1、R 语言入门R 是开源的统计绘图软件，也是一种脚本语言，有大量的程序包可以利用。R 中的向量、列表、数组、函数等都是对象，可以方便的查询和引用，并进行条件筛选。R 具有精确控制的绘图功能，生成的图可以另存为多种格式。R 编写函数无需声明变量的类型，能利用循环、条件语句，控制程序的流程。R 网络资源：R 主页: http:/www.r-project.org R 资源列表 NCEAS http:/www.nceas.ucsb.edu/scicomp/software/r R Graphical Manual http:/bm2.genes.nig.ac.jp/RGM2/index.php 统计之
2、都: http:/cos.name/ QuikR http:/ 丁国徽的 R 文档 : http:/www.biosino.org/R/R-doc/ R 语言中文论坛 http:/rbbs.biosino.org/Rbbs/forums/list.page 一、用函数 install.packages()， 直接输入就可以联网，第一次的话之后选择镜像，然后选择包下载即可如果已经连接到互联网，在括号中输入要安装的程序包名称，选择镜像后，程序将自动下载并安装程序包。例如：要安装 picante 包,在控制台中输入 install.packages(“picante“)已经安装了？二. 安装本地 z
3、ip 包路径：Packagesinstall packages from local files 选择本地磁盘上存储 zip 包的文件夹。(文件，运行 R 的脚本，选择所在文档 )三.调用程序包在控制台中输入如下命令 library(“picnate”) 程序包内的函数的用法与 R 内置的基本函数用法一样。四.程序包内部都有哪些函数？分别有什么功能？查询程序包内容最常用的方法：1 菜单帮助Html 帮助；2 查看 pdf 帮助文档五.查看函数的帮助文件函数的默认值是什么？怎么使用？使用时需要注意什么问题？需要查询函数的帮助。1 ?t.test 直接打开相关函数的说明和使用模板。2 RGuiHe
4、lpHtml help 同样的效果，同上3 apropos(“t.test“)合理使用 T 检验，五种模式的 T 检验4 help(“t.test“)帮助同 1-25 help.search(“t.test“)有关 T 检验的一切东西都可以查出来。6 查看 R 包 pdf 手册六、帮助很强大 lmstats #函数名及所在包 Fitting Linear Models #标题 Description #函数描述 Usage #默认选项 Arguments #参数 Details #详情 Author(s) #作者 References #参考文献 Examples #举例七、R 图形界面： R
5、 commander 1 安装 R commanderinstall.packages(“Rcmdr“) 2 R 将自动下载并安装 Rcmdr 所需的所有程序包调用 R Commander图 12 R commander 界面 library(Rcmdr)八、R 的函数R 是一种解释性语言，输入后可直接给出结果。功能靠函数实现。函数形式: 函数(输入数据，参数 = )如果没有指定，则参数的以默认值为准。例如:平均值 mean(x, trim = 0, na.rm = FALSE, .)线性模型 lm(yx, data=test)每一个函数执行特定的功能，后面紧跟括号，例如：平均值 mean()
6、； 求和 sum()； 绘图 plot() ；排序 sort()。除了基本的运算之外，R 的函数又分为 ”高级”和”低级”函数，高级函数可调用低级函数, 这里的”高级”函数习惯上称为泛型函数。如 plot()就是泛型函数，可以根据数据的类型，调用底层的函数，应用相应的方法绘制相应的图形。这就是面向对象编程的思想。查询的方法：HelpHtml helppackageslog()log10()exp()sin()cos()tan()asin()acos()binom.test()fisher.test()chisq.test()friedman.test()mean()sd()var()glm(y
7、x1+x2+x3, binomial).九、赋值与注释与对象起名= 3) 数据框(dataframe) 是由一个或几个向量和（或）因子构成，它们必须是等长的，但可以是不同的数据类型。每个数据表可以看作一个数据框(dataframe)。每一行(row)作为一个记录(entry)，每一列(column)作为一个向量(vector)。由很多不同类型的向量组成，如字符型，因子型，数值型。如何生成数据框？两种办法：(1)从外部数据读取；(2)各类型因子组合成数据框。列表(list)列表可以包含任何类型的对象。可以包含向量、矩阵、高维数组，也可以包含列表。十一、运算符数学运算运算后给出数值结果： +, -
8、, *, /, (幂)比较运算运算后给出判别结果： (TRUE FALSE)：, =, =（=是计算机编程的二元运算符。当左边的内容与右边的内容相同时，返回 1。其余时候返回 0。=是判断两个值大小是否相同的运算符。）, !=不等于逻辑运算与、或、非：!, axis(at=seq(0.2,1.8,0.2), side=2) 4.补齐散点图的边框 box() 5.添加标题、副标题、横轴说明、纵轴说明 title(main=“Main title“, sub=“subtitle“, xlab=“x-label“, ylab=“y-label“)1 2 34 5 6#4.一页多图par()par(m
9、frow=c(2,2). #5 练习 1 将 Rplots.r 中的代码拷贝到 R 控制台中，查看 R 绘制的图形。练习 2 对例进行回归分析，并绘制散点图，并为散点图添加回归直线。plot(impurityrate)reg-lm(impurityrate)abline(reg,col=“red“)summary(reg) #6.箱线图修饰前后( 左：默认值，右：修改属性后)函数的调用方法, 函数名() 。 如 plot(), lm(),并将对象放入括号中。箱线图绘制函数的调用boxplot(daytype, data=bac, col=“red“, xlab=“Virus“, ylab=“days“)daytype，以 type 为横轴，day 为纵轴绘制箱线图。data=bac 数据来源 baccol=“red”箱线图为红色xlab=“Virus”横轴名称为 Virusylab=“days”纵轴名称为 days9.编写函数编写一个函数，给出两个数之后，直接给出这两个数的平方和。sqtest-function(x, y)z1=x2; z2=y2; z3=z1+z2;return(z3);
