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基本实验技术.ppt

上传人:精品资料 文档编号:10719194 上传时间:2019-12-31 格式:PPT 页数:26 大小:6.70MB
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资源描述

1、基本实验技术,一 分子克隆,分子克隆指按照人的意愿,在体外将某种生物的DNA片断插入到载体(质粒、病毒等)中,形成遗传物质的新组合-重组DNA分子(重组子),然后将重组子转移到宿主细胞中进行复制或表达,即对DNA分子进行克隆,以获得该DNA分子的大量拷贝。,载体构建将编码某一多肽或蛋白质的基因(外源基因)组装到细菌质粒(质粒是细菌染色体外的双链环状DNA分子)中,再将重组质粒转入大肠杆菌,这样重组质粒就随大肠杆菌的增殖而复制,从而克隆基因或表达出外源基因编码的相应多肽或蛋白质。,慢病毒载体(Lentiviral vector, LVs)是在 HIV-1病毒基础上改造而成的病毒载体系统,它能高效

2、将目的基因(或 RNAi)导入动物和人的原代细胞或细胞系。,慢病毒稳定细胞株构建,转染,是将外源性基因导入细胞内的一种专门技术。可通过转染干扰片段或过表达质粒,研究基因的作用。,siRNA转染在一周内有效,需要马上进行功能实验。但转染效率受细胞类型及细胞状态影响,对于难以转染的细胞,建议用慢病毒构建稳定细胞株再进行后续实验,比如神经元细胞、干细胞。,实时定量 PCR (Real - Time Quantitative Polymerase ChainReaction) 是在经典 PCR技术基础上,通过在 PCR 反应体系中加入荧光基团,利用特定仪器检测荧光信号积累的强弱,进而实时监测每一轮 P

3、CR 反应产物,并对与其产物量呈正相关的初始模板进行定量分析的技术。,二 基因表达与调控, 绝对定量(Absolute Quantification,AQ)病原体检测转基因食品检测基因表达研究 相对定量(Relative Quantification,RQ)基因在不同组织中的表达差异药物疗效考核耐药性研究,染色质免疫共沉淀(Chromtin Immuno Precipitation, CHIP)是目前唯一研究体内 DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白

4、结合的 DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与 DNA 相互作用的信息。,研究DNA 甲基化 检测已知蛋白的靶基因 组蛋白修饰 染色质结构 转录因子的协同结合,CHIP实验技术流程图,蛋白免疫印迹( Western Blot) 是将电泳分离后的细胞或组织总蛋白质从凝胶转移到固相支持物NC膜或PVDF 膜上,然后用特异性抗体检测某特定抗原的一种蛋白质检测技术。 该技术广泛应用于检测蛋白水平的表达。,三 蛋白表达与功能分析,四 病理实验,免疫组织化学(Immunohistochemistry,IHC)是利用抗原与抗体特异性结合的原理,通过化学反应使标记抗体的显色剂(荧光素、酶、金

5、属离子、同位素)显色来确定组织细胞内抗原(多肽和蛋白质),进行定位及相对定量研究的一种技术。能将目地抗原的表位及表达量直观的呈现出来 。,免疫荧光(Immunofluorescence,IF)是根据抗原抗体反应的原理,先将已知的抗原或抗体标记上荧光素制成荧光标记物,再用这种荧光抗体(或抗原)作为分子探针检查细胞或组织内的相应抗原(或抗体)。可以采用不同激发波长的荧光二抗标记不同的目的蛋白,同时观察两种蛋白的表达及共定位情况。,TUNEL细胞在发生凋亡时,会激活一些 DNA内切酶,这些内切酶会切断核小体间的基因组DNA。基因组 DNA断裂时,暴露的 3-OH可以在末端脱氧核苷酸转移酶的催化下加上

6、荧光素标记的 dUTP,从而可以通过荧光显微镜或流式细胞仪进行检测。是分子生物学与细胞形态学相结合的研究方法,对完整的单个凋亡细胞核或凋亡小体进行原位染色,能准确反映细胞凋亡的形态特征。,原位杂交(ISH)基本原理是利用核酸分子单链之间有互补的碱基序列,将有放射性或非放射性的外源核酸(即探针)与组织、细胞或染色体上待测 DNA或RNA互补配对,结合成专一的核酸杂交分子,经一定的检测手段将待测核酸在组织、细胞或染色体上的位置显示出来。可确定组织中目的核酸的表达位置和表达量。,IHC,IF,TUNEL,五 细胞功能实验,细胞生长曲线是测定细胞绝对生长数的常用方法,也是判定细胞活力的重要指标,是培养

