1、 自然保护区生物标本数据汇交规范2007-10-20(草案)2目 次前 言 21 范围 22 规范性引用文件 23 汇交数据内容及规范 23.1 汇交内容 23.1.1 共性信息 .23.1.2 规范个性信息 .33.1.3 自然保护区信息 .43.2 汇交规范 44 数据汇交形式 64.1 数据存储及命名 64.2 数据上报方式 64.3 上报周期 65 汇交程序及要求 75.1 汇交流程 75.2 汇交要求 86 汇交数据审核 87 汇交数据管理 88 汇交责任人的权利和义务 9参 考 文 献 .93自然保护区生物标本数据汇交规范1 范围本标准规定了自然保护区标本标准化整理、整合及共享试点
2、项目各成员单位生物标本数字化内容以及上报数据要求;本标准适用项目内部数据管理、汇交及共享;2 规范性引用文件GB/T 1.1-2000 标准化工作导则自然科技资源共性描述规范试行稿GB/T 12404 单位隶属关系代码GB/T 14529-93 自然保护区类型与级别划分原则3 汇交数据内容及规范上报数据的内容体系是数据共享的基础,同时考虑自然保护区生物标本数据的特点、e-平台上报数据要求以及各子项目现有数据的内容特点等各方问题,确定如下汇交内容。3.1 汇交内容3.1.1 共性信息共性信息主要是为满足e-平台上报数据要求而设计的。序号 描述符 说明1 平台资源号 国家自然科技资源 e-平台统一
3、生成的资源编号2 中文名称 以“三志”上的名称为主要依据4 种本名/种加词 生物标本的拉丁种本名/种加词7 种下名称 生物标本的种下名称3 属名 生物标本的拉丁属名10 科名称 生物标本的拉丁科名11 采集地点(省) 生物标本采集地所属省份12 国家 生物标本采集地所属国家名称13 资源归类编码国家自然科技资源平台资源分级归类与编码标准中的编码14 描述 主要(区别)特征/特性的描述15 生境 生物标本采集生境16 寄主 菌物、无脊椎动物、昆虫和植物的寄主,以及植物的附生和腐生17 图像 生物标本的图像信息4序号 描述符 说明19保存单位及其标本馆生物标本的保存单位名称,为单位的正式全称和标本
4、馆的名称20 标本馆代码 可选用标本馆的国际/国内标准代码21 采集人 生物标本采集人22 采集时间 生物标本的采集时间(年、月、日)23 采集号 采集生物标本时附给的采集号码24 标本号或台纸号 生物标本入库时所附给的号码/流水号,如动物和菌物的标本号,植物的台纸号25 鉴定人 对该生物标本所属物种名称进行鉴定的人26 鉴定时间 对生物标本名称进行鉴定的时间27 标本属性 是否为模式标本28 保藏方式生物标本保存的方式:干制标本、玻片标本、液浸标本、针插标本、假剥制标本、剥制标本、皮张标本、骨骼标本、头骨标本、腊叶标本等29 实物状态 生物标本实物的状态。如完整、受损、严重受损、无实物等30
5、 共享方式公益性共享、公益性借用共享、合作研究共享、知识产权性交易共享、资源纯交易性共享、资源租赁性共享、资源交换性共享、收藏地共享、行政许可性共享等31 获取途径 邮件、现场获取、网上订购、其他等32 联系方式 联系人、单位、邮编、电话、E-mail 等3.1.2 规范个性信息针对自然保护区生物标本资源数据的特性,除e-平台的上报数据要求外,项目又添加了如下信息。序号 描述符 说明33 保护区名称 生物标本采集所属的自然保护区34 纬度 标本产地之纬度35 经度 标本产地之经度36 海拔 标本产地之海拔,允许给一个范围37 植被类型 标本采集地的植被类型38 性别 动物的性别,除之外,如为多
6、个个体,或难以辨认,则记录“” ;社会性昆虫的工蜂、工蚁记录“工”5序号 描述符 说明39 年龄 采集标本时个体的年龄或虫龄(植物标本不填)3.1.3 自然保护区信息由于本项目要求所有数据都来源于全国各自然保护区所采集的标本,因此上报单位应填写标本来源地保护区的基本情况。序号 描述符 说明1 保护区代码 根据项目提供的保护区编码规则填写2 保护区中文名 全国保护区名录中对应的保护区名称3 保护区英文名 保护区名称对应的英文名4 级别 保护区现在的级别,GB/T 14529-93 自然保护区类型与级别划分原则中规定的级别5 类型 GB/T 14529-93 自然保护区类型与级别划分原则中规定的类
