1、ICS65.020.99 B22备 案 号 : 40457-2014 DB32江 苏 省 地 方 标 准DB32/T 2571-2013鸡 传 染 性 支 气 管 炎 RT-LAMP 诊 断 技 术 规 程Technical code of detecting RT-LAMP for Infectious Bronchitis2013-12-20 发布 2014-01-20 实施江 苏 省 质 量 技 术 监 督 局 发 布DB32/T 2571-2013前 言为 规 范 鸡 传 染 性 支 气 管 炎 RT-LAMP诊 断 技 术 规 程 , 提 高 鸡 传 染 性 支 气 管 炎 病 毒
2、检 测 的 灵 敏 度 、 稳 定 性 、 特 异 性 , 特 制 定 本 标 准 。本 标 准 按 GB/T 1.1-2009 标 准 化 工 作 导 则 第 1部 分 : 标 准 的 结 构 和 编 写 要 求 编 写 。 本 标 准 的 附 录 为 规 范 性 附 录 。本 标 准 由 江 苏 省 农 业 科 学 院 提 出 。 本 标 准 起 草 单 位 : 江 苏 省 农 业 科 学 院 。 本 标 准 起 草 人 : 刘 宇 卓 、 李 银 、 黄 欣 梅 、 赵 冬 敏 、 韩 凯 凯 、 张 敬 峰 。DB32/T 2571-20131鸡 传 染 性 支 气 管 RT-LAMP
3、 诊 断 技 术 规 程1 范围本 标 准 规 范 了 鸡 传 染 性 支 气 管 炎 RT-LAMP诊 断 技 术 所 用 引 物 大 小 、 所 涉 及 的 样 品 范 围 、 操 作 流 程 、 反 应 条 件 等 技 术 标 准 。本 标 准 适 用 于 鸡 传 染 性 支 气 管 炎 的 实 验 室 诊 断 、 临 床 诊 断 、 流 行 病 学 调 查 、 分 离 毒 株 的 鉴 定 。2 规 范 性 引 用 文 件下列文件对 于本文件 的应用是 必不可少 的 。 凡是注 日 期的引用文 件 , 仅注日 期的版本 适用于本 文件。 凡 是 不 注 日 期 的 引 用 文 件 , 其
4、 最 新 版 本 ( 包 括 所 有 的 修 改 单 ) 适 用 于 本 文 件 。GB 16548-2006 病 害 动 物 和 病 害 动 物 产 品 生 物 安 全 处 理 规 程GB/T 23197-2008 鸡 传 染 性 支 气 管 炎 诊 断 技 术NY/T 541-2002 动 物 疫 病 实 验 室 检 验 采 样 方 法3 主 要 试 剂 和 仪 器3.1 DNA Marker DL-20003.2 6xLoading buffer3.3 Bst DNA Polymerase3.4 MgSO43.5 DEPC3.6 Betaine3.7 lO XThermoPol buff
5、er3.8 异丙醇3.9 无 水 乙 醇3.10 琼 脂 糖3.11 核 酸 染 料3.12 氯仿3.13 电 泳 仪3.14 电 热 恒 温 水 槽4 引物按 照 GenBank上 公 布 的 鸡 传 染 性 支 气 管 病 毒 ( IBV) 衣 壳 蛋 白 M基 因 序 列 保 守 区 域 , 应 用 在 线 LAMP primer designing software PrimerExplorer设 计 一 套 引 物 , 序 列 如 下 :F3: 5 一 AAGGATTTGGCCCTCGTA一 3; FIP: 5 一 TGTAACACGCCCATCATAATTCCTAAGAAGGGAA
6、ATTTTGGTGAT一 3; BIP: 5 一 CTCATGCTTGTCTTTTTGGAAGTAGCAGTAGTAAATTCAAATCTAAGGTG一 3 ; B3: 5 一 CTGCGGGTCATCTCTAGG一 3。DB32/T 2571-20132ddH20溶 解 成 25Pmo1/ul后 分 装 , 一 20 冰 箱 保 存 备 用 。5 临床诊断按照GB/T 2 3197-2008鸡 传 染 性 支 气 管 炎 诊 断 技 术 方 法 进 行 临 床 诊 断 。6 采 样 和 样 品 的 处 理6.1 病 料 的 采 集 及 处 理按照NY/T 541-2002动 物 疫 病 实
7、验 室 检 验 采 样 方 法 , 采 集 病 料 后 , 于 0 4 冷 藏 保 存 并 立 即 送 检 , 采 样 过 程 中 样 品 不 得 交 叉 污 。6.1.1 对 于 急 性 呼 吸 道 的 病 鸡 , 采 集 分 泌 物 , 对 于 刚 扑 杀 的 鸡 , 则 采 取 支 气 管 和 肺 组 织 。6.1.2 对 于 肾 型 和 产 蛋 下 降 型 的 病 鸡 , 应 采 取 发 病 鸡 的 肾 脏 及 输 卵 管 。6.2 样 品 的 处 理取 无 菌 采 集 支 气 管 、 肺 或 者 是 肾 脏 、 输 卵 管 等 组 织 , 置 研 钵 中 剪 碎 并 研 磨 , 反
