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miRNA测序概述及实验分析流程.pdf

上传人:精品资料 文档编号:8588196 上传时间:2019-07-04 格式:PDF 页数:4 大小:334.31KB
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1、中国测序论坛 miRNA测序概述及实验分析流程一 、 microRNA测 序概 述MicroRNAs( miRNAs)是 在真 核生 物中 发现 的一 类内 源性 的具 有调 控功 能的 非编 码 RNA,其 大小 长约 2025个核 苷酸 。 成熟的 miRNAs是由 较长 的初 级转 录物 经过 一系 列核 酸酶 的剪 切加 工而 产生 的, 随后 组装 进 RNA诱导 的沉 默复 合体 ,通 过碱 基互补 配对 的方 式识 别靶 mRNA, 并根 据互 补程 度的 不同 指导 沉默 复合 体降 解靶 mRNA或者 阻遏 靶 mRNA的翻 译 。 最近 的研 究表 miRNA参与 各种 各

2、样 的调 节途 径, 包括 发育 、病 毒防 御、 造血 过程 、器 官形 成、 细胞 增殖 和凋 亡、 脂肪 代谢 等等 。microRNA(miRNA)是一 种大 小 约 21 23个碱 基的 单链 小分 子 RNA, 是由 具有 发夹 结构 的 约 70 90个碱 基大 小的 单 链 RNA前体 经过 Dicer酶加 工后 生成 , 不同 于 siRNA( 双链 ) 但是 和 siRNA密切 相关 。 microRNA通过 和靶 基因 mRNA碱基 配对 引导沉 默复 合体 ( RISC)降 解 mRNA或抑 制 mRNA的翻 译, 从而 在转 录后 水平 调控 蛋白 表达 (最 新发

3、现 microRNA也能 在转录水 平调 控基 因表 达 ) 。 microRNA在物 种进 化中 相当 保守 , 在动 物 、 植物 和真 菌等 中发 现的 microRNA表达 均有 严格 的组 织特异 性和 时序 性。 microRNA在细 胞生 长和 发育 过程 中起 多种 作用 ,包 括调 控发 育、 分化 、凋 亡和 增殖 等。目前 研究 microRNA的方 法主 要是 realtime-PCR、 生物 芯片 技术 以及 第二 代测 序技 术 。 基于 第二 代测 序技 术的 microRNA测序 , 可以 一次 获得 数百 万条 microRNA序列 , 能够 快速 鉴定 出不

4、 同组 织 、 不同 发育 阶段 、 不同 疾病 状态 下已 知和 未知 的 micoRNA及其 表达 差异 ,为 研究 microRNA对细 胞进 程的 作用 及其 生物 学影 响提 供了 有力 工具 。中国测序论坛 二、 microRNA测序技术特点1.高灵 敏度 :理 论上 可以 检测 单个 细胞 中一 个拷 贝的 microRNA;2.高精 度: 可以 检测 microRNA单个 碱基 的差 异;3.不受 先验 信息 的干 扰, 既能 鉴定 已知 microRNA,又 有能 力发 现新 的 microRNA;4.保留 定向 信息 ,用 于链 特异 的表 达分 析;5.利用 Barcode在单 次运 行中 经济 地分 析多 个样 品。三、 miRNA测序实验技术路线中国测序论坛 四、 microRNA测序数据分析技术路线中国测序论坛 五、 microRNA测序数据可研究的方面1.差异表达的 microRNA基因,2.可做分型的 microRNA基因,用于诊断疾病3.新的 microRNA发现4.(欢迎补充。)来源于: htp:/

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