1、 GraphPad Prism 5 (仅供内部学习交流) 孙世光 QQ:155104651 Second Affiliated Hospital, sdutcmGraphPad Prism 5 S.G. SUN 目 录 前言1 一操作界面简介2 二柱形图制作4 三T检验及方差分析.7 四量效曲线.10 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 1 前言 GraphPad Prism集生物统计、曲线拟合和科技绘图于一体，虽然在数据统计分析方面的功能不如SAS、SPSS强大，但是其所具有的功能均非常实用和精炼，包括ROC曲线分析、Bland-Altman分析等；另外，曲线拟合功能是Gr
2、aphPad Prism超越其他统计软件的制胜法宝，GraphPad Prism的线性非线性拟合功能使用操作极其方便，不仅内置了常见的回归模型，还专门内置了Radioligand Binding, Bacterial Growth, 量效曲线，峰拟合等数十个生物统计模块；GraphPad Prism的绘图功能也很具特色，无需专门绘制统计图形，只要输入数据，图表自动生成且随数据改变及时更新（word相衔接）；可以说GraphPad Prism当之无愧为非线性拟合的高手。 当前发现关于GraphPad Prism的中文使用说明较少，本人结合自己初次使用的经验以及自己对认为熟悉版块的理解，对Grap
3、hPad Prism的使用进行略微的讲解，以期使其为广大同仁朋友所熟悉、接受做一点事情。本文除了结合 dxy、emuch各位广大同仁朋友的交流贴，还主要参考GraphPad Prism Examples、GraphPad Prism Regression Book、GraphPad Prism Statistics Guide、GraphPad Prism Users Guide，对于想深入了解学习其使用方法的，推荐上述资料。 因为个人才疏学浅，对很多东西的理解可能会有偏颇，期望能交流指正、共同进步（欢迎在论坛或者以其他方式联系交流）。 孙世光 于济南 2009-12-30 GraphPad
4、Prism 5 S.G. SUN 2 一操作界面简介 1-2.关于Prism使用的video以及新打开数据库。 3-7.重点数据处理操作方法。（黄框界定适用的统计方法） XY: 回归、相关、AUC Column: t检验、单因素方差分析 Grouped: 双因素方差分析 Contingency: 卡方检验、相对危险度 Survival: 生存分析 注意黄框：Aviables Analyses 一组仅仅一个Y值 可选择一组Y值个数及plot显示格式 非原始数据形式，可选择格式 1 , 2 3 7 8 11 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 3 一组仅仅一个Y值 每组3个Y值 M
5、eans SD N GraphPad Prism 5 S.G. SUN 4 8-11.历史操作，可以借鉴选择使用 二柱形图制作 进行统计处理前，先要明白两个基本的统计问题：区分因素variables与水平levels；Prism统计数据格式与SAS、SPSSS统计软件数据格式的区别 Prism统计数据格式 SAS SPSS统计数据格式 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 5 重复测量方差分析及非参数分析需要原始数据。我这里的数据不是原始数据，是means&SD，所以无法进行。但是，如果仅仅需要柱形图，则不需要进行分析，Graphs项下即可见到。 【Two variables】
6、Time（2 levels）： Control BXD-Treatment Open-field test（3 levels）：Crossed Rearing Total GraphPad Prism 5 S.G. SUN 6 【数据转置转换标准化】 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 7 三T检验及方差分析 进行统计处理前，先处理清楚三个问题： 判断数据是否符合正态分布/是否是重复测量数据？ t检验 two groups Grouped by one factor (One-way ANOVA) 方差分析 two groups Grouped by two factors (
7、Two-way ANOVA) 常见的统计方法 Dunnett:其他组与空白组比较 Tukey:各组间比较，强烈推荐使用 Newman-Keuls:各组比较不推荐 Bonferronic:各组比较不推荐 Test for linear trend:变量序列比较，增长或降低由左到右等变化 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 8 t检验 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 9 单因素方差分析 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 10四量效曲线 A:激动剂；I:拮抗剂；R:受体；AnR:激动剂复合物；InR:拮抗剂复合物；E:生理效应 InR nI +
8、R + nA AnR EInR In R An AnRKi KaKa= - = -AnRAnRAnPRPAnRKi= - = -InR InPRPInRInRPR+PAnR=1PR+PAnR+PInR=1PAnR= - = -An+KaAn 11+ EC50 A n- = - = -IC50n+IIC50n 11+ IIC50 nP+IAnRPAnRIC50n = 1+ AnKa Ki 区分饱和曲线方程及抑制曲线方程 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 11 注意原始数据格式 原始数据格式转换 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 12选择合适量效关系饱和方程 量效关系饱和方程参数：EC50 Hill GraphPad Prism 5 S.G. SUN 13(待续)
