1、生 物 化 学,李伟国电话：13477073130 Email: ,二十一世纪 生命科学世纪,一、生物化学的定义 二、生物化学的研究内容 三、生物化学的发展简史 四、生物化学的成就 五、学习生物化学的必要性 六、生物化学课程与学习,一、什么是生物化学(Biochemistry) ?,是研究生物体内化学分子与化学反应(生命化学)的科学，它运用化学原理和方法从分子水平探讨生命现象的本质是介于生物与化学之间的边缘学科，是利用化学的理论和方法研究生物的一门学科，其任务是阐述构成生物体的基本物质（生物大分子糖类、脂类、蛋白质、核酸）的结构、性质及其在生命活动（如生长、生殖、代谢、运动等）过程中的变化规律
2、（物质代谢和能量代谢）,生物化学研究的方法：,主要采用化学的原理和方法，同时也与生物物理、生理学、细胞学、遗传学和免疫学相联系和交叉。,二、生物化学的主要研究内容,生物分子和结构与功能：探讨生物体的物质组成以及分子结构、性质和功能 物质代谢及其调节：物质代谢的规律、能量转化及其调节控制 基因信息传递规律及其调控：DNA复制、RNA转录、蛋白质翻译等 通常将生物大分子结构、功能及其代谢调控的研究称为分子生物学 从分子水平研究遗传学，并运用这些规律去改造自然，称基因工程,生物化学(Biochemistry、Biological Chemistry、 Chemistry of Life、 Physi
3、ological Chemistry)研究生物体的化学组成和生命过程中的化学变化规律分子生物学(Molecular Biology)研究生物大分子(核酸/蛋白)结构功能及其之间的关系,对生物化学过程的调节控制结构与功能(复制、转录、翻译遗传信息)之间的关系,生物化学与分子生物学 (Biochemistry & Molecular Biology),生物分子：,无机小分子（H2O、CO2、Ca2+、Mg2+等）,代谢中间物（丙酮酸、柠檬酸、苹果酸等）,构件分子（氨基酸、核苷酸、单糖等）,生物大分子（核酸、蛋白质、脂类、多糖等）,超分子（核糖体、酶复合体、微管等）,细胞器（细胞核、线粒体、高尔基体
4、等）,实验研究/技术方法,生物化学是以实验技术为前提的技术方法的新进展推动生物化学的深入研究,生物化学的分类,根据对象人、动物、植物、微生物根据生物的进化程度原核生物 (Prokaryote） 真核生物(Eukaryote)根据应用目的医学(药学)生化、营养生化等,三、生物化学的发展简史,起源于18世纪晚期，19世纪逐步发展，到20世纪初期发展成为一门独立学科，20世纪50年代以后随着生物大分子结构与功能的研究及分子生物学的兴起，生物化学进入了一个崭新的发展时期。,三、生物化学的发展简史,生物化学的发展简史,起始阶段：18世纪20世纪初。研究了脂类、糖类及氨基酸；发现了核酸；酵母发酵中的“可溶
5、性催化剂”-酶的概念,法国科学家Lavoisier （1743-1794）研究了动物的体温和呼吸德国Neuberg (1877-1951) 于1903年提出“生物化学”这个名词， 生物化学才成为一门独立的学科，在此之前，由有机化学和生理学分别研究,20世纪的前30年：生理学、化学,营养学的真正的黄金时代,20年代：1926年美国Sumner从刀豆中得到脲酶的结晶,30年代：19331936年Krebs提出了著名的尿素循环和 三羧酸循环,40年代前后：能量代谢，生物能学,20世纪中期生物化学成为一门独立和成熟的学科,快速发展阶段：20世纪初下叶。必需氨基酸、维生素的发现；酶的蛋白质本质揭示；多种
