1、第二章总结 基因的概念，基因的形式 DNA 的一级结构、二级结构、高级结构 DNA 复制的基本概念和法则、复制相关的酶、蛋白质 真核生物、原核生物 DNA 复制的基本过程及其调控 复制的方式（线性、环状 DNA） DNA 的损伤类型与修复 DNA 的重组、同源重组的过程、相关酶、应用 DNA 的转座与返座、真核生物原核生物转座元的种类 转座的机制、遗传学效应等Question:1 名词：基因、基因组、C 值、C 值矛盾、splicing gene、 exon、 intron、 DNA 的呼吸现象、转座元、返座元、 nick translation、replisome、DNA 复制、基因敲除、转
2、座子标签、pseudogene（假基因） 、klenow酶2 简述 DNA 复制的基本法则及复制过程中涉及的酶和蛋白质（以 E.coli 为例） 。3 基因有哪些存在形式、真核生物 DNA 序列有哪些种类？4DNA 超螺旋的计算。5 简述线性和环状双链 DNA 复制的方式。6 试说明 DNA 损伤的类型及其修复机制。7DNA 重组的种类、同源重组的基本过程、相关的酶及其功能。8 简述原核及真核生物转座元的种类及其结构。9 果蝇杂种败育的机理。10 转座元的应用及其遗传学效应。11 生理状态下 DNA 有哪些二级结构，其特点如何？12 简述顺反实验的基本原理及其应用。第三章3.1. Basic
3、concept（转录的基本原则；转录复制的比较）3.2. Trancription survey（转录的基本概况过程、RNApol）3.3. Promoter in Eukaryotes and Prokaryotes（promoter 结构，及各部分的作用；原、真核生物的比较）3.4. Transcription Termination（终止子结构、种类；抗终止作用；极性效应等）3.5. Pre-RNA processing in Eukaryotes（加工rRNA 、tRNA 、hnRNA 的加工；原、真核生物 mRNA 的比较）Question:1 名词：trans splicing 、
4、alternative splicing、 enhancer、 terminator、 promoter、S-D sequence、read through、gRNA、RNA editing、Ribozyme2 转录的基本过程，试比较生物体复制与转录的异同3 原核生物 RNApol 的基本构成及各亚基的功能4 真核生物 RNApol 的种类及各自的转录产物5 原核生物一般的 gene promoter 结构特点及各部分的功能6 真核生物启动子的种类与各自的结构7 终止子种类及异同；终止机制如何？8 极性效应的产生机理9 真核生物、原核生物 mRNA 的异同10 真核生物 hnRNA 加工的种类
5、11RNA splicing 的基本机理（三种）第四章4.1 genetic codons遗传密码的特性、密码子偏爱、密码子配对的摆动性、mRNA 的突变4.2 Translation systemtRNA：结构、校正突变、氨基酸的活化Ribosome：构成组分、活性部位及其功能mRNA：结构4.3 Translation mechanism多肽合成的基本过程原核生物多肽合成的机制：定点起始、延伸、终止真核生物：滑动搜索、起始、延伸、终止4.4 Peptide processing & folding蛋白质的运输：翻译后转运（导肽、NLS、NES） 、共翻译转运（信号肽）蛋白质加工：非功能片断
6、切除、修饰、剪接等蛋白质折叠：折叠机制、分子伴侣、PCD 等思考题1.名词：密码子家族、同功 tRNA、同义密码、错义突变、密码子、 无义突变、同义突变、渗漏突变、S-D 序列、Kozake 序列、 ORF、 molecular chaperone、多核糖体、蛋白质剪接、intein、extein2.遗传密码的特性3.蛋白质中稀有氨基酸的形成方式有哪些？4.叙述发生在氨酰 tRNA 合成酶上的两个反应。5.叙述蛋白质合成三个阶段的主要事件6.试比较真核生物、原核生物翻译过程中的异同（起始方式、涉及的蛋白质因子的作用、起始氨酰tRNA 等） 7.判断下列过程发生在蛋白质合成的哪个阶段/A 核糖体
