1、1. 获取帮助 help.start() 开启帮助文档help(solve) 显示某命令的帮助信息，或者?solve对于由特殊字符指定的功能，这些参数必须用单引号或双引号括起来，使之成为一个“字符串”, 如 help(“)与某个主题相关的例子通常可以用下面的命令得到 example(topic)2. 命令简介R 对大小写是敏感的；名称不能以数字开始；基本的命令由表达式或者赋值语句组成。如果一个表达式被作为一条命令给出，它将被求值、打印而表达式的值并不被保存。一个赋值语句同样对表达式求值之后把表达式的值传给一个变量，不过并不会自动的被打印出来；命令由分号(;) 来分隔，或者另起新行；基本命令可以
2、由花括号(f 和 g)合并为一组复合表达式；注释几乎可以被放在任何地方，只要是以井号( # )开始，到行末结束；如果一个命令在行莫仍没有结束，R 将会给出一个不同的提示符，默认的是 +。3. 命令文件的执行和输出转向到文件如果命令存储于一个外部文件中，比如工作目录 work 中的 commands.R，他们可以随时在 R 的任务中被执行 source(“commands.R“)在 Windows 中 Source 也可以由 File 菜单执行。函数 sink， sink(“record.lis“)将把所有后续的输出由终端转向一个外部文件，record.lis。命令 sink() 将把信息重新恢
3、复到终端上。4. 数据的保持与对象的清除R 所创建、操作的实体是对象。对象可以是变量、数组、字符串、函数以及由这些元素组成的其它结构； objects() 用来显示目前存储在 R 中的对象的名字。而当前存储的所有对象的组合被称为 workspace；清除对象可以使用 rm 命令： rm(x, y, z, ink, junk, temp, foo, bar)所有在一个 R 任务中被创建的对象都可以在文件中被永久保存，并在其它的 R 任务中被使用。在每个 R 任务结束时用户都有机会保存当前有效的所有对象。如果用户这样做的话，对象将被写入当前目录一个名为.RData。当 R 被再次启动时 R 会从这
4、个文件中再载入workspace。同时相关的命令记录也被载入。所以，推荐大家在用 R 进行不同的分析时分别使用不同的工作目录。5. 基本数据结构数值型(numeric） 1,1.2,3.1415926复数型(complex) 1+2i字符型(character) A/ “hello world!”逻辑型(logical) TRUE / FALSE6. 基本数据对象 向量(vector), 见下节矩阵(matrix)： 更一般的说数组是向量在多维情况下的一般形式。事实上它们是可以被两个或更多的指标索引的向量，并且以特定的方式被打印出来。因子(factors) 提供了一种处理分类数据的更简介的方式
5、。列表(list)： 是向量的一种一般形式，并不需要保证其中的元素都是相同的类型，而且其中的元素经常是向量和列表本身。数据框(data frame)：是一种与矩阵相似的结构，其中的列可以是不同的数据类型。可以把数据框看作一种数据“矩阵“，它的每行是一个观测单位，而且(可能)同时包含数值型和分类的变量。函数( function)：能够在 R 的 workspace 中存储的对象。我们可以通过函数来扩展 R 的功能。二 简单操作，数值与向量2.1 向量与赋值R 对命名了的数据结构进行操作。最简单的数据结构是数字向量；如， x assign(“x“, c(10.4, 5.6, 3.1, 6.4, 2
6、1.7) 也可以写成： c(10.4, 5.6, 3.1, 6.4, 21.7) - x如果一个表达式被当作一个完整的命令，它的值将被打印到终端但不被储存。单独输入 x 则会将值打印出来。也可以打印倒数： 1/x y v s5 temp 13逻辑操作符包括, =,完全相等=和不等于!=，与或非分别为 在打印时用双引号 (有时不用引号)。R 使用与 C 语言风格基本相同的转义符, 所以输入打印的也是, 输入“ 打印引号“, n: 换行, t: tab, b: 回格。字符向量可以通过函数 c()连接 ；paste()可以接受任意个参数，并从它们中逐个取出字符并连成字符串，形成的字符串的个数与参数中
7、最长字符串的长度相同。如果参数中包含数字的话，数字将被强制转化为字符串。在默认情况下，参数中的各字符串是被一个空格分隔的，不过通过参数 sep=string 用户可以把它更改为其他字符串，包括空字符串。例如： labs y (x+1)(!is.na(x) text(x, y, names)图形参数 type=“n“阻止了点的生成，但是建立了坐标轴，由函数 text()提供字符向量names 所指定的特定字符。abline(a, b) abline(h=y) abline(v=x) abline(lm.obj)在当前图上添加一条斜率为 b，截距为 a 的直线。h=y 在图形指定的高度上绘制一条贯
