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生物蛋白纯化论文.doc

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1、江苏农林职业技术学院毕业论文(设计)2Cement protein 的转化表达优化与纯化摘要:本实验将含有Cement protein基因片段的重组载体pCold TF转化入E.coli BL21(DE3)中, 在摇瓶培养的条件下,细胞中融合蛋白的含量达到 60%以上;然后利用包涵体处理、复性、Ni-IDA亲和层析的方法纯化蛋白。使用2.4L的菌液, 经诱导、 纯化、复性后大约可以得到10mg的蛋白;同时采用ELISA检测法,证实了纯化的SPG有很高的活性。关键词:融合蛋白的表达;Ni-IDA 亲和层析。Abstract:In this study, containing Cement pro

2、tein fragment pCold TF recombinant vector was transformed into E.coli BL21 (DE3), in shake flask culture conditions, cell protein content above 60%; Then inclusion treatment, renaturation, Ni-IDA affinity chromatography purified protein. Use 2.4L of bacteria, by induction, purification, can be refol

3、ded about 10mg of protein; the same time by ELISA assay, confirmed the purification of the SPG has high activity.Keywords: protein expression; Ni-IDA affinity chromatography.江苏农林职业技术学院毕业论文(设计) 1目 录1 引 言 12 材料及方法 12.1 材料和试剂 12.1.1 菌株与质粒 12.1.2 主要试剂 12.1.3 主要仪器 12.2方法与步骤 12.2.1 重组质粒的转化 12.2.2 转化子的筛选与鉴

4、定 12.2.3 Cement protein 的纯化 12.2.4 ELISA 检测活性: 13 结果与分析 23.1 Cement protein 的诱导表达: 23.2 Cement protein 的分离纯化: 33.3 ELISA 检测的结果: 33.4 成品包装 34 结论 3参考文献 3致谢 5江苏农林职业技术学院毕业论文(设计)21 引言 1亲 和 层 析 的 原 理 是 : 生 物 分 子 间 存 在 很 多 特 异 性 的 相 互 作 用 , 它 们 之 间 都 能够 专 一 而 可 逆 的 结 合 , 这 种 结 合 力 就 称 为 亲 和 力 。 亲 和 层 析 就 是

5、 通 过 将 具 有 亲 和 力的 两 个 分 子 中 一 个 个 固 定 在 不 溶 性 基 质 上 , 利 用 分 子 间 亲 和 力 的 特 异 性 和 可 逆 性 ,对 另 一 个 分 子 进 行 分 离 纯 化 。 被 固 定 在 基 质 上 的 分 子 称 为 配 体 , 配 体 和 基 质 是共 价 结 合 的 , 构 成 亲 和 层 析 的 固 定 相 , 称 为 亲 和 吸 附 剂 。 亲 和 层 析 时 首 先 选 择 与 待分 离 的 生 物 大 分 子 有 亲 和 力 的 物 质 作 为 配 体 , 并 将 配 体 共 价 结 合 在 适 当 的 不 溶 性 基质 上

6、。 将 制 备 的 亲 和 层 析 剂 装 柱 平 衡 , 当 样 品 溶 液 通 过 亲 和 层 析 柱 的 时 侯 。 待分 离 的 生 物 分 子 就 与 配 体 发 生 特 异 性 结 合 , 从 而 留 在 固 定 相 上 ; 而 其 它 杂 质 不 能 与配 体 结 合 , 仍 在 流 动 相 中 , 并 随 洗 脱 液 流 出 , 这 样 层 析 柱 中 就 只 有 待 分 离 的 生 物 分子 。 通 过 适 当 的 洗 脱 液 将 其 从 配 体 上 洗 脱 下 来 , 就 得 到 了 纯 化 的 待 分 离 物 质 。亲 和 层 析 的 优 点 是 它 分 离 蛋 白 经

