1、 原核表达步骤 原核表达先要将基因克隆到原核表达载体上,然后通过转化到 JM109 或BL21 等菌株中,诱导表达蛋白,然后进行蛋白纯化。本实验方案的前提是,目的基因已克隆到载体,并已转进入 JM109 菌株中。一 鉴定目的蛋白是否在大肠杆菌 JM109 或 BL21 中大量表达(一) 制样1 . 挑取经过双酶切鉴定的单克隆菌落于 700ul LB 培养基,加入 0.7ul Amp(100mg/mL) ,37 oC200r/min 摇床培养,过夜活化。2. 以 1:50 比例(200ul) ,将活化的过夜培养物加入 10mL LB 液体培养基中,加入 10uLAmp(100mg/ml) ,37
2、 oC200r/min 摇床扩大培养 2h-3h,期间取样监控菌液的 OD 值,控制菌液 OD600 在 0.6-1.0 之间,以使大肠杆菌处于最适合表达外源蛋白的生长状态。(一般 3h 时,菌液浓度及达到标准,但是不同的基因对菌的影响不同,所以第一次实验时需要确定这个最佳时间)3. 从 10ml 扩大培养物中取 3ml 菌液作为不加 IPTG 的空白对照(CK ) ,其余7ml 菌液加入 7ul IPTG(储存浓度为 0.5mol/l) ,使 IPTG 终浓度达到0.5mmol/l。以 200r/min 的转速,37 oC 摇床培养 3h。4. 以 5000r/min 离心 2min 收集菌
3、体,倾倒上清,每个离心管收集 3ml 培养物。5. 加入 1ml dH2O,将管底沉淀用振荡器打散以充分洗涤,8000r/min 离心2min,倾倒上清。6. 重复步骤 5。将离心管中的水倒干净。(二)菌落 SDS-PAGE 1. 在收集的菌体中加入 200ul 1SDS PAGE loading buffer(可根据沉淀的量增加或减少 loading buffer 的量,一般 200ul 比较合适 )。用漩涡器剧烈震荡,确保将管底沉淀震散。 2. 将样品于 100恒温加热器上开盖加热 10min(Marker 也要加热) 。样品凉后,12000r/min 离心 3min,取每管的上清点样。上
4、样量一般 30ul40ul,marker 20ul。(三) SDS-PAGE 分析1. 根据目的片段的大小,制作不同浓度的分离胶蛋白分子量 (kDa) 凝胶浓度 (%)4-40 2012-45 1510-70 1215-100 1025-200 8分离胶(两块)配方15% 12% 8%ddH2O 3.4ml 4.9ml 6.9ml30% Acr-Bis (29:1) 7.5ml 6.0ml 4.0ml1.5M Tris-HCl( pH8.8) 3.8ml 3.8ml 3.8ml10%SDS 150ul 150ul 150ul10%过硫酸铵 150ul 150ul 150ulTEMED 20ul
5、 20ul 20ul总体积 15ml 15ml 15ml按表中所列顺序从上到下加试剂,加完TEMED后,轻轻摇匀液体,一块胶加7ml溶液。加完后, 用1mLddH 2O封住分离胶液面,在室温(37)凝结30min,至分离胶与水之间出现一条清亮的分界线,倾倒水层,用滤纸条将残余的水吸干。2.制作浓缩胶 浓缩胶(两块)配方5%ddH2O 3.4 mL30% Acr-Bis (29:1) 0.85 mL1M Tris-HCl( pH6.8) 0.63 mL10%SDS 50 uL10%过硫酸铵 50 uLTEMED 20 uL总体积 5ml胶配好后混匀,灌胶 2ml,插梳子时根据点样量和浓缩胶长短调
6、整梳子插入的深度,于室温(37)凝胶 30min。3.胶凝好后,拔梳子,将胶放入电泳槽中,加入 1Tris-Gly 电泳缓冲液没过点样孔,胶外侧缓冲液界面应完全没过电极4.Marker 点 5uL,用 10uL 小枪点样,以防样品冲出点样孔与旁边样品混杂。电压打到 70V,保证电流在 20mA-30mA 之间,当样品跑入浓缩胶时可适当调高电压,但不宜多次调整电压,否则条带会跑歪。5.当溴酚蓝电泳至胶槽底部时,一般需要 2.5h,停止电泳,剥胶,将浓缩胶部分切除后,加入考马斯亮蓝染色液,40r/min 染色 3h,可以过夜染色。6.用移液器回收考马斯亮蓝染色液,再用蒸馏水将浮色冲洗干净后,倒入考
7、马斯亮蓝脱色液,40r/min 脱色至胶背景透明,期间可每 2h 更换一次脱色夜。根据菌落 SDS-PAGE 的结果,可以看到目的蛋白是否大量表达。二 鉴定目的蛋白形成的是包涵体还是可溶性蛋白1. 从冻存的菌液中取 10ul,接种于 5ml 的 LB 培养基中,加入 5ul Amp(100 mg/ml),过夜活化菌株。2. 按照 1:50 的比例,从活化的菌株中,取 1ml 菌液接种于 50ml LB 培养基中,加入 50ul Amp(100 mg/ml),扩大培养 3 h。3. 扩大培养后的菌液,取出 10ml,不加 IPTG,作为空白对照。剩余的40ml 菌液中加入 40ul IPTG(0
