1、基因 SNP 检测技术比较目前，临床可用于药物代谢酶（CYP）基因多态性检测的技术，主要有三种：DNA 测序技术（DNA sequence） 、基因芯片（gene microarray）技术和实时定量PCR（Real time PCR，RT-PCR）技术。这三种技术思路完全迥异，适用的检测对象也因此大不相同。最新的第三代 DNA 测序技术，是采用生物化学和光学技术结合，将 DNA序列中 ATCG 四种碱基逐一转化为电化学信号，通过光学检测设备识读，报告图为四种颜色的峰谷图，根据信号强弱来识别四种碱基。测序技术的优势在于，可以逐一读出全部基因序列，双向测序是基因检测结果金标准，可以用于检测未知基
2、因；缺点是测序对样本 DNA 浓度和纯度要求比较高，实验操作技术要求比较高，且每次实验只能检测一个位点或一段序列。基因芯片技术，是基于生物样本中基因靶序列与固定有基因探针的基因芯片进行特异性杂交，经过酶促化学发光反应，给出待检基因的 SNP 信息的方法。基因芯片技术的优点是可同时在一张芯片上点上多种探针，可一次检测多个 SNP 位点，同时实验操作相对简单，对样本和实验室要求不高,因为比较适合做临床医学转化产品，将临床中与疾病或者药物相关的多个基因放在一张芯片中，开发成试剂盒产品，便于应用。荧光定量 PCR 技术，是指在 PCR 反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号积累实时监测整个 PCR 进程
3、，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。RT-PCR 技术优点是将 PCR 扩增与基因检测同时进行，可以节约大约 2 小时左右的时间，同时在试管中闭盖进行，常用于病毒和微生物的基因检测；缺点是受荧光染料种类限制，一次只能检测 1 个或 2 个 SNP 位点，不适合多基因检测。总体上来说，开展药物代谢酶基因检测大部分临床机构更倾向于采用基因芯片技术，能高效快速的实现一次检测得到全部药物相关遗传信息。美国 FDA 从2005 年起批准用于临床个体化用药相关基因检测产品，至今约 90 中基因检测产品中，绝大部分都采用基因芯片技术。这三种技术的特点和区别列成表格，大致如下：测序 荧光定量 PC
4、R 技术 基因芯片技术资质认证 尚未批准用于临床仅在病毒 DNA 检测领域获得批准；人类基因检测领域尚未批准已获得国家食药监局批准用于临床人的基因检测使用成本 在高通量条件下成本 较低采用荧光显色法，单位点成本高（荧光专利为美国杜邦公司所有）采用化学发光显色方法（类似 ELISA） ，费用大大降低实验条件需要经过培训的高素质专业人员操作，对实验环境有要求需要经过 PCR 扩增资质认证人员和标准的临床 PCR 核酸扩增实验室仅需要一般药师来操作，实验环境与 PCR 核酸扩增实验室相近即可DNA 样本要求纯度和浓度都有较高要求浓度和纯度要求均比较低对 DNA 浓度有要求，纯度要求不高检测通量受限于 PCR 扩增，对于单样本检测多个位点仍比较复杂受限于可用荧光通道数，不同实现高通量检测可同时实现检测样本和检测位点的高通量检测结果检测结果不能直接产生医学报告，需要人工判读检测结果不能直接产生医学报告，需要人工对结果做进一步的分析判断检测结果直接以医学报告的形式呈现，便于医生和患者使用特别情况对部分特殊结构（如发夹结构）的 DNA 检测结果重现性不佳没有限制 没有限制准确性 金标准 准确性较高 准确性高检测信息 产生海量信息，不利 于临床解读 单个基因信息可以是单个或者多个基因，可以有目的的将相关基因组合，一次检测技 术内 容