7、常 只 需 要 经 过 一 步 处 理 即 可 使 某 种 待 提 纯 的 蛋白 质 从 很 复 杂 生 物 蛋 白 质 混 合 物 中 分 离 出 来 , 而 且 纯 度 很 高 。 此 外 蛋 白 在 纯 化 过 程中 得 到 浓 缩 , 结 合 到 亲 和 配 基 后 , 性 质 更 加 稳 定 , 其 结 果 提 高 了 活 性 回 收 率 。 它 可以 减 少 纯 化 步 骤 , 缩 短 纯 化 时 间 , 对 不 稳 定 的 蛋 白 纯 化 十 分 有 利 。江苏农林职业技术学院毕业论文(设计) 12 材 料2.1 材料和试剂2.1.1菌株与质粒 大肠杆菌BL21(DE3), Ge

8、nscript保藏;表达载体pCold TF,Genscript保藏;pCold TF- Cement protein,Genscript构建 。2.1.2主要试剂 Ni-IDA亲和层析凝胶:Genscript生产;LB 液体培养基(g/L):胰蛋白胨(Tryptone) 10g/L,酵母提取物(Yeast extract) 5g/L,氯化钠(NaCl) 5g/L ,用 NaOH 调节该培养基的 pH 为 7.4;氨卡青霉素溶液:50g/mL;IPTG:0.5mmol/L;Tris-HCl:50mM,PH8.0;蛋白Marker:TIANGEN公司,MP102; 2Lysis Buffer :

9、 50mM Tris-HCl 200mM ;NaCl ;pH8.0;Wash Buffer 1 : 50mM Tris-HCl 200mM ;NaCl ;20 mM 咪唑 ;pH8.0;Wash Buffer 2 : 50mM Tris-HCl 200mM ;NaCl ;50 mM 咪唑 ;pH8.0;Elution Buffer : 50mM Tris-HCl 200mM ;NaCl ;250mM 咪唑 ;pH8.0;洗涤缓冲液 : 150mM PBS,0.5mLTween-20(0.13%),PH7.4;封闭液 : 脱脂奶粉(5%),PBS;蛋白电泳试剂:丙烯酰胺、甲叉双丙烯酰胺、蛋白质分

10、子量标准为上海生工公司产品;丙烯酰胺储备液:30%(w/v)丙烯酰胺,0.8%(w/v)甲叉双丙烯酰胺;丙烯酰胺 29.2 g,甲叉双丙烯酰胺 0.8 g,加蒸馏水至 100 mL,用滤纸过滤后于棕色瓶中 4存放;分离胶缓冲液(1.5 M/L,pH8.8):18.15g Tris(分析纯) ,用 1M/L HCl 调节 pH 至8.8,加水至 100 mL,4存放;浓缩胶缓冲液(0.5 M/L,pH6.8):6g Tris,用 1M/L HCl 调节 pH 至 6.8,加水至100mL,4存放;Tris-甘氨酸电泳缓冲液:6g Tris,28.8g 甘氨酸,2g SDS,加水至 2L;SDS

11、溶液(10%):10g SDS,加水定容至 100mL,完全溶解后室温存放;过硫酸铵溶液(10%):0.1 g 过硫酸铵(分析纯) ,加 1 mL 蒸馏水溶解;5样品缓冲液:0.6mL Tris-HCl 缓冲液(1mol/L,pH 6.8) 、5 mL 50%(v/v)甘油、2 mL 10% SDS、0.5 mL巯基乙醇、1 mL 1%(w/v)溴酚蓝、0.9 mL 蒸馏水。4存放;12%分离胶的配制:蒸馏水 3.5 mL,30%丙烯酰胺储备液 (A 液)4 mL,分离胶缓冲液 (B 液)2.5 mL,10%过硫江苏农林职业技术学院毕业论文(设计)2酸铵 50l,TEMED 5 l;5%浓缩胶

