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软件使用说明.ppt

上传人:精品资料 文档编号:10342556 上传时间:2019-11-01 格式:PPT 页数:57 大小:6.99MB
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资源描述

1、SigmaPlot 10.0, ImagePro-Plus 6.0,等软件的使用,邓志钦,2019/11/1,1,主要内容,1 运用SigmaPlot 10.0 做全程图,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2 做瞬时图,3 运用SigmaPlot 10.0做I-V 曲线,4 运用SigmaPlot 10.0做断点柱状图,5 运用ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积,6 运用ImagePro-Plus 6.0截图,7运用ImagePro-Plus 6.0分析灰度值,8 ImagePro-Plus 6.0定标,2019/11/1,2,1 运用SigmaPlot 10

2、.0 做全程图,1 运用SigmaPlot 10.0 做全程图,2019/11/1,3,1 运用SigmaPlot 10.0 做全程图,1 点击“File”“Import” “File”,找到你对应的文件,打开格式为“*.TXT”的文件。或者快捷键“Ctrl + L”,2019/11/1,4,1 运用SigmaPlot 10.0 做全程图,2 点击 “Import” 打开格式为“*.TXT”的文件。,2019/11/1,5,1 运用SigmaPlot 10.0 做全程图,3 点击 “Import”。,2019/11/1,6,事件,时间 (s),电流(nA),4 把事件一栏删除,保留时间和电流。

3、,2019/11/1,7,1 运用SigmaPlot 10.0 做全程图,5“时间”栏,从0开始;点击散点图,开始作图。,2019/11/1,8,1 运用SigmaPlot 10.0 做全程图,5 选择“XY pair”,X 轴是时间,Y轴是电流。,2019/11/1,9,1 运用SigmaPlot 10.0 做全程图,2019/11/1,10,1 运用SigmaPlot 10.0 做全程图,6 双击,对图形进行编辑。“LinesThickness”调整线条厚度, “ScalingRange”调整坐标刻度范围; “TicksTick intervals Major Tick”调整坐标刻度间隔。

4、保存文件,可以作为模板。,坐标轴标题22号,Times New Roman,字符和单位之间要空一格,,画出横线,说明加药时间,横线厚度同样0.5,按需调整坐标刻度范围,字体20号。坐标轴厚度,0.5。,2019/11/1,11,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2 做瞬时图,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2 做瞬时图,2019/11/1,12,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2 做瞬时图,1 以制作加药稳定后的瞬时图为例。单击,选中加药稳定后一点。,2019/11/1,13,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2 做瞬

5、时图,2 返回“data”窗口,图中绿色标记的就是这时间中0,40, 80mV所对应电流。以这5个电流为基础作瞬时图。,3 从图中可以看到,这5个电流所对应的事件是:457-461。这时候打开,2019/11/1,14,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2 做瞬时图,4双击,打开 signal2文件夹里的“Cfsview”应用程序。,2019/11/1,15,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2 做瞬时图,5点击“FileOpen” ,选择这个细胞所对应的 “*.DAT”文件。,2019/11/1,16,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2

6、 做瞬时图,6 直接输出生成瞬时图文件。点击“FileExport As” ,更改文件类型*.TXT 和文件名,点击保存 。,2019/11/1,17,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2 做瞬时图,7 点击“OK”,2019/11/1,18,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2 做瞬时图,8 更改“Frames”内容为刚才选中的这一时间段所对应的事件即:“457461”(中间两个点需在英文状态下输入),点击“Export”,2019/11/1,19,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2 做瞬时图,9 打开“SigmaPlot 10.0”,

7、打开刚才用signal2保存的文件。,2019/11/1,20,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2 做瞬时图,10 点击线条图(第一栏第一个),选择 “XYpair”, 点击“下一步”,“s”为X轴, “chan 0”为Y轴,点击“下一步”。,2019/11/1,21,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2 做瞬时图,11 双击纵坐标轴,“Scaling” “Scale type”,选择“Linear”更改类型。点击横坐标,同样更改类型。,2019/11/1,22,2 运用SigmaPlot 10.0和signal 2 做瞬时图,12 双击,对图形进行编辑。

8、“Tick LabelFactor out 1e-3”调整横坐标,保存文件,可以作为模板。,坐标轴标题22号,字符和单位之间要空一格.,说明处理因素,按需调整坐标刻度范围,字体20号。坐标轴厚度,0.5。,Tick LabelFactor out 1e-3”调整横坐标,2019/11/1,23,3 运用SigmaPlot 10.0做I-V 曲线,3 运用SigmaPlot 10.0做I-V 曲线,2019/11/1,24,1 返回“data”窗口,图中绿色标记的就是这时间中0,40, 80mV所对应电流。复制电流到Excel表格中,按顺序或倒序排序,用电流/电阻(pA/pF )得到这一个细胞的

9、电流密度。同理,获得5个以上的数据,作为统计,得到mean std.err。,3 运用SigmaPlot 10.0做I-V 曲线,2019/11/1,25,2用电流/电阻(pA/pF )得到这一个细胞的电流密度。同理,获得5个以上的数据,作为统计,得到mean std.err。,3 运用SigmaPlot 10.0做I-V 曲线,2019/11/1,26,3 运用SigmaPlot 10.0做I-V 曲线,3 按下列格式排好,制作点线图。,X 轴,Y1轴,Y2 轴,2019/11/1,27,3 运用SigmaPlot 10.0做I-V 曲线,4 单击,点“下一步”,“data format”选

