1、原创 新发现！国外学术资源集锦常用数据库按国家分类详细介绍（转贴）一、美国 (1)Wiley InterScience(英文文献期刊) Wiley InterScience 是 John Wiely s Poetry Database 诗歌 全文 MagillOnLiterature Plus 文学 全文 Military Library FullTEXT 军事 全文 MasterFILE Premier 综合性期刊 全文 Newspaper Source 综合性报纸 全文 World Magazine Bank 综合性杂志 全文 = (4)美国(umi)ProQuest博士论文全文 ,是 U
2、MI 公司的一个分库（我分析之后得来的。） UMI 公司简介： 该公司的全称是 UMI，The answser Company (UMI 有问必答公司），成立于 1938 年，是全球最大的信息存储和发行商之一，也是美国学术界著名的出版商，它向全球 160 多个国家提供信息服务，内容涉及商业管理、社会科学、人文科学、新闻、科学与技术、医药、金融与税务等。其出版物包括 18，000 多种外文缩微期刊、7000 多种缩微报纸、150 多万篇博士/硕士论文、20多万种绝版书及研究专集：从 1980 年起该公司开始电子出版物的制作与发行：如光盘数据库、磁带数据库、联机数据库等。 UMI 提供以下三种数据
3、库： 学术研究图书馆（Academic Research Library，简称 ARL） 综合参考及人文社会科学期刊论文数据库，涉及社会科学、人文科学、商业与经济、教育、历史、传播学、法律、军事、文化、科学、医学、艺术、心理学、宗教与神学、社会学等学科，收录 2，300 多种期刊和报纸，其中全文刊占三分之二，有图像。可检索 1971 年来的文摘和 1986 年来的全文。 商业信息数据库（ABI/INFORM）ABI 即为 Abstracts of Business Information 的缩写，世界著名商业及经济管理期刊论文数据库，收录有关财会、银行、商业、计算机、经济、能源、工程、环境、金
4、融、国际贸易、保险、法律、管理、市场、税收、电信等主题的 1，500 多种商业期刊，涉及这些行业的市场、企业文化、企业案例分析、公司新闻和分析、国际贸易与投资、经济状况和预测等方面，其中全文刊超过 50%，其余为文摘，有图像。 医学电子期刊全文数据库（ProQuest Medical Library） 该数据库收录有 220 种全文期刊，文献全文以 PDF 格式或文本加图像格式存储；收录范围包括所有保健专业的期刊，有护理学、儿科学、神经学、药理学、心脏病学、物理治疗及其它方面。 ProQuest 博士论文全文检索系统, PQDD 的全称是 ProQuest Digital Dissertati
5、ons，是世界著名的学位论文数据库，收录有欧美 1，000 余所大学文、理、工、农、医等领域的博士、硕士学位论文，是学术研究中十分重要的信息资 源 . http:/ = (5)美国 Netlibrary(英文电子图书):http:/ NetLibrary 处在美国科罗拉多州波尔德尔市，于 1999 年成立，是世界上向图书馆提供电子图书的主要提供商。NetLibrary 于 2002 年 1 月 25 日成为 OCLC 联机计算机图书馆中心的下属部门。目前，世界上 7000 多个图书馆通过 netLibrary 存取电子图书，其中包括哥伦比亚大学，斯坦福大学，加州大学伯克莱分校，以及世界上其他成
6、千的大小图书馆。 OCLC netLibrary 目前提供 400 多家出版社出版的 60,000 多种电子图书，并且每月增加约 2,000 种。这些电子图书覆盖所有主题范畴，约 80%的书籍是面向大学程度的读者。大多数 NetLibrary 的电子图书内容新颖，近 90%的电子图书是 1990 年后出版的。 netLibrary 是 OCLC 的一个部门，是当前世界上 eBook 的主要提供商，它提供来自 300 多个出版商的 50,000 多种高质量电子图书，这些电子图书的 90%是 1990 年后出版的，每月均增加几千种。 二、荷兰 （1)Sciencedirect: 荷兰 Elsevi
