGATTCAAACCAGGCTCTGCAAAAAAGGGTGCTACATTGTTTAAAACGAGGTGTCAGCAGTGTCATACAATAGAAGAGGGTGGTCCTAACAAAGTTGGACCTAATTTACATGGTATTTTTGGTAGACATTCAGGTCAGGTAAAGGGTTATTCTTACACAGATGCAAACATCAACAAGAACGTCAAAT
2、GGGATGAGGATAGTATGTCCGAGTACTTGACGAACCCAAAGAAATATATTCCTGGTACCAAGATGGCGTTTGCCGGGTTGAAGAAGGAAAAGGACAGAAACGATTTAATTACTTATATGACAAAGGCTGCCAAATAG(2) Saccharomyces cerevisiae CYC1ACCNUM: V01298.ATGACTGAATTCAAGGCCGGTTCTGCTAAGAAAGGTGCTACACTTTTCAAGACTAGATGTCTACAATGCCACACCGTGGAAAAGGGTGGCCCACATAAGGTTGGTCCAAACTTGC
3、ATGGTATCTTTGGCAGACACTCTGGTCAAGCTGAAGGGTATTCGTACACAGATGCCAATATCAAGAAAAACGTGTTGTGGGACGAAAATAACATGTCAGAGTACTTGACTAACCCAAAGAAATATATTCCTGGTACCAAGATGGCCTTTGGTGGGTTGAAGAAGGAAAAAGACAGAAACGACTTAATTACCTACTTGAAAAAAGCCTGTGAGTAA2. 果蝇(1)cyt-c-pDrosophila melanogasterACCNUM: NT_033779TAATGCGTGGCCCCCGGTCACTCTGGTCAC
4、ACTAATTACCTATCGACATAACGCGCGCTCGTCATTCGTGAAAAATCGGCGACGCTCGACGTTTGTGTTCAATGTAAGTAGTGGGTGGAATTTTTGTATTTTCAAGTGACGTAAATATTACCTTGAATAGTTATTGATTATCAAGCCCCAAGTCAGATAAAGATTAGAAACACTTCCGTGTCATTTACGTAACATCCAGCAGCTGTGTTTTGTTCTGAAAATGATTCGCATGCAAATTTAACGTATTCTTTGGGGGATGATTCAGGTTACATAAACGTGTCCTTGTGTGTGTGTGTATAA
5、GTGTGATTTTTTATTAGATATTTAATAGTTTATTTAGCAAATATTAGCAGTGGTGTATTAATAGTAAAAATAGCATCCCAAAGTCACATTGCCATTGAAAAAAGCCCCGGAGAGAGTCGATTACATGAGCAAAGAGAGTGGCGTACCCGATCATCAGCTGTCTCGCTCGCTCAGTGGCAAAAATTAATTCTTGGATTTTTTGTCAATGCTTCAGCTTTGGAGTCTTTAAGCGCGCCACGTGGTTGCTAAGCAGGTTTTGCTTTCTGCGATGTGCAGTTTTCTATAATATAAATAAAAGAG
6、AATTCACCTCTGCGAAAAGGCGGCTTATGTAACATTCGCTGCTCTCAGGAAACTTGGATGTTGGCCCAATTTTCACTCATCTCTTTGTTCTCACCACCTTGCTCACCCACACAAGGAAAAACACAGCTGCCTTTGGCCTGCTTCCAATTTTCCAATTGCACTTTCCCTTCATCTCACGCACACTCACGCACGGCAATTAACTGAAAAATACTCAACAAGGCCAAATCGGATGTTGACATTGTTGTTGCTTTGCCACCTCTCACTGCCAAAGTGCATGATACTCTACACAGAAAGAAGTGA
7、AAAAAAGGTTGATATTAAATGCAAATTATGTGTAAAAGCGCACAAAATCAATAGTCTATATATATTAGGTTTGTTTTTATAGACAAATGCATATAAAATAAAATTAGTTTTCTAGAATTGAAAGAGCTTCAGCTAATCGAATTTCTCTCAGTCTATGTGCGTGATGTGTAGGTGAATTACTCACCGCAACGGTACTTTGCACTCTCAAGTTCAAATTGCTGCATGCAATTTATAATCCGGCAATTAGCAGGATGACCGTAACACAGACCCTGGAATAATAGAATAGTTATGTAAACAACT
8、AACGTTTTTCGTATTATGATGCTTCCTGGAAGTTTTCCGCCTGTTGCTGAGCAGTTCTGACGCAATTAATCGGCGACTGGCAAATATAAGCGAGTGAGACACAAAGAGAGTGTGAGAAGGAGAGAAAGAGTGTGGGGGCAACATGTGACCAGCGTCTGAAGCTTTTTCAAAGTGTGTTTCTGATGACGTTGCGACGCCCTCCACGCGCGTATTAGTGAGAGCAAAGTATGTGGGTTAAAAAGGGGGTGGCCGCAAATGGAAATGCAGACTACGTTAGATAATAATTTCGGGCCTTATCAG
