1、药物基因组学在肿瘤中应用研究的文献计量学分析 向蓉 金永新 陈世武 杨丽宁 西北民族大学第二临床医学院 甘肃省第二人民医院药剂科 兰州大学药学院 摘 要： 目的:对药物基因组学在肿瘤中应用的研究文献进行计量学分析, 了解该领域目前的研究状态。方法:检索美国科学引文索引网络版数据库, 运用文献计量学分析方法, 对 1982 年 1 月 1 日2017 年 4 月 19 日所收集文献的年份、国家和 (或) 地区、研究机构、期刊、作者、研究领域及被引用频次等进行统计分析。结果:最终纳入文献 3 495 篇, 19822013 年发表文献数量呈上升趋势, 2013年为文献发表高峰年, 之后逐渐下降。共
2、涉及 91 个国家和 (或) 地区, 美国文献发表量显著超过其他的国家和 (或) 地区。共涉及 3 987 家研究机构, 芝加哥大学居首。文献发表在 876 种期刊上, 文献发表量排序居前 10 位的期刊共发表文献 987 篇 (占 28.240%) , 排序居第 1 位的期刊为药物遗传学和基因组学;排序居前 10 位的期刊中影响因子最高的是临床肿瘤学杂志;排序居前10 位的期刊共涉及 16 个期刊引证报告类别。共涉及作者 16 807 位, 其中 140位作者发表的文献量在 10 篇以上;文献发表量排序居前 10 位的作者中, 7 位来自于美国, 排序居第 1 位的作者为美国 H.Lee M
3、offitt 癌症中心的 Mcleod HL。共涉及了 87 个研究领域, 排序居前 4 位的分别为医药学、肿瘤学、基因遗传学和生物技术与应用微生物学。3 495 篇文献被引次数共 94 500 次, 平均被引次数为 27.04 次, 排序居前 3 位的文献中标注的通信作者分别来自英国、德国和法国, 排序居第 410 位的均来自美国;排序居第 1 位的文献为系统识别肿瘤细胞系药物敏感性的基因组标记。结论:药物基因组学在肿瘤中应用研究取得了较大进展, 但近几年的发展减慢, 研究者最关注的问题为基因表达与抗肿瘤药敏感性的关系。目前, 美国研究实力最强, 我国也有较强的科研实力, 但与美国尚存在一定
4、差距。关键词： 药物基因组学; 肿瘤; 美国科学引文索引网络版; 文献计量学分析; 作者简介：向蓉, 副主任药师。研究方向:临床药学。E-mail:收稿日期：2017-08-14基金：西北民族大学中央高校基本科研业务费专项基金资助项目 (No.31920160108) Bibliometrics Analysis on Applied Researches of Pharmacogenomics in OncologyXIANG Rong JIN Yongxin CHEN Shiwu YANG Lining Schoole of the Second Clinical Medicine, No
5、rthwest Minzu University; School of Pharmacy, Lanzhou University; Abstract： OBJECTIVE: To conduct bibliometrics analysis on studies of applied researches of pharmacogenomics in oncology, to investigate the current research situation in this field. METHODS: Web of Science was retrived, bibliometrics
6、analysis was adopted to collect and analyze the collected studies from Jan. 1 st 1982-Apr. 19 th 2017 in terms of published year, nations and ( or) regions, research institutes, journals, authors, research fields, cited frequencies, etc. RESULTS: 3 495 studies were involved finally, the number of st
7、udies presented an increasing trend during 1982-2013, which reached the top in 2013 and then gradually decreased. A total of 91 nations and ( or) regions were involved, the number of studies in America was significantly more than that of other nations and ( or) regions.3 987 research institutions we
8、re involved, the University of Chicago ranked the first. These studies were published on 876 journals, 987 studies ( 28. 240%) were published on the top 10 journals ranked in number of published studies, the first was PHARMACOGENETICS AND GENOMICS; JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY had the highest IF in
