1、临床研究检索策略、中、英文 数据库介绍及文献管理,四川大学华西医院邓可刚 2010-09-09,首先向大家介绍一重要网址： http:/www.cochrane-handbook.org,本讲内容安排,1. 从一“检索实例”开始介绍检索临床研究的检索策略2. 中、英文书目数据库简介3. 如何检索除书目数据库以外的其它内容（重点介绍检索中应注意的问题）4.如何借鉴已有的检索策略5. 回答有关检索策略制定的问题（在介绍相关数据库时简要介绍有关文献管理的内容）,一、检索临床研究的检索策略,从一“检索实例”开始介绍 Anticoagulants versus antiplateletagents fo
2、r acute ischaemic stroke (Cochrane Review),抗凝剂对照抗血小板制剂治疗急性缺血性脑卒中的有效性和安全性,按PICO策略解析这一临床问题 P 为缺血性脑卒中患者而非出血性脑卒中； I 抗凝剂、抗血小板制剂； C 对抗凝剂和抗血小板制剂进行比较研究； O 疗效及不良反应该文作者（Berge E等）的目的是要评价抗凝剂是否优于抗血小板制剂对缺血性脑卒中的治疗。,针对本例系统检索临床试验的思路,如果是为了进行研究而检索，如为完成系统评价、临床实践指南或卫生技术评估等而进行检索，尽可能提高查全率比强调精确性更为重要。以下通过此篇Cochrane Review检索
3、实例的部分内容，简要说明对所关注临床问题的分解、检索词的选择和检索策略的制定。,为制作系统评价进行相关研究而检索,1. MEDLINE, EMBASE, CCTR (Central)，CBM等,先检索书目数据库,在此基础上进行扩展检索,2. 扩展检索扩展检索是在检索主要信息资源（主流数据库）的基础上，扩展检索其他的信息资源。,书目数据库有何的特点?,书目数据库存储的是“二次文献” 即文献的外表特征与内容特征的线索，检索者可通过阅读这些文献线索决定取舍。,为什么要重视检索书目数据库？,书目献数据库中包括了大量制作系统评价所需的研究文献，是各种信息来源中最应引起重视的一类数据库，其特点有：收录范围
4、广，覆盖面宽，信息量大；检索途径多，检索功能丰富；容易识别研究文献的类型。,几种主要的书目数据库,MEDLINE/PubMedEMBASECochrane协作网中心注册数据库The Cochrane Central Register of Controlled Trials （CENTRAL， Clinical Trials or CCTR） 中文书目数据库（如CBM等）,检索策略（简介）,检索策略是指在分析信息需求的基础上，选择适当的数据库并确定检索途径和检索词，确定各词之间的逻辑关系与检索步骤，制定出检索表达式并在检索过程中修改和完善检索表达式。,检索缺血性脑卒中,1. cerebrova
5、scular disorders/ 2. carotid artery diseases/ 3. carotid artery thrombosis/ 4. exp stroke/ 5. exp hypoxia-ischemia, brain/ 6. intracranial arterial diseases/ 7. exp cerebral arterial diseases/exp “Intracranial embolism andthrombosis”/注: exp为扩展检索原检索式中的“cerebrovascular accident”已改为stroke （因MeSH增加了stro
6、ke主题词）,检索缺血性脑卒中 （续）,(stroke$ or apoplex$ or cerebral vasc$ orcerebrovasc$ or cva or transient isch?emicattack$ or tia$).tw 10. (brain or cerebr$ or cerebell$ or vertebrobasil$ or hemispher$ or intracran$ or intracerebral or infratentorial or supratentorial or middle cerebr$ or mca$ oranterior circul
7、ation).tw 11. (isch?emi$ or infarct$ or thrombo$ or emboli$ or occlus$ or hypoxi$).tw 12. 10 and 11 13. or/1-10, 12,主题词检索（简述）,主题词指能代表文献内容实质的经过严格规范化的专业名词术语或词组，其特点是具有唯一性，多个相同概念、名词术语、同义词等在索引中只能用唯一一个术语表达，使内容相同或相近的文献更加集中、更具有专指性，避免同义词的多次检索。采用主题词检索途径进行检索称为主题检索（注：主题词检索的检索用词均来自主题词表）,MeSH 和Emtree简介,美国国立医学图书馆所
8、编制的medical subject headings（医学主题词表，简称MeSH）。 EMBASE数据库中的医学主题词简称Emtree。（检索中应注意不同的数据库主题表也有可能不相同）,主题词扩展检索,主题词来源于分等级的树状结构表或范畴表，对主题词进行扩展检索（explode searching）可对所选主题词的全部下位词进行检索；利用主题词的树状结构，也可缩小检索范围，直接对某主题词的某一下位词进行检索。但放弃扩展检索，也有可能漏检相关文献。,关键词检索 （简述）,关键词（Keyword），是指出现在文献中的具有检索意义，并能表达信息实质内容的名词和术语。出现在文献题录、文摘或是全文中的
