MassHunter 工作站软件 定性分析气质入门指南.pdf

1、Agilent MassHunter 工作站软件 定性分析 GC/MS 入门指南 GCMS_QualFamiliarization.book Page 1 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PMAgilent MassHunter 工 作站软件 - GC/MS 定 性分析 入门指 南 声明 Agilent Technologies, Inc. 2012 按照美 国和 国际版 权法的 规定， 未经 Agilent Technologies, Inc. 事先同意和书 面许可， 不得 以任何 形式或采 取任何 手 段 （包括 电子存 储和检 索或翻 译成其 他 语言

2、） 复制 本手册 中的任 何内容 。 手册部 件号 G3335-97147 版本 修订版 A ， 2012 年 11 月 美国印 刷 Agilent T echnologies, Inc. 5301 Stevens Creek Blvd. Santa Clara, CA 95051 USA 担保 本文档中包含的材料按 “ 现状” 提 供 ， 若在后续版本中有任何更改 ， 恕不另行通知 。 而且 ， 在适用法律 允许的最大范围内，Agilent 不对本 手册及其 所包含的信息做 出任何明 示或 暗示 的担 保 ， 其中 包括 但不 限 于对适销 性和对具体用途 适用性的 暗示的担保 。 Agil

3、ent 不对因提供 、 使用或执 行本文档或其中 所包含的 信息而造 成的任何错误或 任何意外 或附带的损失承担责任 。 如果 Agilent 与用户签有单独的书面协 议 ， 且协议中涉及本文档所含材料 的担保条款与上述条款发生冲突 ， 则该书面 协议中的担保条 款具有优 先法律效力。 技术 许可 本文 档中所 述的硬 件和 / 或软 件是依 据 许可 提供的 ，且只能 根据此 类许可的 条 款进 行使用 或复制 。 受限 权利声 明 美国 政府受限 权利 。授予联 邦政府的 软 件和技术 数据权利仅包 括通常提供给 最 终用 户的那 些权利 。 Agilent 根据 FAR 12.211 （

4、技术 数据） 和 12.212 （ 计算机 软 件） 和 （ 对于国 防部） DFARS 252.227- 7015 （技术 数据 商 品）以 及 DFARS 227.7202-3 （商业 计算机 软件或 计算机 软 件文 档中的权 利 ） 来 提供软 件和技术 数 据方 面的此 常规商 业许可 。 安全 声明 小心 小心声明表示存在危险。 它表示 在执行某个操作步骤或操作方 法时必须加以注意；如果操作 不当或没有遵守相应的规程， 则 可能会导致产品损坏或重要数 据丢失。 只有完全理解并符合指 定的条件时， 才可以忽略小心声 明的要求继续进行操作。 警告 警告声明表示存在危险 。 它表 示在执

5、行某个操作步骤或操作 方法时必须加以注意；如果操 作不当或没有遵守相应的规 程， 则 可能会 导致人 身伤亡 。 只 有完全理解并符合指定的条件 时 ， 才可以忽略警告声明的要 求继 续进行 操作。 Microsoft 、Windows 7 和 Excel 在美 国和 / 或其他 国家 （或 地区） 的注册 商标。 软件修 订版 本指南 在被 替换前 适用于 Agilent MassHunter Workstation Software - Qualitative Analysis 程序的 B.06.00 及 更高版 本。 GCMS_QualFamiliarization.book Page

6、2 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PMAgilent MassHunter 工作 站软件 - GC/MS 定性 分析入 门指南 3 本指南内容提要 本指南包含有关学习如何使用 Agilent MassHunter Workstation Software - Qualitative Analysis 以及 GC/MS 数据的信息。 开始练习之前，请阅读第 5 页的“开始这些练习之前 .”中的说明。 练习 1 了解 定性分 析的基 本知识 在本练习中，您将探究定性分析程序的多种强大功能。无论您使用的数据类型是 什么，这些任务都至关重要。 练习 2 查找 和识

7、别 在前两组任务中，您将在复杂基质中查找并识别低浓度磺胺药，并为 TOF 和 Q-TOF 数据生成其分子式。您还可以使用 TOF 和 Q-TOF 数据对蛋白质消化执行 分子特征提取。此外，还可以对三重四极杆质谱仪数据执行这些任务。 练习 3 使用 工作流 程、导 出和打 印 在这些任务中，您将学习如何设置和运行定性分析方法。还将学习如何对方法进 行编辑，以自动进行分析和 / 或化合物识别。然后将在打开数据文件时使用自动 化方法执行操作。此外，还将学习如何创建一个方法，以使用工作单执行自动化 操作。这些任务中的每一种都使用不同的工作流进行操作。 参考 信息 在本章中，您将学习有关定性分析程序的基

