1、食品生物化学 第一节 概述 第二节 核酸的化学组成 第三节 核酸的结构 第四节 核酸的性质第五章 核酸的化学 食品生物化学学习目标1 掌握核酸的化学组成和基本构成单位。2 掌握核酸的结构,理解 DNA双螺旋结构的要点。3 掌握核酸的性质。食品生物化学第一节 概述核酸 (nucleicacid)是生物体的基本组成物质,从高等动、植物到简单的病毒都含有核酸。它在生物的个体生长、发育、繁殖、遗传和变异等生命过程中起着重要的作用。核酸是生物细胞中最重要的生物大分子之一。根据核酸的化学组成,把核酸分为两类,一类为脱氧核糖核酸( DNA),另一类为核糖核酸( RNA)。食品生物化学DNA是大分子化合物,其
2、分子量约 106 109,它主要分布在细胞核内,在线粒体和叶绿体中也有少量分布。 RNA根据其生理功能和结构分为信使 RNA( mRNA)、 转运 RNA( tRNA) 和核糖体 RNA( rRNA)。 核糖体 RNA是细胞中含量最多的一类 RNA, 约占总 RNA的 75% 80%,分子量约为 106,它以核蛋白形式,存在于细胞质的核糖体中;转运 RNA含量仅次于核糖体 RNA, 约占总 RNA的 10% 15%,分子量约为 0.25105 0.30105,它以游离状态分布在细胞质中。信使 RNA含量较少,占总 RNA的 5%,分子量为 0.2106 2.0106,它在核中合成后转移到细胞质
3、中。食品生物化学第二节 核酸的化学组成一、核酸的元素组成DNA和 RNA分子中,主要元素有碳、氢、氧、氮、磷等,个别核酸分中还含有微量的 S。 磷在各种核酸中的含量比较接近和恒定, DNA的平均含磷量为 9.9%, RNA的平均含磷量为9.4%。因此,只要测出生物样品中核酸的含磷量,就可以计算出该样品的核酸含量,这是定磷法的理论基础。食品生物化学二、核酸的水解产物核酸是一种聚合物,它的结构单位是核苷酸 。图 5-1 核酸的水解产物 食品生物化学三、核酸水解产物的化学结构1戊糖DNA和 RNA的主要区别是所含戊糖不同, DNA分子中的戊糖是 -D-2-脱氧核糖,而 RNA分子中的戊糖是 -D-核
4、糖 。 -D-核糖 -D-2-脱氧核糖图 5-2 戊糖的结构式食品生物化学2碱基核酸分子中的碱基有两类:嘌呤碱和嘧啶碱,它们是含氮的杂环化合物。嘌呤碱类主要有包括二种嘌呤:腺嘌呤( adenine, A) 和鸟嘌呤 (guanine, G)。嘧啶碱类主要包括三种嘧啶:胞嘧啶( cytosine, C), 胸腺嘧啶 (thymine, T )和尿嘧啶 (uracil, U ), 其中 RNA分子中只含其中的两种嘧啶:胞嘧啶( C) 和尿嘧啶( U), 不含胸腺嘧啶( A); DNA分子中则只含二种嘧啶:胞嘧啶( C) 和胸腺嘧啶( A), 而不含尿嘧啶( U)。 食品生物化学图 5-3 碱基母核
5、与碱基结构食品生物化学3核苷核苷是核糖或脱氧核糖与嘌呤碱或嘧啶碱生成的糖苷。核苷中碱基部分与戊糖部分的原子各有一套编号,为表示区别,一般将戊糖部分的原子编号加上 “”。形成核苷时,由戊糖的 1-C和嘌呤的 9-N或嘧啶的 1-N成糖苷键。核苷的名称都来自它们所含有的碱基名称,如含有腺嘌呤的核糖核苷就称为腺嘌呤核苷 (adenosine), 如果是脱氧核糖就称为脱氧腺嘌呤核苷(deoxyadenosine)。 腺嘌呤核苷、鸟嘌呤核苷 (guanosine)、 胞嘧啶核苷 (cytidine)和尿嘧啶核苷 (uridine)分别简称为腺苷、鸟苷、胞苷和尿苷。胸腺嘧啶很少出现在核糖核苷中,所以脱氧胸