7、er Science 公司出版的期刊是世界上公认的高品位学术期刊，它拥有 1263 种电子全文期刊数据库，并已在清华大学图书馆设立镜像站点：ScienceDirect OnSite（SDOS）。国内 11 所学术图书馆于 2000 年首批联合订购 SDOS 数据库中 1998 年以来的全文期刊。 国内镜像： http:/ http:/ http:/ http:/ http:/ = （2)荷兰 OVID(英文文献期刊)，现为 Wolters Kluwer 集团之一 OVID 科技公司是由总裁 Mark Nelson 于 1984 年创立于纽约，由一人开始营业，扩展 至目前已有将近 200 人。分
8、公司分布于世界各地，如：雪梨、伦敦、巴黎等地。 公司名称也从最早的 Online Research System 改名为 CD Plus，CDP echnologies，而至目前的 OVID Technologies，以强调突显 Ovid 公司与客户及软体间的专业关系。 Ovid 是一全球性的资讯公司，以创造容易撷取资讯、独立于平台之媒介为使命。无论我们的顾客使用Dos、Windows、Unix 或全球资讯网和 Java 平台，皆可经由 Ovid 一般使用者介面轻易地撷取资讯。公司的发展最初由医学起家，从 Medline 至目前已包涵人文、社会、科技等近百种资料库。 1984 发展第一代检索界
9、面1990 发表 CDPNet，建立第一套以 PC 为基础，经由 Novell 环境检索的网路系统 1991 发表 CDPNet Version 2.0，并荣获 Information World Review 评为年度最佳产品 1992 Beta version of Ovid 3.0 成为 Medline 第一个 Windows 界面的产品 1993 发表 Unix 版系统，并荣获 Information Today 评为最佳使用界面及检索引擎 1994 1. 并购 BRS 公司，开启 CDP Online 业务 1995 1. 发表 Windows 和 VT-100 界面 Z39.50
10、相容的 Ovid Client/Server 2. 发表 Ovid Core Biomedical Collection 及 Ovid 全文系统 3. 荣获 Business Week 评为全美排行第 14 大成长迅速的公司 1996 发表 Z39.50 相容的 Ovid Web Gateway 1997 发表第一套 Java 检索介面Ovid Java Client 1998 1. 发表 400 种 STM(Science Technology Medicine)电子全文期刊 2. 九月份 Wolters Kluwer 采购 Ovid 公司股票，Ovid 公司原为检索软体出版公司，现为 Wo
11、lters Kluwer 集团之一员，因 Wolters Kluwer 公司为全球知名 900 种期刊之出版商，故现今 Ovid 除了出版检索软体，也是 Information Provider。 http:/= （3)Kluwer:含电子图书和期刊. 荷兰 Kluwer Academic Publisher 是具有国际性声誉的学术出版商，它出版的图书、期刊一向品质较高，备受专家和学者的信赖和赞誉。Kluwer Online 是 Kluwer 出版的 600 余种期刊的网络版，专门基于互联网提供 Kluwer 电子期刊的查询、阅览服务。 三、英国 （1)英国 Ingenta(英文文献期刊) I
12、ngenta 网站是 Ingenta 公司于 1998 年建成的学术信息平台。在几年的发展中，该公司先后兼并了多家信息公司，合并了这些公司的数据库。2001 年，Ingenta 公司兼并了 Catchword 公司，近期 Ingenta 准备将两家公司的信息平台整合为一体。在整合之前，用户可分别从 I 和 C 查询对方提供的全部信息。整合后可提供全球 190 多个学术出版机构的全文联机期刊 5,400 多种，以及 26,000 多种其它类型出版物。目前，Ingenta 公司在英国和美国多个城市设有分公司，拥有分布于世界各地的 10,000 多个团体用户和 2,500 多万个个人用户，已成为全球