7、型6 面积 整个保护区的面积,单位公顷7 保护对象 保护区中主要的保护对象8 范围 经纬度范围9 行政区划 保护区所属的行政地区(具体到省)10 人员编制 保护区现有的人员11 批建时间 批建保护区的时间,具体到年12 核心区面积 单位公顷13 缓冲区面积 单位公顷14 实验区面积 单位公顷15 联系人 具体联系人的姓名16 联系电话 联系电话17 通讯地址3.2 汇交规范3.2.1 内容规范在数据库中上述汇交内容存放的是中文说明。资源提供者最好也是中文说明。如果是代码,需提供代码说明表。标本信息汇交规范 保存单位及其标本馆:非空 中文名:非空 纲:非空 目:非空 科:非空 属:非空6 采集时
8、间:非空,匹配模式按照 YYYYMMDD,即:“年月日”的顺序来填写。同时小于录入时的系统当前时间 2006-8-14 采集地:非空 保护区名称:非空,根据自然保护区编码规范填写标准保护区代码 省:非空,省/直辖市名称:北京市,天津市,河北省,山西省,内蒙古自治区,辽宁省,吉林省,黑龙江省,上海市,江苏省,浙江省,安徽省,福建省,江西省,山东省,河南省,湖北省,湖南省,省/直辖市名称,广东省,广西壮族自治区,海南省,重庆市,四川省,贵州省,云南省,西藏自治区,陕西省,甘肃省,青海省,宁夏回族自治区,新疆维吾尔族自治区,台湾省,香港特别行政区,澳门特别行政区,不详。注:新增记录按上表的标准填写,
9、旧记录保留原来字段的值即可。 国家:新增记录按照国际通用惯例填写,如:中国、美国。旧记录保留原来字段的值即可。 鉴定时间:小于录入时系统当前时间,可以为空 经度:可以为空,匹配模式: E1234654或者 E1234654.1;首字母只能 E 或 W,度值小于等于 180,分值小于 60,秒值小于 60,只能在秒位上有小数点,精确位数不限;最大 180 纬度:可以为空,匹配模式:N542443或者 N542443.1;首字母只能 N 或 S,度值小于等于 90,分值小于等于 60,秒值小于 60,只能在秒位上有小数点,精确位数不限;最大 90 海拔:可以为空,单位是米小于等于 8000 米保护
10、区信息: 保护区中文名:非空 级别:非空 类型:非空 总面积:单位:公顷,非空 保护对象:非空 范围:非空 行政区划:非空 人员编制:非空,整型数 批建时间:非空 匹配模式 2006-8-1 2006-11-13 小于录入时的系统当前时间 2006-8-14 核心区面积:单位:公顷,非空,小于总面积 缓冲区面积:单位:公顷,非空,小于总面积 试验区面积:单位:公顷,非空,小于总面积 联系人:非空 联系电话:非空,匹配模式:010-12345678 、010-1234567、 0371-12345678、0371-1234567 通讯地址:非空标本馆联系方式: 标本馆代码:非空 联系人:非空 联
11、系地址:非空 邮编:非空,六位阿拉伯数字7 电话:非空,匹配模式 010-12345678、 010-1234567、 0371-12345678、 0371-1234567; Email:非空,匹配模式 3.2.2 复选属性值填写格式所有复选值的字段值用“;”分割(中文分号) 。3.2.3 图像文件要求存成JPG的格式上报图片文件命名可以随意,最后统一,同时可以保留统一后的名称和原始名的对应关系。3.2.4 没有值的字段在此类字段上不输入任何字符,请不要用空格或者其它任何字符表示。3.2.5 保密字段如果字段为保密信息,在此类字段上需要填写“保密”两个字,以便与没有值的字段相区别。3.2.6
12、 具有计量单位的字段若规范中有要求,请依据规范中要求的单位填写数值,如果不一致,请按照规范中单位的要求修改数值。如高度:规范单位为米,如果资源单位的数据中单位是英尺,请换算为米后上报。4 数据汇交形式子项目参加单位应根据自己单位所承担的任务,按照任务书规定的数量、类群和时间上报数据和照片。4.1 数据存储及命名子项目成员单位一律使用项目开发的统一标本信息录入模板完成标本数字化工作,各单位尽量按照分别自然保护区-动植物-科-属-种的方式录入及存储标本信息,这样便于文件数据的管理和维护;同时每个XML文件包含的标本分数应不超过20份,否则文件量太大,对下一次文件的打开和修改造成困难。4.2 数据上
