1、第一章 气相色谱/质谱基础,主要内容：,MS和GC检测器的对比 MS的基本理论,5973 MSD 和 6890 GC,5973MSD 和 GC6850,5975 MSD 和 6890 GC,5975在外观上与5973的不同,INTERFACE,GC,MSD,10-5 Torr,2 mL/min,760 Torr,0.5 - 15 mL/min,传输线,色谱柱,流量 控制器,稳压器,空气,氢气,载气,分子筛,脱水管,固定,进样口,检测器,电子部件,PC,限流器,典型的气相色谱,pptrillion,ppb,ppm,ppthousand,percent,1 ppm =,1 ng,1 L,m,1 m
2、g,Liter,1 L,m,Liter,=,=,TCD,FID,ECD,AED,PID,NPD (N),NPD (P),MSD,(SIM),(SCAN),FPD (S),IRD,ELCD,ELCD,(S or N),(X),10-15,fg,10-12,pg,10-9,ng,10-6,10-3,mg,GC检测器比较,保留时间 用于确定样品组分，即进行样品定性分析。 峰面积 用于测定样品的含量，即定量分析。,典型色谱图,柱长 (米),I.D. (mm),.5-10,2-4,5-100,.530,5-100,.1-.25,填充柱,530系列柱,细孔径柱,填充柱,开管柱（毛细管柱）,壁涂,开管柱,色
3、谱柱类型,载气和检测器支持气,氧气捕集器微量的氧气会破坏色谱柱，特别是对毛细管柱。 氧气也会降低ECD检测器的功能。 氧气捕集器 应连接在分子筛干燥器和仪器安装设备的进样口之间。,分子筛干燥器,须使用GC 专用铜管或不锈钢管。塑料管会渗透O2和其它污染物。还可能会释放其它可被检测到的干扰物。管子使用前先用溶剂冲洗，载气吹干。根据工厂的推荐，每用完3瓶气，应更换过滤器，以防止发生气体的污染。每隔一定时间，应对所有外加接头进检漏（大约每隔 4-6个月。,管路和净化器,载气必须通过控制形成恒定的压力和恒定的流量。上下游控制器压差保持1公斤以上。,减压阀和流量控制器,Agilent 6890前视图,A
4、gilent 6890侧后视图,即时功能键功能键快捷键信息键数字键多功能键方法存贮与自动 运行,Agilent 6890键盘介绍,质谱基础,质谱常用术语,丰度 质荷比(m/z) 基峰 分子离子 碎片离子 母离子 子离子 偶电子离子 奇电子离子,常见元素同位素表,M/Z,Abundance,82,166,182,303,50,100,150,200,250,1000000,Scan 33 (5.289 min): ALKDEMO.D,M/Z,Abundance,82,166,182,303,50,100,150,200,250,1000000,Scan 34 (5.297 min): ALKDE
5、MO.D,总离子色谱,气质联用数据是三维的,仪器内部连接示意图,质谱仪器分类,磁质谱 射频质谱（四极质谱，离子阱质谱） 飞行时间质谱 傅立叶变换质谱,飞行时间质谱,离子阱质谱,傅立叶变换质谱,磁质谱,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,+,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,-,四级杆,检测器离子聚焦,高能打拿极,电子倍增器,电子,正离子,信号输出,高能打拿极和电子倍增器,(0 to -3000 V)
6、,+,Incoming Ion,X-Ray Lens,(0 to 218 V),Signal Out,EM Voltage,电子倍增器,电压有使用上限（3000伏） 电压的提高，可以提高检测器的信号,电子倍增器的寿命曲线,提供足够的平均自由程 提供无碰撞的离子轨道 减少离子-分子反应 减少背景干扰 延长灯丝寿命 消除放电 增加灵敏度,为什么MS需要真空,电离技术简介,REPELLER,电子电离（EI）,化学电离（CI）,化学式 观测M/Z电荷转移 X+ + M X + M+ M 电子捕获 M + e- (热) M- M 质子转移 CH5+ + M CH4 + MH+ M+1 CH3+ + M