8、本知识。 GCMS_QualFamiliarization.book Page 3 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM4 Agilent MassHunter 工 作站软件 - GC/MS 定 性分析 入门指 南 新增功能 在 B.06.00 中 可在“化合物详细信息视图”中检查化合物。 “化合物详细信息视图”中有四 个其他窗口。 对于“化合物详细信息视图”，可以为不同类型的色谱图和质谱图定义不同的 线定义。 可使用按积分查找化合物算法。 可以检索多个谱库以查找单位质量谱库检索算法。 在生成分子式算法中，可以选择是否使用分子式标注碎片质谱图峰。碎片标注 根

9、据化合物挖掘算法选择要标注的质谱图。 可对通过按色谱图解卷积查找算法找到的化合物执行生成分子式算法。 生成分子式算法已修改，允许输入每个电荷载体的最大匹配数。 在生成分子式算法中，可以对分子式相同但电荷载体不同的匹配项分组。 可从任何用户质谱图创建化合物。这些化合物的化合物挖掘算法是“质谱图 提取” 。 将结果与数据文件一起保存时，可以选择是将所有化合物结果与数据文件一起 保存还是保存每个化合物的较小的结果集。始终保存所有用户色谱图和用户质 谱图。 C E F 文件的格式已修改，以包括更多信息。 质谱图识别结果表的第一级中包含 m/z 和离子种类信息。 质谱图识别表已修改。可以将过滤器添加到列

10、，并且可以删除行。 现在可以使用分子式和离子种类对峰进行标记。 如果有大量条目，可以非常快速的更改在“质谱图识别结果”窗口中更改标记 为“最佳”的质谱图。 GCMS_QualFamiliarization.book Page 4 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PMAgilent MassHunter 工作 站软件 - GC/MS 定性 分析入 门指南 5 可以指定在化合物报告中叠加化合物色谱图。 缺省分子式确认报告模板已修改，以包括标记（目标化合物）带颜色的列以及 包含带颜色的标记（离子碎片）列的碎片表。 开始这些练习之前 . 安装软件。有关说明，请参见安

11、装指南。 将安装磁盘上名为 Data 的未压缩格式文件夹复制到您硬盘上任意位置。 此文件夹包含这些练习中需要使用的所有数据文件。您可能需要首先从其 .zip 格式文件中提取数据文件。 注意 不要重复使 用系统中已存在的 示例数据文件，除非您确信这些 文件是从磁盘上的 原始文 件复制而来 的 ，并且 只有您使用 过这些文 件 。如果系 统中已存在 的示例数 据文件与磁 盘上的原始文件不 能完全匹配， 则 这些练习中所得 到的结果可能与本 指南 中所显 示的结 果不匹 配。 GCMS_QualFamiliarization.book Page 5 Wednesday, November 21, 2

12、012 5:22 PM6 Agilent MassHunter 工 作站软件 - GC/MS 定 性分析 入门指 南 GCMS_QualFamiliarization.book Page 6 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PMAgilent MassHunter 工作 站软件 - GC/MS 定性 分析入 门指南 7 目录 练习 1 了解 定性分 析的基 本知识 9 任务 1. 打 开 “定 性分析 ”程序 10 任务 2. 配 置适用 于 GC/MS 数据的 用户界 面 12 任务 3. 放 大和缩 小色 谱图 15 任务 4. 锚 定色谱 图 16 任

13、务 5. 更 改窗口 布局 17 任务 6. 提 取色谱 图 19 任务 7. 对 GC/MS 色谱 图进 行交互 式积分 21 任务 8. 计 算系统 适用 性值 25 任务 9. 从 色谱图 中提 取质谱 图 28 任务 10. 添 加注释 37 任务 11. 添 加质量 卡尺 41 练习 2 查找 和识别 43 任务 12. 按 色谱图 解卷积 查找化 合物 44 任务 13. 使 用检索 谱库算 法识别 化合 物 48 任务 14. 按 MRM 查找 化合物 （仅限 于 MRM ） 51 任务 15. 按 积分查 找化合 物 54 任务 16. 为 峰质谱 图生成 分子式 和检 索谱库