13、报方式数据信息上报,时以 XML文档的形式上报。上报方式各成员单位根据自己的实际情况可采用FTP上报、Email或光盘介质等各方式。4.3 上报周期数据上报周期按季度计算,每季度末上报一次数据。85 汇交程序及要求5.1 汇交流程保护区用户在线填写文件名管理员检查数据文件完整性合格数据导入SQL库专家逐条检查数据保护区用户检查或修改文件不合格 保护区用户在线修改记录不合格记录专家重新检查 提供在线查询等服务合格提交数据保护区完成数据后在线提交或FTP方式或其他方式合格图 1 数据汇交流程数据汇交流程如图1所示,首先用户选择数据上报方式,上报数据;第二步在线填写数据上报说明(通知管理员数据已经上
14、报) ,此时文件默认状态为空,说明数据待检查。第三步管理员接到通知后,检查状态为空的数据文件的完整性,如果数据合格,将文件状态变更为“待入库” ;如果不合格,将文件状态变更为“待修改” ,然后将修改信息反馈给数据上报单位;用户在线确认需要修改的文件,文件状态变更为“作废” ;之后用户检查或修改文件后,更换新的文件名,重新上报;管理员继续检查,如果合格将文件状态变更为“待入库” ,否则重复上述修改过程。第四步,数据库管理人员将数据文件状态为“待入库”的数据导入数据库。第五步,行业专家对数据库数据逐条审核,将内容有错误的记录进行标记。管理员通知上报数据单位,在线修改错误数据。重新填写95.2 汇交
15、要求上报的所有电子化材料、数据和照片须刻录在光盘上。为防止因各种因素光盘出现意外损坏,同样内容须分别刻录2-3套不同光盘上报,各套光盘应分别封装,并在每张光盘封套上注明此盘所含内容及起止点。各课题不得重复使用同一数据,不能将已上报过的数据再次上报;同样,照片也不得重复使用,一个标本已经使用过的照片,不得于下次上报新数据时再次使用,或改变名称用于另一标本上报。6 汇交数据审核各课题在向项目汇交数据之前,应当对数据的完整性和真实性进行审查。审核事项包括以下几个方面: 数据是否齐全 数据加工是否符合形式要求 数据是否符合保密规定 数据是否符合规定的质量要求 数据汇交计划的执行情况 数据是否具有科学价
16、值和使用价值等。对照合同中的必填项和需尽可能完善的数据项,一一进行各重要字段是否为空的筛查;对于漏填的要进行补填,对于尚有可能考证的应尽可能考证,对于属必填项又确实无法填写的可在上报数据时附简短的文字说明。仔细核对每一上报的物种是否都已具备相关的图象,对于漏拍的要及时补拍,对于现阶段实在无法完成图象采集的,应附文字说明原因,且所占比例应小于1/10。刻录光盘,同时检查光盘上的数据是否保持完好及能否正常运行,然后通过特快专递等形式上报。7 汇交数据管理各项任务必须按任务书保质保量完成,参加单位一旦签订任务书,不得以任何原因为由减少或变相减少所承担的任务。数据信息真实可靠,照片清晰。数据内容应符合
17、数据整理要求,不得擅自改动数据字段所含内容,必填字段都应按规定填写;照片无论从像素、质量、内容以及保存格式等方面,均须符合相应规定。要切实保证物种、标本、照片能够对应,每个物种应有对应的标本和照片。所有录入数据应与实物相对应。10课题参加单位所整理的原始数据、照片为各参加单位所拥有,并由各课题参加单位自行保存,参加单位所上报的数据及照片报至项目主持单位,仅表明该参加单位对所承担课题的完成程度,不代表数据所有权的转移。项目主持单位未征得参加单位同意的前提下,不得为非本项目之外的目的,以任何形式使用、传播或与他人共享该上报光盘的照片数据,不得将涉及该光盘照片数据成果的内容流传出去。如出现以上条例之
18、外的情况,由项目主持单位负责人与参加单位负责人协商解决。8 汇交责任人的权利和义务保护区标本数据汇交责任人对汇交的数据享有发表权、署名权、修改权、保护数据完整权、使用权等。数据汇交责任人应当承担的义务:按照汇交的程序、期限汇交数据;对汇交数据的完整性、真实性和质量负责;对涉密的数据负有保密义务。参 考 文 献1 黄鼎成,郭增艳(主编).科学数据共享管理研究,北京:中国科学技术出版社,2002.11.1. 2 曹彦荣,毕建涛.基于元数据的科学数据汇交研究 . 测绘科学, 2005,30(6):71-73.3 林丹红等.中医药实验性研究课题科学数据汇交探讨.科技管理研究,2006(11):125-1274国家科技部国家科技计划项目科学数据汇交暂行办法(草案)http:/ 蔡佳男,耿庆斋.水利科学数据共享汇交体系探索与构建. 中国水利水电科学研究院学报,2006,4(1):31-35,46.