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分子生物学大题整理——马显才.doc

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资源描述

1、按照 2011 年向前整理:1. 简述 RNA 聚合酶 II 中的 CTD 序列在转录过程及转录后修饰中的作用。解释:RNA 聚合酶 II 最大亚基末端的羧基端结构域(CTD)是由以七个氨基酸(Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser)为重复单位的高度保守的重复序列组成的。主要作用有一下几个方面:CTD 可以接受转录因子 TFIIH 的磷酸化作用,使得 RNA 聚合酶从 Pol IIA 状态转变为 Pol IIO 状态,最终导致转录起始过渡到转录延伸阶段;CTD 参与新转录出的 mRNA 5端帽子的加工,它可以作为一个停靠点,募集加帽酶中诸如鸟苷酸转移酶、甲基转移酶等,并且这种加

2、工作用在 RNA 聚合酶转录合成出 2530 个核苷酸时便已经开始,属于共转录过程之一;CTD 还参与 mRNA53间的剪接过程,CTD 可以作为剪接体的一个组装位点,使得剪接因子能够快速识别mRNA 上面的内含子序列,介导包括可变剪接在内的剪接过程;CTD 序列还参与到 mRNA 多聚腺嘌呤核苷酸的合成过程,和加帽过程一样,CTD 也是作为 poly(A)聚合酶等酶停靠的位点,从而易于迅速的识别找到聚腺苷酸化信号,并且启动加尾过程。2. 蛋白质合成中是如何保证其翻译的正确性?解释:首先起始过程具有具有“第二遗传密码”保证机制。在 tRNA 的识别过程中,tRNA 可以专一的和某一种氨基酸向识

3、别结合,同时,氨酰 tRNA 合成酶也具有高度的专一性,氨酰 tRNA 合成酶的专一性很高,共有 20 种,每一种只用于单一种氨基酸与相应 tRNA 的结合;tRNA 上的某些结构特征能使它在氨酰 tRNA 合成酶的催化下,与特定的氨基酸结合;这些结构特征就是“第二遗传密码” (the second genetic code) ;“第二遗传密码”常在 tRNA的受体茎(acceptor stem)上,但在其他区域的也有不少; “第二遗传密码”较复杂,且是非简并的, 但专一性同样很强。在延伸过程中,氨酰 tRNA 结合到核糖体的 A 位中的过程具有校对功能,如错误的氨酰 tRNA 进入了 A 位

4、(反密码子与密码子不能很好配对) ,可进行校正,当配对正常时,GTP 可以水解从而使 EF-Tu 从 A 位点离去,但是当配对不正常时,GTP 将无法水解,于是平衡向着核糖体和 GTP-EF-Tu-aa-tRNA 三联复合物解离的方向移动,完成校对作用;在终止的过程中,翻译到达终止密码子后,释放因子及 GTP 结合到核糖体的相应位点,促使肽链与 tRNA 的连结断开;接着释放因子和 tRNA 从核糖体解离(这一过程需 GTP 水解) ;最后,核糖体与 mRNA 解离,核糖体大小亚基解离。3. 什么是选择性剪接?具有什么生物学意义?解释:定义:一个基因转录出来的 RNA 前体,通过不同的剪接方式

5、(选择不同的外显子)而形成不同的成熟mRNA,产生不同的蛋白质。意义:通过选择性剪接,可对基因的表达起一定的调控作用。选择性剪接常用于在不同的组织或发育时期产生组织特异或调控发育的蛋白质;选择性剪接还可有重要的生物学效应,如在果蝇的性决定体系中起重要的作用。4. 简述乳糖操纵子的组成及其表达调控的机制。解释:组成:lacZ: -半乳糖苷酶( - galactosidase)基因lacY: 半乳糖苷透过酶(galactoside permease)基因lacA: 半乳糖苷乙酰基转移酶( galactoside transacetylase)基因lacI: 调节基因( regulatory gen

6、e)Operator: 操纵区Repressor: 阻遏子(阻遏物)Inducer: 诱导物(异构乳糖,allolactose )调控机制:阻遏物的负调控机制:A. 当没有乳糖时,阻遏物将阻止启动子下游的链被打开。B. 当有乳糖时,inducer(乳糖)将和阻遏物结合,导致阻遏物无法结合到启动子下游的序列。CAP-cAMP 的正调控机制:A. cAMP 在细胞中的浓度与葡萄糖的含量成反比,它与一种称为代谢物激活蛋白(catabolite activator protein,又称 CAP,另一称呼是环腺苷酸受体蛋白:cAMP receptor protein,CRP)一起,起到正调控作用。因此,