7、亚基与 mRNA 结合B 多肽被正确合成C 核糖体沿着 mRNA 移动D 核糖体解离成亚基 8.估计一下原核生物中合成 200 个 AA 需要多少个 ATP 和 GTP？9.翻译因子中 GTP 的作用 10.举例说明翻译后的氨基酸修饰 11.SD 序列和 30S 亚基的配对为原核提供了识别起始密码子和 Met 密码子的机制，那么真核如何办呢？12. 描述 SRP 的结构和功能13.假设一个典型的分泌蛋白要被分泌到胞外，描述一下细胞内的加工过程。 14.要用一个多肽的一级结构来预测它的高级结构，主要的困难和问题在那里？15.叙述分子伴侣在蛋白质折叠中的作用。16. 保证准确翻译的关键是什么？氨基
8、酸与 tRNA 的特异性结合依靠氨酰 tRNA 合成酶的特异识别作用。密码子与反密码子特异结合，依靠互补碱基配对结合实现，也有赖于核糖体的构象正常而实现正常的装配功能。17.真核生物蛋白质主要有哪些去向？其转运方式有哪些，基本过程如何？18.胰岛素的加工步骤如何？19.mRNA 的结构如何影响翻译的调控20. 简述蛋白质剪接的基本过程及其应用。 21. （综合）如果得到一个真核生物的基因的 ORF，现需要在大肠杆菌中表达，为达到最佳的表达效率，应考虑对该 ORF 做哪些改造？如果是原核生物基因在真核表达体系中表达呢？（如 B.T 杀虫蛋白在棉花中表达） 22.蛋白质折叠的研究有哪些意义？第五章
9、总结：1 原核生物表达调控： 操纵元模型结构、功能、种类及相关概念 各种操纵元的调控方式乳糖、半乳糖、色氨酸、ara 等 转录后调控严谨反应、翻译起始的调节、反义 RNA、翻译产物的自我调节等 转录调节中 sigma 因子的作用2、真核生物表达调控 DNA 水平的调控甲基化及其效应、活性染色体特点、结构等 反式作用因子的结构、DNA 结合结构域的结构 RNA 水平的调控RNAi、NMD、ncRNA 的种类及其作用 基因与疾病癌症的发生机理及相关基因、基因治疗的原理、流程等思考：1、名词解释cis-acting element,trans-acting factor housekeeping g
10、ene,luxury gene,Gratuitous inducer ,inducer,operon,repressor,Corepressor,attenuater,癌基因,抑癌基因,RNAi,gene imprinting,肽核酸(PNA),micRNA,严谨反映,空转反应,互补,regulon,本底组成型表达,LCR,insulator2、下列哪项不是真核生物基因结构的特点A、庞大 B、分散 C、有内含子 D、90% 以上 DNA 序列编码蛋白质3、属于顺式作用元件的是内含子 启动子 外显子 增强子4、关于操纵元的正确叙述是操纵子是一个转录单位，全部 DNA 序列均可被转录 RNA 聚合
11、酶与启动子结合 RNA 聚合酶与操纵基因结合 操纵基因控制 RNA 聚合酶是否通过5、葡萄糖/乳糖共同存在时，细菌优先利用哪一种糖，为什么？6、lac -O 存在哪些调控方式？其调节基因的效应物分子是什么？7、试以 lac-O 为例说明什么是顺式作用元件和反式作用因子；该操纵元在基因工程上有什么应用？8、根据调节蛋白和效应物分子对操纵元转录的作用可分为哪些种类？说明调节蛋白与效应物分子在不同类型的操纵元中的作用。9、操纵元的结构与各部分的功能。10、真核生物活跃转录染色质的结构特点如何？11、甲基化对真核生物 DNA 的转录活性有什么效应？12、简述 RNAi，RNAi 的作用特点如何？RNA
12、i 的研究有什么意义？13、癌症发生学说有哪些？14、基因治疗的基本原理如何？试说明其基本流程，及操作中应注意的问题。15、试举例说明真核生物个水平的基因表达调控16、转录因子由哪两部分构成？17、反式作用因子的 DNA 结合结构域有哪些结构？18、组蛋白的修饰有哪些？19、RNA 有哪些种类？它们有什么功能？第六章思考：1、名词解释：RFLP、RAPD 、 AFLP、SNP、变性、复性、Tm 值、分子杂交、反向遗传学2、DNA 复性时的影响因素有哪些？3、Tm 值的影响因素有哪些？4、试说明 DNA chip 的基本原理及其应用5、核酸分子杂交的应用及其种类有哪些？6、Southern blot 的基本流程如何？应注意些什么？7、PCR 反应体系有哪些组分？其功能如何？8、PCR 的基本原理是什么？其基本流程如何？9、PCR 有哪些应用？10、DNaseI 足迹法的基本原理如何？其作用是什么？11、试说明酵母双杂合体系的基本原理及其应用。12、DNA Sequencing 的基本方法有哪些，其基本原理如何？