7、细胞生物学特性的基本参数之一。可用于研究与细胞增殖相关基因及细胞毒性实验等。,细胞增殖检测,MTS原理为淡黄色的物质被细胞生物还原为一种可溶性的有色产物,利用分光光度计检测490nm处吸光值来反应细胞的增殖与细胞活性。颜色越深,OD值越大,细胞相对数量越多,细胞相对活力越高。,区别: MTS检测相对细胞数量与相对细胞活力(OD值与细胞数量间为对数关系且与细胞活力共同影响OD值)。 生长曲线检测绝对细胞数量,及死活,但对细胞活性如何无法得知。,细胞生长曲线,MTS,细胞迁移能力检测,细胞划痕愈合实验是测定细胞迁移运动与修复能力的方法,类似体外伤口愈合模型,在体外培养皿或平板培养的单层贴壁细胞上,

8、用微量枪头或其它硬物在细胞生长的中央区域划线,去除中央部分的细胞,然后继续培养细胞至实验设定的时间,取出细胞培养板,观察周边细胞是否生长(修复)至中央划痕区,以此判断细胞的生长迁移能力。,Transwell 迁移实验在 Transwell 小室上室种细胞,下室加入 FBS 或某些特定的趋化因子,细胞会向营养成分高的下室跑,计数进入下室的细胞量可反映细胞的迁移能力。,划痕愈合实验比较细胞的侧向运动能力,Transwell迁移实验比较细胞纵向运动及变形能力。,Transwell小室,细胞划痕愈合,Transwell迁移,细胞侵袭能力检测,Transwell 侵袭实验,与Transwell迁移实验不

9、同的是,侵袭实验上室侧铺上一层基质胶,用以模仿体内细胞外基质,细胞欲进入下室,先要分泌基质金属蛋白酶(MMPs)将基质胶降解,方可通过聚碳酸酯膜。主要模拟细胞分泌金属蛋白酶消化细胞外基质。侵袭实验比较细胞分泌基质金属蛋白酶,破坏细胞外基质并向其他组织转移的能力。,Transwell侵袭,六 流式细胞术,流式细胞术(flow cytometry, FCM)一种在液流系统中快速测定单个细胞或细胞器的生物学性质,并把特定的细胞或细胞器从群体中加以分类收集的技术。,流式检测细胞周期 PI,即碘化丙锭,可以与细胞内 DNA 和 RNA 结合,采用 RNA 抑制剂将RNA 消化后,通过流式细胞术检测到的与

10、 DNA 结合的 PI 的荧光强度直接反映了细胞内 DNA 含量的多少。由于细胞周期各时相的 DNA 含量不同,通常正常细胞 G1/G0 期具有二倍体细胞的 DNA 含量(2N),而 G2/M 期具有四倍体细胞的 DNA 含量(4N),而 S 期的 DNA 含量介于二倍体和四倍体之间。因此,通过流式细胞术PI染色法对细胞内 DNA含量进行检测时,可以了解不同细胞周期各细胞亚群比例。由于晚期凋亡细胞 DNA断裂形成亚二倍体峰,因此可同时检测凋亡。,流式检测细胞凋亡 Annexin VPI双染法,在凋亡细胞的形态学改变中,胞膜的改变是最早的。在细胞凋亡早期,细胞膜内侧磷脂酰丝氨酸(PS)从细胞膜内层翻转,暴露在凋亡细胞表面,构成早期凋亡的重要生化特征, Annexin V是一种分子量为 3536kD的Ca2+依赖性磷脂结合蛋白,与磷脂酰丝氨酸有高度亲和力,故可通过细胞外侧暴露的磷脂酰丝氨酸检测凋亡早期细胞,PI是一种核酸染料,它不能透过完整的细胞膜, PI拒染活细胞和早期凋亡细胞,但对凋亡中晚期的细胞和死细胞,PI能够透过细胞膜而使细胞核染红。因此将 Annexin V与PI匹配使用,就可以将处于不同凋亡时期的细胞区分开来。,流式检测细胞周期,流式检测细胞凋亡,谢谢!,

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