8、穿图形的水平线，同样的，v=x 在 x 轴的指定位置绘制一条贯穿的 垂线。而 lm.obj 是一个包含 coefficients 组件的列表，该组件的长度为 2，分别当作截距和斜率。polygon(x, y, . . . )绘制一个多边形，其顶点由(x,y)指定。同时还（可选的）可以加上阴影线，如果图形设备允许的话还可以将多边形填充。legend(x, y, legend, . . . )这当前图形的指定位置添加图例。绘制的字符，线条类型，颜色等等由字符向量 legend 指定。除此之外至少还要给出一个参数 v，与绘图单元的相应值，分别有：legend( , fill=v)填充方框的颜色leg
9、end( , col=v)绘制点线的颜色legend( , lty=v)线条类型legend( , lwd=v)线条宽度legend( , pch=v)绘制字符(字符向量 )title(main,sub)在当前图形的顶部用大字题添加一个标题 main，在底部用较小的字体添加子标题 sub。axis(side, . . . )在当前图形的指定边上添加坐标，在哪个边上由第一个参数指定（1 到 4，从底部按照顺时针顺序）。其他参数控制坐标的位置|在图形内或图形外，以及标记的位置和标签。适合在调用参数为 axes=FALSE 的函数 plot()后添加定制的坐标轴。低级绘图函数通常都需要一些位置信息（
10、例如，x,y 坐标）来决定在哪里添加新的元素。坐标以用户坐标(user coordinates)的形式给出，这个坐标系是根据所提供的数据由之前的高级绘图语句定义的。需要 x,y 参数的地方还可以选用一个单独的参数，即一个由名为 x,y的元素组成的列表。相似的，一个两列的矩阵也可以。像 locator()（后面会提到）这样的函数也可以按照这种方式交互的指定图形中的位置。添加数学注释某些情况下需要在图形中加入数学符号或公式。在 R 中可以通过在 text, mtext,axis 或 title中指定一个表达式来实现。例如，下面的代码绘制了二项概率函数的公式： text(x, y, expressi
11、on_r(paste(bgroup(“(“, atop(n, x), “)“),px, qn-x)更多的信息，包括其特性的一个完整列表可以在 R 中通过下面的命令得到： help(plotmath) example(plotmath)添加 Hershey 矢量字体 help(Hershey) example(Hershey)12.3 图形的交互R 提供了函数，使用户可以通过鼠标从图形中释放信息或添加信息。locator(n,type)等待用户使用鼠标左键在当前图形上选择位置。直到 n(默认是 512)个点都选完或者点击了鼠标另一个键（Unix,Windows)，在 Mac 下用鼠标点 击图形窗
12、口外的部分也可以结束。参数 type 的效果和在高级绘图函数中使用时是一样的，即在选择的点绘制指定的图形。默认情况是不绘制图形。函数 locator()将所选点的坐标返回到一个列表中，列表包含 x,y 两个组件。通常 locator()在调用的时候并不带参数。这个功能在为图例或标签这样的图形元素选择位置时比较有用，尤其是这些位置不好通过计算得到的时候。举个例子，如果要在一个野点附近添加一些信息，可以使用下面的命令 text(locator(1), “Outlier“, adj=0)identify(x, y, labels)允许用户在 x,y（使用鼠标左键）定义的点附近绘制相应的 labels
13、 的组件（如果没有给出labels 就给出该点的序号），突显该点。当鼠标的另一个键被点击时（Unix,Windows）返回被选点的序号，在 Mac 下通过点击图形窗口外来实现这个效果。有时我们更想确定图形中的点，而非它们的位置。例如，我们可能希望从图示中选出某些感兴趣的观测点，然后进行某些操作。通过两个数值向量 x,y 给定一系列坐标(x; y)，我们可以使用 identify()函数： plot(x,y) identify(x,y)函数 identify()本身不绘图，但是允许用户移动鼠标，在某点附近点击左键。离鼠标指针最近的点将被突显，并标出其序号（也就是它在向量 x/y 中的 位置）。或