6、激素的发现；主要物质代谢途径的确定。,分子生物学的崛起阶段： 20世纪下叶 至今 分子生物学的出现 基因工程与代谢调节,1950年 美国 Pauling等 蛋白质的二级结构-螺旋,1955年 英国 Sanger 胰岛素一级结构的测定,1953年 美国 Watson和英国 Crick DNA双螺旋结构,DNA双螺旋结构的提出使生物化学发展到一个新的阶段分子生物学阶段, 这以后，核酸的研究进展很快，在核酸一级结构测定和核酸人工合成方面取得显著成果。,60年代 1961年法国Jacob和Monod 操纵子模型,70年代 进入生物工程的研究,基因工程、蛋白质工程、酶工程、细胞工程、发酵工程等。 第一个
7、基因工程的产物为somatostatin,90年代 1990年启动了人类基因组计划。,20世纪末和21世纪初，随着人类基因组全序列测定的基本完成，生命科学进入了后基因组时代，产生了功能基因组学、蛋白质组学、结构基因组学等,分子生物学的重要事件,50年代：蛋白质-螺旋结构的发现 1953年Watson和Crick提出了DNA双 螺旋结构模型 分子生物学里程碑 分子遗传学中心法则的提出；遗传密 码的破译等,70年代：建立了DNA重组技术基因工程 基因诊断和基因治疗的发展,80年代：发现了核酶（ribozyme）PCR技术的发明,90年代：开始了人类基因组计划(human genome projec
8、t，HGP)，约2.6109 碱基、 10万个基因(实际3-4万个）,四、生物化学的成就,1953年，DNA双螺旋结构模式 1958年，分子遗传的中心法则 1970年，基因工程方法的建立 1981年，发现有催化功能的RNA（Ribozyme） 1985年，人类基因组作图和测序计划 1997年，第一只克隆羊诞生 1999年，干细胞的研究位列当年科技重大突破 2002年，RNAi荣登重大科技突破榜首,J.D.Watson 和F.H.C.Crick（1953年）,DNA双螺旋结构模型,DNA分子结构是由美国生物学家沃森（James Dewey Watson,1926）和英国生物物理学家克里克（Fra
9、ncis Harry Compton Crick,1916）所确定的。克里克于1949年入剑桥大学卡文迪什实验室医学研究组。1951年沃森来到该研究所，克里克接受了他的观点：了解DNA三维结构即可明了它在遗传中所起的作用。1953年，他们建立了DNA双螺旋结构模式,并跟已知的物理化学性质相符合。这一发现成为分子生物学的里程碑，后来他们分享了1962年的诺贝尔生理医学奖。,返回,分子遗传的中心法则,中心法则(central dogma)是指遗传信息的流向所遵循的法则。Crick提出，在DNA分子可以自我复制（replication）传给子代的基础上，遗传信息可以从DNA传递给RNA（称为转录tr
10、anscription）再从RNA传递给蛋白质（称为翻译translation），这是遗产信息流所遵循的中心法则。Temin又证实RNA也可以是遗传信息的携带者，即DNA以RNA为模板反向转录合成，再推动RNA的合成及蛋白质的合成。,返回,基因工程方法的建立,1970年，Temin和Baltimore从鸡肉瘤病毒中发现反转录酶。 Smith和Wilcox在E.coli中发现芽豆类限制性内切酶,由此为基因工程方法的建立打下了基础。,返回,Ribozyme,1978年，Altman在提纯RNAase时发现，此酶由蛋白质和一个RNA片段组成，单独的RNA能完成对前体tRNA的剪切，而单独的蛋白质却无