9、the top 10 journals; 16 JCR categories were involved in the top 10 journals. 16 807 authors were involved, 140 of which had published over 10 studies; among the top 10 authors ranked in the number of published studies, 7 were from America, the author ranked the first was Mcleod HL from the H. Lee Mo
10、ffitt Cancer Center of America. These studies had involved 87 research fields, the top 4 were respectively medicine and pharmacology, oncology, gene genetics, biotechnology and applied microbiology. The 3 495 studies had been cited for 94 500 times, with an average cited frequency of 27. 04 times, t
11、he correspondent authors of the top 3 studies ranked in cited frequency were respectively from Britain, Germany and France, the fourth to the tenth were from America; the top 1 study was “Systematic Identification of GenomicMarkers of Drug Sensitivity in Cancer Cells ”. CONCLUSIONS: The applied rese
12、arches of pharmacogenomics had achieved great progresses in oncology, yet in a slowdown in recent years, researchers have paid most attention on the relationship between gene expression and the sensitivity of antineoplastic agents; at present, America owns the best research ability, our country also
13、 own well research ability, but there is still a certain gap between.Keyword： Pharmacogenomics; Oncology; Web of Science; Bibliometrics analysis; Received： 2017-08-14肿瘤发病机制及原因复杂, 是目前全世界主要致死原因之一, 会给个人、家庭和社会造成极大负担1。2015 年 1 月 20 日, 时任美国总统奥巴马在国情咨文中提出“精准医疗计划”, 致力于治愈肿瘤和糖尿病等疾病, 让每个人获得个性化的信息和医疗2-3。药物基因组学及相
14、关生物医学技术的广泛应用, 使“精准医疗”成为可能, 相关的研究文献也越来越多4-5。其中, 药物基因组学通过研究个体遗传基因变异与药物反应的关系, 阐明药物反应差异的遗传学本质6-7。文献计量学采用数学和统计学的方法对出版的分布结构、数量关系及变化规律等进行分析研究8, 帮助研究者全面了解相关领域的研究状态9。现借助文献计量学方法对药物基因组学应用于抗肿瘤治疗的研究文献进行计量分析, 为今后的研究提供参考。1 资料与方法数据来源于美国科学信息研究所 (American Institute for scientific information, ISI) 科学引文索引网络版 (Web of S
15、cience) 核心合集数据库, 检索途径为普通检索, 主题为限定的检索字段;以“pharmacogenomic*OR pharmacogenetic*”和“cancer OR neoplasm OR tumour OR tumor OR carcinoma OR adeno-carcinoma OR leukemia OR leukaemia OR sarcoma OR lymphoma OR malignant OR oncology OR metastasis OR oncogene”为检索词检索所有年份的相关文献;对检索结果文献类型选择研究论文进行精炼, 并纳入研究。数据库更新时间为
16、2017 年 4 月 29 日。使用 ISI Web of Knowledge 网站的“分析检索结果”“创建引文报告”功能和 Excel 2007 软件对检索得到文献进行统计分析, 期刊的影响因子 (impact factor, IF) 通过期刊引证报告 (journal citation reports, JCR) 获取。文献计量分析内容为年发表文献量、国家和 (或) 地区、机构、发表期刊、作者及引用次数等。2 结果共检索到 5 461 篇文献, 其中研究论文 3 495 篇 (占 63.999%) , 综述 1 262篇 (23.109%) , 会议摘要 409 篇 (占 7.613%)
17、, 会议论文 229 篇 (占 4.193%) , 其他 (如编者文章、研究快讯、书评、新闻报道、更正、转载和传记等) 66 篇 (占 1.210%) 。最终纳入研究论文 3 495 篇进行分析。2.1 19822017 年每年文献发表量19801990 年仅有 4 篇文献发表, 第 1 篇文献发表于 1982 年;19911997 年每年约有 1025 篇;19982003 年每年约有 4090 篇;20042013 年每年约有130300 篇;20142016 年每年约有 280260 篇文;2017 年截止至 4 月 29 日共有 55 篇。即该领域年文献发表量整体呈先上升后下降趋势,