14、者使用 identify()的 labels 参数，把某些信息（例如案例名称）作为突显的标志；或者通过 plot=FALSE 参数取消所有突显标 志。当选点的过程结束后，identify()返回所选点的序号；用户可以使用这些序号从 x 和 y 中释放所选的点。12.4 使用图形参数通过图形参数可以定制图形显示的几乎所有方面。R 包含大量的图形参数，可以控制的包括线条类型，颜色，图标排列，文本对齐等等。1 持续性变更 (Permanent changes): par()函数通过 par()函数设定图形参数的值会持续性的更改参数的值，也就是说这之后（在当前设备上）所有对图形函数的调用都受到新值的影
15、响。函数 par()用于存取和修改当前图形设备的图形参数列表。par()不带任何参数，返回当前设备所有图形参数和它们的值的列表。par(c(“col“,“lty“)参数为一个字符向量，仅返回参数中指定的图形参数（也是作为一个列表）。par(col=4, lty=2)带指定参数（或一个列表型参数），设定指定图形参数的值，并将参数的原始值作为一个列表返回。所以如果想设定参数绘制一些图形后再恢复成原来的设定，可以这么做： oldpar par(oldpar)2 临时性变更：图形函数的参数图形参数也可以作为（几乎）所有图形函数的命名参数。这种方式的效果和用于 par()函数的效果是一样的，只不过这种改
16、变只在函数调用的区间内有效。比如： plot(x, y, pch=“+“)生成一个以加号作为绘图符号的散点图，而不改变后续图形的默认的绘图符号。3 图形参数列表A 图形元素R 图表由点、线、文本和多边形（填充区）组成。下面的图形参数控制了图形元素的绘制：pch=“+“ 用来绘点的字符。这个默认值随不同的图形驱动是不同的，不过通常都是。除非使用“.“作为绘图字符，否则绘制的点都会比适当的位置高一点或者低一点，而不是恰好在指定位置。pch=4 当给定一个 0 到 18 的整数时，会生成一个特殊的绘图符号。通过下面的命令可以看这些符号都有什么。 legend(locator(1), as.chara
17、cter(0:18), pch=0:18)lty=2 线条类型。并不是所有图形设备都支持多种线条类型（在那些支持的设备上也不全一样），不过线条类型 1 始终是实线，2 及以上的是点、划线或者它们的组合。lwd=2 线条宽度。所需的线条宽度，是“标准“线条宽度的倍数。对 line()等函数绘制的线条和坐标轴都有效果。col=2 点、线、文本、填充区和图像使用的颜色。每种图形元素都有其可用的颜色列表，这个参数的值就是颜色在列表中的序号。显然，这个参数值对有限的一类设备有效。font=2 指定文本所使用字体的一个整数。如果可能的话，设备驱动会把 1 对应普通文本，2 对应粗体，3 对应斜体，4 对应
18、粗斜体。font.axis font.lab font.main font.sub 这几个参数分别指定坐标轴注释，x,y 轴的标签，主、副标题所用的字体。adj=-0.1 文本对齐和绘图位置有关。0 代表左对齐，1 代表右对齐，0.5 代表水平的中间位置。当前的值使会图位置到左端距离的比例，所以-0.1 在文本和绘图位置之间留 10%的空白。cex=1.5 字符缩放。这个值是所需文本字符（包括绘图字符）的大小，与默认文本大小相关。B 坐标轴和标记很多 R 的高级图形都有坐标轴，你可以使用低级图形函数 axis()自己创建坐标轴。坐标轴包含三个主要组件：轴线 axis line（线条类型由参数
19、lty 控制），标记 tick mark（沿着轴线划分单元），标号 tick label（用来标出这些单元）。这些组件可以用下面这些参数定制。lab=c(5,7,12)前两个数字分别是 x 和 y 轴上所要划分的区间数。第三个数字是坐标轴标签的长度，用字符数来衡量（包括小数点）。参数的值如果选得太小可能导致所有标号都聚在一起。las=1 坐标轴标签的方向。0 代表总是和坐标轴平行，1 代表总是水平的，2 代表总是垂直于坐标轴。mgp=c(3,1,0)坐标轴组件的位置。第一个组件是坐标轴标签到坐标轴的距离，单位是文本行(text lines)。第二个组件是到标号的距离，最后一个是轴的巍直到轴线的
20、距离（一般都是 0）。正数代表绘图区域外，负数代表区域内。tck=0.01 标号的长度，绘图区域大小的一个分数作单位。当 tck 比较小时（小于 0.5），就强制 x 和 y 轴上的标记为相同大小。tck=1 就是生成网格线。取负值时标记画向绘图区域外。内部标记可以使用 tck=0.01 和 mgp=c(1,-1.5,0)。xaxs=“s“ yaxs=“d“ 分别是 x、y 轴的类型。如果是 s(standard)或 e(extended)类型，那最大和最小的标记都始终在数据区域之外。如果有某个点离边界非常 近，那么扩展型(extended)的轴会稍稍扩展一下。这种类型的轴有时会在边界附近留出