14、 57 任务 17. 保 存结果 62 练习 3 使用 工作流 程、导 出和打 印 65 任务 18. 使 用常规 工作流 程设置 和运 行定性 分析方 法 66 任务 19. 使用 “GC/Q-TOF 化 合物筛 查” 工作流 程设置 和运行 方法 71 任务 20. 导出 CEF 文件 74 任务 21. 打 印分析 报告 75 任务 22. 打 印化合 物报告 78 参考 信息 81 使用 窗口 82 GCMS_QualFamiliarization.book Page 7 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM8 Agilent MassHunter

15、工 作站软件 - GC/MS 定 性分析 入门指 南 目录 处理 “数据 浏览器” 中的 结果数 据 84 对色 谱图执 行操作 85 对 MS 或 MS/MS 质 谱图执 行操作 86 处理 色谱图 直观数 据 87 使用 质谱图 直观数 据 88 工作 流程 89 自定 义报告 模板 93 GCMS_QualFamiliarization.book Page 8 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM9 Agilent MassHunter 工作 站软件定 性分析 GC/MS 入门指 南 1 了解定性分析的基本知识 任务 1. 打开 “定 性分析 ”程序

16、10 任务 2. 配置 适用于 GC/MS 数据 的用户 界面 12 任务 3. 放大 和缩小 色谱图 15 任务 4. 锚定 色谱图 16 任务 5. 更改 窗口布 局 17 任务 6. 提取 色谱图 19 任务 7. 对 GC/MS 色谱图 进行交 互式积 分 21 任务 8. 计算 系统适 用性值 25 任务 9. 从色 谱图中 提取质 谱图 28 任务 10. 添加注 释 37 任务 11. 添加质 量卡尺 41 在本练习中，您将了解“定性分析”程序的某些强大功能，该程序可用于处理 GC/Q-TOF 和 GC/QQQ 数据。 我们将每一个练习的内容都放在了一个表中，每个表中分别包含以下

17、三列： 步骤 通过这些常规说明自学使用此程序。 详细说明 如果您需要帮助或更喜欢使用步进学习方式，则可使用这些说明。 注释 阅读这些注释可了解有关练习中的每个步骤的提示和其他信息。 GCMS_QualFamiliarization.book Page 9 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM1 了 解定性 分析的 基本知 识 任务 1. 打 开 “ 定性分 析”程 序 10 Agilent MassHunter 工 作站软件 - GC/MS 定 性分析 入门指 南 任务 1. 打开 “定性分析”程序 在此任务中，您可以使用当前方法来打开多个数据文件。 任务

18、1. 打开 包含多 个数据 文件的 “定 性分析 ”程序 步骤 详细说明 注释 1 打开 “ 定性分析”程序。 打开数据文件 Pest - 200 - Scan.d 、 Pest - STD 200 MRM.d 、 Pest Strawb-01 SPIKED 1 ppb - 1 ul inj.d 和 MSD_mix_4stds_DG_spl200_0 3.d ，这些文件位于文件夹 MassHunterData 中，或在 复制这些文件的文件夹中。 a 双击 Agilent MassHunter 定性分析 B.06.00 图标 。 系统将显示 “打开数据文件”对 话框。 b 转到文件夹 MassH

19、unterData GC 或示例文件所在的文件夹。 Pest - 200 - Scan.d 文件包含 MS 数据， Pest - STD 200 MRM.d 和 Pest Strawb-01 SPIKED 1 ppb - 1 ul inj.d 文件包含 MS 和 MS/MS 数 据 （所有 GC/QQQ）。 MSD_mix_4stds_DG_spl200_03.d 包含 GC/Q-TOF 数据。 当窗口处于活动状态时， 通过按 F1 键可以获取大多数窗口、 对话 框和选项卡的帮助。 确保单击使用当前方法按钮。 确保调用结果数据复选框处于 未选中状态。如果调用 结果 数 据 复选框不可用，则没有