7、CH4 + M-H+ M-1 OH- + M H2O + M-H- M-1 加成 C2H5+ + M MC2H5+ M+29,PCI,Spectra,NCI,Spectra,第二章 开机关机与工作站简介,质谱的本地控制面板,诊断 放空 / 抽真空 调谐 运行 / 停止,开机与关机,真空系统,加热区,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,
8、.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,.,出口 (到机械泵),转子,吸油阱,进油口,油液面,排油口,定子,泵腔,油液面观察窗,10-1 - 10-2 torr,10-5 - 10-6 torr,真空泵,到前级泵,轴转速可达 60,000 每分钟,旋转叶片,固定叶片,Lubricating Wick,分子涡轮泵,开机前的准备: 放气阀须关好 MSD连接到接地的电源上 MSD的接口伸入柱温箱 老化好的毛细柱接好两端 99.999%的氦载气接到GC上,推荐使用净化器.,597X MSD开机顺序,打开计算机 打开气相色谱及597X质谱电源。待气相色谱完成自检， 597X质谱真空泵工作正常（如果机
9、械泵声音不正常，检查侧门和放空阀是否关闭） 进入化学工作站 从view菜单选tune/vacuum control 从vacuum 菜单选pump down,开机图标,系统放气,关机,系统放气（续）,5975 的位置,5975开盖装置,放空阀和调谐液的位置不同,工作站介绍,注意：所有窗口之间的切换均通过 view,进入工作站,用于编辑运行方法、序列、设定工作站控制级别等,Qualify下拉菜单包括仪器性能检验（灵敏度测试、调谐评价等）,调谐与真空控制窗口,Data Analysis 数据分析窗口,用于数据后处理（积分、本底扣除、谱库检索、定量分析等）,Parametric Retrival 参
10、数检索窗口,用于反向检索、结构库编辑等,Review Peak Purity 峰纯度检测窗口,用于判断色谱峰的纯度,化学工作站文件夹,第三章,调 谐,本节内容,MS调谐的基本原理 化学工作站中的不同调谐,调谐做什么?,设定离子源部件的电压,以得到良好的灵敏度 设定 amu gain 和 offset 以得到正确峰宽 设定 mass gain 和 mass offset以保证正确的质量分配 设定 EM 电压,稳定 可挥发 碎片涵盖质量范围宽 仅有C-13 和 N-15同位素 无质量缺陷,全氟三丁胺(PFTBA),调谐标样,AMU gain, offset,高能打拿极,电子倍增器,入口透镜,推斥极
11、,离子化区域,样品入口,灯丝,灯丝,拉出极,离子聚焦,Mass axis gain, offset,补偿,调谐参数 EI,离子源结构,电离室：永久磁铁、灯丝、靶透镜：推斥极、拉出极、离子聚焦、入口透镜,Parameter Ramps,四极杆质谱,0,+,-,RF 振幅,DC 振幅,极性,RF 频率,两对电极上的复合电压大小相等，直流电压极性相反,过滤高质量,-,0,+,负棒电位,负棒,M+,*,M+,*,Positive Rod,Positive Rod,正棒电位,过滤低质量,0,+,-,RF 电压,扫描线,502,219,69,DC 电压,斜率 = AMU GAIN,Mathieu Stab
12、ility Diagram,AMU OFFSET,AMU Gain 及其偏移,AMU GAIN,AMU OFFSET,AMU Gain 渐增会:,峰宽,受影响大的是,影响高质量和低质量区,AMU Offset 渐增会:,减小,AMU Gain 及其偏移如何 影响峰宽?,予期质量,观测质量,Mass Axis Gain,100 200 300 400 500,500400300200100,69,219,502,质量轴校正,Mass Axis offset,Methods of Tuning an MSD,化学工作站中提供的调谐方法,为什么做自动调谐?,1. 诊断 2. 编写系统性能变化表 3.
