1、 冯 露南开 大 学学位 论文 使用 授 权 书非 公 开 学位 论文 ， 保 密期 限内 不向外 提 交和提 供 服务 ， 解 密后 提 交和服务 同公 开 论文 。论文 电子版 提 交至校 图书馆 网 站： ： 甴 。本 人 承 诺 ：本 人 的学位 论文 是 在 南开 大 学学习 期 间创 作完 成的作品， 并 已 通过论文 答 辩 ；提 交的学位 论文 电 子 版 与纸 质 本 论文 的内 容 一致， 如因不同造 成不良后 果由 本 人 自负 。本 人 同意遵 守 上 述 规 定 。本 授 权 书签 署 一式 两 份 ， 由 研 究 生 院 和图书馆 留存 。三 株 单核 细 胞 增
2、生 李 斯 特 菌 的比 较 基 因组 学研 究李 芳 芳 博 士 口 同等 学力 硕士 口畁 甧 是 否批 准 为非 公 开 论文本 人 郑 重 声 明：所 呈 交的学位 论文 ， 是 本 人 在 导 师 指导 下 进 行 研 究 工作所 取得 的研 究 成果。除 文 中已 经 注 明引 用 的内 容 外 ， 本 学位 论文 的研 究 成果不包含任何 他人 创 作的、 已 公 开 发表 或 者没有公 开 发表 的作品的内 容 。对本 论文 所涉 及 的研 究 工作做 出 贡 献 的其 他个 人 和集 体 ， 均已 在 文 中以 明确 方 式 标 明。本 学位 论文原创 性 声 明的法律 责任
3、由 本 人 承 担。学位 论文 作者签 名：奎 羞 差非 公 开 学位 论文 标 注 说 明申 请 密级保 密期 限审 批 表 编 号 月 月 月毒 力 相 关 的基 因， 包括虻 亩 J 坝 胝掣 剿 拗 飨 赴 喙氐 腶 基 因的拷 贝关 键词： 单增 李 斯 特 菌 、 进 化种 系 、 比 较 基 因组 琲 琣 日 舌 第 二 节研 究 目 标 、 研 究 内 容 和课 题 创 新性 第 二 章 材 料 与方 法 。第 二 节实 验方 法 双 末 端 测 序 拼 接 肎 釵 预 测 寻找 毒 力 因子 一同源聚类分 析 结果 李 斯 特 菌 属 分 类及 生 物 学特 性图 基 于 细
4、 菌 进 入 真核 细 胞 然 后 整 合 迸 薄 膜 液 泡 的过程 是 由 两 个 蛋 白 和诱发的。蛭 坏惚 嗦 胝饬 礁 鲇胂 赴 肭 趾 妥 橹 蛐 栽硕 喙氐 牡鞍姿 ， 和两 个 磷 脂 酶 ， 磷 脂 酶参 与细 胞 膜 的破碎 和细 菌 进 入 细 胞 质 的过程 。有趣 的是 ， 单增 李 斯 特 菌 显 示出程 是 通过两 个 分 泌 蛋 白 介导 的， 质 膜 裂解 ， 这两 个 蛋 白 能够 使细 菌 从 一 个 细 胞 去 侵入 另 一 个 细 胞 ， 从 而 实 现 细龌 蛭 挥 娜 旧 逦 坏闵 蟗。一心一以 礥序 为基 础的数据 。年 后 ， 这种 方 法最
5、初 是 由 在 年 ， 第 一次和方 法也 发现 龌 蜃 榉 肿 镚 序 列 数据 分 析 相 结合 的方 式 ， 进 一步 支 持 了 的存 在 ， 并 且 表 明， 这个的方 法， 用 探 针检测， 有了 进 一步 的发展。分 离株 的研 究 中， 痝 蚢 毒 力 基 因牟 糠 諨 序 列 数据 为这些在 年 的以 序 列 为基 础的另 一个 研 究 也 支 持 将乜 踟 近 期 ， 在 年 的研 究 数囊恍 掷 胫晷鴋溶血在 年 的最 早的比 较 基 因组 学研 究 ， 分 析 了 菌 株 虵以 及闒 和嬲 诨 蜃 樗 缴 媳 冉 狭 嘶 虻 拇 嬖谟敕 馼究 表 明， 这昃哂懈 叨 鹊
6、 墓蚕 咝 裕个 血 清型 之间， 在 基 因成 分 上 具有很多 区别。这些 区别能够 解 释两 个 血 清型 之间的生 态 学和表 型 的差别。该 研 究 还及 成纤维 细 胞 胸 的内 化作用 具有重要 作用 的毒 力因子。最近。涂盝 蹉 因在 目 前 研 究 过的所有的细 菌 噬 菌 体 ， 能够 感染细 菌 ， 分 成两 种 途径 一裂解 途径 。裂解 噬 菌 体 ， 感染并 在 细 菌 细 胞 内 繁 殖 ， 然 后数域 总长 度 的百 分 比 ， 然 后 乘以 悸 堑 绞 删 逋 返 姆 庾 澳芰 ， ， ， 存 在 ， 每个 关 键词会 使这个 分 数增 加的比 例 占 整 个
7、 区域 总蛋 。区基 因组 测 序 技 术， 从 在 世 纪 年 代发明第 一台 全 自动测 序 仪， 到目 前 单分 子 测 序 仪， 已 经 经 历 了 多 代， 测 序 技 术得 到了 突飞 猛 进 的发展， 由 此产 生的腀序 技 术和衍生 的其 他例 如转录组 测序 技 术的发展， 使得 生命 科学领域 对生 命 的认 识 越来越深 入 ， 从 最 早的达尔文 研 究 生 物 的性 状 ， 到目 前 能够 通过生 物 的遗传 因子 蚏 来阐 明生 物 性 状 的基 础。第 一代测 序 技 术 法第 二 代测 序 技 术 循 环 阵 列 合 成测 序 法阵 列 循 环 方 法的技 术主
8、 要 包括臼 状 谓 沽 姿 岵 庑 蛴 迷诟 咄 坎庑 蛏 希蟊惚 籖诊断 公 司扩 增 出 成千 上 万 相 同的单分 子 簇 ， 这些 单分 子 簇 进 一步 用 做 测 序 的模 板。那 捌谧急 富鞠嗤 玈 的 诓 嫌 端 修 饰 的微 珠 。测 序 所 用 的底 物 是 含这三 种 高 通量 测 序 仪器 虽 然 各 有特 色 ， 在 原理 上 很多 的共同之处：寄芙獶剪切 为小 片 段用 高 通量 测 序 方 法找 出 三 株 菌 中每株 基 因注 释。、 、 的基第 二 章 材 料 与方 法三 株 命 名为， 其 他曾 用 名有 最 初 被 发现 时 的命 名为， 其 他应用 名有， ， ， 琋于 年 分 离自患 有禽 类心肌 疾病的鸟表 本 实 验测 序 用 用 于 进 行 全 基 因组 比 对的其 他单核 细 胞 增 生 李 斯 特 菌 全 基 因组 序 列 均从表 实 验中使用 全 基 因组 序 列血 清型续 表 实 验中使用 全 基 因组 序 列
