1、第二章1. 名词解释（1）顺反子(cistron)：基因所对应的一段核苷酸序列被称为顺反子（ cistron） ，一个顺反子编码一种完整的多肽链。它是遗传的功能单位。（3）转位因子（transposable elements）：是指可以从染色体基因组上的位置转移到另一个位置，甚至在不同的染色体之间跃迁的基因成分。（4）基因组（genome）：细胞中，一套完整单倍体的遗传物质的总合。（5）启动子（promoter）：是 DNA 链上一段能与 RNA 聚合酶结合并能起始转录的序列，其大小不等，具有转录目标基因的 mRNA 的功能。启动子是基因表达不可缺少的重要元件。（6）基因（gene） ，基因是
2、 DNA 分子中含有特定遗传信息的一段核苷酸序列，是遗传物质的最小功能单位。（7）顺反子(cistron)：基因所对应的一段核苷酸序列被称为顺反子（ cistron） ，一个顺反子编码一种完整的多肽链。它是遗传的功能单位。（8）终止子（terminator） ，在基因 3端下游外侧与终止密码子相邻的一段非编码的核苷酸短序列，具有终止转录的功能，叫做终止子（terminator） 。（9）断裂基因（split gene） ，真核生物的结构基因是不连续的，编码氨基酸的序列被非编码序列所打断，因而被称为断裂基因（split gene） 。在编码序列之间的序列称为内含子（intron） ，被分隔开的编
3、码序列称为外显子（exon） 。（10）顺式作用元件（cis-acting elements） ，指那些与结构基因表达调控相关、能够被基因调控蛋白特异性识别和结合的 DNA 序列。包括启动子、上游启动子元件、增强子、加尾信号和一些反应元件等。（11）反式作用因子（trans-acting elements） ，可结合顺式作用元件而调节基因转录活性的蛋白质因子称为反式作用因子（trans-acting elements） 。（13）反应元件（response elements） ，是一类能介导基因对细胞外的某种信号产生反应的DNA 序列，被称为反应元件（response elements） 。（
4、14）增强子（enhancer） ，是一段 DNA 序列，其中含有多个能被反式作用因子识别与结合的顺式作用元件，反应作用因子与这些元件结合后能够调控（通常为增强）邻近基因的转录。（15）转位因子（transposable elements）：是指可以从染色体基因组上的位置转移到另一个位置，甚至在不同的染色体之间跃迁的基因成分。（16）转座子（transposon， Tn） ，是一类较大的可移动成分，它是由几个基因组成的特定的 DNA 片段，除有关转座的基因外，至少带有一个与转座作用无关并决定宿主性状的基因（如抗药性基因） 。（17）假基因（pseudogene） ，假基因是多基因家族中的成员，
5、因其碱基顺序发生某些突变而失去功能，不能表达或表达异常，生成无生物活性的多肽。（18）重叠基因（overlapping genes） ，或嵌套基因（nested genes） ，是指基因的核苷酸序列（或阅读框）是彼此重叠的基因，称为重叠基因或嵌套基因。（19）基因家族（gene family） ，就是指核苷酸序列或编码产物的结构具有一定程度同源性的一组基因。（20）反向重复序列，是指两个顺序相同的拷贝在 DNA 链上呈反向排列。有两种形式，一种形式是两个反向排列的拷贝之间隔着一段间隔序列；另一种形式是两个拷贝反向串联在一起，中间没有间隔序列，这种结构亦称回文结构（palindrome） 。（2