9、AAACAACAGCCGACTAATGCACTTAGCATGAGCAATTTTAATAATTCCGTTTCCGCAGGGAGCTTATCAATTGTTTACATAACGGGGCAAGGGGACAAATATTAATTCACGGTCCATAACTACCTACATTAACCCATTATTTCCCAAGCATGGAAATTTTTGATGATATAAAGACGTTATTATTTTAATACCTTAAAAATATATAATATTATATAAGTAACGTTGGGAAATCAACTGGTTAATAAATTTTAAATTTCGGGTTTATTTATTCAATAATCTTTTGATAATGTATGGCTGAAA
10、GTGAAGCTTTTATCAGTATCTACACAATGGTTCATTGGGGCTAATAATAAATGGTATCAAATATCGTATAACTATTTTTTGCAGTGAAACCAGAATTTCGGACTAAGTACATAAGCAAATGATATAAAATATATATTGTAATCAATTTATCAGAATAGAACAAATTAATTGGTAGCAGTTATGAACTTTGAACCATTTAGTAGCCAGTTTTTTAAGTTTTTCAAACCTAAGATGTAAGATAACAGATATATTGGTTACCCTTGTTTTATGAACCACTCATTAATAACAAACATTTCTTTT
11、TACAGTCGAGTCCGTGTTAACACATTAATTAACCACATAATCCATAATGGGCGTTCCTGCTGGTGATGTTGAGAAGGGAAAGAAGCTGTTCGTGCAGCGCTGCGCCCAGTGCCACACCGTTGAGGCTGGTGGCAAGCACAAGGTTGGACCCAATCTGCATGGTCTGATCGGTCGCAAGACCGGACAGGCGGCCGGATTCGCGTACACGGACGCCAACAAGGCCAAGGGCATCACCTGGAACGAGGACACCCTGTTCGAGTACCTGGAGAACCCCAAGAAGTACATCCCCGGCACCAAGAT
12、GATCTTCGCCGGTCTGAAGAAGCCCAACGAGCGCGGCGATCTGATCGCCTACCTGAAGTCGGCGACCAAGTAATGGTGCTGTCCATCAACTTACCCACAACCACTGCAGGATGTCAAACTGTATTATTGTGTTCAGTCACAGTCCGGCACGCAAATGCAGCAGCAGCAACAACTACAACTACAAATCAACATAGTACAGACCTAAAGAACTACAATTATGTTAATTATAAAGTTTAAATAGGACAATTTATTATTTAATTTAAATAAAAAGTGGAATATTTAATTCAAACCCGATGAGAA
13、TTGTGACATCCACAAAAAAGTTAAATAATAAAAAAAGAACTAAAAAATGATATAAA(2)cyt-c-dDrosophila melanogasteACCNUM: NT_033779GAAACGCTCTAGAAATTTCAGTAGTGGTAAAGGCCAGAACACATAACTTTCGAAGGTGACAAGCAGCAAACAAATTTTCCGTTCTCGCCGAGTCTTGTTGTTTTGGGGATATTTTCCAACTCAAAAACTGGTGCGTTTCAGTTCCTTTACAGACGCAAGACGCGTAATATTCGATCGGTGTAACGGTGAACAGAA
14、TCGGCAGCGGGAAAACCGAACGCGGCGAACTCAGCTGATTGAATGAAAACGCCAAGCTGAGCAGCAGCCACAATTGCCATTGCCCCAACCAGCGCTCATTGAGAGAGGGAGCCAACGAGAGAGCGAGCAACAAGCAACTGCAGAGCGAGAAGAACTGTCCGTCGGGTAAGCTTGTTGCGTTGTTGCTGCCCCTTACACAGCAAAAAAGAACTTAGCTAGTTTTACAATTGCTTAATTTTATATGAAACTAAGCATATAGTCATATTTGTTTATTAAACTAAATAAGTAGCTATATTAAAA
15、AAGCTAATTATTGGCATTCTCCTTCTTTTCTCCCACTGTGCACGATGCAGAGACGTCAGCAGTGCACTCAGAGCAAAGAACAGGTATAAAATGCCCAAAAAGAAGCATTTTTAGTAATTTTTCATTCACACATTTCCAACATTGCTCTCACGCGCAGCGCTGCAGCTCTCTCGCAGCGCTTTCTCCGTGTCATTTATGTTGGAGCTGCTCTCTTTCTAGTCTCTCTGCCCCACTCTTTCACCTCTTTCTCTCTCTCTCGCTCAGCATAAAATGCAAAACCAACTAGCGGTGTTGTTGTTG