18、2013 年为文献发表高峰年, 见图 1。图 1 19822017 年每年文献发表量的变化趋势图 Fig 1 Trend chart of number of published studies during 1982-2017 下载原图2.2 文献发表涉及的国家和 (或) 地区3 495 篇文献共涉及 91 个国家和 (或) 地区, 其中 41 个国家和 (或) 地区文献量在 10 篇以上。排序居第 1 位的为美国, 其所发表文献量显著超过其他的国家和 (或) 地区;排序居第 210 位的国家和 (或) 地区的文献发表量差距较小, 见表 1。2.3 文献发表涉及的研究机构3 495 篇文献共
19、涉及 3 987 家研究机构, 其中 68 家机构的文献发表量在 20 篇以上。文献发表量排序居前 10 位的机构中, 芝加哥大学居首位, 各机构之间文献发表量的差异不显著;除第 5 位的机构来自日本外, 其余均来自美国, 见表2。2.4 文献发表涉及的期刊3 495 篇文献发表在 876 种期刊上, 文献发表量排序居前 10 位的期刊共发表文献 987 篇 (占 28.240%) 。排序居前 4 位的期刊发表量明显多于排序居第 510位的期刊;排序居第 1 位的期刊为药物遗传学和基因组学;排序居前 10 位的期刊中 IF 最高 (20.982) 的是临床肿瘤学杂志, 最低 (2.710) 的
20、为药物基因组学, 平均为 IF 6.327。排序居前 10 位的期刊共涉及 16 个 JCR 类别 (Q1 9 个类别, Q2 6 个类别, Q3 1 个类别) , 其中 7 个为医药学, 3 个为基因遗传学, 3 个为肿瘤学, 2 个为生物技术和微生物学, 1 个为多学科, 见表 3。表 1 文献发表量排序居前 10 位的国家和 (或) 地区 Tab 1 Top 10 nations and (or) regions ranked in the number of published studies 下载原表 表 2 文献量排序居前 10 位的研究机构 Tab 2 Top 10 resear
21、ch institutions ranked in the number of published studies 下载原表 表 3 文献发表量排序居前 10 位的期刊 Tab 3 Top 10 journals and their impact factors of articles published 下载原表 2.5 文献发表涉及的作者3 495 篇文献共涉及作者 16 807 位, 其中 140 位作者发表的文献量在 10 篇以上。文献发表量排序居前 10 位的作者中, 7 位来自于美国 (包括圣裘德儿童研究医院 3 位, 芝加哥大学 2 位, H.Lee Moffitt 癌症中心 1
22、 位) , 德国约翰古登堡大学、荷兰雷登大学和加拿大阿尔伯塔大学各 1 位;排序居第 1 位的作者为美国 H.Lee Top 癌症中心的 Mcleod HL, 见表 4。表 4 文献发表量排序居前 10 位的作者 Tab 4 Top 10 authors ranked in the number of published studies 下载原表 2.6 文献发表量涉及的研究领域3 495 篇文献共涉及 87 个研究领域。文献发表量排序居前 4 位的分别为医药学、肿瘤学、基因遗传学和生物技术与应用微生物学, 见表 5。表 5 文献发表量排序居 10 位的研究领域 Tab 5 Top 10 re
23、search fields ranked in the number of published studies 下载原表 2.7 文献被引次数3 495 篇文献被引次数共 94 500 次, 平均被引次数为 27.04 次, 有 124 篇论文至少被引用 124 次 (即 H 指数=124) 。年均被引次数100 次的文献 1 篇, 50100 次的 3 篇, 3050 次的 6 篇;排序居前 3 位的文献中标注的通信作者分别来自英国、德国和法国, 排序居第 410 位的均来自美国;IF 最高为 44.002, 最低为 9.423;研究领域为科学技术其他主题的文献 3 篇、普通内科 3 篇、肿
24、瘤学 2 篇、基因遗传学 1 篇和血液学 1 篇;排序居第 1 位的文献为 2012 年由英国剑桥大学的 Mathew Garnett 及其团队发表的系统识别肿瘤细胞系药物敏感性的基因组标记, 见表 6。3 讨论由图 1 可见, 从年文献发表量的变化趋势来看, 19821997 年药物基因组学在肿瘤中应用研究的文献从无到有, 处于起步阶段;19982013 年发表的文献量明显增加, 进入快速发展阶段, 2013 年达到高峰;20142016 年文献量逐年下降, 发展减缓。2017 年数据不完整, 无法反映真实的变化趋势, 不进行分析, 但随着 2015 年 1 月 20 日时任美国总统奥巴马提
25、出实施“精准医疗计划”, 可能会再次掀起高潮。由表 16 可见, 从国家和 (或) 地区、文献发表的机构分布、作者分布及文献被引用情况等方面分析, 美国均具有绝对优势, 科研实力最强。英国、德国和法国发表的文献年均被引次数排序居前 3 位, 表明上述国家的研究水平很高, 影响力很大;日本国家癌症研究中心发表文献量排序居第 5位, 科研实力较强。其他国家虽也有较强的科研实力, 但与美国相比, 尚有一定差距。我国仅有年发表文献量排序进入了前 10 位, 与美国相比, 差距较大。同时, 高被引次数文献的研究内容以基因表达与药物敏感性的关系10-11、基因多态性12-13、基因组测序14及急性淋巴细胞
