1、Topos4.0软件 分析MOFs拓扑实例王飞 福建物构所张健课题组 2012.06.15,主要内容,Topos4.0软件下载 官方网站：http:/www.topos.ssu.samara.ru/软件使用前检查及主要功能简介Topos4.0分析MOFs拓扑实例,Topos4.0软件下载,可以直接在http:/www.topos.ssu.samara.ru 网站上免费注册下载。除主程序之外，网站还提供说明帮助文件以及使用教程。 为方便大家使用，网站把主程序和ttd，tto等文件集成在一起，制作成kit文件。我们只需要下载kit文件，解压即可使用。,Topos4.0软件官方网站：http:/ww
2、w.topos.ssu.samara.ru/,Kit文件下载,软件使用检查,主要功能简介,IsoCryst,Dirichlet,AutoCN,HSite,DiAn (Distances and Angles),IsoTest,ADS,主要功能简介,分析MOFs拓扑实例,以ZIF-8 为例，演示topos4.0软件分析MOF拓扑类型的具体流程多核金属和簇单元处理断键型分子筛-LTA 拓扑分析,具体流程,.cif 文件导入，生成.cmp文件； 运行“IsoCryst”，点击图标， 查看分析结构； 运行“autoCN”，点击图标， 分析配位数； 运行“ADS”，点击图标， 分析结果。,Zif-8为例
3、分析MOFs拓扑的具体流程,双击此代码， 查看ZIF-8的一些信息。,运行“IsoCryst”,运行auto CN,运行“ADS”,多核金属和簇单元处理-配位键弱化成氢键,Zhong min Su, CrystEngComm. 2012, DOI: 10.1039/c0xx00000x,Import .cif,IsoCryst,AutoCN,IsoCryst,ADS,Simplify adjacent matrix,ADS,断键型分子筛-LTA 拓扑分析,Hai-Xia Zhang, Jian Zhang*, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133 (31), 11884118
4、87,Import，IsoCryst,AutoCN,Simplify adjacent matrix,IsoCryst,ADS,Isocryst,ADS,Export,diamond,AutoCN,ADS,小结,Topos4.0功能强大。除分析拓扑外，作图（isocryst）；分析tilings， 产生3dt软件的输入文件；导出各种不同格式文件，cif文件可用于diamond作图， systre.cgd文件可用于systre 软件的输入文件；等等。 对简单的化合物，智能化程度较高，如ZIF-8，全部按照默认操作进行即可。 不具备纠错功能。 分析拓扑的目的在于简化，便于结构描述和他人的认知，单纯的new topology 没有任何意义。对同一结构，不同的人进行分析可能会得到不同的结果，没有对错之分，关键是选取节点要有一定的化学意义，和结构描述有关联性。因此，做拓扑分析前，需要对化合物的结构很熟悉，做到心中有数，合理选取节点。,谢谢大家！,