13、 提高灵敏度,自动调谐流程图,例如:,* This is known as AutoTune on the HP5973 MSD,上述丰度值不是精确值，只做演示用,(Default Value),mV,amu,( ),69 502,m/z,Ent.,Lens,Offset,入口透镜电压,ENTR,(Set to Maximize m/z 69),m/z,69 502,Ent.,Lens,Offset,Entrance Lens Voltage,ENTR,mV,(amu),自动调谐与标准谱图调谐比较,相近的峰宽,平滑对称的峰形,适当的EM电压,合适的丰度值,Low water and air,正
14、确的质量分配,典型的相对丰度,自动调谐报告,合适的同位素比例,质量数的峰宽,平滑对称的峰,合适的电子倍增器电压,适当的丰度值,低水峰及空气峰,正确的质量分配,合适的相对丰度,合适的同位素比例,标准谱图调谐报告,Amu gain 和 offset, EM 电压 及质量 轴校正 调整 所有其它源参数不变 调谐69，219，502三个质量数,快速调谐,目标调谐,BFB调谐的评价,DFTPP（十氟三苯磷）调谐评价基峰 m/z = 198.00 可替换基峰 m/z = 442Mass Rel. to m/z % Low %High Alt. Base 51.00 198.00 30.0 80.0 N 6
15、8.00 69.00 0.0 2.0 N 69.00 198.00 0.0 100.0 N 70.00 198.00 0.0 2.0 N 127.00 198.00 25.0 75.0 N 197.00 198.00 0.0 1.0 N 199.00 198.00 5.0 9.0 N 275.00 198.00 10.0 30.0 N 365.00 198.00 0.75 100.0 N 441.00 443.00 0.01 100.0 N 442.00 198.00 40.0 110.0 Y 443.00 442.00 15.0 24.0 N,有权使用MS参数 易于建立用户调谐文件 诊断,手
16、动调谐,电离室参数,四极杆参数,离子源参数,电子倍增器电压,轮廓图,连续扫描,离子丰度随离子源参数变化曲线,影响质量轴,影响峰宽(分辨与灵敏度),影响灵敏度(传输效率),通过手动调谐检漏,Vacuum 菜单,Execute菜单,Calibrate菜单,Parameters 菜单,Edit tune and display parameters,选择参数,把当前修改纳入调谐参数,Status菜单,第四章 色谱进样技术,分流/不分流毛细管柱进样口分解图,插入件组件衬管绝缘层垫圈变径接头保温层垫圈柱螺母,进样垫固定螺母进样垫O形环分流出口管线分流/不分流 进样口实体固定螺母分流平板保温套,衬管的作用
17、,保护色谱柱：不挥发组分滞留在衬管内。但当污染物积攒到一定量时，会吸附样品造成峰拖尾/分裂或出现鬼峰 衬管内少量经硅烷化处理的石英玻璃毛可防止注射器针尖的歧视（即针尖内的溶剂和易挥发组分首先汽化）；加速样品汽化；避免固体物质进入并堵塞色谱柱等 硅烷化处理可以选用DMDCS（二甲基二氯硅胺）如果使用ECD检测器或CI源，一定要选择不含卤素的硅烷化试剂。如：HMDS、BSTFA、BSA、TSIM等。如果衬管太脏，可以用盐酸或硝酸浸泡8小时，清洗烘干后用硅烷化试剂配制成10甲苯溶液，浸泡8小时，再依次用甲苯、甲醇清洗。注意：高温下工作3，硅烷化的有效期只有几天。因此衬管需要及时清洗或更换。,溶剂膨胀
18、方程,溶剂蒸汽体积 = 22,400 x A x B x C x IA = 溶剂密度/溶剂分子量B = 15/(15 + 柱头压 in psi)C = (进样口温度C + 273)/273I = 液体进样体积 L 例如 1 L 水于 250 C 15 psi 柱头压产生 22,400 x 1/18 x 15/30 x 523/273 x 1 = 1,192 L 蒸汽,18740 - 80220,19251 - 60540,18740 - 60840,900 uL,250 uL,1000 uL,1000 uL,工厂去活处理,杀虫剂衬管,未去活,普通型,250 uL,直接进样,不分流,分流/不分流