16、TAGTTGGGGGGTTATGTAACTTTCGGGCATCCGCAAGCACAGAAAGCTGAAAGCGTTGAAGGGCAGTCAGCGACCTCGTTCTAGAAAAGAAGCCATCTCTTCAGCCCCTCCACGCACCACCCCTCAAAAGAAAGCCCCCCCCCAAAGAAGAAGAAGCAACAGCAGTGAAAAGCGCGTAGTATAAACACATGCTGTAACATAAACAGTGGTACTTGCTTAACTAAAGCAACTATGCTTGCACATATAATTATAATTAACTAAATGTATTTGCTACCATTATCTTTAATGTAAAGTTTTGAC
17、AATGTGTTTTTCCTTAAATATCCATATTAAGCTCACTAATATTTCATAAAAACTTTTCTTTAATCTAAATATTTGACATCATGTCATATAAGTATTACTGTGCAATCAAAAAGAAAGGGGAGCAAGAAAGAAATGTAGGTTTTCTGCCATGCAGGGCAGGGGCAAACCAGAAATGTCTGCTTTTTAGGTTGGGGAGGTGGTTCTTTATGGGTATAGCTTTCGAGGGGGTGTGGCCTGGCGGGAATCCCAAAGTCATGCCAAATTGCGCAACAGCCAAAGCGTTGTTCTTGGTAACCCGCT
18、GACCGAGGATATTGACGCAGAAGTGGGTATGGAGTGGCAATAATAATAATTTCACTGGTCAAGTCTGAGGTACTCCAAGAAACCGTTATTAAATTATGTTAAGTGAACTTTCCATGGTTACAACAAAAAAAAACGAAAGAGAACAACAGTATAGTCGATTTCCATGACTATACACCCAGCTAGAGGTAGTGCTAGGAAGATTTTATAGTTTTTGGCATATCGATAGAATCTTTTTAAAAAAAAAAACGTTAAATCATAGTTTTTGGCGTGACACCTTTGCAGTCTTCTGAAAGAAAGCTG
19、CGTATCGTACATACGGACAAATAGACGGACAGCAGACATTGTCAGATCGGCTGGTGATCCTAATTAAGAATATACTCTATAGGGTCGGAACCGTTTTTTCCCTCTTACATACTTTACGAAAGTAGCGGGTGGAGCTACATAAAACATTTTTCCCTTCCTCATTACATTTGAGCAGATGCCGCAATATGCTTTTTATTTTTGCATAACAATTTCCGCACCTTACAGGCAATTCAATATCTGCACCTCCTTTAGCACGCAGACTCCTTTGTGCCTTTGCACTCTTTTTGAACTCTATTTGTC
20、CTGGACCATCCTCTCACCTTTTTATGGACTTCCGCAGCAATAGATCTAGTAAACAATATAGCCTCCCCACAACCTTTCCGCAGGCTATCTCTTTCCTACTACTACCCCATGTTCGGCCGAGCCCGTTCAAGCGTAATTTAATTTCTTGCACCATTTATTTATAGTGGTCCGGCAAAAGAACTCGGGCCAACAGGCAGGATAGTTTAGCCTGCGGGTAAATTATGGTTCCATTGCCAATTAGGTTAGGTCACAACCAGGATGTCCCATTGGGGATATATGTATGTATGTATGTAGATGGAT
21、GCACAGGGAGTACACCTAATACCAGTGCAGGGCTGCCAGGAAAATGTCATTGTTTGGATTTAGAATGTGACATTTACATACGTACGTAATATAAATATATAAATAATATCATTCTCTGAAAAATATCATAATGCACTCTTGTAAATTTAAAACAAATTTAATTTTAAGATAATTGGTTGAGATAAACATAGTTAATATTTTCAATTGATCCTTTAAATTTTAAATTGCAGGTGAATATCATCCCTGTGTGACCGTTGTATGCGGCATGGTTCCATGTCTCTTTCCCGTTATTCATTTCCC
22、TCTGCTTTGTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTGTTATGCGGTGGCATCTGTTTTTGCCACAGGAAAATGGTTGAGAGAGGGGAAGGCAGGGGGCGAAAGCGGAGAGTGCGTAAAATGCGTTTTAATTGAAAGGAAATGTTCAAAGCACATGTGCATCTGCTAGTCAACGAATTGGTTGGGAAAGGGGGTGGCAAGCCGAATGTGTCTGCTAATTGAATTACCTTTCGGTTGCTTTTCCCATTAGAAGTGCCGACAAGTTCTCGAGCTGCTTGTTTGCTTTTCATTTAATACCCATTTTGATTT