9、关键词，通常也被称为文本词（text word）。凡是在文献中不受词表约束的能被检索出的有意义的名词和术语也被称作自由词(free text)。,采用关键词检索需要考虑哪些因素?,1. 注意筛选同义词如：heart attack和myocardial infarction， physiotherapy或physical therapy等2. 注意词形变化diet or diets or dietary,采用关键词检索需要考虑哪些因素?,3. 注意词的拼写差异 如：ischemic/ischaemic, paediatric/pediatric, leukaemia/leukemia, beha
10、viour/behavior4. 注意缩写词 如：EBM or evidence based medicine, SR or systematic review,检索抗凝治疗,14. exp Anticoagulants/ 15. anticoagulant$.tw (acenocoumarol$ or dicoumarol$ or ethyl biscoumacetate$ or phenprocoumon$ or warfarin$ or ancrod$ or citric acid$ or coumarin$ or chromonar$ or coumestro$ or esculi$
11、or ochratoxin$ or umbelliferone$ or dermatan?sul$ or dextran$ or edetic acid$ or enoxaparin$ or gabexate$ or heparin$ or lmwh$ or nadroparin$ or pentosan sulfuric polyester$ or phenindione$ or protein c or protein s or tedelparin$).tw,检索抗凝治疗 （续）,17. (argatroban or tinzaparin or parnaparin or revipar
12、in or danaparoid or lomoparan or org 10172 or mesoglycan or polysaccharide sulphate$ or sp54 or sp-54 or md805 or md- 805 or cy222 or cy-222 or cy216 or cy-16).tw 18. (Marevan or Fragmin$ or Fraxiparin$ or Klexane).tw 19. exp Pipecolic acids/ae, tu 20. exp Vitamin K/ai 21. Vitamin K antagonist$.tw 2
13、2. exp Antithrombins/ae, pd, de, tu 23. exp Blood coagulation factors/ai, de 24. exp Blood coagulation/de 25. (anticoagulat$ or antithromb$).tw 26. or/14-25,检索抗血小板制剂,27. exp Platelet aggregation inhibitors/ 28. (antiplatelet$ or anti-platelet$ or antiaggreg$ oranti-aggreg$ or (platelet$ adj5 inhibit
14、$) or (thrombocyt$ adj5 inhibit$).tw 29. (alprostadil$ or aspirin$ or dipyridamol$ or disintegrin$ or epoprostenol$ or iloprost$ or ketanserin$ or ketorolac tromethamine$ or milrinone$ or mopidamol$ or pentoxifyllin$ or procainamide$ or ticlopidine$ or thiophen$ or trapidil$).tw 30. (acetyl salicyli
15、c acid$ or acetyl?salicylic acid or clopidogrel$ or picotamide$ or ligustrazine$ or levamisol$ or suloctidil$ or ozagrel$ or oky046 or oky-046 or defibrotide$ or cilostazol or satigrel or sarpolgrelate or kbt3022 or kbt-3022 or isbogrel or cv4151 or cv-4151 or triflusal).tw,检索抗血小板制剂（续）,31. (Dispril
16、or Albyl$ or Ticlid$ or Persantin$ or Plavix).tw 32. exp Platelet glycoprotein gpiib-iiiacomplex/ai, de 33. (glycoprotein iib$ or gp iib$) adj5 (antagonist$ or inhibitor$) or GR144053 or GR-144053 or abciximab$ or tirofiban$or eftifibatid$).tw 34. (ReoPro or Integrilin$ or Aggrastat).tw 35. exp Plat