8、.5mol/l),诱导蛋白表达。两者在 37,200rpm 的条件下培养 3h。4. 用 50ml 离心管收集菌体,8000rpm,离心 3min。注意配平。5. 倒掉上清,加入 40ml 左右的 dH2O 洗菌体一遍,12000 rpm,离心2min。注意要将菌体充分打散。6. 倒掉上清,用枪头将上清吸干净。根据菌体的浓度,加入适量的 PBS buffer 悬浮菌体。7. 用大功率的超声波将菌体破碎,其间超声波每工作 2min,停止 1min。菌体要始终保持在冰水混合物上,以保证低温,蛋白不易变性。如此反复 6-10 遍,直至菌液清澈。8. 12000rpm, 离心 3min,分离上清和沉淀
9、。9. 在沉淀中加入 250ul 1SDS Loading buffer ,取 200ul 上清,加入 50 ul 5SDS Loading buffer,在恒温加热器上 100加热 10min。 10.加热后的样品冷却到室温后,12000rpm,离心 2min。11.取上清 40ul 点样,按照一中的方法进行 SDS-PAGE 检测。点样顺序是:对照的上清,沉淀,样品的上清,沉淀。12.根据 SDS-PAGE 结果,判断目的蛋白是以包涵体还是以可溶性蛋白的形式产生。如果蛋白在沉淀中大量表达,则形成包涵体,需要改变诱导表达条件,比如将扩大培养与诱导培养的温度改为 25,并延长相应培养时间。如果
10、蛋白在上清中表达,则形成可溶性蛋白,可继续进行下一步实验。三 纯化目的蛋白(整个过程要尽量保持在 4进行)1. 大量诱导目的蛋白(一般需要 2-4 L 的菌量) ,用超声波破碎细胞,收集上清。2. GST 纯化柱的柱床保存在 20%的乙醇中,使用之前,先用吸管将柱床轻轻加入到柱子中,打开柱子,流出乙醇,使柱床沉积下来。3. 加入 10ml PBS buffer,洗柱床 3 遍,使得柱床重新平衡。4. 将准备好的样品加入到柱子中,每次加入 5-10ml 样品,使样品结合在柱子上(每次上样量不能太多,因为柱子的结合能力有限) 。5. 用 PBS buffer 洗柱子 3 遍,每次用 10ml,去除
11、柱子中非特异性结合的杂蛋白。6. 加入 5ml 洗脱液(10m mol/l 的还原型谷胱甘肽,用 50mmol/l tris-bufferr 或者 PBS buffer 溶解)将目的蛋白洗脱出来。用 1.5ml 离心管收集流出来的样品,每管接 0.5ml 样,一共收集 6-8 管(一般情况,第一管流出的是 PBS,第二和第三管大部分是目的蛋白,所以 OD 值很大,第三至第六管的 OD 值慢慢降低。不要偷懒一次接太多,不然会影响后续收集蛋白。还原型谷胱甘肽很容易被氧化,如果一次没有用完,请用保鲜膜封口置于 4 度冰箱保存,超过 2 天的话请更换新的洗脱液。)7. 用 PBS buffer 洗柱子
12、 1 遍。8. 用分光光度计测每一管的 OD 值,记录下读数,将读数大于 200 的样品留下(一般是第 2 至第 4 管),冻于-20冰箱中。9. 重复步骤 4-8,直至所有样品均纯化完毕。10.可以用 SDS-PAGE 检测纯化出来的样品浓度以及纯度。重生柱子的方法:(柱子使用三四次之后,需要重生,即让柱子上的 GST 结合基团重新暴露出来)1用还原型谷胱甘肽洗脱液洗柱子 3 遍,每次加入 10ml。2. 用 PBS 缓冲液洗柱子 4 遍,每次加入 10ml。3. 用 50 mmol Tris HCl(pH 8.0)洗柱子 3 遍,每次加入 10ml。4用 0.5M NaCl(pH 8.0)
13、洗柱子 3 遍,每次加入 10ml。5. 用 100 mM 醋酸钠(pH 4.5)洗柱子 3 遍,每次加入 10ml。6. 用 0.5M NaCL 洗柱子 3 遍,每次加入 10ml。柱子长时间不用,需要按照以下方式清洗及保存:1. 按照重生的 1-6 步骤先将柱子重生一遍。2. PBS 洗柱子 2 遍,每次加入 10ml。3. 将柱床用吸管吸出,分别用 5%,10%,15%,20%的乙醇洗 2 遍。4. 用单蒸水轻轻冲洗柱子底部的膜,洗出杂蛋白。5. 柱床保存在含 20%乙醇的 PA 瓶中。柱子和柱床置于 4 度冰箱保存。如果柱子用于纯化不同的蛋白, 只需要按照重生方法的 1,2 步骤操作即
14、可,然后直接纯化另外一个蛋白。如果柱子流速很慢,可能是柱子底部的膜被杂蛋白堵住了。柱子重生之后,将柱床用吸管吸出,然后用单蒸水将柱子底部的膜轻轻冲洗,再将柱床加入到柱子中,重新上样。如果柱子需要重生,请用完柱子的同学自觉完成这份工作,以免影响下一位同学的使用。四 根据不同的用途浓缩蛋白1. 若蛋白用于制作抗体如果洗脱液用的是 tris-bufferr 配制的,需要用 1/4 的 PBS buffer 进行透析,然后在冷冻干燥机中冻干浓缩,因为公司最终需要将目的蛋白溶于 PBS buffer 中。如果洗脱液是用 PBS buffer 配制的,则直接在冷冻干燥机中冻干浓缩。GST 纯化柱手册上建议的是用 tris-bufferr 配制洗脱液,但用 PBS buffer 配制的洗脱液可以将目的蛋白洗脱下来。可自己选用。2. 若蛋白用于活性检测由于蛋白在 tris-bufferr 和 PBS buffer 中,均能保持活性,所以不论用哪种,都不需要透析,直接浓缩干燥即可。