19、,不分流,分流,5183-4711,5181 - 8818,直接连接衬管可以减少进样时样品损失,底部,分流平板的维护,在溶剂中超声处理烘干用非氯化剂去活化 HMDS BSTFA BSA TSIM用溶剂清洗 先惰性洗涤 - 甲苯 再用醇类清洗- 甲醇烘干,分流过滤装置(Cartridge Assembly),Cartridge Split Vent Trap Assembly P/N G1544-60610,分流进样需注意的问题,尽量减少分流歧视：分流比越大，越有可能造成分流歧视 保证样品快速汽化（适当添加经硅烷化处理的玻璃毛） 分流进样时，柱的初始温度尽可能高一些 柱安装时注意柱与衬管同轴,分
20、流进样,总流量 50 mL/min,隔垫吹扫流量 3 mL/min,分流出口流量 46 mL/min,柱流量 1 mL/min,Internal Detail,衬管,密封圈,柱子,槽,进 样,过 载,Vent Flow,3 mL/min,Total Flow,50 mL/min,1 mL/min,Split Vent Flow,46 mL/min,(Septum) Purge,Vent Flow,3 mL/min,Total Flow,50 mL/min,节省载气,节省载气功能会在样品进入色谱柱后，减少分流出口的载气流量 以节约载气。柱前压和柱流速仍保持不变，只有分流出口的流量减少。可用于分流
21、和不分流方式。节省载气启动的时间应选在样品进入色谱柱后。,分流出口 流量 (mL/min),200 - 175 - 150 - 100 -75 -50 -25 -,-2 -1 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10,预运行,时间,节省载气 流量,进样,节省载气启动时间设在 2.5 分钟。,运行结束,节省载气流量,正常 流量,不分流进样,柱初始温度尽可能低一些，最好低于溶剂的沸点10-20度。溶剂要与柱子固定相匹配。 衬管尺寸尽量小（0.25-1ml),使样品在衬管内尽量少稀释。最好使用直通式衬管,对于比较脏的样品,要加经硅烷化处理的玻璃毛并注意经常更换 根据样品(溶剂沸点,待测组分沸点,
22、浓度等)优化开启分流阀的时间,一般在30-80秒之间,多用0.75分钟，可以保证95%以上的样品进入柱子.,溶剂效应,Solvent BP Temp Dichloromethane 40 10-30 Chloroform 61 25-50 Carbon Disulfide 46 10-35 Diethyl Ether 35 10-25 Pentane 36 10-25 Hexane 69 40-60 Iso-Octane 99 70-90,溶剂与固定相须谐调.,不分流进样,总流量 4 mL/min,隔垫吹扫 3 mL/min,分流出口流量 0 mL/min,柱流量 1 mL/min,冷柱上进样
23、,冷柱上进样是将样品直接注入处于室温或更低温度下的色谱柱内，再逐步升高温度使样品各组分依次汽化。 优点 消除进样口对样品的歧视效应。 避免热分解 容易利用溶剂效应 准确度与精密度均高于分流/不分流进样 缺点 进样体积小 操作复杂，对初始温度、溶剂种类、进样速度等要求较严格 易污染毛细管适用于热不稳定化合物及痕量分析,冷柱头进样,注射器针,柱子,固定相,样品,其它进样口,程序升温汽化进样口使用PTV进样口大体积进样 (LVI)，用于较晚流出组分或不净样品的痕量分析在冷的进样口进行大体积进样，然后进样口采用温度 阶程进样升温。进样口使用“无隔垫顶盖”挥发进样口从一个外加设备如顶空，吹扫捕集或毒性气
24、体进样器引入气体样品。,其它进样口（续）,程序升温汽化进样（PTV）,程序升温汽化进样（PTV）是将液体或气体样品注射于低温的进样口衬管内，再按程序升高进样口的温度。 优点： 无注射器头的样品歧视 不需要特殊注射器 抑制了分流歧视 可除去溶剂和低沸点组分，实现样品浓缩 可低温捕集气体样品，便于同阀进样或顶空进样技术结合 有多种操作模式，分流、不分流及溶剂消除模式 重线性接近于冷柱头进样,CO2 或液氮冷却无隔垫，不会造成隔垫污染无隔垫吹扫，不损失样品多次进样后无泄漏最优化的端口体积，适合于毛细管柱,HP PTV with Septumless Head Assembly,Septumless
