1、生 物 化 学 (下册),BIOCHEMISTRY,如何学习代谢,* 课前预习, 课上认真记笔记, 课后及时复习 * 在理解的基础上,加强记忆 * 与先修课程内容相联系, 以促进理解 * 学习过程中学会总结、归纳和提炼! * 要反复复习和回顾,不可突击学习! * 养成看参考书的习惯,参考书,1 沈同, 王镜岩. 生物化学(第二版). 高等教育出版社, 1995 2 郑集, 陈钧辉. 普通生物化学(第三版). 高等教育出版社, 1998 3 宓怀风. 生物化学. 南开大学出版社,1987 4 周爱儒. 生物化学(第五版). 人民卫生出版社,2001 5 于自然,黄熙泰. 现代生物化学. 化学工业
2、出版社(教材出版中心),2001,课时安排,代谢总论(19) 2课时; 生物膜与物质运输(21) 2课时; 生物氧化 (24) 2课时; 糖代谢(22,23,25,26) 10课时; 脂代谢(28,29) 4课时; 蛋白质(30,31) 4课时; 核酸代谢(DNA,RNA)(33-37) 8课时; 蛋白质合成与代谢 (38) 2课时; 代谢调控(39) 2课时.,第19章 代谢总论,代谢研究的主要内容,营养物质的摄入 营养物质的消化和降解:由大分子形成小分子 由小分子物质合成自身需要的各种生物分子 提供和储存生命活动所需要的能量,1. 代谢描述的是细胞的所有反应 2. 代谢过程是在酶的催化下进
3、行的 3. 代谢过程是复杂的、逐步进行的: 代谢物(metabolite):代谢循环的各种中间物 代谢途径(catabolic pathways) 4. 代谢是受到调控的,代谢研究的基本特点,第一节 新陈代谢的一般规律,(一)基本概念 新陈代谢是体内化学反应的总称,体内的化学反应通常由酶催化,一系列的连续反应构成代谢途径,代谢途径的个别步骤称作中间代谢,个别步骤的产物称作中间产物。,新陈代谢的主要特点: 获取营养物质,并将其转化为自身所需的物质,称作合成代谢;分解营养物质提供生命活动所需的能量,称作分解代谢; 合成代谢和分解代谢的调控步骤通常由不同的酶催化,分解代谢中大量释放能量的反应通常是不
4、可逆的,在合成代谢中,这样的步骤需要输入能量来完成。 有时,合成代谢和分解代谢可以在不同的细胞器中进行。 有些代谢环节是合成代谢和分解代谢共同利用的,称作两用代谢途径,如柠檬酸循环就是两用代谢途径。,(二)代谢途径的一览图,(五)能量代谢在新陈代谢中的重要地位 P2,P3-5 (六)辅酶I和辅酶的的递能作用(七)FMN和FAD的递能作用(八)辅酶A在能量代谢中的作用,(九)代谢途径的区域化,第二节 代谢中常见的有机反应机制,有机化学反应常涉及共价键的断裂。 共价键断裂时,若两个电子分开,称作均裂断裂,产生不稳定基团,常见于氧化还原反应。 若两个电子不分开,称作异裂断裂,如C-H键断裂,电子对通
5、常留在碳原子一侧(碳原子的电负性大于氢原子),形成碳负离子和氢离子,富电子的碳负离子为亲核基团,容易与缺电子的亲电基团发生反应。 若有氢负离子的受体存在,C-H键断裂时电子有可能留在氢原子一侧形成碳正离子和氢负离子,缺电子的亲电基团容易与富电子的碳负离子(为亲核基团)发生反应。,一、基团转移反应(grouptransferreaction),在生物化学反应中,通常为亲电基团从一个亲核体转移到另一个亲核体,常见的转移基团有酰基、磷酰基和葡萄糖基等。 1酰基转移,2磷酰基转移,3葡糖基转移 P8,二、氧化反应和还原反应 (oxidation and reduction),实质是电子的得失,在生物化
6、学反应中十分普遍,从代谢物转移的电子,通过一系列的传递体转移到氧,并伴随能量的释放。,NAD+H+2eNADH,三、消除、异构化及重排反应,消除反应伴随碳-碳双键的生成,可通过协同机制、碳正离子机制或碳负离子机制完成,形成顺式或反式消除产物。 在生物化学中,常见的异构化反应是双键移位。如酮糖-醛糖互变。 重排反应伴随碳-碳键的断裂和重生成,使碳骨架发生变化。,1消除反应,消除反应的机制,2异构化反应,3. 分子内重排反应,分子内重排反应 -C-C-C- 变位酶 -C-C-C- (rearrangement) C B12 C,4. 碳-碳键的形成与断裂反应,分解代谢和合成代谢以碳-碳键的形成与断
7、裂为基础,常见的有: 1羟醛缩合反应和羟醛裂解反应,如果糖-1,6-二磷酸裂解为二羟丙酮磷酸和甘油醛-3-磷酸。 2克莱森酯缩合反应如柠檬酸合酶催化的反应(在柠檬酸循环中介绍)。 3-酮酸的氧化脱羧反应如异柠檬酸的氧化脱羧。,第三节 新陈代谢的研究方法,一、使用酶的抑制剂,二、利用遗传缺欠症研究代谢途径,微生物的营养缺陷型可以分为若干种亚型,每种亚型由一种酶的缺陷造成,对比研究可以搞清代谢途径。 如途径AB C D中B C的酶缺失,则A和B会堆积;C D的酶缺失,则A、B和C会堆积。,三、同位素示踪法 同位素:原子序数相同(在周期表上地位相同, 化学性质相同),但质量不同的元素。天然同位素:稳定的同位素,如:2H(D)、15N、13C和18O 放射性同位素:人工制备,不稳定。有特定的半衰期。常用的:32P、14C、3H、34S,放射自显影用14C标记CO2,培养绿藻,提取液进行双向纸层析,放射自显影,发现放射性最早出现在3-磷酸甘油酸(PGA),随后出现在其他中间物。,四、核磁共振波谱法 运动19分钟前后ATP和磷酸肌酸的变化情况 磷酸肌酸,基本要求,1掌握分解代谢与合成代谢及与能量代谢的关系。 2熟悉辅酶I、辅酶、FMN、FAD和辅酶A在能量代谢中的作用。 3掌握新陈代谢调节的一般规律。 4了解代谢中常见的有机反应机制。 5熟悉新陈代谢的研究方法。,