13、学术信息服务领域的一个重要的文献检索系统。 ingenta http:/ = （2)英国 Blackwell(英文文献期刊) (www.blackwell-) Blackwell 出版公司是世界上最大的期刊出版商之一(总部设在英国伦敦的牛津)，以出版国际性期刊为主，包含很多非英美地区出版的英文期刊。它所出版的学术期刊在科学技术、医学、社会科学以及人文科学等学科领域享有盛誉。 近年来，Blackwell 出版的期刊不断发展。目前，Blackwell 出版期刊总数已超过 700 种，其中理科类期刊占 54%左右，其余为人文社会科学类。涉及学科包括：农业、动物学、医学、工程、数学统计、计算机技术、商
14、业经济、生命科学、物理学、人文科学、艺术、社会及行为科学等。 180Emuch.NetV5ZW11Y2geE5Blackwell 出版期刊的学术质量很高，很多是各学科领域内的核心刊物，据最新统计，其中被 SCI 收录的核心期刊有 239 种，被 SSCI 收录的有 118 种。 Blackwell-Synergy journals http:/www.blackwell- 四、德国 springer 德国施普林格(Springer-Verlag)是世界上著名的科技出版集团, 通过 Springer LINK 系统提供学术期刊及电子图书的在线服务。 Springer 公司和 EBSCO/Meta
15、press 公司现已开通 Springer LINK 电子期刊服务。目前 Springer LINK 所提供的全文电子期刊共包含 439 种学术期刊(其中近 400 种为英文期刊)，按学科分为以下 11 个“在线图书馆”：生命科学、医学、数学、化学、计算机科学、经济、法律、工程学、环境科学、地球科学 、物理学与天文学，是科研人员的重要信息源。 目前大部分期刊可以阅读全文，但也有一些期刊尚不能阅读全文，一般规律是：显示 pdf 字样的，可以打开全文，显示 remote pdf 字样的，则不能打开全文，目前代理公司正在解决此事。 Springer Link 涵盖的学科范围及种数： Law (法律)
16、: 5 种 Environmental (环境科学): 37 种 Medicine (医学): 179 种 Geoscience (地球科学): 53 种 Mathematics (数学): 73 种 Life Science (生命科学): 105 种 Economics (经济学): 30 种 Chemical Sciences (化学): 36 种 Engineering (工程): 58 种 Computer Science (计算机科学):45 种 Physics and Astronomy(物理与天文学):61 种 附：（1)wiley 和 spring 可以通过代理注册,注意的是
17、 wiley 需要激活，而且 wiley90 天以后必须进入代理续激活。(2)sd 只能通过代理获取相关文献,注册以后也不能脱离代理。 (3)springer 搜索完以后，前面有眼镜的是可以直接下载观看的，而那些没有的则是要会费的。SCOPUS 数据库介绍SCOPUS 是 Elsevier 公司开发的文摘索引数据库， http:/ 使用说明 SCOPUS 是 Elsevier 公司开发的文摘索引数据库，它收录了来自全球 4000 家 出版社的 14000 多种文献 (主要为期刊)，涵盖了 2700 万条文摘，学科覆盖数学、物 理学、化学、生物学、生命科学、农业、地球和环境科学、工程、心理学、社
18、会科 学等领域。 SCOPUS 数据库有以下几个主要特点： 1） 可以检索论文被其它文献引用的情况； 2） 可以检索到上至 19 世纪发表的文章； 3） 无缝链接至互联网上的全文文献和本馆的其他图书馆资源。生物信息学相关数据库介绍（转贴）数据库是生物信息学的主要内容，各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。核酸序列数据库有 GenBank, EMBL, DDB 等，蛋白质序列数据库有 SWISS-PROT, PIR, OWL, NRL3D, TrEMBL 等，蛋白质片段数据库有PROSITE, BLOCKS, PRINTS 等，三维结构数据库有 PDB, NDB, BioMagResBank,