25、Sampling Head,GC,Detector,Step 1:,注样,Step 2:,予柱升温，使溶剂与样品分离,Step 4:,目标化合物结束残留物从分流出口流出,Step 3:,溶剂分离结束，目标化合物进入柱子,.,溶剂,被分析物,基质,S,A,M,分流,不分流,高分流流量,Pre-column,恒温,Pre-column,程序升温,Pre-column,程序升温烘烤,GC Column,GC,Detector,GC Column,GC,Detector,GC Column,GC,Detector,Split / Splitless Configuration,APEX ProSep
26、Precolumn Separation Inlet,手动进样应注意的问题,注射速度快 取样准确，重现 避免样品间互相干扰 选用合适的注射器，用10ul进样器进样量不要小于1ul。 减少注射针尖歧视：每次进样速度尽量一致，玻璃毛放在衬管中间偏下位置，即针尖到达的位置。 取样后可用滤纸拭去针尖外面的残留样品，但要注意不要吸去针内样品,第五章 色谱柱,气液色谱 (GLC),柱分离指标,分析物,时间,进样,不保留组分,t,m,t,R,t,R,我们希望知道组分保留在固定相中的真实时间。,将 n与柱长相比：,每块理论塔板高度 (HETP) =,因此，柱效越高， “N”值越大， “HETP”值越小,计算柱
27、效,R,t ,= 调整保留时间,n = 有效理论塔板数 Wh=半峰宽,测量线速度和流量,柱效受载气线速度和流量影响。曲线的最低点代表最小板高 HETP (或最大每米理论塔板数) 也就是最好的柱效。 毛细管柱中不存在“A”项。,柱效与载气线速度,HETP与线速度形成的曲线叫做范德姆特曲线。 曲线最低点的线速度值即为可获得最好柱效的最佳线速度值。,使用内径更小的柱子。GC/MS要用o.25mm以下的柱子。 减小固定相百分组成或固定相液膜厚度。 减小进样量。 选用更长的柱子。 使用程序升温改善后流出组分峰形。, 好的进样技术可以保障高柱效。进样应该紧凑快速，以免峰展宽。,如何提高柱效,分离度是柱将两
28、个相邻峰分开能力的反映。,通过两个欲分离相邻峰的分开程度来测算分离度。一般我们选择两个最难分开的 峰，如果它们被成功分开，那么其它的也就解决了。,1.18 ( RT - RT ),2,1,(W + W ),1,2,R =,R = 1.5 认为可以实现基线分离W1=化合物1的半峰宽W2=化合物2的半峰宽,分离度,1. 欲分离样品 2. 柱内径 3. 固定相 4. 柱长 5. 膜厚或填充剂 %量 A. 柱容量 B. 保留能力 C. 惰性 D. 柱效 E. 流失,柱选择方面的考虑,先试手边的柱子 向同事咨询 查询已发表的相似应用 如果难以确定，先用一个非极性柱，如 HP1或 HP5这只是一些好的开端
29、，而操作者必须自行优化条件。,柱选择,恒温,程序升温,在整个分析过程中，色谱炉温保持恒定。 用初始时间设定运行结束时间。 升温速率设为“0”。 后流出的峰展宽。,当组分有较宽的沸点范围 (100C)时使用。减少分析时间并使峰变窄。增加柱流失，引起基线漂移。可设多阶程序升温。HP6890 可设“快速变化速率”至 120C/min。,柱温操作,色谱柱类型,载气条件,色谱炉条件,进样参数,检测器参数,样品信息,应用举例说明：,固定相商品名称 固定相化学名称 可替代的固定相 溶剂 最低温度和最高温度 应用举例,消耗品手册提供的信息:,第六章 样品采集技术,讨论主题:SCAN采集方式的适用性 各种数据采
30、集参数对数据的影响,Scan 采集原理,总离子色谱,质量峰检测,影响扫描时间的因素: 平均每 0.1 amu 增加 数据点的数目(sampling rate)扫描质量范围 离子检测的真实数目 (scan threshold)每个色谱峰通过5-10次扫描可以很好地 定性! 每个色谱峰通过10-20次扫描可以很好地 定量!,MASS,TIME,程序时间,回扫时间,扫描时间,扫描循环时间,数字式扫描过程,用五个邻近的数据点平滑 确定中心质量 (质量峰最大).,质量中心的水平应超过质量阈值 数据文件同时储存质量和丰度,阈 值,阈值过高,82,182,M/Z,相对强度,M/Z,相对强度,82,303,1
31、82,阈值设置适当,阈值对质谱图质量的影响,数据采集设置,method 是为仪器和计算机设定的采集和处理数据的一个完整指示,数据采集,采集方式 调谐文件 MS 质谱应用参数 GC 质谱应用参数进样口参数,n 表示仪器编号,什么是方法?,仪器控制,所有的仪器控制界面都可以从这一界面看到 当前的方法和序列可以在标题栏看到,数据分析界面,用快照功能处理正在采集的数据 用于定性和定量分析,选择方法的某部分进行编辑,方法/编辑完整方法,编辑方法,填入关于方法的说明 选择acquisitions 和 analysis,方法信息,进样方式,选择样品来源 (GC or other) 选择进样方式 (manua