6、1）看家基因（housekeeping gene） ，在几乎所有细胞中或发育过程中持续表达的基因，被称为看家基因。（22）锌指（zinc fingers）结构，由约 30 个氨基酸残基组成的一段多肽序列，其中 4 个氨基酸残基（两个是半脱氨酸两个是组氨酸，或 4 个都是半脱氨酸）以配位键与 Zn2+相互结合，形成指状结构，常存在于真核转录因子的 DNA 结合结构域中。（23）亮氨酸拉链（leucine zippers） ，是指在一段肽链中每隔 7 个氨基酸残基就有一个亮氨酸残基，这段肽链所形成的 -螺旋就会出现一个由亮氨酸残基组成的疏水面，而另一面则是由亲水性氨基酸残基所构成的亲水面。由亮氨酸
7、残基组成的疏水面即为亮氨酸拉链条，两个具有亮氨酸拉链条的反式作用因子，能借疏水作用形成二聚体。（24）基因重排（gene rearangement)，是指某些基因片段改变原来存在顺序，通过调整有关基因片段的衔接顺序，重新组成为一个完整的转录单位。（25）RNA 编辑（RNA editing） ，是一种较为独特的遗传信息加工的方式，即转录后的mRNA 在编码区发生核苷酸改变的现象，是在 RNA 分子上出现的一种修饰现象。（26）分子伴侣（molecular chaperone） ，是指能帮助新生肽链折叠，使之成为成熟蛋白质，但本身并不参与共价反应的物质，大部分为蛋白质。DNase 超敏位点（hy
8、persensitive site）：染色体 DNA 中转录较为活跃的区域，组蛋白相对缺乏，并对核酸酶（DNase）高度敏感，故名。2. 简述乳糖操纵子中 CAP 的正性调节作用机制。降解物基因活化蛋白（catabolite gene activation protein，CAP ）是一种同二聚体，其分子内有 DNA 结合区和 cAMP 结合位点。CAP 与 cAMP 结合形成复合物才能刺激操纵子结构基因的转录。当葡萄糖浓度低时，会使 cAMP 浓度升高，形成 cAMP-CAP 复合物，并与启动子上游的 CAP 位点结合，刺激 RNA 聚合酶的转录作用，使转录效率提高 50 倍，然而这种作用的
9、前提条件是无阻遏效应存在。当葡萄糖浓度较高时，cAMP 浓度降低，cAMP与 CAP 结合受阻，转录效率下降，由此可见，乳糖操纵子结构基因的高表达既需要有诱导剂的存在（消除阻遏效应） ，又要求无葡萄糖或低浓度葡萄糖的条件（促进 cAMP-CAP 复合物的形成，刺激转录） 。3. 比较原核基因组与真核基因组的结构与功能特点1 原核生物基因组仅由一条环状双链 DNA分子组成，含有 1 个复制起点，无染色体结构，基因的转录和翻译在同一区域进行。1多条染色体，两份同源的基因组，而原核生物的基因组则是单拷贝的。基因组庞大、复杂，具有许多复制起点，每个复制子大小不一。2具有操纵子结构这是原核基因组的一个突
10、出的结构特点。2. 无明显操纵子结构，存在大量反式作用因子与顺式作用元件的相互作用调节3编码序列在基因组中约占 50%编码顺序不重叠，其转录产物多为多顺反子结构。3非编码的顺序占绝大部分，约占 90%以上。基因组中非编码的顺序所占比例是真核生物与细菌、病毒的重要区别。4多顺反子结构，无内含子，是连续的，因此转录后不需要剪切。4单顺反子结构，即一分子 mRNA 只能翻译成一种蛋白质。存在断裂基因。5基因组中重复序列很少 5含有大量重复顺序，这是真核生物基因组的重要特点。6存在移动基因，包括插入序列和转座子 6 有基因家族，功能相关的基因构成各种基因家族，它们可串联在一起，亦可相距很远。4. 简述
11、真核表达调控的主要环节和调控方式。（一）DNA 水平的调控：（1） 染色质结构对基因表达的调控作用， （2）基因修饰，（3） 基因重排， （4）基因扩增。（二）转录水平的调控（转录起始的调控）（1）反式作用因子的活性调节；（2）反式作用因子与顺式元件的结合；（3）反式作用因子的组合式调控作用（三）转录后水平调控（1） “加帽”和“加尾”的调控；（2）mRNA 选择性剪接对表达的调控 ；（3）RNA 编辑的调控；（4）mRNA 转运调节（四）翻译水平的调控（1）翻译起始调控；（2）mRNA 稳定性对翻译的影响 （五）翻译后水平的调控（1）信号肽的切除；（2）新生肽链的修饰；(3) 肽链的剪接与正