7、起正调控作用的是 CAP-cAMP。B. 乳糖操纵子的启动子实际上是一种弱启动子,其 -35 box 与原核启动子相应的共同序列相差甚大,因此才需要CAP-cAMP 进行正调控;如果是强启动子(与共同序列十分相近) ,则不需要正调控,但这种情况会使得即使葡萄糖存在,乳糖操纵子也一样运作。C. 通过对有关突变体进行分析,发现 CAP-cAMP 的结合位点在启动子的上游(与启动子紧密相邻) ,该位点称为激活物位点(activator site) 。 CAP-cAMP 结合到激活物位点后,就会促进 RNA 聚合酶与 DNA 形成 open promoter complex( CAP-cAMP 能加快

8、 closed promoter complex 的形成,从而提供了更多形成 open promoter complex 的机会) ,结果是促进转录。5. 简述枯草杆菌色氨酸操纵子的衰减作用机理。解释:衰减(弱化)作用指的是 因子非依赖性的终止。在最后的序列中会形成一段强的 G-C 结合区间(单纯的 RNA之间) ,然后形成一段 A-T 弱结合的相互作用(RNA 和 DNA 之间) 。前导区与弱化子转录物的第一种较稳定的结构有一终止子(-independent terminator) ,能使弱化作用发生,转录终止转录物的第二种较不稳定的结构没有终止子,转录能继续色氨酸的多寡决定形成哪一种结构(

9、在转录与翻译偶联的情况下) 。所以我们要注意的是在细菌中,当色氨酸操纵子的前导区转录后,便开始了翻译过程。当核糖体到达色氨酸密码子后,会出现色氨酸依赖性翻译受阻和前进问题:A. 色氨酸缺乏,核糖体不能前进,翻译受阻,前导区与弱化子转录物只能形成第二种结构;结构基因能转录。B. 色氨酸充足,前导肽的翻译能顺利完成,前导区与弱化子转录物能形成第一种较稳定的结构,导致弱化作用发生。简而言之,色氨酸操纵子的模型为:1) 当色氨酸浓度下降时,阻遏蛋白没有活性,无法和操纵区相结合,于是RNA 聚合酶可以前进。并且,前导肽合成受阻,核糖体结合在 RNA 上面,形成 12,34 结合方式(2,3 结合) ,终

10、止信号不停止,反而继续进行下去。2) 当色氨酸浓度上升时,阻遏蛋白有活性,结合于操纵区,阻止 RNA 聚合酶和启动子的结合。此外,前导肽合成完全,形成 1,23,4 结合方式,前导肽掉下来,从而使得 RNA 聚合酶掉下来,合成提前终止。色氨酸操纵子的调控必须达成有一定的必要条件:1) 转录与翻译偶联,且速率大致相等2) 每个结构基因的转录产物都有其起始密码子,核糖体从各个基因的 mRNA 的起始信号(密码子)开始翻译,即结构基因的翻译与前导序列的翻译无关3) 细菌能符合这样的要求,说明其体系中各组分的协调性。6. 转座的概念和类型解释:定义:转座因子(transposable element,

11、TE)是细胞中能改变自身座位的一段 DNA 序列,可从复制子的一个座位跳跃到另一个座位,也可从同一个细胞的一个复制子跳跃到另一个复制子,DNA 片断的这种运动称为转座。1) 在细菌发现了两种转座类型:A. 复制性转座(replicative transposition) 转座过程有 DNA 复制,结果一个转座子留在原位,另一个插入到新的位点B. 保守性转座(conservative transposition)转座子离开原位置,插入到新的位点;这种转座又称非复制性转座(nonreplicative transposition )2) 真核生物中的转座类型:A. 玉米的 Ds(dissociat

12、ion)和 Ac(activator )最早发现(1940s)的转座子,与某些品种的玉米种子上的色斑变化有关(玉米种子的颜色由 C 基因编码的因子造成;若 C 基因突变,就没有色素产生,种子几乎白色;若部分细胞产生回复突变,就会在种子上形成颜色斑点) 。Ac 能自行转座,而 Ds 必须要有 Ac 的帮助才能转座 Ac 或 Ds 插入到功能基因中,就会使该基因失活。Ac 与细菌的转座子相似,约 4500 bp,两端有反向重复序列,中部含有转座酶基因。 Ds 是 Ac 的衍生物(功能不全,不能自主转座) ,有 Ds-a、Ds-b 、Ds-c 3 种。B. 反转录转座子(retrotransposo