26、性白血病的治疗15等为主。排序居第 1 位的是关于 639 个肿瘤细胞系与 130 种抗肿瘤药敏感性关系的文献, 研究结果发现基因突变与大多数抗肿瘤药的敏感性有相关性;研究者认为采用药物基因组学方法分析肿瘤细胞系, 能将抗肿瘤药的药效与肿瘤基因组的复杂功能联系起来, 为抗肿瘤治疗提供了新策略10, 提示该领域研究最关注的热点集中在基因表达与药物敏感性的关系上。表 6 年均被引次数排序居前 10 位的文献 Tab 6 Top 10 studies ranked in the annual cited frequency 下载原表 综上所述, 药物基因组学在肿瘤中的应用研究取得了较大进展, 但近几
27、年的发展减慢, 研究者最关注的问题为基因表达与抗肿瘤药敏感性的关系;美国综合研究实力最强, 英国、德国和法国的研究内容关注度最高, 我国也有较强的科研实力, 但与美国尚存在一定差距。参考文献1Moodley J, Singh V, Kagina BM, et al.A bibliometric analysis of cancer research in South Africa:study protocolJ.BMJ Open, 2015, 5 (2) :e006913. 2Collins FS, Varmus H.A new initiative on precision medicine
28、J.N Engl J Med, 2015, 372 (9) :793-795. 3Reardon S.Precision-medicine plan raises hopesJ.Nature, 2015, 517 (7536) :540. 4徐婵娟, 徐玉萍, 王春松, 等.临床药师参与 1 例华法林个体化抗凝中基因型检测的临床实践J.中国医院用药评价与分析, 2015, 15 (9) :1256-1258. 5Singh A, Singh N, Behera D, et al.Polymorphism in XRCC1 gene modulates survival and clinical
29、 outcomes of advanced North Indian lung cancer patients treated with platinum-based doublet chemotherapyJ.Med Oncol, 2017, 34 (4) :64. 6Olivier C, Williams-Jones B.Global pharmacogenomics:where is the research taking us?J.Glob Public Health, 2014, 9 (3) :312-324. 7马丙钧, 薛文华, 刘凤云, 等.胃肠癌 MTHFR 基因 C677T
30、 多态性与 5-氟尿嘧啶化疗方案治疗敏感性的相关性 Meta 分析J.肿瘤, 2017, 37 (7) :762-772. 8Caglar C, Demir E, Kucukler FK, et al.A bibliometric analysis of academic publication on diabetic retinopathy disease trends during1980-2014:a global and medical viewJ.Int J Ophthalmol, 2016, 9 (11) :1663-1668. 9Miao Y, Liu R, Pu Y, et a
31、l.Trends in esophageal and esopha-gogastric junction cancer research from 2007 to 2016:A bibliometric analysisJ.Medicine (Baltimore) , 2017, 96 (20) :e6924. 10Garnett MJ, Edelman EJ, Heidorn SJ, et al.Systematic identification of genomic markers of drug sensitivity in cancer cellsJ.Nature, 2012, 483
32、 (7391) :570-575. 11Crystal AS, Shaw AT, Sequist LV, et al.Patient-derived models of acquired resistance can identify effective drug combinations for cancerJ.Science, 2014, 346 (6216) :1480-1486. 12Hoffmeyer S, Burk O, von Richter O, et al.Functional polymo-rphisms of the human multidrug-resistance
33、gene:multiple sequence variations and correlation of one allele with P-glycoprotein expression and activity in vivoJ.Proc Natl Acad Sci U S A, 2000, 97 (7) :3473-3478. 13Cartron G, Dacheux L, Salles G, et al.Therapeutic activity of humanized anti-CD20 monoclonal antibody and polymorphism in Ig G Fc receptor FcgammaRIIIa geneJ.Blood, 2002, 99 (3) :754-758. 14Dewey FE, Grove ME, Pan C, et al.Clinical interpretation and implications of whole-genome sequencingJ.JAMA, 2014, 311 (10) :1035-1045. 15Inaba H, Greaves M, Mullighan CG.Acute lymphoblastic leukaemiaJ.Lancet, 2013, 381 (9881) :1943-1955.