32、l, ALS, or valve) 如果是手动 manual, 选择进样口的位置 选择 “Use MS”如果用质谱采集数据；如果用GC检测器就不选,自动进样器,进样体积及洗针次数 按 Configure . . . 设定进样针体积 按 More . . . 设定取样位置等,黏度：最后一次泵起至进样的时间有效值0-7,样品深度：0.00表示针尖与标准瓶底距离3.6mm有效值 -230.0,进样前注射器在进样口停留时间,有效值0.00-1.00,进样后注射器在进样口停留时间,有效值0.00-1.00,进针速度,注射器控制（More),阀进样,必须先配置阀(如果安装了) 用RunTime 对话框，控
33、制阀的运行事件,分流模式,选择 “Split“ 输入所有的设置,不分流模式,选择 “Splitless“ 输入所以的设置,脉冲不分流模式,选择 “Pulsed Splitless“ 输入所有设置,脉冲分流模式,选择 “Pulsed Split“ 输入所有设置,流量模式,色谱柱流量和压力都可以随时间程序变化,色谱柱,设定流量模式，连接方式等参数,安装柱子,输入柱子编号，点击OK,在目录中添加新柱子,从目录中选择柱子 在目录中增加柱子 从目录中删除柱子,从目录中选择柱子 在目录中增加柱子 从目录中删除柱子,更换柱子 (添加新柱子于目录中),使用其他厂家柱子,柱安装,选择欲安装的柱子 从目录中删除柱
34、子,校正柱长,步骤1首先用1微升空气进样，记录其保留时间。点击 change/calibrate,步骤2,输入空气峰的真实保留时间,步骤3,步骤4,步骤5,输入炉温设定值,炉温,输入 GC 检测器温度设定值 (如果有GC检测器),检测器,保存 GC 检测器数据 (如果有GC检测器) 监控温度 监视流量或压力,信号,输入辅助部件（MS接口）温度 输入辅助部件压力,辅助部件,运行期间可自动运行25个时间表,运行时间表,为方法定义压力单位 锁住 HP6890 键盘 GC 检测器柱补偿 (如果有GC检测器),选项,从仪器控制面板监视信号时观察GC检测器保留时间（ 如果有GC检测器）,GC 实时绘图,选
35、择用于MS采集的调谐文件,MS 调谐文件,更改EM电压,溶剂延迟,采集方式,编辑采集参数,离子源与四极杆温度,编辑时间事件表,MS采集参数（SCAN）,MS采集参数（续）,扫描范围,阈值与采样点数,MS采集参数（时间和扫描范围）,MS 扫描参数 （阈值和取样率）,为每一组定义阈值和取样率,MS 扫描参数（绘图）,定义要绘图的量和范围 激活由 MS SIM/Scan 参数面板的“实时绘图”控制的区域,定时事件,检测器 on/off 时间程序 倍增电压随时间变化程序 阀时间程序,用于监视 MS 源压力, 阀 和 MS 温度范围.,MS 监控,适用于远距离控制,监控警告器,采集数据,选择 Metho
36、d/Run,点击样品瓶图标,选择 Method/Run,样品瓶标识,采集数据,样品总量,稀释倍数,讨论主题: 选择离子检测（SIM）与扫描的区别 SIM 采集参数如何影响数据 SIM 方式如何进行数据采集,选择离子检测的原则,选择离子检测,SIM 数据采集,Dwell,time,SIM,mass 1,SIM,mass 2,SIM 循环时间,四极杆,电压,(amu),TIME,SIM,mass 3,空中时间,扫描数据采集,扫描时间,扫描循环时间,空中时间,四极杆,电压,(amu),TIME,SIM 与SCAN比较,选择: 离子/组数目 每个离子驻留时间 以便获得良好的数据采集所需的循环/峰数目
37、目标: 每个峰通过 15-25 次循环 每个离子驻留时间相同 运用时间规划 (SIM Groups) 使 采集/循环离子数目最少,设置 SIM 采集,该 SIM质谱图是 9-羧基 THC的离子以 0.1 amu 增加量. 选择最大丰度的质量数做SIM采集,动态质量校正,在左图的三种可能性中选择最大丰度质量, 不会导致 来源于调谐与调谐之间不正确比率的错误负峰,选择精确质量和整数质量对照,如果自动调谐质量轴为 -0.1amu 离子比率将如何？ 左图为精确质量，右图为整数质量 二者化合物相同但测定结果不同,9-羧基 THC TMS 衍生物峰比率,可以监视 30 离子/组, 50 组/采集 使用最小