6、腺嘧啶核苷,常简称为胸苷,也称为脱氧胸苷。食品生物化学图 5-4 一些重要的核苷结构 食品生物化学用表示碱基的单字母也可以用来表示核苷,即用 A、 G、 C、 U分别表示腺苷、鸟苷、胞苷、尿苷。以 d表示脱氧,用 dA、dG、 dC和 dT表示脱氧腺苷、脱氧鸟苷、脱氧胞苷和脱氧胸苷。4核苷酸核苷与磷酸结合生成的化合物称为核苷酸。即核苷酸是由核苷分子中戊糖环上的羟基与一分子磷酸上的氢通过脱水生成磷酯键形成的化合物。含有核糖的核苷酸称为核糖核苷酸,而含有脱氧核糖的核苷酸称为脱氧核糖核苷酸。核苷含有 3个可以被磷酸酯化的羟基 (2、 3和 5),而脱氧核苷含有 2个这样的羟基(3和 5)。食品生物化
7、学在自然界中出现的游离核苷酸为 5核苷酸,可以省去 5字样。核苷酸可以含有一个、两个或三个磷酸基团,分别称为核苷一磷酸 (NMP)、 核苷二磷酸 (NDP)及核苷三磷酸 (NTP)。 例如腺苷的 5-单磷酸酯就称为腺苷一磷酸 (AMP), 也可简称为腺苷酸。同样,脱氧胞苷的 5-磷酸酯可以称为脱氧胞苷一磷酸(dCMP), 简称为脱氧胞苷酸。胸腺嘧啶的脱氧核苷的 5-磷酸酯常称为胸苷酸,但有时为了避免混淆,也称为脱氧胸苷酸。腺苷的 5-二磷酸酯就称为腺苷二磷酸 (ADP), 而腺苷的 5-三磷酸酯就称为腺苷三磷酸 (ATP)。食品生物化学图 5-5 主要核糖核苷酸和脱氧糖核苷酸的结构通式食品生物
8、化学续图 5-5 主要核糖核苷酸和脱氧糖核苷酸的结构通式食品生物化学5 DNA和 RNA的组成差别DNA和 RNA的组成差别主要是戊糖和碱基的不同。从而导致形成不同的核苷和核苷酸 。表 5-1 参与 DNA和 RNA的组成的碱基、核苷及核苷酸 食品生物化学图 5-6 ATP结构示意图食品生物化学四、核苷酸的衍生物1.腺苷三磷酸( ATP)ATP是生物体中重要的化合物 。 ATP结构中磷酸与磷酸之间的联结键水解断裂时产生大量的能,叫高能磷酸键,习惯用 “ ”表示高能键。凡含有高能磷酸键的化合物称为高能磷酸化合物。ATP含两个高能磷酸键, AMP分子中所含的磷酸键不是高能磷酸键,所以它是普通磷酸化
9、合物。普通磷酸化合物其磷酸键能较低,水解时只能释放 8.4KJ/mol能量,而高能磷酸键水解时可释放 30.7KJ/mol能量。 ATP依次水解可分别产生腺苷二磷酸( ADP)、 腺苷一磷酸( AMP), 即:ATPADP+Pi ; ATPAMP+ PPi; ADPAMP+Pi 食品生物化学ATP分解为 ADP或 AMP时释放出大量的能量,这是生物体主要的供能方式, ATP是机体生理活动、生化反应所需能量的重要来源。反之, AMP磷酸化生成 ADP、 ADP继续磷酸化生成ATP时则储存能量,这是生物体暂时贮存能量的一种方式。ATP在生物体或细胞的能量代谢中起着极为重要的传递作用,被称为 “能量
10、货币 ”。此外体内存在的多种多磷酸核苷酸都能发生这种能量转化作用,如 GTP、 CTP和 UTP。 在核酸合成中,四种三磷酸核苷( ATP、 GTP、 CTP、 UTP) 是体内合成 RNA的直接原料,四种三磷酸脱氧核苷( dATP、 dGTP、 dCTP、dTTP) 是合成 DNA的直接原料。 2.腺苷衍生物 环腺苷酸( cAMP)cAMP是由 ATP经腺苷酸环化酶催化而成的。食品生物化学图 5-7 环腺苷酸( cAMP)食品生物化学cAMP广泛存在于一切细胞中,浓度很低。它们的主要作用不是作为能量的供体,而是在生物体内参与细胞内多种调节功能,如它可调节细胞内催化糖和脂肪反应的一系列酶的活性