12、确折叠第三章1. 核酸分离纯化应注意哪些事项？一般的分离纯化分为哪些步骤？各步的要点是什么？分离纯化核酸应注意：应保证核酸一级结构的完整性，防止降解；排除其它分子的污染。为了保证核酸结构与功能的研究，完整的一级结构是最基本的要求，因为遗传信息全部贮存在一级结构之内。保持核酸的完整性，即保持其天然状态。细胞内的核酸酶活力很高，在制取过程中必须防止核酸酶对核酸的降解。防止化学因素(酸碱等)和物理因素(高温或机械剪切等)引起核酸变性或破坏。制备 RNA 要特别注意防止核酸酶的作用，因为 RNase 分布很广，活力很高；而对 DNA 更重要的是防止张力剪切作用，因为 DNA 分子特别长，容易断裂。核酸
13、的纯化：首先是去除蛋白质。要点：从细胞裂解液等复杂的分子混合物中纯化核酸，要先用某些蛋白水解酶消化大部分蛋白质后，再用有机溶剂抽提。从核酸溶液中去除蛋白质常用酚/氯仿抽提法，在氯仿中加入少许异戊醇的目的在于减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。用氯仿抽提处理，去除核酸溶液中的痕量酚。要点：如果下一步骤中酶反应的条件要求严格，最可靠的方法是再用水饱和的乙醚抽提一次，以彻底去除核酸样品中的痕量酚与氯仿，然后在 68水浴中放置 10 分钟使痕量乙醚蒸发掉。6.PCR 反应的基本原理是什么？每个循环包括哪些步骤？有何应用价值？PCR 反应的基本原理：首先是双链 DNA 分子在临近沸点的温度下加热时便会分
14、离成两条单链的 DNA 分子，然后 DNA 聚合酶以单链 DNA 为模板并利用反应混合物中的四种脱氧核苷三磷酸（dNTPs）合成新生的 DNA 互补链。此外， DNA 聚合酶同样需要有一小段单链 DNA 来启动（“ 引导”）新链的合成。每一个温度循环周期均是由高温变性、低温退火及适温延伸等三个步骤组成。应用价值：PCR 技术不仅可以用来扩增与分离目的基因，而且在临床医疗诊断、胎儿性别鉴定、癌症治疗的监控、基因突变与检测、分子进化研究，以及法医学等诸多领域都有着重要的应用。9.PCR 的引物设计应遵守哪些原则？如何对体系反应条件按优化？原则： PCR 引物合成的 DNA 片段通常长 1525 碱
15、基，其中 GC 约占 50%。在设计时必须特别注意引物之间不能互配形成双链结构，引物内部也不能形成发夹结构。 引物的 3末端必须与目的片段完全相配。引物的 5末端可以不与目的片段互补，可以包含内切酶位点或启动子序列，但在下一轮反应中，这些序列会被同样合成。有时在扩增仅知其表达产物的目的片段时，可以在引物中设计成简并密码子。体系反应条件按优化：首先是使模板 DNA 解离成为单链，这个过程可以通过加热完成，在 9095条件下，根据模板 DNA 复杂程度，调整变性温度和时间。一般情况下选择 94，30 秒可使各种复杂的 DNA 分子完全变性。过高温度或高温持续时间过长，会对Taq DNA 聚合酶活性
16、和 dNTP 分子造成损害。 变性后的 DNA 迅速冷却至 4060，可使引物和模板 DNA 发生结合。复性温度的选择，可以根据引物的长度及其 GC 含量确定。长度在 1525bp 之间时，引物的退火温度可通过 Tm=4（GC）2（AT）计算得到。 PCR 反应的延伸温度建议选择的 7075之间，此时，Taq DNA 聚合酶具有最高活性。当引物在 16 个核苷酸以下时，过高的延伸温度不利于引物和模板的结合。此时，可采用使反应温度缓慢升高到 7075的方法。 PCR 延伸反应的时间，可根据待扩增片段的长度而定，一般 1kb 以内的片段，延伸时间 1 分钟即可；扩增片段在 1kb 以上则需加长延伸