13、ns)以 RNA 作为中介进行复制(转座) ,与反转录病毒(retroviruses)的复制相似,含有编码反转录酶的基因,能进行反转录;酵母中的 Ty(transposon yeast) 、果蝇中的 copia 等反转录转座子的两端有 LTRs(long terminal repeats) 。7. 真核生物转录延伸过程中染色质的变化,目前比较认可的模型是怎么样的?解释:在转录过程中(含延伸)的染色质变化包括以下几个方面:1) 组蛋白对 5S rRNA 基因转录的影响卵母细胞 5S rRNA 基因的启动子区域在体细胞中具核小体结构,因而表达被抑制;在卵母细胞中,这些基因的启动子区域基本上无核小体

14、结构,因此可与转录因子结合,使基因转录;转录因子与组蛋白在启动子区处于一种相互竞争的状态,转录因子取胜,则基因可转录;组蛋白取胜,则基因关闭;实验表明,若把组蛋白H1 除去,则原来在体细胞不能转录的卵母细胞 5S rRNA 基因也变得可转录;因此,H1 对在启动子区域形成稳定的核小体结构是必需的。2) 组蛋白对 II 类基因转录的影响原则上与 III 类基因的情况相同;若启动子区上有核小体结构,则基因不转录;若没有核小体结构,则可转录;核小体结构只由核心组蛋白(H2A, H2B, H3, H4)与 DNA 构成时,即能起到抑制基因转录的作用,且一般的转录激活子不能解除这种抑制(这里和 III

15、型基因显著不同,III 型基因只要没有 H1 就不能够发挥作用,而在II 类中,H1 只是起着更加稳固的作用,并且作用可以被激活子抵消) ;若核小体结构还含有组蛋白 H1,那么其抑制基因转录的能力更强,但 H1 的这种作用可被转录激活子抵消。3) 核小体定位(nucleosome positioning)转录激活子能使核小体结构不在启动子区内形成,而只在启动子周围形成;核小体定位使得启动子区成为无核小体区(nucleosome-free zones) ,对 DNase 高度敏感。4) 组蛋白乙酰化(histone acetylation)乙酰化的形式是在赖氨酸侧链的氨基上加上乙酰基;组蛋白是否

16、乙酰化与基因的活性有关,乙酰化的组蛋白对转录的抑制作用较弱,因为乙酰化使组蛋白易从 DNA 上脱落,从而使核小体结构(染色质结构)发生变化;起乙酰化作用的酶是组蛋白乙酰基转移酶(histon acetyltransferase, HAT) ,它能把供体乙酰辅酶 A(acetyl-CoA)的乙酰基转移到核心组蛋白(H2A, H2B, H3, H4) ;酵母中的组蛋白乙酰基转移酶还是一种转录激活子的辅助因子,其他一些转录激活子的辅助因子也是组蛋白乙酰基转移酶。细胞核中的组蛋白乙酰基转移酶(HAT A)与细胞质中的组蛋白乙酰基转移酶(HAT B)作用不同:HAT A 能结合到染色质上,使核小体中的核

17、心组蛋白(N 端尾部)乙酰化,从而促进转录; HAT B 是使细胞质中新合成出来的 H3 和 H4 乙酰化,从而使它们能正确地组装到核小体中(它们的乙酰基在组装后就会被组蛋白去乙酰化酶除去) 。5) 组蛋白去乙酰化(histone deacetylation)核心组蛋白去乙酰化能抑制转录。去乙酰化由组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylases)催化。组蛋白去乙酰化酶要与其他转录抑制因子相互作用,才能在合适的区域使组蛋白去乙酰化。例如前面讲过的甲状腺受体TR-RXR 他是一个沉默子,它一方面和甲状腺素应答元件(the thyroid hormone response element

18、,TRE)结合,一方面和其他因子结合介导和组蛋白去乙酰化酶结合,介导沉默作用。但是当甲状腺激素和 TR-RXR 结合时,会促进一系列增强子的作用,介导转录复合物的形成。6) 染色质重建(chromatin remodeling , 染色质改造)组蛋白乙酰化还不足以改变核小体核心,还必须重建核小体核心,才能在增强子和启动子处产生无核小体区,使基因可转录。至少有 4 类蛋白质参与染色质重建:SWI/SNF 家族、ISWI 家族、NuRD 家族、INO80 家族。这 4 类蛋白质都能改变核小体核心的结构,其中一些蛋白质也可能会移动核小体。 7) 异染色质与基因沉默(silencing)异染色质不但能