21、大片空白。而i(internal)或 r(默认值) 类型的轴， 标记始终在数据区域内，不过 r 类型会在边界留出少量空白。如果这个参数设为 d，就锁定当前轴，对之后绘制的所有图形都用这个轴（直到参数被重新设定为其他的那几个值）。这个参数适用于生成一系列固定尺度的图。C 图边缘（Figure margins）在 R 中一个单独图形，图（ figure），包含一个绘图区(plot region)，以及环绕着这个区域的边缘（其中可能含有坐标轴标签、标题等等），（通常）这两部分以轴为边界。一个典型的图是控制图的样式的图形参数包括：mai=c(1,0.5,0.5,0)分别是底部，左侧，顶部，右侧的宽度，
22、单位是英寸。mar=c(4,2,2,1)与 mai 相似，只是单位是文本行(text lines)。由于更改一个就会改变另一个的值，所以在这个意义上，mai 和 mar 是等价的。这个参数的默认值通常都太大了；右侧边缘很少用到，如果没标题，顶部边缘也 不需要，左侧和底部的边缘应当足够大，以容纳坐标轴和标号。此外，默认值并没有考虑到设备表面的大小：比如，使用 postscript()驱 动，height=4 参数时，除非用 mar，mai 另外设定，否则图的边缘就要占上大约 50%。使用多图环境时（后面会提到）。边缘会减少一半，不过这在 多图共用一页的时候可能还不够。D 多图环境R 允许在一页上
23、创建一个 nm 的图的阵列。每个图由自己的边缘，图的阵列还有一个可选的外部边缘，如下图所示。与多图环境相关的图形参数有：mfcol=c(3, 2) mfrow=c(2, 4)设定多图阵列的大小。第一个值是行数，第二个值是列数。这两个参数唯一的区别是mfcol 把图按列排入，mfrow 把图按行排入。上图所示的版式可用 mfrow=c(3,2)创建；上图显示的是绘制四幅图后的情况。mfg=c(2, 2, 3, 2)当前图在多图环境下的位置。前两个数字是当前图的行、列数；后两个是其在多图阵列中的行列数。这个参数用来在多图阵列中跳转。你甚至可以在后两个数中使用和真值(true value)不同的值，
24、在同一页上得到大小不同的图。fig=c(4, 9, 1, 4)/10当前图在页面的位置，取值分别是左下角到左边界，右边界，下、上边界的距离与对应边的百分比数。给出的例子是一个页面右下角的图。这个参数可以设定图在页面的绝对位置。oma=c(2, 0, 3, 0) omi=(0, 0, 0.8, 0) 外部边缘的大小。与 mar 和 mai 相似，第一个用文本行作单位，第二个以英寸作单位，从下方开始按照顺时针顺序指定。外部边缘对页标题这类东西很有用。文本可以通过带 outer=TRUE 参数的 mtext()函数加入外部边缘。默认情况下是没有外部边缘的因此必须通过 oma 或 omi 指定。函数
25、split.screen()和 layout()可以对多个图形作更复杂的排列。12.6 设备驱动R 几乎可以在任何一种类型的显示器和打印设备上生成（不同质量的）图形。不过，在这之前，需要告诉 R 要处理的是哪一种设备。这通过启动一个设备驱动来完成。设备驱动通过调用设备驱动函数来启动。某些常用的设备驱动有：X11()Unix 使用 X11 视窗系统windows()Windows 使用 Windows 视窗系统 postscript()在 PostScript 打印机上打印或者创建 PostScript 图形文件pictex()生成一个 LATEX 文件当一个设备使用完之后，可以通过下面的命令终
26、止设备驱动 dev.off()这个命令可以确保设备已经结束；例如，在某些硬拷贝的设备中，这个命令可以保证每页都已经完成，并且都被传送到打印机了。PostScript 文档通过给 postscript()函数带上 file 参数，我们可以把图形以 PostScript 格式存储到文件中。如果没有给出 horizontal=FALSE 参数，图形是横向的，你可以通过 width 和 height 参数控制图形的大小（图形会自动适应）。例如，命令 postscript(“file.ps“, horizontal=FALSE, height=5, pointsize=10)为一个五英寸的图生成一个包含 PostScript 代码的文件，可以放在文当中。如果命令中的指定的文件名已经存在，将会被覆盖。多重图形设备每个对设备驱动的新调用都会打开一个新的图形设备，在设备列表中加入新的一项。这个设备就成为当前设备，图形输出就传送到这个设备。dev.list() 返回所有活动中设备的序号和名称。在列表位置 1 的设备始终是空设备(null device)，这个设备不接收任何图形命令。