17、时间。其他参数选定后，PCR 循环次数主要取决于模板 DNA 的浓度。理论上2025 次循环之后，PCR 产物的积累即可达到最大值，实际操作中因此不管模板浓度是多少，2030 次是比较合理的循环次数。10.解释以下名词：反向 PCR，不对称 PCR，反转录 PCR，多重 PCR反向 PCR: 用于扩增位于靶 DNA 区段之外的两侧的未知 DNA 序列。不对称 PCR：可用于制备单链模板 DNA。这种方法除了使用的两种引物浓度相差 100倍之外，其它方面与标准的 PCR 并没有本质的区别。反转录 PCR：用于扩增被反转录成 cDNA 形式的特定 RNA 序列。多重 PCR 技术：即在同一试管中加
18、入多对引物，扩增同一模板的几个区域。12.简述核酸杂交的基本过程，核酸印迹转膜有哪些方法?核酸杂交的基本过程：将核酸从细胞中分离纯化后，在体外与探针杂交，或直接在细胞内进行杂交的过程。核酸印迹转膜有：Southern 印迹杂交、Northern 印迹杂交、斑点杂交及狭缝印迹杂交。第四章1、什么是 DNA 限制性内切酶；基因工程中常用的是哪种类型，如何命名？答：DNA 限制性内切酶：是能识别并切割双链 DNA 序列内部特定核苷酸序列的 DNA 水解酶。它可以将外源 DNA 切断，从而限制外源 DNA 的侵入并使之失去活力，但对自身的 DNA 却无损害作用，这样可以保护细胞原有的遗传信息。由于这种
19、切割作用是在 DNA 分子内部进行的，故名限制性内切酶(简称限制酶) 。基因工程中常用的是 II 型限制性内切酶。人们使用限制性内切酶寄主菌的种属名称，来命名限制性内切酶，即以微生物属名第 1 字母（大写）和种名前两字母（小写）写成斜体三字母，例如，大肠杆菌（Escherichia coli）用 Eco 表示。菌株名以非斜体在此三字母后，若菌株有几种不同限制性内切酶时，则以罗马字母区分，如 Hind、Hind、Hind等等。4、利用逆转录酶和 mRNA 模板合成 cDNA 的主要步骤是什么？答：（）以具有 poly（A）结构的 mRNA 做模板，并以 1218 个碱基长的多聚胸腺嘧啶寡核苷酸
20、oligo（dT）片段作引物，在逆转录酶的 5-3聚合酶活性催化下，合成出与模版 mRNA 的单链互补的 cDNA 单链。具有 poly（ A）结构的 mRNA 是采用一定的抽提方法从生物体内分离纯化而来，在 mRNA 单链的 3端是由一连串碱基 A 组成的多腺嘌呤尾巴。胸腺嘧啶可以与腺嘌呤配对互补，所以采用 oligo（dT ）做引物，与 mRNA3端的 poly（A）尾巴结合。 （2）碱水解法除去 mRNA 模板之后，单链 cDNA 能够自我折叠形成发夹环结构，折叠的短链即成为第二条 cDNA 链合成的引物，反转录酶或 Klenow 酶就可催化第二条链 cDNA 合成。 （3）采用 SI
21、核酸酶消化法，除去单链区的发夹环结构，就可将获得完整的 DNA 分子。6、为什么通过碱性磷酸酶处理可以防止质粒载体 DNA 自连的作用？答：碱性磷酸酶可催化除去 DNA、RNA 的 5磷酸基团。碱性磷酸酶处理过的 DNA片段缺少连接酶所要求的 5磷酸末端，因此它们不能进行自我连接。在质粒载体与外源DNA 连接构建重组质粒时，使用碱性磷酸酶处理酶切过的质粒，可以降低载体 DNA 的自连。第五章1. 以 pBR322 为例，论述质粒载体必须具备哪些条件？（1） 具有复制起点，在宿主细胞中能自主复制。（2） 带有尽可能多的单一限制性酶切位点，以供外源 DNA 片段定点插入。（3） 具有合适的选择标记
22、基因，为宿主细胞提供易于检测的表型特征。（4） 具有较小的分子量和较高的拷贝数。2. 试述 噬菌体载体是如何进行构建的？（1） 去除 DNA 非必需区，增加承载外源 DNA 片段的容量。（2） 去除多余的限制酶切割位点，确定 12 个单酶切位点作为克隆位点。（3） DNA 的非必需区组入选择标记基因，以方便对重组子进行筛选。（4） 建立重组的 DNA 分子的体外包装系统，高效的感染受体细胞。5. 简述表达载体需要哪些基本元件？各有什么作用？在克隆载体的基础上，表达载体的构成特别强调与表达强弱相关的构成元件如启动子、终止子、核糖体结合位点等。（1）启动子：启动子位于转录起始点上游，是 DNA 链