19、使其内的基因沉默,而且使附近的基因也沉默,如端粒位置效应(telomere position effect, TPE) ,即距端粒 3 kb 内的基因都沉默。参与形成异染色质的蛋白质: RAP1, SIR2, SIR3, SIR4(silencing information regulator, SIR), H3, H4。H4 上 16 位的赖氨酸乙酰化,能阻止异染色质的形成。8) 核小体与转录延伸两种假说:聚合酶能使核小体结构变得足够松散,因而不用除去核小体也能前进;聚合酶前进时,能把遇到的核小体移动位置,因而转录后,所有核小体的位置都发生了改变。事实表明,第二种假说是正确的,且在转录后,核

20、小体一般是被后移了(移到聚合酶后) 。8. RNA 转录后加工有哪些?解释:1) RNA 剪接:断裂基因;核 mRNA 前体的剪接;自剪接的内含子;A. I 类内含子;B. II 类内含子;tRNA 剪接主要是核 tRNA 内含子的剪接;2) 加帽和聚腺苷酸化;3) rRNA 与 tRNA 的加工;rRNA 的加工(真核和原核有所不同,主要表现在使用的酶不同) ;tRNA 的加工;A. 真核和原核有所不同,主要是由于原核是多顺反子引起;B. 真核和原核的 tRNA5端的加工成熟都需要 Rnase P 的参与;C. 真核和原核的 tRNA3端的加工都需要 6 中 Rnase 的参与:Rnase

21、D/BN/T/PH/II 和 PNPase,其中PNPase、Rnase PH 和 Rnase T 最重要。4) 反式剪接5) RNA 编辑;6) RNA 干扰(干涉/沉默)转录后基因沉默。9. 比较原核生物和真核生物翻译起始、延伸和终止的异同A 起始的异同:相同点:1) 都需要 tRNA 识别氨基酸并装载;2) 都需要核糖体大小亚基解离;3) 都需要起始因子。不同点:1) 起始 tRNA 携带的氨基酸不同,原核是甲酰甲硫氨酸,而真核是甲硫氨酸;2) 原核中甲酰甲硫氨酸识别的起始密码子有三种 AUG/GUG/UUG,而甲硫氨酸只识别 AUG; 3) 原核中不需要通过扫描寻找起始密码子,而真核中

22、需要扫描寻找起始密码子;4) 原核中需要 SD 序列帮助 mRNA 与小亚基结合,而真核没有 SD 序列,需要 5端帽子引导两者结合;5) 原核中起始因子比较简单,种类少,而真核中起始因子要复杂的多,种类也多;6) 原核中起始的控制是通过 mRNA 二级结构影响起始和反馈控制,而真核中通过起始因子磷酸化来控制。7) 原核中的 mRNA 上有两个以上的可读框(ORF) ,为多顺反子,而真核生物的一条 mRNA 上面只有一个ORF;8) 原核翻译速度快,而真核翻译速度慢,但是可以有多个核糖体结合在上面进行同时翻译。B 延伸过程:两者相似,都包括进位、转肽、移位,都需要延伸因子和 GTP,只是延伸因

23、子不同。C 终止过程:终止过程也相似:都需要释放因子和一些相关的蛋白质参与。10. 启动子在基因内的基因如何进行转录具有内部启动子的在真核生物中主要为 III 类转录因子参与的转录。在 III 类转录因子中有三种重要的转录因子:TFIII A 和 B 和 C。TFIIIC 结合到基因内部的启动子中(如果是 5S rRNA 基因,则先有 TFIIIA 结合到启动子区) ,再帮助 TFIIIB 结合到启动子上游区(转录起始位点上游) ,而 TFIIIB 则帮助 Pol III 结合在起始位点周围。TFIIIB 里面有 TBP。转录开始后,TFIIIC(或 TFIIIA 和 C)被除去,而 TFII

24、IB 留在原位,可促进另一轮的转录。11. 组蛋白乙酰化对基因转录的影响主要作用是促进转录的进行。乙酰化的形式是在赖氨酸侧链的氨基上加上乙酰基;组蛋白是否乙酰化与基因的活性有关,乙酰化的组蛋白对转录的抑制作用较弱,因为乙酰化使组蛋白易从 DNA 上脱落,从而使核小体结构(染色质结构)发生变化;起乙酰化作用的酶是组蛋白乙酰基转移酶(histon acetyltransferase, HAT) ,它能把供体乙酰辅酶 A(acetyl-CoA)的乙酰基转移到核心组蛋白(H2A, H2B, H3, H4) ;酵母中的组蛋白乙酰基转移酶还是一种转录激活子的辅助因子,其他一些转录激活子的辅助因子也是组蛋白