11、此能力。1981年，Cech在研究四膜虫前体rRNA的加工过程中发现，在没有蛋白质存在的情况下，一段RNA序列（IVS）能进行自动剪切，生成L-19IVS。后者在离体条件下能催化五聚胞嘧啶核苷酸的合成。由此提出了具有催化功能的核酸（Ribozyme）的概念。Ribozyme的提出为解决人类的起源问题提供了一种新的假说，为此，Cech与Altman共同获得了1989年化学诺贝尔奖。,返回,“人类基因组作图和测序”计划,1985年，美国科学家率先提出“人类基因组测序和作图”计划（简称HGP）。国际合作始于1990年该计划的核心就是测定人类基因组的全部DNA序列，从整体上破译人类遗传信息，以使人类能
12、在分子水平上全面地认识自我。HGP的精神是：全球共有，国际合作。即时公布，免费共享。,人类基因组计划顺利完成,2000年6月26日，参与人类基因组计划的各国科学家，同时向全世界宣布人类基因组“工作框架图”绘制完成。2004年10月21日出版的自然杂志公布了人类基因组最精确的序列（包含有28.5亿个碱基对），同时澄清人类基因组只有2到2.5万个基因（而不是原来的10万个基因）这篇文章标志着人类基因组计划又迈出了里程碑意义的一步。,人类基因组计划的应用前景,将揭示生命世界的一些重大奥秘，如生命起源，生物进化等 将应用于疾病的诊断和治疗，将改变21世纪的医学 将大大促进生命科学工业的发展，特别是基因
13、制药工业的发展,1995 完成原核生物Hemophilus luenzae的基因组测序 1996 完成啤酒酵母的基因组测序 1997 完成大肠杆菌的基因组测序 2000 人类基因组序列框架（中国完成1%） 2000 拟南芥基因组序列（第一个高等植物） 2002 水稻(日本粳米)基因组(中国完成10%)水稻(籼稻)基因组序列框架图(中国独立完成) 2003 中国家蚕基因组框架图(中国独立完成),人类基因组计划实施以来的成就,2004 鸡基因组测序完成(中、英、瑞典、荷兰、德、美) 2005 家猪基因组序列公布(中国、丹麦)犬基全因组测序 2007 葡萄全基因组测序完成“炎黄一号”中国人基因组序列
14、图谱 2008 玉米全基因组测序完成 2008 甲虫赤拟谷盗全基因组测序 2009 美国能源部联合基因组研究所群体测序项目继续支持44个DNA测序计划，包括火炬松、浮萍、棉花、木质素退化真菌、产油微藻和几种纤维素退化细菌等,返回,克隆羊诞生,1997年2月23日，英国罗斯林研究所宣布，他们成功创造了世界上第一个克隆羊 多莉。它的意义在于，人类已能用高度分化的乳腺细胞作为核供体，通过无性繁殖方法，复制出与核供体完全一致的新个体。,返回,1999年干细胞的研究工作位列年度科学技术重大突破首位,干细胞（stem cell）是一类既有自我更新能力，又有多分化潜能的细胞。干细胞的研究一方面可以揭示许多有
15、关细胞生长和发育的基础理论难题；另一方面可望将其用于创伤修复，神经再生和抗衰老等临床医学研究。,返回,2002年 RNAi荣登重大科技突破榜首,RNA曾被认为是一种缺乏活力的生物分子，但最近一系列发现表明，一种称作小RNA的RNA分子参与着多项细胞控制工作，能够关闭基因或改变它们的表达水平。这一现象称为核糖核酸介入（RNAi），它是体内抵御外在感染的一种重要保护机制。小RNA的这种功能有可能使21世纪的医药研究产生革命性的变化。,2006年诺贝尔生理学或医学奖,我国生物化学发展,20世纪20年代后期建立了制备血滤液的方法以及测定血糖的方法（Folin-Wu法）,20世纪30年代，1931年蛋白