19、 CCSD 等，与蛋白质结构有关的数据库还有 SCOP, CATH, FSSP, 3D-ALI, DSSP 等，与基因组有关的数据库还有 ESTdb, OMIM, GDB, GSDB 等，文献数据库有 Medline, Uncover 等。另外一些公司还开发了商业数据库,如 MDL 等。生物信息学数据库覆盖面广，分布分散且格式不统一, 因此一些生物计算中心将多个数据库整合在一起提供综合服务，如 EBI 的SRS(Sequence Retrieval System)包含了核酸序列库、蛋白质序列库，三维结构库等 30 多个数据库及CLUSTALW、PROSITESEARCH 等强有力的搜索工具，用
20、户可以进行多个数据库的多种查询。 下面循序简介一些著名和有特色的生物信息数据库。基因和基因组数据库1. GenbankGenbank 库包含了所有已知的核酸序列和蛋白质序列，以及与它们相关的文献著作和生物学注释。它是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护的。它的数据直接来源于测序工作者提交的序列；由测序中心提交的大量 EST 序列和其它测序数据；以及与其它数据机构协作交换数据而来。Genbank 每天都会与欧洲分子生物学实验室(EMBL)的数据库，和 JP 的 DNA 数据库(DDBJ)交换数据，使这三个数据库的数据同步。Genbank 的数据可以从NCBI 的 FTP 服务器上免费
21、下载完整的库，或下载积累的新数据。NCBI 还提供广泛的数据查询、序列相似性搜索以及其它分析服务，用户可以从 NCBI 的主页上找到这些服务。Genbank 库里的数据按来源于约 55,000 个物种，其中 56%是人类的基因组序列(所有序列中的 34%是人类的 EST序列)。每条 Genbank 数据记录包含了对序列的简要描述，它的科学命名，物种分类名称，参考文献，序列特征表，以及序列本身。序列特征表里包含对序列生物学特征注释如：编码区、转录单元、重复区域、突变位点或修饰位点等。所有数据记录被划分在若干个文件里，如细菌类、病毒类、灵长类、啮齿类，以及 EST 数据、基因组测序数据、大规模基因
22、组序列数据等 16 类，其中 EST 数据等又被各自分成若干个文件。(1)Genbank 数据检索NCBI 的数据库检索查询系统是 Entrez。Entrez 是基于 Web 界面的综合生物信息数据库检索系统。利用 Entrez系统，用户不仅可以方便地检索 Genbank 的核酸数据，还可以检索来自 Genbank 和其它数据库的蛋白质序列数据、基因组图谱数据、来自分子模型数据库(MMDB)的蛋白质三维结构数据、种群序列数据集、以及由 PubMed 获得 Medline 的文献数据。Entrez 提供了方便实用的检索服务，所有操作都可以在网络浏览器上完成。用户可以利用 Entrez 界面上提供
23、的限制条件(Limits)、索引(Index)、检索历史(History)和剪贴板(Clipboard)等功能来实现复杂的检索查询工作。对于检索获得的记录，用户可以选择需要显示的数据，保存查询结果，甚至以图形方式观看检索获得的序列。更详细的 Entrez 使用说明可以在该主页上获得。(2)向 Genbank 提交序列数据测序工作者可以把自己工作中获得的新序列提交给 NCBI，添加到 Genbank 数据库。这个任务可以由基于 Web 界面的 BankIt 或独立程序 Sequin 来完成。BankIt 是一系列表单，包括联络信息、发布要求、引用参考信息、序列来源信息、以及序列本身的信息等。用户
24、提交序列后，会从电子邮件收到自动生成的数据条目，Genbank 的新序列编号，以及完成注释后的完整的数据记录。用户还可以在 BankIt 页面下修改已经发布序列的信息。BankIt适合于独立测序工作者提交少量序列，而不适合大量序列的提交，也不适合提交很长的序列，EST 序列和 GSS 序列也不应用 BankIt 提交。BankIt 使用说明和对序列的要求可详见其主页面。大量的序列提交可以由 Sequin 程序完成。Sequin 程序能方便的编辑和处理复杂注释，并包含一系列内建的检查函数来提高序列的质量保证。它还被设计用于提交来自系统进化、种群和突变研究的序列，可以加入比对的数据。Sequin