25、乙酰基转移酶。细胞核中的组蛋白乙酰基转移酶(HAT A)与细胞质中的组蛋白乙酰基转移酶(HAT B)作用不同:HAT A 能结合到染色质上,使核小体中的核心组蛋白(N 端尾部)乙酰化,从而促进转录; HAT B 是使细胞质中新合成出来的 H3 和 H4 乙酰化,从而使它们能正确地组装到核小体中(它们的乙酰基在组装后就会被组蛋白去乙酰化酶除去) 。12. RNA 编辑的机制?RNA 与中心法则的关系?机制:基因转录产生的 mRNA 分子中,由于核苷酸的缺失,插入或置换,基因转录物的序列不与基因编码序列互补,使翻译生成的蛋白质的氨基酸组成,不同于基因序列中的编码信息,这种现象称为 RNA 编辑。简

26、单来说就是指 mRNA 加 U 或减 U。编辑的机制为: 在转录后进行,沿 35方向进行,由 gRNA(guide RNA,向导 RNA)指导进行; 一些 gRNA 由大环的某些区域编码,另一些 gRNA 由小环编码; 大部分 gRNA 80 nt。RNA 与中心法则的关系:遗传信息从 DNA 传递给信息 RNA 的转录;在逆转录酶的作用下,以 RNA 为模板合成 DNA;以 RNA 为模板合成蛋白质,体现生物性状;以 RNA 为模板复制 RNA(如某些只有 RNA 的病毒)13. 简述基因组学的几个分支基因组学是把基因组作为研究对象的学科:1) 结构基因组学(structural genom

27、ics)基因组结构(genome structure )定位基因(gene mapping )测定基因组全序列(whole-genome sequencing)2) 功能基因组学(functional genomics)大规模、高通量分析基因组中基因表达的技术基因功能的分析3) 进化基因组学(evolutionary genomics)在整体水平上研究基因和基因组的结构、功能的起源与进化;比较基因组学(comparative genomics) 进化基因组学的初始阶段;通过比较,发现基因组中蛋白质和功能 RNA 基因的密度与生物的复杂程度有一定的负相关。14. 与类核基因组(原核基因组)相比,

28、核基因组在结构上有什么特点?类核基因组:环状,较小;通常由单拷贝或低拷贝(low-copy)的 DNA 序列组成;基因排列紧密,较少非编码序列 “streamlined”核基因组:多线状;大小一般要比类核基因组大好几个数量级,且变化范围很大;有大量的非编码序列(重复序列、内含子等) ,内含子是基因中的插入序列。真核生物的 genome size 一般要比原核生物的大很多,且变化范围也很大(最大/最小可达 8 万) ;真核生物基因组存在 C 值佯谬现象(基因组中基因数目与基因组大小无关) 。15. 简述增强子的作用机制增强子:能增强转录的元件,但又不是启动子的一部分(无位置、方向的限制)增强子常

29、在启动子的上游,但也可以在基因内部(如内含子中) 。增强子的远距离作用:激活子是使增强子能远距离作用的原因。4 种可能性(第三、四种可能性较符合实际情况) Coiling (change in topology)超螺旋 Sliding滑行 Looping成环 Facilitated tracking (looping and tracking)异化追踪。远距离增强子元件的成环作用机制。16. tRNA 的转录后加工有哪些?tRNA 加工:真核和原核加工的不同点:1) 在真核生物中, tRNA 前体含单个 tRNA 分子,两端有额外的序列,其加工是要除去这些额外的序列2) 在原核生物中, tRN

30、A 前体含 1 至多个 tRNA 分子,或与 rRNA 前体混在一起,故其加工首先要把含单个tRNA 分子的片段切割出来(由 RNase III 负责) ,然后再除去 5及 3 端额外的序列真核与原核加工的相同点:1) 真核生物与原核生物 tRNA 5 端的加工成熟由 RNase P 负责,一次切割即除去 5端的额外的序列RNase P 含有 2 个亚基,一个是 RNA(M1 RNA, 125 kD) ,另一个是蛋白质(14 kD) ,而起催 化(酶切)作用的是 RNA 这个亚基。2) 真核生物与原核生物 tRNA 3端的加工成熟 有 6 种 RNase 参与 RNase D RNase BN