23、AATTTTCGTTTTTCCTATTTTTCTGACCCAATTTTGTTTTGCTTTCGTGCATTAGCAGCTGTCTCTGTCTATCGCTGTGCAGCCAAGAGAGTGACCAAGAGAAACGCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTTGTCCAGGACTTGCACTTTTCAAACGGTTTTTTAGGACACTGAAACAAATTGAATCTGTTTTTCTTTTCTATCAAATTTTTAGTTCTACACTTTTCTTTTTCATGATAGTTTCGGAATCAACCAATTTCTATTTGATCCAAATTAACAAAAAACAAATAACAAAAAATTAAAAA
24、ATATAGAAATAAAAGCTGCATAAAAAGTTGAATTCTAAATCATAAATATCATTTTTCCCTATTTGTCTTTCAGGCTTCCAAGATGGGTTCTGGTGATGCAGAGAACGGCAAGAAGATATTTGTGCAGAAGTGCGCCCAGTGCCACACCTACGAAGTGGGCGGCAAACACAAGGTGGGCCCAAATCTTGGCGGGGTCGTGGGTCGCAAGTGTGGCACAGCAGCGGGATACAAGTATACCGATGCCAATATAAAGAAGGGCGTTACCTGGACAGAGGGGAATTTGGACGAGTACCTCAAGGA
25、CCCGAAGAAATACATTCCCGGAACAAAGATGGTGTTCGCAGGTCTTAAAAAGGCTGAGGAGCGGGCCGATTTGATTGCCTTCCTCAAGTCAAACAAGTAGAATCGCCTGCGAAACAACAAGATCGGCCACCATGCTATCCAGAAAACTGCGCTTAAAGACTACAAACATATTCAAAAGATGACGTATTTCACTTGGATTTCGAAACTTTGATTGGGAATGGTCGAGCTCAAATACATTTCAAAAAGGTTTACTTTCACTTTAGCCAATTAAAGTTGATAAACCAAAAACC3. 小鼠Mus m
26、usculusACCNUM: BC094054.1 ggtctgtctt cgagtccgaa cgttcgtggt gttgaccagc ccggaacgaa ttaaaaatgg61 gtgatgttga aaaaggcaag aagatttttg ttcagaagtg tgcccagtgc cacactgtgg121 aaaagggagg caagcataag actggaccaa atctccacgg tctgttcggg cggaagacag181 gccaggctgc tggattctct tacacagatg ccaacaagaa caaaggcatc acctggggag241
27、 aggataccct gatggagtat ttggagaatc ccaaaaagta catccctgga acaaaaatga301 tcttcgctgg aattaagaag aagggagaaa gggcagacct aatagcttat cttaaaaagg361 ctactaatga gtaattccac tgccttattt attacaaaac aaatgtctca tggcttttaa421 tgtacaccat aatttaattc acacaccaaa ttcagatcat gtatggctag caatgttttt481 gttggacagt cctgatttaa g
28、taaaactga cttgtcataa agtgggtacg gtctttatta541 aagcaacagt tccagttgta tacatgctac cacggctctc cctttctcaa gataagattg601 gacttaatta gcaatgtttt actttccata aataggggca tgtcacctca aacctactaa661 atggttttat acttagattt atataactgg gcatatgaat atgcttaaac actgggaaaa721 ttctatcact gtctcagaaa caagaagact caaatgtgtt tca
29、gtttgtg ttcactggcc781 tctttcaggt catggctaac caccaggagg caactgtcta ttcttgacag tgcagtttta841 attagaattc cctacatcaa ggatgttgcc ttttactatt gaaaggcatt tactgtggtt901 tatgtatgat atcaaataaa gagtatttaa cacttcttta tagttgatct gcaaattaaa961 atgcttttag aaacaagcaa gttaggcctt ttaaattctc tattttctaa gactaagttg1021 t