12、的配制:蒸馏水 2.3 mL,30%丙烯酰胺储备液 (A 液)0.67 mL,浓缩胶缓冲液(C 液)1.0 mL,10%过硫酸铵 30l,TEMED 5l;考马斯亮蓝染色液:考马斯亮蓝 R-250 1 g,甲醇 450 mL,冰醋酸 100 mL,蒸馏水 450 mL;脱色液:甲醇200 mL,冰醋酸200 mL,蒸馏水1600 mL。封闭液:5%脱脂牛奶或者20%BSA2.1.3主要仪器PK-8D 型电热恒温水槽 (上海精宏实验设备有限公司)TH2-25 大容量恒温震荡器 (上海欣蕊自动化设备有限公司)JY98-3D 超声细胞破碎仪 (宁波新芝生物科技有限公司)GL21K 高速离心机 (湖南

13、湘仪仪器有限公司)HL-2 恒流泵 (上海沪西分析仪器厂)IHZD-3 紫外检测仪 (上海沪西分析仪器厂)TH-300 梯度混合器 (上海沪西分析仪器厂)5414D 型台式高速离心机 (美国 Eppendrof 公司产品)垂直板状电泳系统(Bio-Rad 公司产品)移液枪(DAIGGER)水浴锅 DK-8D(上海一恒仪器)江苏农林职业技术学院毕业论文(设计) 13 方 法 与 步 骤3.1 Cement protein重组质粒的转化 31)取重组质粒;pCold TF- Cement protein 4l于100l感受态细胞BL21中,冰浴30min;2)42水浴热激90s;3)立即放置冰上冰

14、浴3 min;4)加入600 l 37预热的LB液体培养基,摇床震荡培养30min;5)12000rpm 离心2min,弃400l培养基,剩约200l,混匀菌体,涂布平板(A +),37过夜培养;3.2 Cement protein优化与表达鉴定 41)取5支4mlLB试管培养基分别标记对照、1、2、3。2)其中对照中加入50ul葡萄糖,对照、1、2、3,分别加入4ul A+,从平板中挑取5个白色菌落。分别加入5支试管。3)对照、1、2、37摇床培养,待OD=0.6时,加4ul IPTG,37,诱导培养4h;4)4号试管37摇床培养,待OD=0.6时,加2ul IPTG,15,过夜诱导12h;

15、5)取4只EP管分别标记对照、1、2、3。6)从试管中取200ul菌体,依次加入EP管中。7)11000rpm,4min,4离心4min,去上清。8)沉淀用15l Tris重悬;再加入15l 2Loading Buffer,沸水煮15min,离心,SDS-PAGED 5 电泳检测。3.3 Cement protein可溶性分析1)取4支1.5mlEP管标记1-沉淀、1-上清、3-沉淀、3-上清、取表达鉴定的1号管和3号管菌液分别加入1-沉淀、3-沉淀,5000rpm,3min,离心去上清,沉淀用200ulTris重悬。2)超声破碎冰水浴 6 (间歇时间:3s; 工作时间:3s;全程时间:10m

16、in;) 。3)5000rpm,3min,离心,上清液分别倒入1-上清、3-上清中,1-沉淀、3-沉淀中沉淀用200ulTris重悬,4支EP管各加入200ul2Loading Buffer混匀沸水浴15分钟。4)4支EP管各取8ul进行SDS-PAGE检测。3.4 Cement protein扩大培养1)接种,1%的接种量,接种到4mL液体LB培养基中,30,200rpm,摇床培养过夜,即种子液;2)转接, 4mL的种子液转接到1LLB摇瓶,并向其中加入800l 的A +,37,180rpm 摇床震荡培养4 h; 3)诱导,1L培养基加入400l的IPTG,于15 摇床内,180rpm,过夜