25、除了用于编辑和修改序列数据记录，还可以用于序列的分析，任何以 FASTA 或 ASN.1 格式序列为输入数据的序列分析程序都可以整合到 Sequin 程序下。在不同操作系统下运行的 Sequin 程序都可以在ftp:/ncbi.nlm.nih.gov/sequin/下找到，Sequin 的使用说明可详见其网页。NCBI 的网址是：http:/www.ncbi.nlm.nih.gov。Entrez 的网址是：http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/。BankIt 的网址是：http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt。Sequin 的相关网址是：
26、http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/。2. EMBL 核酸序列数据库EMBL 核酸序列数据库由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护的核酸序列数据构成，由于与 Genbank 和 DDBJ 的数据合作交换，它也是一个全面的核酸序列数据库。该数据库由 Oracal 数据库系统管理维护，查询检索可以通过通过因特网上的序列提取系统(SRS)服务完成。向 EMBL 核酸序列数据库提交序列可以通过基于 Web 的 WEBIN 工具，也可以用 Sequin 软件来完成。数据库网址是：http:/www.ebi.ac.uk/embl/。SRS 的网址是：http:/srs.ebi
27、.ac.uk/。WEBIN 的网址是：http:/www.ebi.ac.uk/embl/Submission/webin。3. DDBJ 数据库JPDNA 数据仓库(DDBJ)也是一个全面的核酸序列数据库，与 Genbank 和 EMBL 核酸库合作交换数据。可以使用其主页上提供的 SRS 工具进行数据检索和序列分析。可以用 Sequin 软件向该数据库提交序列。DDBJ 的网址是：http:/www.ddbj.nig.ac.jp/。4. GDB基因组数据库(GDB)为人类基因组计划(HGP)保存和处理基因组图谱数据。GDB 的目标是构建关于人类基因组的百科全书，除了构建基因组图谱之外，还开发
28、了描述序列水平的基因组内容的方法，包括序列变异和其它对功能和表型的描述。目前 GDB 中有：人类基因组区域(包括基因、克隆、amplimers PCR 标记、断点 breakpoints、细胞遗传标记 cytogenetic markers、易碎位点 fragile sites、EST 序列、综合区域 syndromic regions、contigs 和重复序列)；人类基因组图谱(包括细胞遗传图谱、连接图谱、放射性杂交图谱、content contig 图谱和综合图谱等)；人类基因组内的变异(包括突变和多态性，加上等位基因频率数据)。GDB 数据库以对象模型来保存数据，提供基于 Web 的数
29、据对象检索服务，用户可以搜索各种类型的对象，并以图形方式观看基因组图谱。GDB 的网址是：http:/www.gdb.org。GDB 的国内镜像是：http:/ PIR 和 PSDPIR 国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和 JP 国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库。这是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库，其中包括来自几十个完整基因组的蛋白质序列。所有序列数据都经过整理，超过 99%的序列已按蛋白质家族分类，一半以上还按蛋白质超家族进行了分类。PSD 的注释中还包括对许多序列、
