1、Cytoscape 软件画图说明1、画图前，先准备两个输入文件。2、打开 cytoscape 软件，导入数据。导入 edge.txt 文件点击 File -Import -Network点击 ok 得到原始图形节点 1，文件中第一列节点 2，文件中第 2 列连接类型，文件中第 3 列点击 layout -Apply Preferred Out 改变图形排列方式此处可以用鼠标在画布中拖动图形到合适的位置。改变画布背景。点击左侧 Contro Panel -Style-network -Backgroud paint设置节点之间连线的宽度和颜色Contro Panel -Style-Edge宽度颜
2、色导入 node.txt 个文件点击 File -Import -Table设置节点图形属性Contro Panel -Style-Node1、 node 大小通过设置 Height 和 Width 来控制大小2、 Node 性状通过设置 Shape 来控制3、 Node 填充色通过设置 Fill Color 来控制4、 Node 标签的设置点击 Properties - Label Position点击 Label Position 来设置标签位置。这里是一个示范操作，要细致调整标签位置还是要设置 Column 和 Mapping Type 两个参数。设置完成之后图形调节节点之间的距离点击 layout -Scale鼠标拖动最后，画图导出成 pdf 文件点击 File -Export-Network View as Graphics