11、,也可以调节蛋白激酶的活性。一般把激素称为第一信使,而称 cAMP为 “第二信使 ”。3.次黄嘌呤衍生物 次黄嘌呤核苷酸( IMP)在肌肉组织中,腺嘌呤核苷酸循环过程中由 AMP脱氨形成次黄嘌呤核苷酸。次黄嘌呤核苷酸在生物体内是合成腺嘌呤核苷酸和鸟嘌呤核苷酸的关键物质,对生物的遗传有重要的功能。另外,它还是一种很好的助鲜剂,有肉鲜味,与味精以不同比例混合制成具有特殊风味的强力味精(见第九章第二节鲜味) 。食品生物化学图 5-8 次黄嘌呤核苷酸食品生物化学第三节 核酸的结构核酸水解为核苷酸,核苷酸经完全水解后,可释放出等量的碱基、戊糖和磷酸。核苷酸是核酸的基本组成单位, DNA的基本组成单位是脱
12、氧核糖核苷酸, RNA的基本组成单位是核糖核苷酸。各种核酸中核苷酸少的有 70多个,多的有几十万种。而且核苷酸以一定的数量和排列顺序相互连接,并形成一定的空间结构。食品生物化学一、核酸的一级结构核酸的一级结构就是通过 3, 5-磷酸二酯键连接的核苷酸序列,也称多核苷酸链。多核苷酸链由交替的戊糖和磷酸基团形成核苷酸链的共价骨架。连接在戊糖上的碱基贮存和传送遗传信息。1核苷酸的连接方式聚合酶催化细胞中的 RNA和 DNA的合成。 RNA以 ATP、GTP、 CTP和 UTP为底物;而 DNA以 dATP、 dGTP、 dCTP和dTTP为底物。通过催化一个核苷酸的核糖或脱氧核糖第 5位的磷酸,与另
13、一个核苷酸的第 3位的羟基之间脱水缩合形成 3, 5-磷酸二酯键,并释放出无机焦磷酸。多个核苷酸以 3, 5-磷酸二酯键连接成线形大分子,即多核苷酸链。食品生物化学图 5-9 RNA和 DNA的共价骨架结构食品生物化学2.核酸的一级结构的表示方法RNA和 DNA的多核苷酸链,也像多肽链一样有方向性,它的一端为 5末端,而另一端为 3末端。无论是 DNA, 还是 RNA, 在它们的生物合成的聚合反应中,都是按照 53 方向进行的,因此没有特别指定时,核苷酸序列都是按照 53 方向读写。核酸的一级结构的表示方法有两种,一种是线条式缩写法,用竖直线表示戊糖;斜线表示 3, 5-磷酸二酯键,一端与戊糖
14、的 3相连,另一端与下一个戊糖的 5相连; p表示磷酸残基, A、 U、 G、 C、 T表示各碱基。 食品生物化学另一种是文字缩写法,即磷酸用 p表示,腺苷一磷酸表示为 pA, 而脱氧腺苷一磷酸表示为 pdA, 其它的类似。将上图的线条式可改写成 pApCpGpUpA, 也可进一步简写为 ACGUA。图 5-10 线条式缩写示意图食品生物化学二、 DNA的空间结构DNA的空间结构是指多核苷酸链与多核苷酸链之间以及多核苷酸链内通过氢键及碱基堆积力,在空间形成的螺旋、卷曲和折叠的构象。 DNA的空间结构包括 DNA的二级结构和 DNA的超螺旋结构。1.DNA的二级结构DNA的二级结构一般是指 DN
15、A分子的空间双螺旋结构。DNA双螺旋结构模型的建立,揭开了现代分子生物学的序幕。( 1) DNA分子是由两条互相平行、但走向相反(一条链为3 5 ,另一条链为 5 3 )的脱氧多核苷酸链组成,两条链以右手螺旋方式平行地围绕同一个轴盘旋成双螺旋结构。食品生物化学图 5-11 DNA双螺旋结构模型食品生物化学( 2) 双螺旋的两条主链都是由脱氧核糖酸残基中的糖和磷酸构成的,是双螺旋的骨架。两条链上的碱基两两成对层叠分布于双螺旋的内侧,碱基平面与螺旋轴垂直。( 3) 两条脱氧多核苷酸链之间同一水平上的碱基是通过氢键相连形成碱基对,并且碱基配对有一定规律,即 A与 T通过形成两个氢键配对( A=T); G与 C通过形成三个氢键配对( GC)。 因此,有 4种可能的碱基对,即 A T、 T A、 G C和 C G。在碱基对之中的两个碱基称为互补碱基,由于 DNA双链同一水平上的碱基对都是互补的,所以两条链也是互补的,称为互补链,只要知道一条链的碱基排列顺序,就能确定另一条链的碱基排列顺序。 DNA的复制、转录、反转录以及蛋白质的生物合成都是通过碱基互补原则实现的,碱基互补规律有重要的生物学意义。