30、结构、基因组和文献数据库的交叉索引，以及数据库内部条目之间的索引，这些内部索引帮助用户在包括复合物、酶底物相互作用、活化和调控级联和具有共同特征的条目之间方便的检索。每季度都发行一次完整的数据库，每周可以得到更新部分。PSD 数据库有几个辅助数据库，如基于超家族的非冗余库等。PIR 提供三类序列搜索服务：基于文本的交互式检索；标准的序列相似性搜索，包括 BLAST、FASTA 等；结合序列相似性、注释信息和蛋白质家族信息的高级搜索，包括按注释分类的相似性搜索、结构域搜索 GeneFIND 等。PIR 和 PSD 的网址是：http:/pir.georgetown.edu/。数据库下载地址是：f
31、tp:/nbrfa.georgetown.edu/pir/。2. SWISS-PROTSWISS-PROT 是经过注释的蛋白质序列数据库，由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护。数据库由蛋白质序列条目构成，每个条目包含蛋白质序列、引用文献信息、分类学信息、注释等，注释中包括蛋白质的功能、转录后修饰、特殊位点和区域、二级结构、四级结构、与其它序列的相似性、序列残缺与疾病的关系、序列变异体和冲突等信息。SWISS-PROT 中尽可能减少了冗余序列，并与其它 30 多个数据建立了交叉引用，其中包括核酸序列库、蛋白质序列库和蛋白质结构库等。利用序列提取系统(SRS)可以方便地检索 SWISS-PROT
32、和其它 EBI 的数据库。SWISS-PROT 只接受直接测序获得的蛋白质序列，序列提交可以在其 Web 页面上完成。SWISS-PROT 的网址是：http:/www.ebi.ac.uk/swissprot/。3. PROSITEPROSITE 数据库收集了生物学有显著意义的蛋白质位点和序列模式，并能根据这些位点和模式快速和可靠地鉴别一个未知功能的蛋白质序列应该属于哪一个蛋白质家族。有的情况下，某个蛋白质与已知功能蛋白质的整体序列相似性很低，但由于功能的需要保留了与功能密切相关的序列模式，这样就可能通过 PROSITE 的搜索找到隐含的功能 motif，因此是序列分析的有效工具。PROSIT
33、E 中涉及的序列模式包括酶的催化位点、配体结合位点、与金属离子结合的残基、二硫键的半胱氨酸、与小分子或其它蛋白质结合的区域等；除了序列模式之外，PROSITE 还包括由多序列比对构建的 profile，能更敏感地发现序列与 profile 的相似性。PROSITE 的主页上提供各种相关检索服务。PROSITE 的网址是：http:/www.expasy.ch/prosite/。4. PDB蛋白质数据仓库(PDB)是国际上唯一的生物大分子结构数据档案库，由美国 Brookhaven 国家实验室建立。PDB 收集的数据来源于 X 光晶体衍射和核磁共振(NMR)的数据，经过整理和确认后存档而成。目前
34、 PDB 数据库的维护由结构生物信息学研究合作组织(RCSB)负责。RCSB 的主服务器和世界各地的镜像服务器提供数据库的检索和下载服务，以及关于 PDB 数据文件格式和其它文档的说明，PDB 数据还可以从发行的光盘获得。使用 Rasmol 等软件可以在计算机上按 PDB 文件显示生物大分子的三维结构。RCSB 的 PDB 数据库网址是：http:/www.rcsb.org/pdb/。5. SCOP蛋白质结构分类(SCOP)数据库详细描述了已知的蛋白质结构之间的关系。分类基于若干层次：家族，描述相近的进化关系；超家族，描述远源的进化关系；折叠子(fold)，描述空间几何结构的关系；折叠类，所有
35、折叠子被归于全 、全 、/、 和多结构域等几个大类。SCOP 还提供一个非冗余的 ASTRAIL 序列库，这个库通常被用来评估各种序列比对算法。此外，SCOP 还提供一个 PDB-ISL 中介序列库，通过与这个库中序列的两两比对，可以找到与未知结构序列远缘的已知结构序列。SCOP 的网址是：http:/scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/。6. COG蛋白质直系同源簇(COGs)数据库是对细菌、藻类和真核生物的 21 个完整基因组的编码蛋白，根据系统进化关系分类构建而成。COG 库对于预测单个蛋白质的功能和整个新基因组中蛋白质的功能都很有用。利用 COGNITOR 程序，可