10、择 “X many Y” 完成。,2019/11/1,28,3 运用SigmaPlot 10.0做I-V 曲线,5 按需对图形进行编辑。,2019/11/1,29,4 运用SigmaPlot 10.0做断点柱状图,2019/11/1,30,4 运用SigmaPlot 10.0做断点柱状图,1 组间差异很大,需要对柱状图做出调整。,2019/11/1,31,4 运用SigmaPlot 10.0做断点柱状图,2 双击坐标轴,点击“Breaks” “Show breaks” 更改合适的断点位置,点击“确定”。再对图形做出合适的编辑,如柱子颜色,组间距离,线条粗细,字体字号等。,2019/11/1,3

11、2,4 运用SigmaPlot 10.0做断点柱状图,2019/11/1,33,5 运用ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积,2019/11/1,34,5 运用ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积,1 打开目标图像。点击“Edit” “Show breaks” “Duplicate/Crop to AOI”,2019/11/1,35,5 运用ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积,2 点中新创建的图像,点击“Best fit equalization”使图像均衡化。,2019/11/1,36,3 选择菜单栏的“Measure” “Count / Size

12、”, 打开“Count / Size”对话框。,5 运用ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积,2019/11/1,37,5 运用ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积,4 选择 “Count / Size”对话框中的“Select Ranges”。打开“Segmentation”对话框,拖动对话框中“histogram Based”框条和时间轴,保证每个时间点时红色部分填充满细胞,使细胞与背景尽量分开。完成后选择“Apply Mask” “Closd”。,2019/11/1,38,5 运用ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积,5 完成后点击一次 “Cou

13、nt / Size”对话框中的“Count”。这时候看到已经有106个点被标记。 “Count / Size”对话框中的“Measure” 点击“Select Measurements”,打开测量选项对话框。,2019/11/1,39,5 运用ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积,6 选择测量选项对话框中: “Area”, “Center-X (mass)”, “Center-Y (mass)”和“Roundness”四个测量选项。分别对它们进行编辑范围。,2019/11/1,40,5 运用ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积,7 编辑“Area”, “Center

14、-X (mass)”, “Center-Y (mass)”和“Roundness”四个测量选项范围,同时观察左边红色部分的变化,使得细胞面积都在这个范围内。完成后点击“OK”,第二次 点击“Count / Size”对话框中的“Count”,这时候看到已经只有27个点被标记。 。,2019/11/1,41,5 运用ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积,8 第二次 点击“Count / Size”对话框中的“Count”,这时候看到已经只有27个点被标记 。,2019/11/1,42,5 运用ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积,9 点击菜单栏“Measure” “T

15、rack Objiets”, 打开对话框,点击对话框中“ ”图标 ,开始测量。,2019/11/1,43,5 运用ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积,10 测量完成后,点击图标“ ”,对离群值进行剔除,然后输出结果到Excel,就可以算出面积和体积了。,2019/11/1,44,6 运用ImagePro-Plus 6.0截图,2019/11/1,45,6 运用ImagePro-Plus 6.0截图,1 点击“Edit” “AOI”调出 AOI对话框。点击 AOI对话框中“Add”,增加一个区域,命名,保存。,2019/11/1,46,6 运用ImagePro-Plus 6.0截

16、图,2 打开图像,点击下方按钮,选中需要截图的区域。“Ctrl + C” 打开PowerPoint文档, “Ctrl + V” 。直接复制粘贴选中的区域。,2019/11/1,47,6 运用ImagePro-Plus 6.0截图,3 按时间轴,把细胞序列切换到你感兴趣的时间点。双击AOI对话框中刚才所命名的文件。 “Ctrl + C” 打开PowerPoint文档, “Ctrl + V” 。直接复制粘贴选中的区域。,2019/11/1,48,7运用ImagePro-Plus 6.0分析灰度值,2019/11/1,49,7运用ImagePro-Plus 6.0分析灰度值,1 打开图像,打开“Co

17、unt / Size”对话框。,2019/11/1,50,7运用ImagePro-Plus 6.0分析灰度值,2 选择 “Count / Size”对话框中的“Select Ranges”。打开“Segmentation”对话框,拖动对话框中“histogram Based”框条,保证红色部分填充满你的条带,使条带与背景尽量分开。完成后选择“Apply Mask” “Closd”。,2019/11/1,51,7运用ImagePro-Plus 6.0分析灰度值,3 完成后点击一次 “Count / Size”对话框中的“Count”。这时候看到已经有106个点被标记。 “Count / Size

18、”对话框中的“Measure” 点击“Select Measurements”,打开测量选项对话框。选择“IOD”,点击“OK”。,2019/11/1,52,7运用ImagePro-Plus 6.0分析灰度值,4 选择 “Count / Size”对话框中的“View Data”。打开“Measurements Data”对话框。点击“File”,输出数据到Excel。,2019/11/1,53,8 ImagePro-Plus 6.0定标,2019/11/1,54,8 ImagePro-Plus 6.0定标,2019/11/1,55,2019/11/1,56,https:/ 使用教程网站:,谢谢!,2019/11/1,57,

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