23、上一段能与 RNA 聚合酶结合并能起始 mRNA 合成的序列，是启动基因转录所必需的一段 DNA 顺式调控元件。没有启动子，基因就不能转录。（2）终止子：在一个基因的 3端或是一个操纵子的 3端往往还有一特定的核苷酸序列，它有终止转录的功能，这一 DNA 序列称为转录终止子（terminator） 。在构建表达载体时，为了防止由于克隆的外源基因的表达干扰了载体系统的稳定性，一般都在多克隆位点的下游插入一段很强的核糖体 RNA 的转录终止子。（3）核糖体结合位点：核糖体（rRNA）是蛋白质合成的场所， mRNA 有效地翻译依赖于mRNA 的稳定性及其与核糖体结合的能力。6.论述双元载体的概念及构
24、建原理。双元表达载体由 2 个分别含有 T-DNA 和 Vir 区的相容性突变 Ti 质粒构成，即微型 Ti质粒（min-Ti plasmid）和辅助 Ti 质粒（helper Ti plasmid） 。利用二元载体进行遗传转化时，首先要将外源基因构建到微型 Ti 质粒上，再将微型Ti 质粒转入含有辅助 Ti 质粒的土壤农癌杆菌菌株中，用该菌株侵染植物组织，含目的基因的 T-DNA 可整合到植物基因组中。双元载体不仅构建方便，而且其 T-DNA 整合进入植物细胞不需要带进许多冗余 DNA 序列，转化效率高于一元载体。第六章1、克隆基因的方式有哪些？目前基因克隆的手段多种多样，概括起来主要包括两
25、种策略：一种是构建大容量或者经特定手段优化的基因文库，然后利用一定的筛选方法从中分离、鉴定出需要进行研究的目的基因；另外一种策略是在基因序列已知的基础上，通过 PCR 扩增、改造或者人工化学合成的方法获得目的基因。目前几种常见的基因克隆手段，如基因组 DNA 文库、cDNA 文库、PCR 扩增法、人工化学合成法、差异克隆技术等。2、试述基因组文库的构建流程及其影响因素。构建流程一般来说，构建基因组文库的基本步骤有五步：高分子量 DNA 的制备；外源DNA 片段与载体分子的重组；重组载体转化受体细胞； 阳性克隆的挑选；基因组文库的评价和鉴定。影响因素（1）载体的种类与质量;（2 ）高分子量的染色
26、体 DNA 的获得 ;（3）避免 DNA 的降解;（4）选用的限制性核酸内切酶对基因组 DNA 的切割频率及酶切反应条件。; （5）插入DNA 片段的大小;（6）插入 DNA 片段与载体的比例;（7 ）DNA 的总浓度;（8）连接的温度3、用于扩增基因的 PCR 方法有哪些？各有什么特点？（1）RT-PCR 法，是一种从细胞 mRNA 中高效扩增 cDNA 序列的方法，它将反转录与PCR 扩增技术相结合。 （2）反向 PCR，用于扩增已知目的基因序列侧翼的 DNA 片段，即根据已知的目的基因DNA 序列设计引物，以已知序列和未知序列的环化 DNA 分子为模板来扩增未知 DNA 序列。（3）锚定
27、 PCR，是一种根据已知目的基因的一小段序列信息来快速扩增已知序列上游或下游片段的技术。（4）连接介导的 PCR，在只知道 DNA 一端的序列的情况下，能够对未知的一端序列进行测序和对体内甲基化图谱或 DNA 印迹进行分析。 （5）盒式 PCR，盒式 PCR 可特异性地扩增 cDNA 或基因组 DNA 上的未知区域。（6）RACE，是一种通过反转录和 PCR 技术进行 cDNA 末端快速扩增，得到基因转录本的未知序列，从而获得 mRNA 完整序列的一种方法。4、什么是 cDNA 文库？它的基本构建流程是怎样的？以 mRNA 为模板，在体外经逆转录酶催化反转录成 cDNA，与适当载体连接后转化受