36、以把某个蛋白质与所有 COGs 中的蛋白质进行比对，并把它归入适当的 COG 簇。COG 库提供了对 COG 分类数据的检索和查询，基于 Web 的 COGNITOR 服务，系统进化模式的查询服务等。COG 库的网址是：http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/COG。下载 COG 库和 COGNITOR 程序在：ftp:/ncbi.nlm.nih.gov/pub/COG。功能数据库1. KEGG京都基因和基因组百科全书(KEGG)是系统分析基因功能，联系基因组信息和功能信息的知识库。基因组信息存储在 GENES 数据库里，包括完整和部分测序的基因组序列；更高级的功能信息存储在 P
37、ATHWAY 数据库里，包括图解的细胞生化过程如代谢、膜转运、信号传递、细胞周期，还包括同系保守的子通路等信息；KEGG 的另一个数据库是 LIGAND，包含关于化学物质、酶分子、酶反应等信息。KEGG 提供了 Java 的图形工具来访问基因组图谱，比较基因组图谱和操作表达图谱，以及其它序列比较、图形比较和通路计算的工具，可以免费获取。KEGG 的网址是：http:/www.genome.ad.jp/kegg/。2. DIP相互作用的蛋白质数据库(DIP)收集了由实验验证的蛋白质蛋白质相互作用。数据库包括蛋白质的信息、相互作用的信息和检测相互作用的实验技术三个部分。用户可以根据蛋白质、生物物种
38、、蛋白质超家族、关键词、实验技术或引用文献来查询 DIP 数据库。DIP 的网址是：http:/dip.doe-mbi.ucla.edu/。3. ASDB可变剪接数据库(ASDB)包括蛋白质库和核酸库两部分。ASDB(蛋白质)部分来源于 SWISS-PROT 蛋白质序列库，通过选取有可变剪接注释的序列，搜索相关可变剪接的序列，经过序列比对、筛选和分类构建而成。ASDB(核酸)部分来自 Genbank 中提及和注释的可变剪接的完整基因构成。数据库提供了方便的搜索服务。ASDB 的网址是：http:/cbcg.nersc.gov/asdb。4. TRRD转录调控区数据库(TRRD)是在不断积累的真
39、核生物基因调控区结构功能特性信息基础上构建的。每一个 TRRD的条目里包含特定基因各种结构功能特性：转录因子结合位点、启动子、增强子、静默子、以及基因表达调控模式等。TRRD 包括五个相关的数据表：TRRDGENES(包含所有 TRRD 库基因的基本信息和调控单元信息)；TRRDSITES(包括调控因子结合位点的具体信息)；TRRDFACTORS(包括 TRRD 中与各个位点结合的调控因子的具体信息)；TRRDEXP(包括对基因表达模式的具体描述)；TRRDBIB(包括所有注释涉及的参考文献)。TRRD 主页提供了对这几个数据表的检索服务。TRRD 的网址是：http:/wwwmgs.bion
40、et.nsc.ru/mgs/dbases/trrd4/。5. TRANSFACTRANSFAC 数据库是关于转录因子、它们在基因组上的结合位点和与 DNA 结合的 profiles 的数据库。由SITE、GENE、FACTOR、CLASS、MATRIX、CELLS、METHOD 和 REFERENCE 等数据表构成。此外，还有几个与TRANSFAC 密切相关的扩展库：PATHODB 库收集了可能导致病态的突变的转录因子和结合位点；S/MART DB 收集了与染色体结构变化相关的蛋白因子和位点的信息；TRANSPATH 库用于描述与转录因子调控相关的信号传递的网络；CYTOMER 库表现了人类转
41、录因子在各个器官、细胞类型、生理系统和发育时期的表达状况。TRANSFAC 及其相关数据库可以免费下载，也可以通过 Web 进行检索和查询。TRANSFAC 的网址是：http:/transfac.gbf.de/TRANSFAC/。其它数据库资源1. DBCatDBCat 是生物信息数据库的目录数据库，它收集了 500 多个生物信息学数据库的信息，并根据它们的应用领域进行了分类。包括 DNA、RNA、蛋白质、基因组、图谱、蛋白质结构、文献著作等基本类型。数据库可以免费下载或在网络上检索查询。DBCat 的网址是：http:/www.infobiogen.fr/services/dbcat/。下