20、在数 据文件中保存任何结果。您可 以了解如何在第 62 页的 “任 务 17. 保存结果” 中保存结果， 以获得如何保存结果的说明。 确保从所选的方法中运行 “文 件打开” 操作 复选框处于未选 中状态。 图 1 打开 软件时 打开数 据文件 GCMS_QualFamiliarization.book Page 10 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM了 解定性 分析的 基本知 识 1 任务 1. 打 开 “ 定性分 析”程 序 Agilent MassHunter 工作 站软件 - GC/MS 定性 分析入 门指南 11 c 按住 Shift 键的同时单

21、击 Pest - 200 - Scan.d 、 Pest - STD 200 MRM.d 、 Pest Strawb-01 SPIKED 1 ppb - 1 ul inj.d 和 MSD_mix_4stds_DB_spl200_03.d 。 d 单击打开。 “ 数据浏览器 ” 窗口中将显示所有 的四个数据文件 ， “ 色谱图结果 ” 窗口中将显示 1 到 3 个色谱图。 e 单击 “色谱图结果 ” 工具栏中的 列 表模式图标 。 如果按 Ctrl 键，则可以选取列表 中多个彼此不相邻的文件。 此时在主窗口中看到的 内容取决 于打开这些文件之前所 使用的方 法 、布局 、显 示和 图谱 设置 。

22、 单击 “列表模式” 图标时， 图标 的背景将变为橙色。 图 2 调用 了 GC/Q-TOF 化合 物筛查 工作流 程的 “定性 分析” 主窗口 。 任务 1. 打开 包含多 个数据 文件的 “定 性分析 ”程序 （续 ） 步骤 详细说明 注释 “最 大列表窗 格数” 图标 “显示选项” 图标 单击 X 按钮 可关闭此 窗口。 GCMS_QualFamiliarization.book Page 11 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM1 了 解定性 分析的 基本知 识 任务 2. 配 置适用 于 GC/MS 数据的 用户界 面 12 Agilent Ma

23、ssHunter 工 作站软件 - GC/MS 定 性分析 入门指 南 任务 2. 配置适用于 GC/MS 数据的用户界面 在此任务中，您将切换到“常规”工作流程（适用于 GC/QQQ 客户）或 “GC/Q-TOF 化合物筛查”工作流程（适用于 GC/Q-TOF 客户）。这两个工作流 程是仅支持对 GC/MS 数据进行分析的工作流程。然后，打开“用户界面配置” 对话框，并选中 GC/QQQ 系统或 GC/Q-TOF 系统对应的复选框。 任务 2. 配置 适用于 GC 的用户 界面 步骤 详细说明 注释 1 如有必要，打开 “ 定性分析” 程序。 a 双击 Agilent MassHunter

24、定性分析 图标 。 系统将显示 “打开数据文件”对 话框。 b 单击 “打开数据文件 ” 对话框中的 取消。 当窗口处于活动状态时， 通过按 F1 键可以获取有关任何窗口、 对 话框或选项卡的帮助。 2 切换到 “ 常规”工作流程或 “GC/Q-TOF 化合物筛查 ” 工作 流程。 a 如果您有 GC/QQQ 仪器，请单击配 置 配置工作流程 常规 命令。 如 果您具备 GC/Q-TOF 仪器 ， 请单击 配置 配置工作流程 GC/Q-TOF 化合物筛查命令。 b 单击 调 用工作 流程 的缺 省方 法按钮 和调用工作流程的缺省布局按钮。 c 单击确定。 d 单击 “色谱图结果 ” 工具栏中的

25、 列 表模式图标 。 如果在同一计算机上安装了适 用于 GC/QQQ 或 GC/Q-TOF 的“ 数 据采集” 程序， 则软件将自动配 置用户界面 。 “方 法 管 理 器”中 可能已有 “GC/Q-TOF 化合物筛 查”部分。 缺省情况下，色谱图会重叠起 来。 对于这些示例， 将以 列表模 式显示色谱图。 GCMS_QualFamiliarization.book Page 12 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM了 解定性 分析的 基本知 识 1 任务 2. 配 置适用 于 GC/MS 数据的 用户界 面 Agilent MassHunter 工作 站

26、软件 - GC/MS 定性 分析入 门指南 13 3 如果您具备 GC/QQQ ，请配置用 户界面以仅显示 GC/QQQ 功能。 a 单击配置 用户界面配置。 b 在 “分离” 类型下方， 仅选中 GC 复 选框。 c 如果您具备 GC/QQQ 仪器， 则在 “电 离”类 型 下，选 中 EI 或 其 他 “硬” 电离技术复选框 ， 然后清除 CI 、 APCI 、 ESI 、 MADLDI 或其他 “软” 电 离技术复选框。 d 在 “ 质量 精确度 ” 下方， 清除 精确 质量 （TOF 、Q-TOF ） 复选框。 选中 单位质量 (Q, QQQ) 复选框。 e 在 “ 可选 软件功能 ”