8、复 冻 融 三 次 , 将 研 磨 好 的 组 织 以 4 12000 rpm/min 离心10 min, 取 上 清 200 L备 用 。 或 者 经 过 鸡 胚 接 种 后 的 尿 囊 液 200 L 备用。7 RT-LAMP7.1 RNA 的 提 取取已处理的 待检样品 , 以IBV 阳性病毒 为阳性 对照, 以 无菌水为阴 性对照 , 每管依 次加入Tri zol 600L, 振 荡 混 匀 后 , 室 温 放 置 10 min, 加 入 氯 仿 200 L, 剧 烈 振 荡 后 , 室 温 放 置 1 min, 4 12000 rpm, 离心15 min, 取 上 层 水 相 750
9、 L, 加 入 500 L异 丙 醇 , 混 匀 , -20 放 置 15 min, 4 10000 rpm离 心 10 min, 去 上 清 , 缓 缓 加 入 75 %乙 醇 1 mL洗 涤 , 4 8000 rpm离 心 5 min, 去 上 清 , 室 温 干 燥 20 min,加入 DEPC水10 L, 使 充 分 溶 解 。 或 使 用 RNA提 取 试 剂 盒 进 行 提 取 。7.2 反 应 条 件FIP引物1.2 L, BIP引 物 1.2 L、 F3引 物 0.15 L、 B3引 物 0.15 L、 Bst DNA poLymerase2 L、 lO XThermoPol
10、buffer 2.5 L、 100 mmol/L MgSO4 1.5 L、8 mmol/L Betaine5 L、 10 mmol/L dNTPs4 L、 RNA酶 抑 制 剂 0.5 L、 RNA模 板 2 L、 反 转 录 酶 1.0 L、 ddH2O 4.8 L, 总 体 积 为 25 L, 瞬 间 离 心 混 匀 。 60 水浴60 m in, 80 灭 活 10 min, 4 保 存 。7.3 RT-LAMP 试 验 结 果 观 察 及 判 定下 述 方 法 任 取 其 一 :7.3.1 电泳7.3.1.1 取 RT-LAMP反 应 产 物 8 10 L于 1.0 %琼 脂 糖 凝
11、胶 进 行 电 泳 , 电 压 为 120 V, 时 间 30 40 min, 紫 外 灯 下 观 察 结 果 , 并 进 行 拍 照 。7.3.1.2 以 阳性 IBV液作为阳 性对照, 以灭 菌水作 阴 性对照 , 做RT-L AMP,所有 反应产物 同时电泳。 在阳 性对照有梯 状目的条 带, 阴性对 照无条带 的情况下 , 检 测样品出现 与阳性对 照相同梯 状条带的 判为阳性 , 即该样品的I BV核酸呈 阳性; 检 测样品未 出现与阳 性对 照相同目的 条带的判 为阴性, 即 该样品 为 IBV核酸 阴 性 。 如 果 阳 性 对 照 无 相 应 的 目 的 条 带 , 或 者 阴
12、 性 对 照 出 现 条 带 , 结 果 均 无 效 , 该 试 验 需 要 重 做 。DB32/T 2571-201337.3.2 显 色 反 应7.3.2.1 在 每 个 RT-LAMP反 应 管 内 加 入 荧 光 染 料 SYBR Green I 0.5 L, 旋 涡 混 匀 , 肉 眼 观 察 颜 色 变 化 。7.3.2.2 加 入 核 酸 染 料 后 5 10 min进 行 显 色 判 定 。 肉 眼 观 察 反 应 管 , 当 阳 性 对 照 管 液 呈 现 绿 色 , 阴 性 对 照 管 液 呈 现 橘 黄 色 时 , 说 明 染 料 正 常 , 显 色 反 应 成 立 ,
13、可 以 进 行 其 它 样 品 的 判 定 , 否 则 , 显 色 反 应 无 效 。 其 它 样 品 , 如 反 应 管 中 液 体 呈 绿 色 时 , 该 样 品 即 可 判 定 为 IBV核 酸 阳 性 , 呈 橘 黄 色 时 判 定 为 IBV核 酸 阴性。8 结果判定8.1 临 床 诊 断当 鸡 出 现 与 第 5 条 相 符 临 床 表 现 , 可 以 初 步 诊 断 为 鸡 传 染 性 支 气 管 炎 。8.2 实验室 RT-LAMP 结 果 的 判 定同 7.3。8.3 诊 断 结 果 判 定根 据 临 床 诊 断 可 以 初 步 判 定 为 鸡 传 染 性 支 气 管 炎 的
14、 病 例 , 结 合 实 验 室 RT-LAMP检 测 结 果 , 当 鸡 传 染 性 支 气 管 炎 病 毒 检 测 为 核 酸 阳 性 时 , 即 可 将 该 病 例 诊 断 为 鸡 传 染 性 支 气 管 炎 。DB32/T 2571-20131附录 A (规 范 性 附 录 ) 阳 性 样 品 的 制 备A.1 毒株鸡 传 染 性 支 气 管 炎 病 毒 阳 性 毒 株 。A.2 制备取 已 知 保 存 阳 性 毒 株 , 用 灭 菌 生 理 盐 水 作 1:50 100 倍 稀 释 , 接 种 1011 日龄 SPF 鸡 胚 尿 囊 膜 , 0.1 mL/枚 。 置 37 恒 温 箱 继 续 培 养 , 每 天 照 蛋 观 察 3 次 。 弃 去 24 h 前 死 亡 胚 , 无 菌 收 获 4896 h 死 亡 胚 及 活 胚 尿 囊 液 , 12000 g 离心 10 min, 吸 取 上 清 分 装 到 1.5 mL 离 心 管 中 , 每 管 200 L, -20 保 存 , 备 用 。