1、电泳缓冲液比较,琼脂糖凝胶中DNA的检测,凝胶中核酸染色方法:溴化乙锭(EB)染色法和SYBR Gold染色法前者检测灵敏度低10ng,但价格便宜,常用后者检测灵敏度高20pg,但价格昂贵,不常用 染料存在时,线状DNA电泳迁移率降低约15 在凝胶中没有EB时,DNA条带更为清晰,当需要知道DNA片断的准确大小时,可以在无EB情况下电泳,电泳结束后用EB染色 染色方法:将凝胶浸入含有EB(0.5ug/ml)的电泳液中,室温下30-45min。染色完毕后通常不需要脱色。在检测小量DNA(10ng)时,需要脱色,具体方法为将染色后的凝胶浸入水中或1mmol/LMgSO4中,室温脱色20min,电压
2、,琼脂糖凝胶分离大分子DNA实验条件的研究结果表明,在低浓度、低电压下,分离效果较好。 随着电压的增高,电泳分辨率反而下降,对于大分子DAN片断。电场强度不宜高于5V/cm。 但对于小片断的DNA可以5-20 V/cm电压电泳,凝胶制备的注意事项,1、配胶和电泳需要使用同一批次的缓冲液(一些限制酶缓冲液含有高浓度盐,能减慢DNA的迁移,并可使临近孔泳带变斜) 2、琼脂糖要彻底熔化,时间不宜过长 3、EB含量要适当 4、凝胶应存放在阴凉处,再次用时加入少量电泳液,再熔化 5、检查梳子 6、拔取梳子时应均匀用力,检查凝胶孔的整齐度 7、凝胶稍厚些,避免样品溢出,电泳时间,PCR产物,应该在24h之内电泳 电泳时间不易过长,对于长片断影响不大,但对小片断DNA影响明显 电泳期间,EB向阴极迁移,与DNA迁移方向相反,长时间电泳将导致凝胶中EB含量显著较少,小片断DNA检测发生困难,电泳上样量,中号梳子:810ul 小号梳子:68ul 上样注意事项:1、加样时应悬空2、加样尽可能快3、不必每一个样品用一个吸头4、上样量中DNA含量过高,容易产生“弯月亮”,凝胶拍照,曝光时间:6-10s 拍照尺寸的选取:选用大的尺寸拍摄可获得清晰的电泳图片 一般拍摄两次才可以得到清晰的照片,小结,电泳图片的影响因素:凝胶,电泳液,EB,上样操作,拍照 好的电泳图片不一定一次就可以获得,