1、技术参数:测序NextSeqTM500 测序系统快速、灵活、可调整数据量的高通量桌面式测序平台,采用精确的 SBS 测序技术,具有广泛的应用范围。图 1:NextSeq 500 测序系统图 2:NextSeq 500 系统从样本到结果的流程 *主要特点:NextSeq 500 系统采用最先进的 SBS 测序化学原理,以及行业最便捷的工作流程,可产出高质量的全基因组、外显子组或转录组测序结果。NextSeq 500 系统简便的工作流程可产出高精度的测序数据。* 时间可能据不同实验和试剂类型而不同。这里展示的是一个假定在仪器上进行的测序长度为 2 X 75 bp 的 mRNA 表达谱实验,数据分析
2、包括差异表达和识别剪切转录本。 第一台高通量桌面式测序系统适用于全基因组、外显子组、转录组测序,以及众多其他应用,满足您现在和未来的研究需求 高度的灵活性适合研究的需求提供可调节的测序长度和不同通量的配置,支持广泛的测序应用 快速的运行速度快速的运行速度,时间紧张的实验也可以创记录的短时间完成 行业领先的 Illumina 化学原理最高精度的 SBS 化学反应,保证高质量的数据结果,无需担心重复连续碱基测不准问题 便捷的操作及数据分析无需干预的由样本到结果的解决方案,流畅的生物信息学分析可在本地或云上完成 Illumina 整体的技术支持Illumina 的科学家和工程师从安装、培训、应用和数
3、据分析的每一步提供完整的支持简介源自行业领先的 Illumina 新一代测序( NGS)产品线, NextSeq 500 系统可同时提供高通量的测序能力,以及桌面式测序系统的操作便捷性(图 1)。它的快速、一体化、从样本到结果的便捷流程,可以在一次运行中实现快速的外显子组、全基因组和转录组测序,同时还可以根据需要调节到较低的测序通量。此系统无需其他特定的配套设备,即可整合入研究实验室, Illumina 的科学家可在全过程的每一步提供支持,使得研究者可以专注于获得突破性的发现。促生新的发现NextSeq 500 系统帮助研究者紧跟技术的发展,并将新技术应用于测序项目中。此可靠、可调整通量的系统
4、,可以将广泛的、高通量的应用成为可承受的日常研究工具。 NextSeq 500 系统的灵活性可帮助研究者快速地在不同的应用之间切换,并且根据样本量和覆盖度调整产出的数据量。现在,即使很小的实验室都可以采用不同的测序应用组合推动研究,以更快的获得有价值的研究结果。快速、简单的流程NextSeq 500 系统直观的用户界面,以及上机后无需人员看管的实验流程,可以帮助研究者实现更多样本的更多测序应用,并且获得最高的测序深度和分辨率。只需不到 10 分钟的时间,即可完成在 NextSeq 500 系统上加样和设定步骤。不同于其他平台需要多种额外的特定设备, NextSeq 500 系统在一台仪器上整合
5、了簇生成和测序功能,并且可以在系统上或云端进行流畅的数据分析。样本准备可以选择简单、便捷的 Illumina TruSeq或 Nextera样本准备试剂盒,然后上样到 NextSeq 500 上进行快速的自动化测序。在不到一天的时间内即可得到新一代测序的数据。准备5.5 小时手动操作测序10 分钟手动操作分析5 分钟手动操作,在本地或是云端进行分享安全、无限存储9小时15-18小时10 M Reads1 X 75 bp40 11 小时 N/A N/AmRNA-Seq40 M Reads2 X 75 bp10 18 小时 3 15 小时捕获富集12 Mb 区域95% 的靶向区域具有 20x 的覆
6、盖度N/A N/A 20 26 小时全外显子组测序90% 区域 10x 覆盖度9 18 小时 3 15 小时人全基因组测序3 GB 基因组30x 覆盖度2 X 150 bp1 29 小时 N/A N/A图 3:Illumina NGS 产品线使得测序适合所有的研究者的应用Illumina NGS 系统可提供适合任何应用,任何样本类型和测序通量的解决方案。每个平台都可以提供高质量的数据和精度,灵活的通量和样本的选择,以及便捷的实验流程。数据可以在 BaseSpace 上无缝的进行比较、交换和分析。HiSeq 2500高效实现大规模基因组测序NextSeq 500快速、简便的个人基因组解决方案Mi
7、Seq快速、简便的靶向和小基因组测序平台技术参数:测序可以在两种不同的流动槽模式(高通量和中等通量)中进行选择,方便的在较低和较高的测序运行之间切换(表 1)。NextSeq 500 系统提供从短到长插入片段的配对末端测序读取,提供可以调整的长至 2 X 150 bp 的测序读长。系统支持全系列 Illumina 的样本准备和靶向富集解决方案,测序文库可与 Illumina 其他的测序平台兼容。这可以帮助研究者方便的将研究升级至更高通量的 HiSeq系统,或是使用 MiSeq系统进行后续的研究(图 3)。便捷的生物信息学分析NextSeq 500 系统支持一系列的数据分析选择。初级数据分析,包
8、括碱基读取和质量评估在整合到仪器上的计算机中进行。测序数据可即刻被转移、分析、并安全存储在 Illumina 的BaseSpace(云端或本地)等基因组计算环境中(图 4)。BaseSpace 下游数据分析包括比对和变异体检出、注释、可视化和诠释。BaseSpace 还包括 Illumina 开发的数据应用,可用于外显子组、转录组、全基因组,以及体细胞突变检出。得益于 Illumina 行业标准的数据格式,第三方开发者可以开发更广泛的、开源的下游数据分析环境。总结NextSeq 500 系统可将高通量测序应用变为全世界实验室的日常工具。结合最先进的 SBS 测序试剂,灵活的 NextSeq 5
9、00 系统便捷的触摸屏操作和流畅的样本到结果实验流程,可帮助研究者在不到一天的时间内完成最热门的高通量测序应用。它的多个流动槽的结构和试剂配置,可根据需要实现中高通量测序,提供给研究者从事不同大小项目的操作效率。更多信息请访问 了解新一代革命性测序技术的更多信息。加入 Illumina 社区NextSeq 500 的用户,可以加入全世界范围包含60,000 个采用 Illumina 技术进行其研究项目的科学家的社区。 Illumina 每年定期组织社区活动,使得研究者可以一起分享想法。用户会议、科学论坛,以及博客等,可成为讨论新的研究方法和突破性研究的平台。Illumina 社区还包含了全世