27、 下， 清除 肽序 列编辑器复选 框和 BioConfirm 软件 复选框。 f 在“ 非 MS 检测器” 下方 ， 清除 UV 和 ADC 复选框。 g 选中显示高级参数复选框。 h 单击确定。 您可以更改用户界面配置对话 框中可用的命令。 在 “用户界面配置” 对话框中清 除某个复选框后， 如果该复选框 对应的功能不可见， 则它可能被 隐藏。 图 3 配置 用户界 面以使 用 GC/QQQ 数据 任务 2. 配置 适用于 GC 的用户 界面 步骤 详细说明 注释 GCMS_QualFamiliarization.book Page 13 Wednesday, November 21, 20

28、12 5:22 PM1 了 解定性 分析的 基本知 识 任务 2. 配 置适用 于 GC/MS 数据的 用户界 面 14 Agilent MassHunter 工 作站软件 - GC/MS 定 性分析 入门指 南 4 如果您具备 GC/Q-TOF 仪器，请 配置用户界面以仅显示 GC/Q-TOF 功能。 a 单击配置 用户界面配置。 b 在 “分离” 类型下方， 仅选中 GC 复 选框。 c 在 “ 电离” 类型下， 选中这两个复 选框。 d 在 MS 级别下， 选中这两个复选框。 e 在 “ 质量 精确度 ” 下， 选中 精确质 量（TOF 、Q-TOF ） 复选框。 清除单 位质量 (Q,

29、 QQQ) 复选框。 f 在 “ 可选 软件功能 ” 下， 清除 肽序 列编辑器复选 框和 BioConfirm 软件 复选框。 g 在“ 非 MS 检测器” 下方 ， 清除 UV 和 ADC 复选框。 h 选中显示高级参数复选框。 i 单击确定。 您可以更改用户界面配置对话 框中可用的命令。 在 “用户界面配置” 对话框中清 除某个复选框后， 如果该复选框 对应的功能不可见， 则它可能被 隐藏。 图 4 配置 适用于 GC/Q-TOF 的用户 界面 任务 2. 配置 适用于 GC 的用户 界面 步骤 详细说明 注释 GCMS_QualFamiliarization.book Page 14

30、Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM了 解定性 分析的 基本知 识 1 任务 3. 放 大和缩 小色谱 图 Agilent MassHunter 工作 站软件 - GC/MS 定性 分析入 门指南 15 任务 3. 放大和缩小色谱图 在此任务中，您将熟悉“定性分析”程序的放大和缩小功能。 GCMS_QualFamiliarization.book Page 15 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM1 了 解定性 分析的 基本知 识 任务 4. 锚 定色谱 图 16 Agilent MassHunter 工 作站软件 -

31、GC/MS 定 性分析 入门指 南 任务 4. 锚定色谱图 在此任务中，您可以锚定色谱图。如果锚定了一个色谱图，则在滚动浏览其他色 谱图来显示这些色谱图时，锚定的色谱图将永久位于显示屏中。 任务 4. 锚定 色谱图 步骤 详细说明 注释 锚定色谱图。 显示所有色谱图。 确保将色谱图查看列表设置 为 1 。 在 “色谱图结果” 窗口中， 选 择第二个 TIC 。 锚定此 TIC 。 滚动浏览色谱图。 清除锚。 a 在 “ 数据 浏览器 ” 中， 标记与在以 前 的任务 中隐 藏的 色谱 图对应 的复 选框。 b 确保在 “色谱图结果 ” 窗口中将窗 格的最大数目设置为 1 。 c 在 “ 色谱

32、图结果 ” 窗口中， 选择第 二个 TIC 。 d 在 该色谱 图中单 击鼠标 右键 ， 然后 单击设置锚。 e 使用 “色谱图结果 ” 窗口中的滚动 条滚动浏览色谱图列表 。 第二个 TIC 始终作为第一个色谱图处于可 见状态。 f 单击色谱图 清除锚。 为色谱图设置锚定属性时， 一个 锚定图标将出现在 “ 数据浏览 器” 窗口中的锚定色谱图名称的 旁边。 在锚 定一个 色谱 图之后 ， 即 使查 看列表显示 1 ， 两个色谱图也会 显示在 “ 色谱图结果 ” 窗口中 。 目前这表示您除了 可查看一个色 谱图外，还可查看锚定色谱图。 此外， 您还可以右键单击该色谱 图，然后单击快捷菜单中的

