1、Q-PCR 实验流程一、 总 RNA 抽提1)细胞培养皿中细胞样品用 1X PBS 洗两次后,用 1ml 枪将 PBS 吸干净,加入1ml Trizol (invitrogen)溶液,吹打混匀,并吸至 1.5ml RNase free EP 管中使细胞充分裂解,室温静置 5min;组织样品用液氮充分研磨,加入 1ml Trizol (Invitrogen)溶液,混匀,室温放置 5min 使其充分裂解;(管盖与管壁都需标记样品名称)2)加入 200l 氯仿(5X),剧烈振荡混匀 1min,使水相和有机相充分接触,室温静置 3-5min;(离心时离心管按顺序排放,离心完毕,离心管的顺序也按顺序排好
2、,与第一步的顺序一致)3) 4下,14000g 离心 5min,可见分为三层,RNA 在上层水相,移至另一个新的 RNase free EP 管;(用 20-200ul 的枪吸取上清,吸上清时,枪头应沿着液面上层吸取上清,枪头不可碰到、吸到中间层)4)沉淀 RNA:加入等体积(1:1)异丙醇,轻柔地充分混匀(颠倒 6-8 次)(不应用振荡器混匀),室温静置 10min;5)4下,14000g 离心 15min,收集 RNA 沉淀(如离心后仍不见 EP 管底部有沉淀,应将 EP 管放置在-80 度冰箱过夜,继续在 4下,14000g 离心 10min,收集RNA 沉淀),去上清;6)用 75%乙
3、醇洗涤两次,12000g 离心 5min(加入乙醇后只需轻轻颠倒 EP 管即可,不用振荡器震荡或枪头吸打沉淀),弃去上清液,空甩一次,以完全去除乙醇,开盖晾 35min,反复 2 次,挥干,使样品变透明。7)视沉淀量加入适量 DEPC 水(至少 15ul)溶解沉淀。,打散,备用。二、反转录1) 在 RNase free 的 PCR 管中配置下列溶液.Oligd T 1 ulRNA 4 ulDEPC 水 3 ul2) 将上述溶液吹打均匀,置 70保温 5min,使 RNA 变性。随后 4,保持5min, 以防止 RNA 复性;3) 在该 PCR 管中加入下列试剂(M-MLV Reverse Tr
4、anscriptate)E 1 uldNTP 4 ulMgcl2 3 ulM-MLV RT 5X buffer 4 ul4) 将上述 20l 反应溶液混匀,空甩,开始反转录:25保温 10min;42保温 60min;70保温 15min;4,。三、调 cDNA 浓度反转结束后,每个样品加入 80 ul 的超纯水,混匀,用微量分光光度计检测浓度,先用超纯水校准。20 ul(cDNA)+ 80 ul 超纯水100 ul(cDNA)然后将各样品的 cDNA 浓度调至 150 ng/ul.初始浓度 X 100 = 150 X (水 + 100)加水量 = 初始浓度 X 100/150 100.四、PCR:酶 E 10 ul模版 2 ul引物 2.5 ul20 ul 体系水 5.5 ul离心甩匀后,放入 PCR 扩增器中,设置反应体系。五电泳配胶:1.5%80 ml 1 X TBE + 1.2 g 琼脂微波 3 min,使之澄清,加入 8 ul Gelred 摇匀(与 TBE 1:10000),加入板上,排除气泡,放入梳子,静置。垂直拔出梳子,倒入 TBE 使之没过所有孔,上样,注意每行预留 Marker 位置,加样完成后,120 V 跑胶。