1、提取 RNA(以下步骤都在冰盒中进行)1. TRLzol 加入培养皿中(1ml) ,静置 5min 后,将每个面都吹一下,转入1.5ml 的离心管(附一)2. 加入氯仿,量为 TRLZOL 的五分之一,悬空打入,然后摇匀静置 5min,然后离心:4,12000g,15min3. 吸取三层中最上层的水层,加入等量的异丙醇,悬空打入,混匀,静置10min,离心:4,12000g,10min,吸去上清液4. 加入 1ml 的 75的乙醇,离心:4,12000g,5min(重复两遍)5. 吸干酒精,静置 10min 使酒精风干,再加入 20l 的 DEPC 水,加入后吹打几下,使 RNA 溶解。6.
2、用 DEPC 水稀释 10-20 倍,每份总量为 10l,既 9l 的水和 1l 的 RNA,测 RNA 浓度(附二)7. 逆转录,总体系 10l,RNA 加入量不超过 500ng,但是尽量靠近 500ng。5Prime 2lRT Enzyme 0.5lPrimer 0.5lRandom 0.5lRNADEPC 水8. 先配好前四样的混合液,后两样根据测的 RNA 浓度计算,保证 RNA 不超过500ng9. 按照要求加入药品,放入仪器中,设置 HAO,10l 逆转录。10. 转录完成后,取 1l 的样品,稀释 10 倍,用 Q5000 测浓度,一般都是120-130,所以可以稀释 13 倍,
3、使 cDNA 不超过 100ng。11.PCR 体系:SYBR GREEN 12.5lDEPC 水 10.5l前引物 0.5l后引物 0.5lDNA 模版 1l6.5 l10 l算好总量,提前混合使用前离心,再根据说明书溶解成母液,再稀释 10 倍成为工作液12. 前后引物和模版稀释后都需要涡旋离心。加入 SYBR GREEN 需要避光,准备八连管。13.PCR 仪器使用前先打开预热 30min,打开 GFX manager 软件,File 里打开Protocol,选择设定好的程序,再点 next,设定 plate , setting 里的Target(目标名称)和 Sample(样品名称)1
4、4. 选择样品位置,名称,直到显示点击开始运行。附一:台内操作手套在细胞间拿,所有物品进入都需酒精灭菌,离心管需用镊子夹出使用,出操作台要带上一层一次性的手套防止污染。附二:测浓度需要用一组空白的溶剂进行 BLANK,确定基线。 ,每份样品涡旋离心使其浓度均匀。使用 Q5000 进行测量BLANK 空白校准Measure 测样品浓度Sample type 测量种类260/280 纯度,2.0 左右,不低于 1.8260/230 有机残留,2.0 左右每次用完都用二次水湿润的纸擦一次,干燥的纸擦一次,每个样品测三次。导出到 Excel。退出系统 exit关闭机器,罩上罩子。UNK目标引物名称样品名称