28、体菌并繁殖扩增，这样包含着细胞全部 mRNA 信息的 cDNA 克隆集合称为该组织细胞的cDNA 文库。基本构建流程: 一般来说，构建 cDNA 文库的基本步骤有五步：制备 mRNA；第一链 cDNA 合成；第二链 cDNA 的合成；双链 cDNA 的修饰及克隆；对构建的 cDNA 文库进行鉴定，测定文库的代表性以及重组 cDNA 片段的序列完整性。7、人工合成长片段基因的方法有哪些？长片段基因的合成，通常的策略是将需要合成的基因分成若干个相互重叠的片段，先利用化学合成法分别合成这些小片段，然后让这些片段退火配对，最后利用连接酶和聚合酶将这些片段连接成完整的基因序列。包括退火-连接法、多步退火
29、- 延伸-连接法和由内向外多步退火-延伸合成法。12、转化后对重组子进行筛选的方法有哪些？重组子的筛选方法多种多样，是由载体的类型、插入 DNA 片段大小和性质，以及受体细胞的遗传特性等的不同决定的。主要包括两类：一、依据载体的选择性标记对转化子进行初步筛选，包括抗药性筛选法、显色筛选法、营养缺陷型筛选法和噬菌斑筛选法。二、菌落原位杂交法14、对 DNA 进行定点突变的方法有哪些？DNA 定点突变的方法分为两大类。第一类是基于 PCR 的点突变，包括重叠延伸 PCR 法、大引物 PCR 法、特殊位置碱基的定点突变和扩增环状质粒全长的突变。第二类是不依赖于 PCR 的定点诱变方法，包括盒式诱变、
30、寡核苷酸介导的诱变和Kunkel 法第七章1. 什么是 RBS？RBS 在基因表达中有何作用？RBS，即核糖体结合位点，是指紧靠启动子下游的，从转录起始位点开始延伸几十个碱基长度的一段序列，翻译起始密码子 AUG 通常位于它的中心位置，是核糖体 RNA 识别与结合的位点。作用：SD 序列是翻译起始密码子（AUG）上游 5-13 个核苷酸处的一段富含嘌呤UAAGGAGGU 的全部或者其中的一部分序列，在翻译起始阶段与核糖体小亚基 16S rRNA的 3端相互作用，以正确定位起始密码子。2. 外源基因在原核生物中表达时，蛋白质的存在形式有哪些？各有什么优缺点？ 包涵体表达：优点：包涵体的形成有利于
31、防止宿主蛋白酶对表达蛋白的降解。缺点：包涵体形成后，表达蛋白不具有生物活性，因此必须溶解包涵体并对表达蛋白进行复性；另外，由于表达产物形成包涵体，负责水解起始密码子编码的甲硫氨酸的水解酶，不能对所有的表达蛋白质都起作用，这样就可能产生 N-末端带有甲硫氨酸的目的蛋白质的衍生物，而非生物体内的天然蛋白，这可能会对某些蛋白质的性质产生影响。 分泌型表达： 优点：简化了发酵后处理的纯化工艺；减少了外源蛋白在细胞内被蛋白酶降解的几率；通过对分泌表达的设计有利于形成正确的空间构象，获得有较好生物学活性或免疫原性的蛋白质。 融合型表达：优点：能以较高的效率进行，因为受体菌自身蛋白基因的 SD 序列和碱基组
32、成等有利于基因的表达。外源蛋白以融合蛋白的方式表达时易于分离分离纯化，可根据受体菌蛋白的结构和功能特点，利用受体菌蛋白的特异性抗体、配体或底物亲和层析等技术分离纯化融合蛋白，然后通过蛋白酶水解或化学法特异性裂解受体菌蛋白与外源蛋白之间的肽键，获得纯化的外源蛋白产物。3. 分离纯化基因工程菌的表达产物策略的制定要考虑哪些因素？表达系统的影响；表达产物性质的影响；初始物料、杂质等因素的影响；生产工艺、生产条件的影响。4. 分离纯化基因表达产物的过程一般包括哪些步骤？各有哪些细节需要注意？一般都包括对发酵液进行预处理、回收菌体、细胞破碎、离心分离、样品的浓缩与预处理、柱层析和电泳等步骤。 发酵液的预
