1、液体活检的专家共识 军事医学科学院附属医院 秦海峰Content 基因变异类别及分析技术需求 液态活检的应用 耐药机制的精准分析 精准诊断-分子分型Content 基因变异类别及分析技术需求 液态活检的应用 耐药机制的精准分析 精准诊断-分子分型原癌基因 (proto-oncogene) 癌基因活化 (oncogene) 基因变异类别 抑癌基因 (tumor suppressor gene, TSG) 功能缺失 活化 失活 基因突变 扩增或缺失 易位融合 表观遗传修饰 其他基因 Modifying gene 调节功能异常 表达异常分子标志物种类及其对应的检测方法 Bio-specimen 33
2、9(6127):1546-1558.Content 基因变异类别及分析技术需求 液态活检的应用 耐药机制的精准分析 精准诊断-分子分型A Single Dominant Mechanism of Acquired Resistance to Rociletinib is not Readily Identifiable Presented By Lecia Sequist at 2015 ASCO Annual Meeting 耐药机制的精准分析 15 AZD9291 treated pts 6 cases of C797S mutations (40%) Oxnard, et al. Nat
3、 med, 2015 耐药机制的精准分析耐药机制的精准分析 Acquired resistance to Rociletinib 12 Pts with 13 T790M+ samples: 7 samples retained T790M (3 EGFR amp); 6 samples loss of T790M ( 2 conversion to SCLC) 2015 ASCO, 20 cases: FGFR3 mut; MET amp Acquired resistance to AZD 9291 15 plasma DNA samples from 15 pts 6/15 C797S
4、+ E19 del + T790M 5/15 E19 del + T790M 4/15 E19 del HER2 amp BRAF mut NRAS mut MET amp EGFR-independent Presented By Christine Lovly at 2015 ASCO Annual Meeting耐药机制的精准分析 Circulating tumour DNA profiling reveals heterogeneity of EGFR inhibitor resistance mechanisms in lung cancer patients Presented B
5、y Jacob J.Chabon at 2016 ASCO Annual MeetingALK TKI resistance Camidge DR;Doebele RC ;Treating ALK-positive lung cancer-early successes and future challenges.Nat Rev Clin Oncol.2012V9N5:268-77 耐药机制的精准分析耐药机制的精准分析EGFR mut T790M C797SL798I Oxnard, et al. Nat med, 2015; ASCO 2015; Lin, Nat Genet, 2015;
6、Alice Shaw, NEJM 2015 TKI ALK fusionALK C1156Y ALK L1198F +C1156Y Bypass Bypass Bypass Bypass TKI TKI TKI TKI TKI 耐药机制的精准分析Content 基因变异类别及分析技术需求 液态活检的应用 耐药机制的精准分析 精准诊断-分子分型75 40 Liquid biopsy: blood sampling for testings as done in biopsied tissue samples Circulating markers: DNA Circulating tumor c
7、ells (CTCs) Exosome Proteins RNA Platelets Immune cells (TCR repertoire) Liquid Biopsy and Circulating BiomarkersAM Newman, et al. Nat Med, 2014 CAPP_Seq: targets 521 exons and 13 introns from 139 recurrently mutated genes, in total covering 125 kb (0.004% of the human genome) 17 NSCLC pts 5000X cov
8、erage ctDNA 超敏感深部测序：发现临床药物靶点约3/4 ALK融合为经典的EML4-ALK 融合，但有1/4为与其他基因的融合 ，包括： STRN-ALK CATSPERB-ALK ACVR1-ALK CLIP1-ALK DPH6-AS1-ALK KIF5B-ALK RP11-320M2.1-ALK UGP2-ALK 燃石血检：10000X coverage ctDNA 超敏感深部测序：发现临床药物靶点 Burning Rock Dx 内部数据请勿拍照Aaron M Newman et al. Nat Med. 2014 突变谱动态变化反映实时肿瘤负荷大小 基于NGS的ctDNA动态
9、监测可实现定性与定量有机结合，准确反映肿瘤时空异质性 液体活检带来的动态监控Zofia, et al. Journal of Thoracic, March 2016 液体活检带来的动态监控 L858R+T790M L858R 全脑放疗+6 周期的卡铂+培美+贝伐+厄洛替尼 厄洛替尼 联合治疗 Nivo AZD9291 biopsy timeline L858R 3 6 9 12 female, aged 60 lung adenocarcinoma with bone metastases4.2 6.3 6.30 7.27 8.17 T790M出现 ALK融合消失 C797S出现 1 stg
10、en EGFR-TKI + 3 rdgen EGFR-TKI Liver PD 1 stgen ALK-TKI + 3 rdgen EGFR-TKI 2 stgen ALK-TKI + 3 rdgen EGFR-TKI PR Liver PD Liver PR, Other PD TP53 EGFR 19del ALK fusion EGFR T790M 液体活检带来的动态监控结合随访，动态监测，新方向，国际最前沿 COMPASS（ctDNA Ominibus Mutations Predictive Association）是燃 石医学使用其朗清NGS产品检测晚期NSCLC病人ctDNA从而
11、进行疾病随访以 及支持治疗决策的一个诊断行动。 燃石医学血液检测产品的敏感性/特异性在前处理合适的情况下已达到国际领 先水平是COMPASS行动开展的技术基础 液体活检带来的动态监控晚期NSCLC 驱动基因异常 临床随访信息 B和IV期的 NSCLC 初治复治均可 鳞癌，腺癌均可 身体状况和器官 功能允许开展下 一步抗肿瘤全身 治疗尤其是靶向 治疗 已知具有至少一 个明确的异常驱 动基因 患者配合临床 随访以及必要 的治疗 可以提供研究 所需要收集的 临床资料 液体活检带来的动态监控 目标人群具有下列至少一个明确的基因异常 EGFR：18-21号外显子COSMIC或TCGA收录的所有突变 ALK：19内含子发生的任何重排融合 ROS1：31-34号内含子发生的任何重排融合 RET：11号内含子发生的任何重排融合 MET：14号外显子可变剪切突变 KRAS：2-4号外显子COSMIC或TCGA收录的所有突变 PIK3CA：10号与21号外显子COSMIC或TCGA收录的所有突变 ERBB2：20号外显子框内插入突变 BRAF：15号外显子COSMIC或TCGA收录的所有突变 CTNNB1：3号外显子COSMIC或TCGA收录的所有突变 液体活检带来的动态监控Thanks for your attention