33、清除锚。 图 5 “色谱 图结果 ”窗口 中锚定 的 TIC GCMS_QualFamiliarization.book Page 16 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM了 解定性 分析的 基本知 识 1 任务 5. 更改 窗口布 局 Agilent MassHunter 工作 站软件 - GC/MS 定性 分析入 门指南 17 任务 5. 更改窗口布局 在此任务中，您可以在主视图中移动窗口并创建多个窗口布局。 任务 5. 更改 窗口布 局 步骤 详细说明 注释 1 更改窗口布局： 更改窗口大小。 保存窗口布局。 解除布局锁定。 将 “色谱图结果” 窗口

34、更改为 浮动状态。 移动 “ 色谱图结果”窗口。 显示用于重新定位窗口的 工具。 要更改窗口的大小 ， 请在窗口之间 拖动边界。 要保存窗口布局，请单击配置 窗 口布局 保存布局。 要解除布局锁定，请单击配置 窗 口布局 锁定布局。 为了使窗口浮动 ， 请右键单击窗口 的标题栏 ， 然后单击快捷菜单中的 浮动。 要移动窗口 ， 请单击窗口的标题栏 并将该窗口拖动到所需的位置。 要显示重新定位工具 ， 请将该窗口 拖动到某个其他窗口之上 。 当一个 窗口与另一个窗口重叠时 ， 该程序 将显示多个布局工具， 如图6 所示。 如果解除布局锁定， 则系统不会 在 “锁定布局” 菜单旁边显示选 中标记。

35、 您只能在解除布局锁定时使用 重新定位工具。 此外 ， 通过双击窗口的标题栏 ， 也可以使窗口浮动。 该软件创建了许多不同的布局 。 您还可以尝试调用不同的布局。 该软件具有多个不同的工作流 程。 每个工作流程调用的布局都 不同。 此外， 切换到不同的工作 流程时，布局也将随之更改。 图 6 窗口 重新定 位工具 GCMS_QualFamiliarization.book Page 17 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM1 了 解定性 分析的 基本知 识 任务 5. 更 改窗口 布局 18 Agilent MassHunter 工 作站软件 - GC/M

36、S 定 性分析 入门指 南 2 重新定位 “色谱图结果” 窗口。 移动该窗口， 使其依次位于其 他窗口的顶部、 左侧、 右侧和 底部。 同时移动两个窗口， 使其中某 个窗口位于另一个窗口的顶 部， 且只能通过底部的选项卡 来使用。 恢复缺省布局。 如果将 光标拖动 到某个 较小的图 标 之上 ， 则您正在拖动的窗口将被置 于所有其他窗口的上方 、 右侧 、 下 方或左侧。 将光标拖动到较大的图标上方 。 通 过将光 标拖动到 较大图 标的边缘 上 方 ， 还可以将该窗口置于另一个窗 口的上方、右侧、下方或左侧。 要将两个窗口一同显示在选项卡 中 ， 请将光标拖动到较大图标的中 心上方 。 这两

37、个窗口将一同显示在 选项卡上 ， 您将看到它们的副本 。 停止拖动鼠标 。 这两个窗口将一同 显示在选项卡中。 单击配置 窗口布局 恢复缺省 布局。 光标必须位于框中某个箭头上 方才能执行重新定位。 单击恢复缺省布局命令， 可以恢 复 “常规 ” 工作流程和 “GC/Q-TOF 化合 物筛查”工 作流 程中使用的布局。 如果使用的是 其他工作流程， 则需要调用在该 工作流程中使用的布局。 任务 5. 更改 窗口布 局 （ 续） 步骤 详细说明 注释 GCMS_QualFamiliarization.book Page 18 Wednesday, November 21, 2012 5:22 P

