1、PCR聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction ,PCR)是 80 年代中期发展起来的体外核酸扩增技术.它具有特异、敏感、产率高、快速、简便、重复性好、易自动化等突出优点;能在一个试管内将所要研究 的目的基因或某一 DNA 片段于数小时内扩增至十万乃至百万倍,使肉眼能直接观察和判断;可从一根毛发、一滴血、甚至一个细胞中扩增出足量的 DNA 供分析研 究和检测鉴定.过去几天几星期才能做到的事情,用 PCR 几小时便可完成.PCR 技术是生物医学领域中的一项革命性创举和里程碑.PCR 在医学检验学中最有价值的应用领域就是对感染性疾病的诊断.癌基因的表达增加和突变,在许多肿瘤
2、早期和良性的阶段就可出现.PCR 技术不但能有效的检测基因的突变,而且能准确检测癌基因的表达量, 可据此进行肿瘤早期诊断、分型、分期和预后判断.PCR 技术首次临床应用就是从检测镰状细胞和 -地中海贫血的基因突变开始的.基因的突变和缺失均会引起各种珠蛋白的表达不平衡,用 FQ-PCR 检测各种珠蛋白基因表达差异,是地中海贫血诊断的有效手段.PCR 技术的基本原理 类似于 DNA 的 天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物.PCR 由变性-退火-延伸三个基本反应步骤构成:模板 DNA 的变性:模板DNA 经加 热至 93左右一定时间后,使模板 DNA 双链或经 PCR 扩增形
3、成的双链 DNA 解离,使之成为单链,以便它与引物结合, 为下轮反应作准备;模板 DNA 与引 物的退火( 复性):模板 DNA 经加热变性成单链后,温度降至 55左右, 引物与模板 DNA 单链的互补序列配对结合;引物的延伸:DNA 模板-引物结合 物在 TaqDNA 聚合酶的作用下,以 dNTP 为反应原料, 靶序列为模板, 按碱基配对与半保留复制原理 ,合成一条新的与模板 DNA 链互补的半保留复制链重复循环变性-退火-延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板.每完成一个循环需 4 分钟 ,3 小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍.到达平台期(Pl
4、ateau)所需循环次数取决于样品中模板的拷贝 .PCR 的应用在基因诊断和肿瘤标志物检测两大领域.关于名称根据 MIQE(Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments)的指导方针,qPCR 为 Quantitative real-time PCR 的简称,RT-qPCR指的是 Reverse transcriptionqPCR,RT-PCR 仅用来表示 Reverse transcription polymerase chain reaction,而不是 Real-time PCR,
5、但是有少数作者并没有坚持这一原则。根据所使用的技术不同,实时荧光定量 PCR 可以分为:荧光探针和荧光染料两种方法。现将其原理简述如下:1. TaqMan 荧光探针:TaqMan 探针法是高度特异的定量 PCR 技术,其核心是利用 Taq酶的 35 外切核酸酶活性,切断探针,产生荧光信号。PCR 扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR 扩增时,Taq 酶的 35外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每
6、扩增一条 DNA 链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与 PCR 产物形成完全同步。而新型 TaqMan-MGB 探针使该技术既可进行基因定量分析,又可分析基因突变(SNP),有望成为基因诊断和个体化用药分析的首选技术平台。2. SYBR 荧光染料 :在 PCR 反应体系中,加入过量 SYBR 荧光染料,SYBR 荧光染料非特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的 SYBR 染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。SYBR 仅与双链 DNA 进行结合,因此可以通过溶解曲线,确定 PCR 反应是否特异。SYBR 荧光染料法定
7、量 PCR 的基本过程是:1 开始反应,当 SYBR 染料与 DNA 双链结合时发出荧光;2 DNA 变性时,SYBR 染料 释放出来,荧光急剧减少;3 在聚合延伸过程中,引物退火并形成 PCR 引物;4 聚合完成后,SYBR 染料与双链产物结合,定量 PCR 系统检测到荧光的净增量加大。实时荧光定量 PCR 技术根据化学原理可以分为探针类和非探针类。探针类实时荧光定量 PCR 技术主要是利用与靶序列特异杂 交的探针来指示扩增产物的增加;非探针类实时荧光定量 PCR 技 术主要通过荧光染料来指示产物的增加。无论是探针类实时荧光 定量 PCR 技术还是非探针类实时荧光定量 PCR 技术,检测的都
8、是 扩增产物的增加量。但探针类实时荧光定量 PCR 技术增加了识别 探针的具体的流程,操作的难度较大。实时荧光定量 PCR 技术的特点1 准确性高 实时荧光定量 PCR 技术使用专门针对靶序 列设计的特异性来识别定量分子,准确度很高,由靶序列和探针 双方面控制,大大提升了 PCR 技术的特异性,降低了检测的假阳 性率。2 灵敏度高 实时荧光定量 PCR 技术将传统的 PCR 技 术、荧光标记技术和激光技术进行了融合,提高了检测的灵敏性。3 线性反映好 由于荧光信号和扩增产物具有一定的联 系,因此,使用实时荧光定量 PCR 技术可通过检测荧光信号定量 扩增产物。4 易操作、环保性高 使用实时荧光定量 PCR 技术进行 检测是在一个管内完成的,可减少相关污染物的排放,检测可在 一次完成,无需进行反复的检测,不会出现反复污染的情况。5 速度快、效率高 使用实时荧光定量 PCR 技术可在 2 3 个小时完成多个样品的定量分析,有效地减少医务工作者 的劳动量。