33、处理：主要包括改变发酵液物理性状（如加热、调节 pH 值、絮凝等）以及改善固液分离特性（通过过滤等方法实现固液分离）两类方法，根据被分离物质的性质可选择某一种或者其中的几种方法相结合使用。 细胞分离：通过原核细胞培养获得的培养液，无论目标蛋白位于细胞内还是被分泌到细胞外的培养基中，首先都应该将细胞与培养液进行分离，一般通过离心沉降或者过滤的方式进行分离。 细胞破碎：对于在胞内表达的蛋白质，将细胞与液态相分离后，就要考虑将细胞破碎，以使目标蛋白质从胞内释放到提取液中，然后进行目的产物的纯化。 离心分离：高速离心的离心力一般在 10000g 的范围以内，主要用来去除未破碎的细胞和细胞壁碎片等。如果
34、基因表达产物是小分子可溶性蛋白，还可以进行超速离心（100000g 以上）以除去细胞膜碎片等杂质。 柱层析：根据蛋白质的不同用途，需要对表达的特异性蛋白质进行进一步的分离纯化。 亲和层析：是利用固定化配基与目的蛋白质之间特异的生物亲和力进行吸附，如抗原与抗体、受体与激素、酶与底物或抑制剂、操纵基因与阻遏蛋白、凝集素与糖类以及核酸与有关蛋白之间的结合。 电泳：蛋白质电泳通常采用聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE） 。PAGE 可分为 Native-PAGE 和 SDS-PAGE 两种，前者主要用于不能变性的表达蛋白的分离与纯化，后者则用于可通过变性的方法作进一步纯化的特异性表达蛋白。该电泳纯的样品可用
35、来进行氨基酸序列分析、免疫学分析和医学研究等。5. 重组质粒发生逃逸的原因有哪些？ 重组质粒在细胞分裂时不均匀分配，造成受体菌种所含的重组质粒拷贝数存在差异； 来自受体细胞的遗传影响； 重组质粒所携带的外源基因过度表达，抑制了受体细胞的正常生长，以致原来体系中数目极少的不含重组质粒的菌体经过若干代繁殖后在数量上占据优势； 重组质粒因种种原因被受体细胞分泌运输至胞外，这种情况多发生在细菌处于高温或含表面活性剂（如 SDS） 、某些药物 (如利福平）以及染料（如吖啶类）的环境中。第八章1 对作为表达目标蛋白宿主的酵母细胞有什么基本要求？答：对作为表达目标蛋白宿主的酵母细胞的基本要求是安全无毒，没有
36、致病性。遗传背景清楚，容易进行遗传操作。外源 DNA 容易导入宿主细胞，转化效率高。培养条件简单，容易进行高密度发酵。有较强的蛋白质分泌能力。有类似高等真核生物的蛋白质翻译后的修饰加工能力。2 什么叫穿梭载体？指出酵母穿梭表达载体 pYES2 每个元件的功能。答：穿梭表达载体是由来自酵母的部分核酸序列和细菌的部分核酸序列所组成，其原核部分主要包括可以在大肠杆菌中复制的起点序列(Ori)和特定的抗生素抗性基因序列，这两个部分主要是作为在大肠杆菌宿主时增殖和筛选组分。酵母部分包括酵母转化子的筛选组分，主要是与宿主互补的营养缺陷型基因序列(如：HIS4 基因序列)或特定的抗生素抗性基因序列(如：抗
37、Zeoein 的基因序列)，以及编码特定蛋白的基因启动子和终止子序列。pYES2 每个元件的功能: 2ori: 酵母细胞复制起点，URA3：酵母细胞尿嘧啶营养筛选标记；Amp：氨苄青霉素抗性筛选标记；PUC ori: 大肠杆菌复制起点； CYCTT：CYC 基因加尾信号；Pgal1 ：gal 基因启动子；f1 ori: f1 噬菌体复制起点。3 提高外源基因在酵母中的表达水平，考虑从哪些方面入手？答：为提高外源基因在酵母中的表达水平，可以考虑从以下方面入手：一、转录水平控制外源基因在酵母中的表达和基因的转录水平有密切的关系，筛选高效的启动子就显得十分重要，强启动子还可以表达多种基因。二、表达载
38、体的拷贝数和稳定性表达载体在细胞中的拷贝数对外源基因在酵母中的表达有明显的影响。酿酒酵母和其他一些酵母有多拷贝的内源质粒，以这类质粒为基础可以建成高拷贝质粒表达载体。三、其他因素还有一些因素应该考虑，其中包括采取提高翻译效率的措施，如：优化翻译起始区前后 mRNA 的二级结构，在外源基因中尽量选用酵母偏爱的密码子等；避免表达产物在细胞内的降解；选择或改造宿主，如：采用二倍体宿主、采用酿酒酵母以外的酵母菌作为宿主；优化工程菌发酵工艺，如：提高发酵密度、控制发酵阶段和发酵时间等等。四、酵母表达系统的新的应用方向近年来，酵母表达系统除了用来高效表达外源基因，获得基因工程产品外，还开辟了一些新的应用方
