1、,传统的DNA测序方法,演讲人:马怡 2016.3.31,传统的DNA测序法,1,Sanger双脱氧链终止法,2,Maxam-Gilbert化学降解法测序,Sanger双脱氧链终止法,英国生物化学家Frederick Sanger,于2013年11月19日逝世,享年95岁。 他是唯一一个两度斩获诺贝尔化学奖的科学家,也是仅有三位得到两次科学类诺贝尔奖的人之一。 他的第一个诺奖是1958年,开发了蛋白质化学结构的测量方法、并测定了胰岛素的氨基酸序列。第二个诺奖是1980年,发明了测定DNA序列的双脱氧链终止法。人类基因组计划用到了这一方法,因此他常被称为基因组学之父。不知道他终止在哪一个碱基上。
2、 科学作者 Ed Yong 用DNA序列写了一段悼词: “CGCATTCCGTTTCGCGAAGATAGCGCGAACGGCGAACGC”,Sanger双脱氧链终止法,Sanger法是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的碱基处终止,并且在每个碱基后面进行荧光标记,产生以A、T、C、G结束的四组不同长度的一系列核苷酸,然后在尿素变性的PAGE胶上电泳进行检测,从而获得可见的DNA碱基序列。,1,Maxam-Gilbert化学法测序,基本原理是,首先对待测DNA末端进行放射性标记,再通过4相互独立的化学反应分别得到部分降解产物,其中每一组反应特异性地针对某一种或某一类碱基进行切割。因此
3、,产生4组不同长度的放射性标记的DNA片段,每组中的每个片段都有放射性标记的共同起点,但长度取决于该组反应针对的碱基在原样品DNA分子上的位置。此后各组反应物通过聚丙烯酰胺凝胶电泳进行分离,通过放射自显影检测末端标记的分子,并直接读取待测DNA片段的核苷酸序列。,1,待测DNA的末端标记,化学降解法测序首先要制备单侧末端标记的待测DNA片段。,碱基特异的化学切割反应,肼(hydrazine):C和C+T 二硫酸甲酯:G,测序图谱的识读,如果在G+A泳道中出现一条带,就看G泳道中是否有相同大小的带,如果有即为G碱基,如果没有则为A碱基;同样,在C+T泳道中出现的条带,就检查C泳道中有无同样大小的条带,如果有即为C,无则为T。,THANKS!,