31、 RNase T RNase PH RNase II PNPase (polynucleotide phosphorylase, 多核苷酸磷酸化酶 ) PNPase、 RNase PH 和 RNase T 最为重要。tRNA 剪接:核 tRNA 内含子:内含子较小(10 bp 左右) ,且只有 1 个,一般在相应于反密码子的碱基附近(与反密码子的 3端隔 1 个核苷酸)tRNA 剪接(tRNA splicing)的步骤:分 2 步进行,需要 tRNA 内切酶及 RNA 连接酶的参与Step 1:由剪接内切酶把内含子切除Step 2:由 RNA 连接酶把两个外显子连接起来17. 真核 mRNA5

32、帽子和 3pol(A)的功能帽子分步合成:首先,RNA 三磷酸酯酶将 mRNA 末端的磷酸集团去掉,然后鸟苷转移酶水解 GTP 在此末端加上GMP,接着两个甲基转移酶分别将鸟苷第 7 位的 N 和倒数第二个碱基的 2-OH 甲基化。帽子功能:(1)保护 mRNA:一般的 RNase 不能切割含有 3 个磷酸基的帽子;(2)提高翻译能力(增加 mRNA 的可译性):通过与帽子结合蛋白结合,mRNA 能更好地进入核糖体;(3)有利于 mRNA 在细胞内的运输(运出细胞核):若没有帽子,则 mRNA 基本上留在细胞核;(4)使 mRNA 前体能正确剪接:第一个内含子的剪接所需。多聚腺苷酸化功能:(1

33、)保护 mRNA,延长其寿命(半衰期) ;(2)提高 mRNA 的翻译能力,能与 poly(A)结合蛋白 poly(A) binding protein I 结合,促进翻译,促进 mRNA 与核糖体结合。多聚腺苷酸化的发生需要前体 mRNA 的剪切和在剪切处的多聚腺苷酸化,polyA 和 poly的 CTD 等参与。(3)促进最后一个内含子的切除。18. 简述并举例生物信息学的研究方法。生物信息学是把基因组 DNA 序列信息分析作为源头,找到基因组序列中代表蛋白质和 RNA 基因的编码区;同时,阐明基因组中大量存在的非编码区的信息实质,破译隐藏在 DNA 序列中的遗传语言规律;在此基础上,归纳

34、、整理与基因组遗传信息释放及其调控相关的转录谱和蛋白质谱的数据,从而认识代谢、发育、分化、进化的规律。生物信息学还利用基因组中编码区的信息进行蛋白质空间结构的模拟和蛋白质功能的预测,并将此类信息与生物体和生命过程的生理生化信息相结合,阐明其分子机理,最终进行蛋白质、核酸的分子设计、药物设计和个体化的医疗保健设计。首先,它需要一定的计算能力,包括相应的软、硬设备。要有各种数据库或者能与国际、国内的数据库系统进行有效的交流。要有发达、稳定的互联网络系统;同时,生物信息学需要强有力的创新算法和软件。没有算法创新,生物信息学就无法获得持续的发展。最后,它要与实验科学,特别是与自动化的大规模高通量的生物

35、学研究方法与平台技术建立广泛、紧密的联系。这些技术,既是产生生物信息数据的主要方法,又是验证生物信息学研究结果的关键手段。19. RNAi 的原理和应用。RNA 干扰( RNA interference, RNAi)是指双链 RNA 诱导同源 mRNA 降解导致基因表达抑制的现象,又称基因沉默,是一种转录后基因沉默(post- transcriptional gene silencing, PTGS)现象,是生物体在进化过程中抵御病毒感染及防御重复序列和突变引起基因组不稳定的保护机制。RNA 干扰(RNA interference, RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链 RNA(dou

36、ble-stranded RNA,dsRNA )诱发的、同源 mRNA 高效特异性降解的现象。 其机制分两步:(1) 长双链 RNA 被细胞源性的双链 RNA 特异的核酸酶切成 2123 个碱基对的短双链 RNA,称为小干扰性RNA(small interfering RNA) 。(2) 小干扰性 RNA 与细胞源性的某些酶和蛋白质形成复合体,称为 RNA 诱导的沉默复合体(RNA-induce silencing complex,RISC)该复合体可识别与小干扰性 RNA 有同源序列的 mRNA,并在特异的位点将该 mRNA 切断。它的应用:意义:抑制病毒的复制;抑制转座。应用:研究基因的表达调控;研究基因的功能,有时候可以替代基因敲除技术。马显才2013-1-16

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