39、向。（1） 用于人类基因组研究。 （2） 用于分析蛋白质相互作用。 （3） 用于蛋白质、药物、抗体等的快速筛选。 第九章1 动物细胞表达系统中常用的表达载体有哪些？答案：根据载体进入宿主细胞的方式，可将表达载体分为病毒载体与质粒载体。其中病毒载体有逆转录病毒、慢病毒、腺病毒、腺相关病毒载体等。质粒载体又分为整合型和附加体型载体两类。整合型载体无复制能力，需整合于宿主细胞染色体内方能稳定存在；而附加体型载体则是在细胞内以染色体外可自我复制的附加体形式存在。4 什么是转基因动物？答案：转基因动物是指由于外源 DNA 导入（包括同一物种的 DNA）动物的基因组而产生了可以遗传的改变的动物。这些可以遗
40、传的改变包括：外源 DNA 片段至少整合到一条染色体的一个位点上；外源 DNA 的插入使基因组中任何一个基因的结构发生改变；外源 DNA 的插入使染色体发生重排；导入可以持久存在的遗传实体，例如，一条人工染色体或者可以自我复制并传递给子细胞的非染色体 DNA 元件。5 显微注射法制备转基因动物的主要过程是什么？答案：显微注射法建立转基因动物的过程至少涉及以下四个主要步骤： 构建外源基因表达载体并生产用于注射的 DNA 溶液； 准备供注射用的胚胎并制定显现原核的技术方案； 实施显微注射并将注射后的胚胎进行相应的技术处理，然后移植到受体母畜中；对出生的幼畜进行基因整合和表达的检测，把筛选出来的转基
41、因动物繁殖传代培育，进而建立转基因动物的家系和群体。6 外源基因整合到宿主染色体上时，其构型有什么特点？答案：在一个特定的胚胎或一个特定细胞克隆中，外源基因总是整合在染色体的单一位点，最多整合在少数几个位点上，且在每个整合位点，外源基因通常呈现多拷贝串状结构，采取头尾相连的排列方式。只有在稀有的情况下，外源基因的两个拷贝呈现头对头或尾对尾的连结方式，在这种情况下常发生末端缺失。第十章1.解释植物基因工程及其与常规育种相比的意义？植物遗传转化，又称转基因或植物基因工程，其研究的关键是利用重组 DNA、细胞组织培养或种质系统转化等技术，将外源基因导入植物细胞或组织，使之定向重组遗传物质，改良植物性
42、状，培育优质高产作物新品种(王关林等，1998)。自 1983 年首例转基因植株诞生，天然植物基因工程开始在人工控制下定向改良植物的遗传性状。与常规育种方法相比，它具有以下一些特点：不受亲缘关系的限制，可实现动物、植物和微生物间遗传物质的交流，从而充分利用自然界存在的各种遗传资源；有效地打破有利基因和不利基因的连锁，充分利用有用基因；加快育种进程，缩短育种年限。6. 讲述农杆菌介导转基因的主要步骤？合适外植体的选择及再生系统的建立抗生素筛选压的确定及农杆菌菌株的选择叶盘(或其他外植体) 预培养(15 天，非必须 ) 农杆菌侵染(数秒、分钟) 共培养(23 天) 推迟筛选或筛选(培养基中加入抑菌
43、抗生素和选择抗生素) 抗性芽的获得选择抗生素(如 Km)中生根转基因植株的获得分子生物学检测7.讲述基因枪转化的原理和主要步骤？基因枪(particle gun)介导转化法又称微弹轰击法(microprojectile bombardment, particlebombardment, biolistic)，是指利用火药爆炸、高压气体和高压放电作为驱动力(这一加速设备称为基因枪)，将载有目的基因的金属颗粒加速，高速射入植物组织和细胞中，然后通过细胞和组织培养技术，再生出新的植株。微粒上的外源 DNA 进人细胞后，整合到植物染色体上，得到表达，从而实现基因的转化。基因枪转化的基本步骤如下： 受体细胞或组织的准备和预处理； DNA 微弹的制备； 受体材料的轰击； 轰击后外植体的培养和筛选。