17、elet activation/de 36. exp Blood platelets/de 37. or/27-36,对检索结果进行组配检索,通过检索，已获缺血性脑卒中、抗凝治疗干预措施、抗血小板治疗干预措施的检索结果。在此基础上可通过逻辑运算符对结果进行组配，如： 38 缺血性脑卒中 and 抗凝治疗 and 抗血小板治疗 39 animals.sh. not (humans.sh. and animals.sh.) 40 38 not 39注：有时还需用“and”将上述检索结果与有对照的研究文献进行组配。,系统评价为什么需要RCT研究文献？ （当这种文献有可能获得时）,因为随机对照试验是评
18、价治疗效果的最好的研究设计。 系统、全面的检索与随机对照试验有关的研究文献，是将发表偏倚控制在最小范围的途径，也是系统评价区别于传统的叙述性文献综述的关键步骤之一。 但随机对照试验在检索干预措施不良反应信息方面也有其局限性。,从何处去检索研究文献（包括RCT）文献？ 怎样检索研究文献（包括RCT）文献？,这些文献的来源主要有以下三类： 1. Bibliographic databases2. Journals and other non-bibliographic database sources3. Unpublished and ongoing studies,二、从书目数据库（Bibli
19、ographic databases）中检索研究文献,The Cochrane Central Register of Controlled Trials(CENTRAL, Clinical Trails 或 CCTR） MEDLINE and EMBASE National and regional databases （如：CBM） Subject-specific databases Citation indexes （如：SCI） Dissertations and theses databases Grey literature databases,中、英文书目数据库简介 (1) 检
20、索EBM Reviews,EBM Reviews将多个重要的循证医学证据数据库整合到一个检索功能丰富的单一的检索平台，该平台可同时检索多个数据库，并提供有快速、便捷的网络超链接功能。EBM Reviews同样收录有Cochrane系统评价数据库、DARE、Cochrane协作网对照试验中心注册数据库等。EBM Reviews也提供OVID MEDLINE链接,从本校图书馆检索EBM Reviews http:/202.115.54.22,OVID database,检索MEDLINE应注意的情况,Cochrane系统评价手册（5.0.1版）指出如下一种情况：如通过OVID平台对MEDLINE进
21、行检索时，选择了Ovid MEDLINE 某某年至今并且每天更新（如：Ovid MEDLINE(R) 1996 to Present with Daily Update），同时也应选择Ovid MEDLINE的这样一个数据库“于某年某月正在处理和其它尚未标引的记录”（如：Ovid MEDLINE(R) In-Process & Other Non-Indexed Citations May 05, 2009）。,OVID Database Field Guides,The Ovid MEDLINE In-Process & Other Non-Indexed Citations databas
22、e consists of In-Process and PubMed-not-MEDLINE records from NLM. The In-Process records are records that will be put into the Medline database after they have been enhanced with MeSH headings. PubMed-not-MEDLINE records are records from journals found in PubMed but not selected for MEDLINE. These r
23、ecords are constantly changing. PubMed-not-MEDLINE records will not be added to the Medline database.,In-Process & Other Non-Indexed Citations database,从OVID的数据库指南可获悉该数据库包括两部分的内容，一部分是在进行了医学主题词标引后将被增加到MEDLINE 数据库的记录，另一部分是那些能从PubMed 中检索到，但不被MEDLINE 收录的记录。因此，如果要通过OVID 检索平台进行检索，不同时检索这两个数据库可能会造成漏检。对该数据库的
24、检索应特别注意对关键词（自由词）的筛选。,OVID 基本检索（Basic Search）,OVID 基本检索（Basic Search）,可进行自由词检索。可选择“包含相关词汇”选项，对英文单词的同义词、 复数以及拼写变异等进行检索，以扩大检索范围。通过添加限制条件或根据条件进行筛选可缩小搜索范围,引文检索（Find Citation）,引文检索（Find Citation）,查找引用语可对标题、期刊、作者、卷数、发行、页数、发行年份、发行商等的组合进行检索。,检索工具（Search Tools）,提供主题词检索，包括扩展检索、加权检索和副主题词检索等。也可包括对相关词汇的检索，以及进行限定检
25、索等。,检索工具（Search Tools）,字段限定检索（Search Fields）,提供用于限定检索词的字段，包括刊名、文摘、索取号、著者、著者关键词、标题文本、文献类型等。 在输入框内输入检索词后，即可在字段列表中选择所要限定的字段，单选、多选均可。,字段限定检索（Search Fields）,OVID高级检索（Advanced Ovid Search）,关键词检索（Keyword） 著者检索（Author） 篇名关键词检索（Title） 期刊名称检索（Journal）,OVID高级检索（Advanced Ovid Search）- CCTR数据库,OVID高级检索（Advanced