42、载 DBCat 在：ftp:/ftp.infobiogen.fr/pub/db/dbcat。2. PubMedPubMed 是 NCBI 维护的文献引用数据库，提供对 MEDLINE、Pre-MEDLINE 等文献数据库的引用查询和对大量网络科学类电子期刊的链接。利用 Entrez 系统可以对 PubMed 进行方便的查询检索。PubMed 的网址是：http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/。除了以上提及的数据之外，还有许许多多的专门生物信息数据库，涉及了目前生物学研究的各个层面和领域，由于篇幅所限无法一一详述。国内也有一些大数据库的镜像站点和自己开发的有特色的数据库，如欧洲分子
43、生物学网络组织 EMBNet 中国节点北京大学分子生物信息镜像系统，上海博容基因公司与上海嘉瑞软件公司合作开发的国产汉化基因数据库及分析管理系统，同时国家级的生物信息学中心也在筹建之中。我们期待国内能有更多高质量和使用便利的数据库资源，推动我国生物信息学和整个生命科学的发展。清华大学生物信息学研究所网址：http:/北京大学生物信息镜像系统网址：http:/国外生物医学类（转贴）Genes s Health http:/www.ama-assn.org/public/journals/womh/womhhome.htmArchives of Otolaryngology-Head & Neck
44、 Surgeryhttp:/www.ama-assn.org/public/journals/otol/otolhome.htmArchives of Surgery http:/www.ama-assn.org/public/journals/surg/surghome.htmArchives of Pediatrics & Adolescent Medicine http:/www.ama-assn.org/public/journals/ajdc/ajdchome.htmAmerican Medical Association Science News Updateshttp:/www.
45、ama-assn.org/sci-pubs/sci-news/1997/pres_rel.htmNew England Journal of Medicine新英格兰医学杂志(美国) http:/www.nejm.org该杂志是一本周刊，报道世界上重要的医学研究成果. 由此页面可查询过刊的全部信息，也可阅读现刊的论文摘要. Antimicrobial Agents and Chemotherapy抗菌剂与化学治疗(期刊) (美国)http:/ 其目的是报导目前正在研究的有关在抗菌，抗寄生虫，抗癌制剂与化学治疗等方面的信息. 该页面提供了自 97 年 1 月以来出版的的各期文章目录及文章摘要.
46、American College of Physician美国内科医生学会杂志. http:/www.acponline.org/journals/journals.htm这是一本双月刊，汇集了美国国内著名医学杂志上的重点文章。 该页面提供其过刊及现刊的文章， 其中包括全文和摘要. American Family Physician 美国家庭保健医生杂志http:/www.aafp.org/afp这是由美国家庭保健医科院创办的一份刊物。此页面给出了现刊及部分过刊的文章全文及摘要。还可以进入“疾病咨询”栏目, 帮助你解除疾病带给你的痛苦。 The Journal of Neuroscience神经学杂志 (美国) http:/www.jneurosci.org这是由美国神经学会创办的一份刊物. 由该主页可以进入现刊内容摘要及全文阅读、过刊内容的查找及网上阅读. 并提供一个方便的查询界面，可根据作者名查询、也可用关键词进行查找. Emerging Infectious Diseases 急性传染性疾病 http:/www.cdc.gov/ncidod/EID/eid.htm这是由美国国家传染病中心创办的刊物. 该页面提供了自 95 年至 97 年各期的文章，读者可免费阅读及下载. Cell 细