17、诱导12h;江苏农林职业技术学院毕业论文(设计)24)收菌,7000rpm,7min,4离心收集菌体,收集的菌体放于-20备用。3.5 蛋白RAC-22的纯化 73.5.1. 超声破碎:1)1L培养液菌体 用 30mL Lysis Buffer重悬,将菌液置于冰水中,超声破碎(间歇时间:3s; 工作时间:3s;全程时间:15min;) ;3.5.2菌体分离: 81)破碎液11000RPM离心15分钟。取上清。C. Ni柱纯化蛋白1)装柱:将层析柱洗净,用去离子水润洗柱子及管道,用适量的Ni-IDA介质(5ml)装入层析柱中;2)平衡:静置完成后,用Lysis Buffer平衡介质至紫外检测仪示

18、数稳定;3)上样:上清液以1ml/min的速度上样;4)洗杂:上样完成后,先用Lysis Buffer洗涤;而后用Wash Buffer 1洗涤杂蛋白至紫外检测仪数值趋于稳定。并收集样品。标记“20” 。再用Wash Buffer 2洗涤至紫外检测仪数值趋于稳定。并收集样品,标记“50” 。5)洗脱:用Elution Buffer洗脱目标蛋白,当紫外检测仪的示数开始变化后,取20ul加入350ul的G250中观察颜色变化。当有G250由棕色变为蓝色时,开始收集流出液于无菌的塑料瓶中,洗脱直至样品不再使G250变蓝并紫外检测仪示数不再下降。3.5.3透析 9 :1)取2000ml透析液,将洗脱所

19、得的溶液装入透析袋中,4,过夜透析12h, 3.5.4. 蛋白复性:将蛋白稀释至10mg/ml,100ul/ml的速度加入20倍体积的0.1M磷酸盐缓冲液.菌液于 7000RPM,离心20分钟.取上清。 3.5.5. 蛋白浓度和纯度的检测1)蛋白浓度测定,取3mlG250,加入比色皿中。A调100%,T调零。取透析所得的蛋白溶液, 50ul加入3MLG250中混匀,待分光光度计数值不再变化,记录数值。2)电泳检测蛋白纯度,将蛋白电泳图片经专业软件测定蛋白纯度。取样,取10l 电泳。3.6蛋白印记检测(Western blot) 103.6.1电泳1)取样,取10l,SDS-PAGE电泳。3.6

20、.2转膜1)准备4-6张滤纸和1张PVDF膜或NC膜。戴一次性PE手套,避免手上的蛋白污染膜。转膜前,NC膜要置于去离子水中浸泡1 min;PVDF膜应在甲醇溶液中浸泡20 min。2)在转移液里放入转膜用的夹子、两块海绵垫、一支玻棒或滴管、滤纸和浸过的膜。江苏农林职业技术学院毕业论文(设计) 13)取出SDS-PAGE胶将浓缩胶轻轻刮去。将胶在转膜缓冲液中浸泡5分钟左右,以平衡离子强度。4)打开平放底部黑色电极(阴极) ,放一张海绵垫片,擀气泡。于海绵垫片上放置2-3张用转移缓冲液浸泡过的滤纸,逐张叠放,对齐,擀气泡。取出浸在转膜液中的凝胶平放于滤纸上,排除所有气泡。将PVDF膜或NC膜置于

21、聚丙烯酰胺凝胶上,排除所有气泡。在膜上盖上2-3张转移缓冲液浸泡过的滤纸,排除所有气泡。最后盖上另一个海绵垫,放上另一张或几张海绵垫片,盖上阳极板(白色) ,夹紧。保证对凝胶有一定的压力。5)将夹子放入转移槽中。转膜在冰上进行,用磁力搅拌器搅拌。用恒压60V或恒流200mA转移2 h-2 h 30 min。3.6.3转膜免疫反应1 )取膜,将膜正面超上在PBST溶液中摇动五分钟,移至含有封闭液的平皿中,室温脱色摇床上4度静置过夜。 2)取出膜在PBST溶液中洗5分钟,放入含有一抗的PBST缓冲液中,室温下孵育1.5 h后,用PBST在室温下脱色摇床上洗四次,每次5min;3)膜放入含有二抗的P