26、Ovid Search）- Cochrane SR数据库,多字段检索（Multi-field Search),OVID 的Combine组合功能,OVID 的Combine组合功能,获得检索结果和链接全文,获取全文,OVID的运算符,OVID可用以下4种运算符进行组配检索：and or not adj前3种属逻辑运算符，使用与其它数据库相同但adj运算符有以下特点： 1. adj运算符适用于高级检索方式，当在基本检索方式下用adj时，系统只根据检索词出现的数量及密密切程度给出最相关的结果。 2. adj后可跟数字，如adj1,adj6等，以示检索词之间相邻程度，但与检索词的先后无关。,使用ad
27、j运算符的图示,drug adj treatment的检索等同于没有adj即drug treatment的检索,所以检索结果是有顺序的，即drug在先紧跟treatment。而drug adj1 treatment则不考虑俩字的顺序，即drug treatment及treatment drug均可。这也就是为什么用adj1比只用adj检索的结果要多。 据OVID亚太区培训经理周达的邮件回复,Box 6.4.c: Cochrane Highly Sensitive Search Strategy for identifying randomized trials in MEDLINE: sens
28、itivity-maximizing version (2008 revision); Ovid format,1 randomized controlled trial.pt. 2 controlled clinical trial.pt. 3 randomized.ab. 4 placebo.ab. 5 drug therapy.fs. 6 randomly.ab. 7 trial.ab. 8 groups.ab. 9 1 or 2 or 3 or 4 or 5 or 6 or 7 or 8 10 exp animals/ not humans.sh 9 not 10注：.fs. deno
29、tes a floating subheading; .sh. denotes a Medical Subject Heading (MeSH) term;,Box 6.4.d: Cochrane Highly Sensitive Search Strategy for identifying randomized trials in MEDLINE: sensitivity- and precision-maximizing version (2008 revision); Ovid format,randomized controlled trial.pt. controlled clin
30、ical trial.pt. randomized.ab. placebo.ab. clinical trials as topic.sh. randomly.ab. trial.ti. 1 or 2 or 3 or 4 or 5 or 6 or 7 exp animals/ not humans.sh 8 not 9 注； .pt. denotes a Publication Type term; .ab. denotes a word in the abstract; .ti. denotes a word in the title.,Box 6.4.f: Demonstration se
31、arch strategy for MEDLINE (Ovid format) , for the topic Tamoxifen for breast cancer 手册,12. exp Breast Neoplasms/ 13. (breast adj6 cancer$).mp. 14. (breast adj6 neoplasm$).mp. 15. (breast adj6 carcinoma$).mp. 16. (breast adj6 tumour$).mp. 17. (breast adj6 tumor$).mp. 18. 12 or 13 or 14 or 15 or 16 or
32、 17 19. exp Tamoxifen/ 20. tamoxifen.mp. 21. 19 or 20 22. 11 and 18 and 21.mp. indicates a search of title, original title, abstract, name of substance word and subject heading word.,OVID Search History,通过图示说明截词符及高级检索方式所检索的相关字段,检索时应注意的一些问题,根据所选数据库的不同，检索界面也略有差异 应根据各相关数据库的功能选择有关的检索模块如以下数据库可选“Search To
33、ols”： CCTR MEDLINE HTA EED等 应注意“Search Fields” 中有的字段只对部分数据库起作用。如：Publication Type针对的是CCTR和MEDLINE数据库,中、英文数据库介绍 (2) 检索Cochrane Library,Cochrane图书馆(CLIB)是一个的收集高质量卫生保健决策证据的检索系统，CLIB协作网系统评价是基于临床治疗决策的高水平证据，除此之外，CLIB图书馆还收集有来自卫生技术评价、经济评价等系统评价的摘要信息和单个临床试验相关信息等资源，系统提供的检索界面可对多个数据库同时进行检索。,Cochrane Library的出版方式