30、aaatcagaa ttgtccttaa atacccactc agaaacacac ataactggaa ttcgattagg1081 aatggcactc tttgctaact tactagatgg aaagatggaa ataaaggaaa tagtttgtat1141 cagcagaaag aagataatta aaacaaccac agatcgtgaa aaaaaaaaaa aaa4. 人Homo sapiensACCNUM : M22877.1 gcacgtcagg gcgcgggagc gcggagcgag tttggttgca cttacaccgg tacttaagcg61 c
31、ggaccggcg tgtccttgga cttagagagt ggggacgtcc ggcttcggag cgggagtgtt121 cgttgtgcca gcgactaaaa agaggtgaga gcgggtcgcg gaggccgcac ctggttagag181 gcagagctgt gggaggcgcg cacttgcgag cgagccgaaa cccaagcggg gagcattcga241 ggtggagccc gcgctgggtg ggagggcggg gagtgaagac cctggactgt ggtcagaccg301 agctgggcga gtaacggctt gag
32、gtgcggc ggagccctaa ctagggacag gtatggtctc361 ggtcagggac tggaggcggc ttggatacag atccgaggag gaggcggcct cttccgtagt421 ggttgctgaa gggctatgga aatgataggc aagacttccc tcctggaaag ccgaagctta481 gagcttcacg ttcttcttca gagggcaaaa gctgttgctc ttctaataag gggccagttc541 ttttcgtggg cacatgtttc ttccgtcagt cgttctgaca tccta
33、gaagg agtttcatca601 atcaccttga aaccgacctg gacgggtgac ctcgtggtcg ccccaggaga tcacaggtag661 gggagttggg atcgcccggg ggaccgtgca gcctgcccct gagctcccat tcacaagttc721 gagtgtcaag ctactcctgt gacctgggca gatagaaaca gccaggaccg ctttttaaac781 atttgtgtgc tttgcgttat cctcagggag aggtggcttt acattgtagt aagattaaat841 ggtt
34、aggtct ttttaaaagt tgcggttgtg gtgattttgg cttaatgtgt tcgcccttga901 gcttcagatc tgtgacttcg tgaccatgat tgtctcttct gaaactggag tttgaattag961 gttccctctt tgcttgggct ttaacgttcc ttcacgtata cacacaaaaa tacgtttttg1021 aggaggtact cctaaaaatg tttttggtat taaagaatat ttggtataaa gagtattaaa1081 gcaaaacaag attcattctg gtat
35、ttaatg acataaatta gcaatggatt ggtaattaag1141 tggctagagt ggtcattcat ttacactgta tttgttacct gaggaaaaat ttactaagtt1201 gaagctttcg tttttagaat taaatatggg tgatgttgag aaaggcaaga agatttttat1261 tatgaagtgt tcccagtgcc acaccgttga aaagggaggc aagcacaaga ctgggccaaa1321 tctccatggt ctctttgggc ggaagacagg tcaggcccct gg
36、atactctt acacagccgc1381 caataagaac aaaggtaaga gtcacttgtt aaataaaaca acacaaaatg caggaatata1441 acatgtggca aactatcagg agtgtgaaat aaccgatgca ttctttcttg tttaggcatc1501 atctggggag aggatacact gatggagtat ttggagaatc ccaagaagta catccctgga1561 acaaaaatga tctttgtcgg cattaagaag aaggaagaaa gggcagactt aatagcttat1