38、M了 解定性 分析的 基本知 识 1 任务 6. 提 取色谱 图 Agilent MassHunter 工作 站软件 - GC/MS 定性 分析入 门指南 19 任务 6. 提取色谱图 在此任务中，您可以从原始 TIC 提取并合并色谱图。 任务 6. 提取 色谱图 步骤 详细说明 注释 1 提取并合并从 Pest - 200 Scan.d 数据文件两个质量数中得到的 提取离子色谱图 (EIC) 。 m/z 值为 129.0 和 414.2 。 请勿将各个质量中的峰合并 到一个色谱图中。 a 在 “数据浏览器”窗口中，清楚 Pest - 200 Scan.d 以外的数据文件 对应的复选框。 b

39、使用下列选项或右侧的选项之一 ， 打开 “提取色谱图”对话框： 单击色谱图 提取色谱图。 c 在已打开 的数据 文件列 表 中，单 击 Pest - 200 - Scan.d 。 d 在类型列表框中，选择 EIC 。 e 在 m/z 值字段中，键入 129.0, 414.2 。 f 如果 有 必要，清 除 将 多个质 量合并 到一 个色 谱 图中 复 选框 以合并 这些 EIC 。 g 单击确定。 h 将 “色谱图结果 ” 工具栏中的 最大 列表窗格数设置为 3 。 您还可以采用下列方法之一来 提取色谱图： 在色谱图中单击鼠标右键， 然 后单击提取色谱图。 在 “数据浏览器” 中， 选中与 s

40、ulfas_PosMS.d 对应的 TIC 全 扫描 ， 然后右键单击 TIC 全扫 描并单击提取色谱图。 您可以对全部或 MS 使用 MS 级别。 请注意， 您还可以选择在提取后 对提取的色谱图自动进行积分。 也可以从质谱图中提取色谱图。 图 7 “提取 色谱图 ”对话 框 GCMS_QualFamiliarization.book Page 19 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM1 了 解定性 分析的 基本知 识 任务 6. 提 取色谱 图 20 Agilent MassHunter 工 作站软件 - GC/MS 定 性分析 入门指 南 图 8 合并

41、 后的提 取离子 色谱图 (EIC) （ 与原始 TIC 比较 ） 任务 6. 提取 色谱图 （续 ） 步骤 详细说明 注释 GCMS_QualFamiliarization.book Page 20 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM了 解定性 分析的 基本知 识 1 任务 7. 对 GC/MS 色谱图 进行交 互式积 分 Agilent MassHunter 工作 站软件 - GC/MS 定性 分析入 门指南 21 任务 7. 对 GC/MS 色谱图进行交互式积分 在此任务中，您将学会用于对色谱图进行积分、更改积分参数以修改结果，以及 为 MS/MS

42、数据的积分峰计算信噪比的多种不同方法。 任务 7. 对色 谱图进 行交互 式积分 (GC/MS) 步骤 详细说明 注释 1 使用右侧列出的任一选项 ， 对 Pest - 200 - Scan.d 数据文件的 “TIC 全扫描”色谱图进行 积分。 a 选中 “数据浏览器”窗口中的 Pest - 200 - Scan.D 数据文件。 b 选中 TIC 全扫描色谱图，然后使用 下列命令之一： 在菜单栏中，单击色谱图 积分 色谱图。 在色谱图窗口中的任意位置单击 鼠标右键，然后单击积分色 谱图。 在 “数 据 浏 览 器”窗 口 中，选 择 Pest - 200 - Scan.D 用户色谱图 TIC

43、全扫描 ， 右键单击 “TIC 全扫 描” ，然后单击积分色谱图。 请注意， 该程序实际上已对色谱 图中的所有峰进行了积分。 您可以选择 “方法编辑器” 窗口 中对 MS 数据 、 MS/MS 数据和 GC 数据使用的积分器。 该色谱图是 MS 色谱图，因此在 对此色谱图积分时 ， 将使用在 “方 法 编 辑 器”的 “积 分 (MS) ” 部分中设置的值。 2 同一时间仅显示两个色谱图。 在 “色谱图结果 ” 工具栏的最大列 表窗格数框中，选择 2 。 图 9 包含 多个小 峰的已 积分 TIC 全扫描 色谱图 对多个小峰积分。 GCMS_QualFamiliarization.book P