34、,1996年由Update Software公司出版发行了第1期CLIB（光盘版）。此后，CLIB又有了网络版，内容仍为每季更新，更新后的光盘覆盖以前的内容。从2005年起，CLIB改由Willey公司（John Wiley & Sons Ltd.）出版发行，仍为光盘版和网络版。,Cochrane Library网络版 http:,Cochrane Library的图标,Cochrane Library的高级检索,Cochrane Library的浏览和检索,从Cochrane Library中检索肺癌,#1 MeSH descriptor Lung Neoplasms explode all
35、 trees #2 lung near cancer* #3 lung near neoplasm* #4 lung near carcinoma* #5 lung near tumour* #6 lung near tumor* #7 #1 or #2 or #3 or #4 or #5 or #6,Box 6.4.e: Demonstration search strategy for CENTRAL, for the topic Tamoxifen for breast cancer Cochrane系统评价手册,#1 MeSH descriptor Breast Neoplasms e
36、xplode all trees #2 breast near cancer* #3 breast near neoplasm* #4 breast near carcinoma* #5 breast near tumour* #6 breast near tumor* #7 #1 or #2 or #3 or #4 or #5 or #6 #8 MeSH descriptor Tamoxifen explode all trees #9 tamoxifen #10 #8 or #9 #11 #7 and #10,The near operator defaults to within six
37、 words; * indicates truncation.,检索Cochrane图书馆碰到的一个有趣的检索结果 #3的命中数多于#1 OR #2 为什么？,Cochrane协作网信息检索专业组“E-mail讨论”专家的回复：,Once you use a truncation sign you turn off the automatic function. #1 (breast near tumour*) 254 #2 (breast near tumor*) 428 #3 breast near tumour 640 #4 (#1 OR #2) 670 #5 (#3 AND NOT #
38、4) 0 #6 (#4 AND NOT #3) 30 If you do #1 or #2 you will get 670 hits 30 more than you would using the automatic function (you would need to check these , but probably shows that it is worth using truncation).,Cochrnae Library的部分检索规则,对多个词同时检索，词与词间默认有“AND”逻辑运算符；可用“,“代替OR逻辑运算符，例如：gene, therapy可替代gene OR
39、 therapy对词组（短语）进行精确检索，应加上双引号，例如： “clodronate therapy” 紧邻的两词之间可使用“next”进行邻近检索； 使用“near”相邻位置算符默认状态为将两词限定在6个词以内，near/后的数字表示两词之间允许有的词数。,检索时需要注意的一些问题,在检索中尤其需要将主题词检索和关键词检索结合起来制定检索策略；对标题、作者字段的限定检索可针对所有的数据库；对摘要字段的限定检索可针对DARE和Clinical Trails (CENTRAL) ；对publication type（出版物类型）字段的限定检索仅针对Clinical Trails (CENTR
40、AL) 。,中、英文数据库介绍 (3) 检索中国生物医学文献数据库 CBM,中国生物医学文献数据库 （新的检索平台）,中国生物医学文献数据库 （新的检索平台）,中国生物医学文献数据库 （新的检索平台）,中、英文数据库介绍 (4) 中国生物医学期刊引文数据库,CMCI基本检索,CMCI引文检索,中、英文数据库简介 (4) PubMed,PubMed Clinical Queries,PubMed MeSH,PubMed Limits,PubMed Advanced Search,Box 6.4.a: Cochrane Highly Sensitive Search Strategy for id
41、entifying randomized trials in MEDLINE: sensitivity-maximizing version (2008 revision); PubMed format,#1 randomized controlled trial pt #2 controlled clinical trial pt #3 randomized tiab #4 placebo tiab #5 drug therapy sh #6 randomly tiab #7 trial tiab #8 groups tiab #9 #1 or #2 or #3 or #4 or #5 or