16、质变性理论,1965年全合成结晶牛胰岛素；是世界上公认的第一 个具有全部生物活性的蛋白质人工合成,1981年又首先人工合成了具有生物活性的酵母丙氨酸转移核糖核酸(tRNAAla),80年代后的生物工程,吴宪教授的工作,五、为什么要学习生物化学？,化学与生命科学的交叉 化学生物学的内涵：采用化学手段研究生物问题采用生物手段研究化学问题 Bio-X研究中心生物化学与生活息息相关营养生化：保健品医学生化：疾病诊断,培养复合型人才的需要既懂化学又懂生物切入点：样品制备、生物分析等生物化学是学习生命科学的基础生物化学、分子生物学、细胞生物学、 微生物学、神经生物学、生理学、医学、药学等,为什么要学习生物
17、化学？,我们能做什么？,生命科学研究中的化学问题生物大分子结构与功能的关系代谢途径及中间产物生命科学研究的分析方法新的方法往往会带来生命科学的飞跃式发展,1929年 A. 哈登（英），冯奥伊勒 歇尔平（瑞典）阐明糖发酵过程和酶的作用1946年 J. B. 萨姆纳（美）、 J. H. 诺思罗普，W. M. 斯坦利（美） 分离提纯酶和病毒蛋白质1958年 F. 桑格（英） 胰岛素结构研究1981年 福井谦一（日）、R. 霍夫曼（英）确定核酸碱基排列顺序1984年 R.B. 梅里菲尔德（美） 开发了极简便的肽合成法,与生物化学相关的诺贝尔化学奖,1989年 S. 奥尔特曼， T.R. 切赫 （美）R
18、NA自身具有酶的催化功能1993年 K.B. 穆利斯（美） 发明“聚合酶链式反应”法 M. 史密斯（加拿大） 开创“寡聚核苷酸基定点诱变”法1997年 P.B.博耶（美）、J.E.沃克尔（英）、J.C.斯科（丹 麦）发现人体细胞内负责储藏转移能量的离子传输酶,“据统计,90年代的化学以及医学/生理学诺贝尔奖获得者的工作40%都可以归属于生物化学的范畴”,2002年 约翰芬恩（美）、田中耕一（日）发明了生物大分 子的质谱分析法库尔特维特里希（瑞士）发明了对生物大分子进行确认和结构分析的方法2003年 彼得阿格雷（美）、罗德里克麦金农（美）在细胞膜通道方面 做出的开创性贡献。2004年 阿龙-西查
19、诺瓦、阿弗拉姆-赫尔什科（以）和伊尔 温-罗斯（美）泛素调节的蛋白质降解2006年 罗杰 科恩伯格(美)阐明了真核细胞转录的具体机理,2008年诺贝尔化学奖,“在发现和研究绿色荧光蛋白方面做出贡献 ”,下村修(日本),马丁沙尔菲(美国)哥伦比亚大学,钱永健(美国) 加州大学圣地亚哥分校,展示了绿色荧光蛋白作为发光的遗传标签的作用,1962年首次从水母中发现了荧光蛋白,改造绿色荧光蛋白取得多项成果,2009年诺贝尔化学奖,“核糖体结构和功能的研究”,耶鲁大学,剑桥大学MRC分子生物学实验室,以色列魏茨曼科学研究所,文卡特拉曼拉马克里希南,托马斯施泰茨,阿达约纳特,六、生物化学课程与学习,第七章
20、核酸化学 第八章 糖代谢 第九章 脂代谢 第十章 氨基酸代谢 第十一章 核酸的生物合成 第十二章 蛋白质的生物合成,第一章 绪论 第二章 蛋白质化学 第三章 酶 第四章 糖类化学 第五章 脂类化学 第六章 维生素和辅酶,静态生物化学,动态生物化学,第十三章 生物化学研究进展,课程特点及学习与安排,内容多 复杂而繁琐按生物分子的功能分类（不同于化学的结构和官能团分类） 理论性强、概念多且前后交错,随时消化温故知新 及时总结归纳比较分类 理解的基础上必要的记忆 理解与记忆结合；理论联系实际 把握学科交叉；追踪发展前沿,全面理解 强调记忆 联系前后 注重复习,对学习生物化学课程的要求,本课程还独立设有实验，即生物化学实验，要求重视实验，提高动手能力,使用教材及参考书,使用教材：生物化学，王镜岩、朱圣庚主编，高等教育出版社，2002 年 主要参考书： 生物化学，古练权主编，高等教育出版社，2000年 principles of Biochemistry (科学出版社) 生物化学教程(第三版)，张洪渊主编，四川大学出版社，2002年,Thanks!,