44、age 21 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM1 了 解定性 分析的 基本知 识 任务 7. 对 GC/MS 色 谱图进 行交互 式积分 22 Agilent MassHunter 工 作站软件 - GC/MS 定 性分析 入门指 南 3 更改阈值 ， 减少要进行积分的 峰的数量。 更改阈值以便仅保留这三个 最大的峰。 a 在 “ 方法 管理器 ” 窗口中， 单击 色 谱图 积分 (MS) 以显示 “ 积分 (MS) ”选项卡。 b 选择 Agile 积分器。 c 单击峰过滤器选项卡。 d 在 “最大峰数量” 下， 选中上限 （按 峰高） ，然后键入 3

45、 。 请注意， 当前方法的设置发生更 改时， 会出现蓝色三角形。 保存 该方法时，该三角形将消失。 图 10 选中 了上限 （按 峰高） 的 “ 峰过滤 器”选 项卡 4 对色谱图重新积分 e 单击 “ 方法编辑器 ” 工具栏中的按钮，以便使用新设置进行 积分。 请注意， 现在仅对这三个最大的 峰进行积分。 2.491 处的峰比 16.858 分钟处的峰 更高，因此，可将其选作第三 个峰。 图 11 限制 了峰数 量的已 积分 TIC 全扫描 色谱图 任务 7. 对色 谱图进 行交互 式积分 (GC/MS) （续） 步骤 详细说明 注释 GCMS_QualFamiliarization.boo

46、k Page 22 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM了 解定性 分析的 基本知 识 1 任务 7. 对 GC/MS 色谱图 进行交 互式积 分 Agilent MassHunter 工作 站软件 - GC/MS 定性 分析入 门指南 23 5 对 Pest - STD 200 MRM.D 数据文 件的 TIC MRM 色谱图进行 积分。 a 在 “数据浏览器”窗口中，对 Pest - STD 200 MRM.d 数据文件选择 TIC MRM 。 b 使用下列命令之一积分色谱图。 在菜单栏中，单击色谱图 积分 色谱图。 在色谱图窗口中的任意位置单击 鼠标右

47、键，然后单击积分色 谱图。 在 “ 数据 浏览器 ” 窗口中， 右键 单击 高亮显 示的色 谱图 ， 然后 单 击积分色谱图。 c 在 5.8 至 8.5 分钟范围内放大。 d 将最大列表窗格数设置为 2 。 按 Ctrl 键以在 “数据浏览器” 窗 口中选中多个色谱图。 请注意， 该程序实际上已对色谱 图中的所有峰进行了积分。 这些色谱图是 MS/MS 色谱图， 因此在对这些色谱图积分时， 将 使用在 “ 方法编辑器 ” 窗口的 “积 分 (MS/MS)” 部分中设置的 值。 您可以选择使用一个积分器 对 MS 色谱图积分 ， 使用其他积 分器对 MS/MS 色谱图积分。 图 12 已积 分

48、的 MRM 色谱图 6 选择 MS/MS (GC) 积分器。 将过 滤器更改为仅接受绝对峰高大 于或等于 20,000 的峰。 a 在 “ 方法 管理器 ” 窗口中， 选择 色 谱图 积分 (MS/MS) 。 b 选择 MS/MS (GC) 作为积分器。 c 单击峰过滤器选项卡。 d 在过滤下，单击峰高。 e 在 “ 峰高 过滤器 ” 下， 选中 绝对峰 高复选框。 f 键入 60000 作为绝对峰高。 请注意， 当前方法的设置发生更 改时， 会出现蓝色三角形。 保存 该方法时，该三角形将消失。 任务 7. 对色 谱图进 行交互 式积分 (GC/MS) （续） 步骤 详细说明 注释 GCMS_

49、QualFamiliarization.book Page 23 Wednesday, November 21, 2012 5:22 PM1 了 解定性 分析的 基本知 识 任务 7. 对 GC/MS 色 谱图进 行交互 式积分 24 Agilent MassHunter 工 作站软件 - GC/MS 定 性分析 入门指 南 图 13 选中 了绝对 峰高的 “峰 过滤器 ”选项 卡 7 对色谱图重新积分 g 单击方法编辑器工具栏中的 按钮。 请注意， 现在仅对这些最大的峰 进行积分。 图 14 使用 较高的 阈值设 置对 TIC 和 EIC MS/MS 色 谱图进 行积分 8 恢复为当前方法保存的设置并 关闭 “ 方法编辑器” 。 a 在 “方法管理器” 中， 选择 “色谱 图” “积分 (MS/MS) ”部分。 b 单击方法编辑器中的