42、 #6 or #7 or #8 #10 animals mh not humans mh #11 #9 not #10注: Publication Type PT Title/Abstract TIAB MeSH Subheadings SH MeSH Terms MH,Box 6.4.b: Cochrane Highly Sensitive Search Strategy for identifying randomized trials in MEDLINE: sensitivity- and precision-maximizing version (2008 revision); Pu
43、bMed format,#1 randomized controlled trial pt #2 controlled clinical trial pt #3 randomized tiab #4 placebo tiab #5 clinical trials as topic mesh: noexp #6 randomly tiab #7 trial ti #8 #1 or #2 or #3 or #4 or #5 or #6 or #7 #9 animals mh not humans mh #10 #8 not #9 注： mesh: noexp denotes a Medical S
44、ubject Heading (MeSH) term (not exploded ) ti denotes a word in the title,中、英文数据库简介 (5)EMBASE.com http:/,EMBASE.com收录的时间及内容,E是爱思唯尔（Elsevier）推出的针对生物医学和药理学领域信息所提供的基于网络的数据检索服务的专业检索引擎。 EMBASE.com将EMBASE（1974年以来）MEDLINE（1966年以来）的1800多万条生物医学记录。检出记录不重复。 囊括了70多个国家/地区出版的7,000多种刊物，覆盖各种疾病和药物信息，涵盖有大量欧洲和亚洲医学刊物,E
45、MBASE.com的标引和分类,EMBASE.com独有EMTREEEMTREE可在EMBASE和MEDLINE 之间检索，可自动进行主题词对照检索。EMTREE包含超过4.5万条药物与医学索引术语、2万条同义词（包括所有的MeSH术语）配以17个核心的药物关联词47个投药途径关联词和14个疾病关联词。 （关联词与MEDLINE副主题词相似）EMTREE 每年更新,EMBASE.com的检索,分为:快速检索 高级检索 字段检索 药物检索 疾病检索 文章检索,主页为快速检索, 可使用自然语言检索，可用单词或词组进行检索，检索词组时需加单（双）引号或连字符。如: clinical trial或cl
46、inical-trial 。 可使用无限截词符（*）或有限截词符（？），但截词符的使用不适用词组。,EMBASE.com的Quick Search,EMBASE.com的高级检索,，,EMBASE.com高级检索的More Limits,，,EMBASE.com的限定检索,EMBASE.com的Drug Search,EMBASE.com的Disease Search,EMBASE.com的Article Search,EMBASE.com的检索结果,EMBASE.com其它检索功能,在检索结果的界面下端，可运用Elsevier的科学搜索引擎Scirus来对互联网进行搜索。,三、如何检索除书目
47、数据库以外的文献,补充检索与主题有关的数据库(supplementary subject databases） 检索收录各种指南的网站 (guidelines sites) 检索会议摘要和学术会议录网站(meeting abstracts and conference proceedings) 检索灰色文献索引 (grey literature indexes) 检索官方网站 (government/official websites) 检索卫生技术评估方面的网站(other HTA websites) 检索主要的在线书目数据库(major online book catalogues) 检索
48、已注册和在研的临床试验数据库 手工检索相关杂志,如何检索除书目数据库以外的研究文献,还可参考Cochrane Collaborationr的“The Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions” (Version 5.0.2, updated September 2009)的相关内容(6.2 Sources to search)进行扩展检索（见以下几张幻灯片的内容）,1. Journals and other non-bibliographic-database sources,HandsearchingFull-text
49、 journals available electronicallyTables of contentsConference abstracts or proceedingsOther reviews, guidelines and reference lists as sources of studiesWeb Searching,(1) Full-text journals available electronically,BioMed Central: (PMC):www.pubmedcentral.nih.govWeb sites listing journals offering free full-text access include:Free Medical Journals:HighWire Press:highwire.stanford.edu/lists/freeart.dtl,