10、界范围超过 300 个我们专业的服务和支持团队的员工,其中 75% 具有高级学位。Illumina 的科学家和工程师将提供 NextSeq 500安装、设置,以及针对实验室全体人员的培训。全球范围内有全天候的系统支持回答每一步骤中遇到的问题,是研究者可以安心专注于下一步的研究。当研究者需要变动时,比如实验室整合入新的系统,或者采用新的方法, Illumina 的支持和培训团队将在此提供支持。除了现场支持以外,通过网络或是在Illumina 办公室的培训课程,可以使实验室人员了解最新的进展。流动槽配置 读 长( bp) 通 量( Gb) 运行时间 起始样本量 数据质量高通量流动槽多至 400M
11、的单端读取多至 800M 的配对末端读取2 X 150 100-120 29 小时100ng-1g 使用 TruSeq样本准备试剂盒在 2 X 150 bp 测序时75% 碱基质量高于 Q302 X 75 50-60 18 小时1 X 75 25-30 11 小时中等通量流动槽多至 130M 单端读取多至 260M 配对末端读取2 X 150 32-39 26 小时2 X 75 16-19 15 小时NextSeq 500 系统性能参数总时间包括在 NextSeq 500 系统上的簇生成、测序和碱基读取。装机参数基于在支持的簇密度( 129 至 165 k/mm2clusters passin
12、g filter) 下的Illumina PhiX 文库结果。由于不同样本类型、样本质量和 clusters passing filter 情况,实际参数可能略有变化。Q30 的碱基比率一般高于整个运行。技术参数:测序Illumina 1.800.809.4566 toll-free (U.S.) +1.858.202.4566 tel For research use only 2013 Illumina, Inc. All rights reserved.Illumina, IlluminaDx, BaseSpace, BeadArray, BeadXpress, cBot, CSPro
13、, DASL, DesignStudio, Eco, GAIIx, Genetic Energy, Genome Analyzer, GenomeStudio, GoldenGate, HiScan, HiSeq, Infinium, iSelect, MiSeq, Nextera, NuPCR, SeqMonitor, Solexa, TruSeq, TruSight, VeraCode, the pumpkin orange color, and the Genetic Energy streaming bases design are trademarks or registered t
14、rademarks of Illumina, Inc. All other brands and names contained herein are the property of their respective owners. Pub. No. 1270-2013-007 Current as of 06 January 2014lllumina China上海办公室 电话:+86 21-60321066 传真:+86-21-60906279北京办公室 电话:+86 10-84554866 传真:+86-10-845548552014 年 2 月 11 日印刷订购信息NextSeq 50
15、0 系统参数Instrument ConfigurationRFID tracking for consumablesInstrument Control Computer (Internal)*Base Unit: Dual Intel Xeon ES-2448L 1.8 GHz CPUMemory: 96 GB RAMHard Drive: 750 GBOperating System: Windows 7 embedded standard*Computer specifications are subject to change.Operating EnvironmentTempera
16、ture: 19 to 25 (22 3 )Humidity: Non-condensing 20%80% relative humidityAltitude: Less than 2,000 m (6,500 ft)Air Quality: Pollution degree rating of IIVentilation: Up to 2,048 BTU/hr 600 WFor Indoor Use OnlyLight Emitting Diode (LED)520 nm, 650 nm; Laser diode: 780 nm, Class IIIbDimensionsWDH: 58.5
17、cm53.4 cm63.5 cm (23.0 in21.0 in25 in)Weight: 83 kg (183 lbs)Crated Weight: 151.5 kg (334 lbs)Power Requirements100120 VAC 15 A220240 VAC 10 ARadio Frequency Identifier (RFID)Frequency: 13.56 MHzPower: Supply current 120 mA, RF output power 200 mWProduct Safety and ComplianceNRTL certified IEC 61010
18、-1CE markedFCC/IC approvedSystem Name Catalog No.NextSeq 500 Sequencing System SY-415-1001Output Kit NameNextSeq 500 Mid Output Kit (150 cycles) FC-404-1001NextSeq 500 Mid Output Kit (300 cycles) FC-404-1003NextSeq 500 High Output Kit (75 cycles) FC-404-1005NextSeq 500 High Output Kit (150 cycles) FC-404-1002NextSeq 500 High Output Kit (300 cycles) FC-404-1004