37、621 ctcaaaaaag ctactaatga gtaataattg ggccactgcc ttatttatta caaaacagaa1681 atgtctcatg acttttttat gtgtaccatc ctttaataga tctcatacac cagaattcag1741 atcatgaatg actgacagaa tattttgttg ggcagtcctg atttaaaact aagactggct1801 tgtggttaaa tgaatatgtt cagtttttga attttaatag taactccaat tcagtaaatg1861 gtatcactgt ttacc
38、ccttt taaagatatg attagacttc gttagtaatg ttcaactttt1921 cacaaagatg gtgagtgcca tcttaaaact tactggagat tggttttata tttagattta1981 tataactggt tatgtgaata tatttaaata ctggggaaat tgcttcactg tcttagaacc2041 aagcaagatt cacctgtgtt ttgtgttcat gttcatttgc ctcttaaagg caagggttga2101 agataaataa ggtagcaatg tctatagttt tgg
39、ccttaac tatgccaatc taattataat2161 tccctgtatt taaaatggtt tcttttactt attgaaaggc attttagtgt ggtttatgtg2221 taatattaaa gattattcaa cacctctcac atcttacaga tctataaggt cacatgcttt2281 taaaatagta gcaagttaaa cttcactctt gaattcttta caatctaagt caaactaagt2341 tataatttag gattgtcttt aaacagccat tcagaaacaa aactgtagaa c
40、tgtgtattt2401 gattgggaat ggtgcttttg ccaacttaaa aggattaaag taacggagat atacacaaat2461 tttaaaatta tgtgtgatca caagactaaa gataattaaa aagaaaacca cagatcatga2521 ctttttgact gtgcttgatt tcatgactga tgcacaaatt ttaatgatta aaaagtgcag2581 gagccctaaa tgtcagtgca gcagccctaa atgtcagtgc agcagtgtta accagtcatg2641 gtgcta
41、gatt gtttacttgg ttttctagga ctgcctcaac tagaataaca cttcactaat2701 tgactcttag tttctttgct cagattgaga actgcagcat ttatcgcaga catggacaga2761 ggaatgcctg tggtcatagt tttgtgatgt gtaacagtgt ataattacat actgaattat2821 ttcatgcata gtctgtgcca tacacattta gagtagtcct tggagatttt atggagatgg2881 tgagcacaag gtaagtcata aaga
42、ataatg agaaaataaa tctatgctgg tgcagctgag2941 aactgtatct ttgtgggaca gtgagaagac tgagaagatg tgaatccatg gtctcaaagg3001 tgatagggac gattagatag gtgttttaag gcctgaaagc aatttataac atatgagtct3061 tatttttatt tatagaaatg tgaagctt二、BLAST(1) 核酸-核酸blast 程序:blastn比对的数据库:nr相似性最高的序列的 ACCNUM:XM_594199相似性最高的序列所在的物种:Bos taurus (cow)相似性最高的序列的功能描述:Bos taurus similar to ribosomal protein S19,mRNA(2) 核酸-蛋白质blast 程序:blastx比对的数据库:nr相似性最高的序列的 ACCNUM:XP_512692相似性最高的序列所在的物种:Pan troglodytes (chimpanzee)相似性最高的序列的功能描述:Ribosomal protein S19e三、进化关系树树二为合理的进化树。1-4 与 A-D 的对应关系是:1-B;2-C;3-D ;4-A。支长长度:a=6;b=4;c=10;d=8。