22、BST溶液中,室温下孵育1.5 h后,用PBST在室温下脱色摇床上洗四次,每次5min;再用PBS洗二次,每次5min,进行化学发光反应。 3.6.4化学发光,显影,定影 1 )将A和B两种试剂(Genscript公司HRP标记的底物)在离心管中上等体积混合,避光保存;用纸巾吸去印迹膜边缘或者边角部分多余的液体,正面朝上置与平整的保鲜膜上,加上以上的A、B混合液2ml,使膜正面与液体充分接触,避光静置3分钟;3min后,用纸巾吸去印迹膜边缘或者边角部分多余的液体,置与另一平整的保鲜膜上,包好,放入X-光片夹中。 2 )在暗室中,将1显影液和定影液各500ml分别到入塑料盘中;在红灯下取出X光片

23、,用切纸刀剪裁适当大小;把X光片放在膜上,关上X-光片夹,曝光3分钟,打开X-光片夹,取出X-光片,迅速浸入显影液中显影,待出现明显条带后,即刻终止显影。立刻将X-光片浸入定影液中,定影10min,用自来水冲去残留的定影液后,室温下晾干。江苏农林职业技术学院毕业论文(设计)24结 果 与 分 析4.1Cement protein的表达鉴定 11挑取菌落至4 mL培养基培养,标记对照、1、2、3,摇床培养当OD 6000.6 时加入4ulIPTG,而后对照、1、2、37诱导4小时,3号试管15过夜诱导12h,离心收集菌体,取样进行SDS-PAGE电泳分析。Cement protein表达鉴定检测

24、图1.1如图所示,根据专业软件对蛋白基因序列分析此融合蛋白大小为58kd。对照组没有58kd处无目的蛋白的表达,1号、2号为37、4h诱导有58kd处明显表达条带。3号为15、过夜诱导58kd处也有明显表达条带。对照 1 2 3 M图1.1 Cement protein 64P-BA1蛋白表达鉴定Lane1:对照 lane2:1 号Lane3:2 号 lane4:3 号Lane5: M100kd75kd50kd32kd25kd15kd江苏农林职业技术学院毕业论文(设计) 14.2Cement protein的可溶性分析取上述1号管3号管菌液400ul分别加入2支EP管中,离心去上清,沉淀用20

25、0ulTris重悬。冰水浴超声破碎。离心,上清液取样电泳,沉淀用200ulTris重悬,电泳。Cement protein可溶性分析检测图3.2如图所示,破碎离心上清和沉淀中58kd处都有明显表达条带,因为蛋白在上清中活性较高,这意味着蛋白正确折叠率高,易与和柱体结合,纯化所得蛋白活性较高。而15、过夜诱导蛋白分泌速率相对较慢,蛋白易正确折叠,所以优先采用15、过夜诱导。这就是所谓的优先做上清。图1.2 Cement protein 64P-BA1蛋白可溶性分析Lane1:对照 lane2:1 号Lane3:2 号 lane4:3 号Lane5: M1-上清 1-沉淀 3-上清 3-沉淀 M1

26、00kd75kd50kd32kd25kd15kd江苏农林职业技术学院毕业论文(设计)24.3Cement protein的分离纯化本实验采用Ni-IDA亲和层析一步纯化蛋白 Cement protein,最终得到的融合蛋白纯度能达到90%以上,Cement protein的分离纯化检测图如图所示Lane1为全菌破碎后蛋白条带58KD处有明显表达条带;Lane2为上清中蛋白条带58KD处有明显表达条带;lane3为上清过柱后流出条带;融合蛋白表达条带降低很多,说明融合蛋白大量挂柱;Lane4为20mm咪唑洗涤后流出有杂质和部分融合蛋白洗出;Lane5为50mm咪唑洗涤后流出有杂质和部分融合蛋白洗

27、出;Lane6为250mm咪唑洗脱后流出融合蛋白被大量洗脱,且浓度和纯度很高。2 3 Marker 图1.3 Cement protein 64P-BA1蛋白纯化检测图Lane1:全菌 lane2:上清Lane3:流出 lane4:20Lane5: 50 Lane5:250 100kd75kd50kd32kd25kd15kd江苏农林职业技术学院毕业论文(设计) 14.4Cement protein的 Western blot检测Cement protein 的Western blot检测图如图Western blot检测58kd处有融合蛋白条带,证明纯化得到蛋白为实验预期纯化的融合蛋白。图1.