38、数目的 离子/组 以获得最大灵敏度和精度 选择最有特征的离子 高质量 丰度 化合物特有的 可以选择化合物的特征离子以达到分类目的,选择 SIM 离子,RF 电压,低或高质量分辨,质谱 SIM 方式,选择 SIM 采集方式 编辑 SIM 参数,SIM 方式（参数）,添加或删除组 添加，修改或删除每组标记,输入新方法名称,保存方法,SIM/Scan同步采集,一次进样，同时采集SIM和Scan的数据: SIM 数据用于目标化合物的定量 Scan 数据用于未知化合物的谱库检索 SIM and Scan 的数据保存在相同的数据文件夹中（data.ms和datasim.ms) 可以使用 AutoSIM 的
39、指令自动将全扫描的方法转换为SIM的方法 SIM 组和离子会被自动选择 不需要手动建立,第七章 定性分析,本章将学到: 数据分析主菜单的特征 数据浏览工具 熟练处理数据的性能 积分参数 利用反检索 (PBM) 进行定性分析 自动谱库检索及报告 参数恢复 如何自建库,定性分析,数据分析窗口,调用数据 放大缩小图 获得质谱图 背景扣除 峰纯度 谱库检索,导航键,快速浏览文件夹 可关闭，提供给多的界面空间,数据分析中鼠标的功能及按相对丰度显示质谱图,数据分析界面的鼠标右键功能,可以通过点击工具栏快捷键，切换是否启动右键功能 右键在导航界面，总离子流图和质谱图的内容不同,本底扣除,用于设置化学工作站
40、积分参数 用于保存当前化学工作站 积分参数 用于加载，修复，保存化学工作站 积分 参数,化学工作站积分参数,积分事件表：面积加和 开启/关闭,积分事件表： 基线划至所有峰谷开启/关闭,积分事件表：基线后置、维持开启/关闭,Baseline Back & Baseline hold,基线后置Baseline Back,基线维持Baseline hold,积分事件表：积分器与负峰检测开启/关闭,积分器 关闭/开启,负峰检测开启/关闭,积分事件表： 切线撇去开启/关闭,用于设置 RTE 积分参数 用于保存当前 RTE 积分参数 用于加载，修复，保存 RTE积分参数,RTE 积分参数,峰起点与终点丰度
41、差与峰高相比,基线位置。分离相邻两峰的最少扫描次数,基线落下或切线,峰位置（顶点或峰重心,最小峰面积,最多峰数目,RTE积分文件扩展名为 .P,提取离子色谱,SIM/Scan 同步数据,可以选择要调用的数据 通常都是同时显示。如图所示,Scan,SIM,不纯,纯,峰纯度,PBM 库检索运用所包含的压缩谱图,压缩谱图: 当 U+A 值 最大时， 质谱图包含 15-26 质量 ( “最重要的峰“).,定义,由检索目录决定.0 - 100% 分组唯一性和丰度的函数,唯一性:丰度:意义:,PBM 库检索的概念,选择所要检索的谱库,库检索,选择谱库,谱库检索,选择 “Spectrum/Select Li
42、brary.” 点击 “OK“,设定检索策略,谱库检索,选择 “Spectrum/Edit Strategy.“ 设定适合的参数,PBM检索结果,PBM检索结果文本文件,检索统计表,将检索报告作为方法的一部分,自动谱库检索,选择 “Method/Edit Method.“ 选择 “LibSearch Report“ 设定期望的报告风格及打印目的地,自动谱库检索摘要报告,参数检索,参数反相检索结果,选用分子结构数据库步骤,在molstruc处双击左键,在molstruc.sdb处双击左键,点击OK,建立自建库,添加和编辑信息 将用户当前数据文件中的一张质谱图放入自建库,建立用户自己的结构库,建立
43、用户自己的结构库（续）,建立用户自己的结构库（续）,建立用户自己的结构库（续）,自动化工具: DOSCAN,信噪比测定,信噪比测定(续),NIST检索,标准谱,局部放大,命中者,丰度表,未知谱,比较,标准谱,化合物名字检索,正向（标准库的峰与未知谱对照）,反向（未知谱的峰与标准库对照）,纯度,M：主库；R：重建库；U：自建库,从tools菜单下选择Mass Spectrum Interpreter进入谱图解析,谱图解析,以最大峰高百分比设定一阈值，高于该值的峰被解析,同位素计算,通过化合物名称、CAS号、分子式等信息检索,AMDIS,进入路径：data analysis/spectrum/AMDIS,