28、4 Cement protein 的Western blot检测图Lane1:全菌 lane2:融合蛋白江苏农林职业技术学院毕业论文(设计)25 结 论5.1 本实验利用 Ni 离子与咪唑基特异的亲和性,使螯和有 Ni 离子的亲和层析柱可以用来纯化含有组氨酸的融合蛋白,在 Cement protein 经过重组后,融合蛋白带上了 HIS标签,在纯化时可以特异性结合在层析柱上,用含高咪唑的 Elution Buffer 溶液使蛋白Cement protein 与杂蛋白分开由电泳的检测结果可知,用这种简单、快捷的一步纯化的方法,能够得到达到电泳纯的蛋白,而 HIS 标签并不影响蛋白 Cement

29、protein 的活性;5.2 重组后的蛋白Cement protein虽然很稳定,但在纯化的过程当中还要使蛋白溶液始终保持在低温冰浴的环境中。接触到蛋白的容器一定要灭菌干净,避免杂菌的污染;5.3 在用 IPTG 进行诱导表达时先做一个浓度梯度,实验发现终浓度在 1mM,温度为 37,时间为 4h,融合蛋白产生量最多,但易形成包涵体。终浓度为 0.5mM,温度为 15,时间为 12h,上清中融合蛋白增多。参考文献l 4 赵永芳编著。生物化学技术原理及其应用(第二版)。武汉大学出版社.2 Sven Lofdal,Bengt Guss,Mathias Uhlen,Lennart Philipso

30、n,and Martin Lindberg.gene for Streptococcal Protein G.Proc,Natl,Acad,Sci,USA,Vol.80.pp697-701,February 19833 范代娣,沈立新,米珏编著。重组蛋白分离与分析。化学工业出版社, 2 P104(德)amp,(德)B.Wittmann-Liebold,(希腊)T.Choli-Papadopoulou。蛋白质结构分析:制备,鉴定与微量测序 。北京科学出版社5 phyllis,nano db,蛋白质电泳实验技术6 叶勤主编。现代生物技术原理及其应用。中国轻工业出版社7 Salamon ML,Ahh

31、ausen PL,Gupta McThe effects of BMP 一 7 in a rat posterolateral inter transverse process fusion modelJJ Spinal Disord Tech,2003,l6(1):908 Simon M, Feliers D,Arar M,et o1Cloning of the 5 -flanking region of the murine bone morphogenetic protein一7 geneJMol Cell Biochem,2002,233(1-2):3l9 Chang CF,Lin S

32、Z,Chiang YH,et o1Intravenous administration of bone morphogenetie protein一7 after ischemia motor function in stroke ratsJStroke,2003,34(2):55810 Wozney JMOverview of bone morphogenetie proteins【JJSPINE, 200227(16S1:S211 马歇克DR,门永JTr,布格斯RR,等朱厚础,等译蛋白质纯化与鉴定实验指南M北京:科学出版社,199940,41江苏农林职业技术学院毕业论文(设计) 1致 谢本论文自始至终是在金思瑞(GenScript)生物科技(南京)有限公司蛋白部完成。组长王成林(蛋白纯化工程师) 、郭振宇(蛋白纯化工程师) 、蔡立涛(蛋白纯化工程师) ,技术员张正卫、崔明(蛋白纯化工程师) ,给了我很大的。在这期间我的老师和同学,也给了我极大的帮助。让我论文如期完成。在这里我向以上各位表示最真挚的感谢。同时我也感谢父母养育了我,学校培育了我。

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