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医学数据挖掘第7章.ppt

上传人:kpmy5893 文档编号:7862969 上传时间:2019-05-28 格式:PPT 页数:40 大小:902KB
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资源描述

1、第7章 聚类分析,OUTLINES,一、引言 二、聚类标准 三、k-means算法 四、EM算法 五、利用Microsoft SQL Server 2005实践聚类分析算法,2,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,一、引言,对某城市年龄范围为25岁55岁的中青年人群进行调查。调查数据项包括年龄、性别等项。,3,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,一、引言,4,血脂高的,都没有冠心病,分类1的血脂较高的人多,有冠心心脏病的人多; 而分类6的血脂普遍正常,且都没有冠心病。,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,一、引言,聚类(Cluster An

2、alysis)是一个将数据集划分为若干组或类的过程。将一组物理的或抽象的对象,根据它们之间的相似程度,分为若干组,其中相似的对象构成一组,这一过程称为聚类过程。,5,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,一、引言,对在坐的各位同学进行聚类,你们看看可以分成哪些类?,6,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,一、引言,从上面的讨论可以发现 知道分类的数目后更容易进行划分 不知道分类数怎么办? 需要确定分类标准 如何把数据输入计算机,如何让计算机进行计算? 每个元素是否只能属于某一类? 软聚类 硬聚类,7,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,二、聚

3、类标准,输入模式可用向量表示,比较不同模式的相似性可转化为比较两个向量的距离,因而可用模式向量间的距离作为聚类判据。传统模式识别中常用到的两种聚类判据是欧式最小距离法和余弦法。,8,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,二、聚类标准,欧氏距离法,9,X1(0,2) X2(0,0),医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,二、聚类标准,余弦法,10,X1(0,2) X2( 5,0 ),医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,三、k-means算法,k-means算法以距离值的平均值对聚类成员进行分配,如果一个对象属于一个聚类,则该数据一定比较靠近聚类的

4、中心,11,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,三、k-means算法,对二维坐标中的5个点X1,X2,X3,X4,X5作聚类分析。5个二维样本为:X1(0,2),X2(0,0),X3(1.5,0),X4(5,0),X5(5,2)。假设要求的簇的数量k=2。,12,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,三、k-means算法,13,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,三、k-means算法,14,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,三、k-means算法,15,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,三、k-m

5、eans算法,16,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,三、k-means算法,k-means聚类被认为是硬聚类,因为每一个对象只能被分配到一个聚类。类与类之间不相互连接,并且也不相互重叠,计算步骤如下: 1)选择一个含有随机选择样本的k个簇的初始划分,计算这些簇的质心(簇的平均值)。 2)根据欧氏距离把每个样本重新分配到距离它最近的簇质心。 3)计算被分配到每个簇的样本的均值向量,作为新的簇的质心。 4)重复2,3直到k个簇的质心点不再发生变化或准则函数收敛。,17,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,三、k-means算法,k-means算法的准则函数通

6、常用平方误差标准准则,其定义如下:其中E为数据集中所有对象的平方误差总和;X代表每个样本;mi为簇Ci的平均值(质心)。该准则使生成的类别尽可能地紧凑和独立。,18,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,三、k-means算法,练习:对二维坐标中的6个点X1,X2,X3,X4,X5,X6作聚类分析。6个二维样本为:X1(0,2),X2(0,0),X3(1.5,0),X4(5,0),X5(5,2), X6(0,20) 。假设要求的簇的数量k=2。,19,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,三、k-means算法,20,医学数学挖掘SQL SERVER 2005

7、案例分析,这种分法有意义吗?,三、k-means算法,从前面的例子可以看出主要存在如下两点不足: k-Means方法只有在簇的平均值被定义的情况下才能使用。这可能不适用于某些应用。要求用户必须事先给出k(要生成的簇的数目)可以算是该方法的一个缺点。 k-Means方法不适用于发现非凸面形状的簇,而且,它对于“噪声”和孤立点数据是敏感的,少量的该种数据能够对平均值产生极大的影响。,21,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,四、EM算法,现实世界很多数据是不完整的,即数据存在残缺问题。例如数据集中缺少一些变量,更一般的情况是,任何含有隐含变量(不能直接观察到的变量)的模型都可以被

8、归纳为数据残缺问题。EM(Expectation Maximization,期望最大化)是K-Means方法的一种扩展。它不把对象分配给一个确定的簇,而是根据对象与簇之间的隶属关系发生的概率来分配对象。EM算法是解决数据残缺问题的一种出色算法。,22,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,四、EM算法,EM算法基本思想: EM算法不是为每一个维选择一个点,然后计算距离,而是把每一维作为一个钟型曲线,并计算平均值和标准差。当某一个点落到一个钟型曲线内时,它以某一概率分配给某一聚类。 每一个聚类的曲线可以重叠,所以每一点可以属于多个聚类,且每一聚类有不同的概率。 这种技术被认为是软

9、聚类,因为该算法允许聚类之间重叠,并且允许模糊的边界。,23,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,四、EM算法,EM算法的步骤:估计步骤(Estimate)和最大化步骤(Maximize),EM算法的名字由这两个步骤的英文单词的第一个字母组成。具体情况如下:令D=x(1), x(n)为n个观察到的数据向量。设H=z(1), z(n)表示隐藏变量z的n个值,与观察到的数据点D一一对应 观察到数据的对数似然函数为:,24,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,四、EM算法,25,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,四、EM算法,EM算法在以下两者

10、间交替:固定参数,使F相对于分布Q最大化;固定分布Q=p(H),使F相对于参数最大化。具体分为如下两个步骤:,26,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,对某城市年龄范围为25岁55岁的中青年人群进行调查。各属性的含义如下:,27,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,五、Microsoft SQL Server 2005实践聚类分析,28,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,五、Microsoft SQL Server 2005实践聚类分析,Microsoft聚类分析通过其查看器来解释,SQL Server Analysis Server提供

11、的聚类分析查看器有4个选项卡。聚类之间是相互联系的,通过单独的某一个视图难以理解挖掘模型,但可以同时使用这些视图。聚类的目的之一是给每一类贴上标签,29,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,五、Microsoft SQL Server 2005实践聚类分析,(1)获得顶层视图,30,血脂高的,都没有冠心病,分类1的血脂较高的人多,有冠心心脏病的人多; 而分类6的血脂普遍正常,且都没有冠心病。,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,五、Microsoft SQL Server 2005实践聚类分析,(1)获得顶层视图,31,分类1,医学数学挖掘SQL SERVE

12、R 2005 案例分析,五、Microsoft SQL Server 2005实践聚类分析,(2)选择一个聚类并且找出与其它聚类之间的区别,以聚类1为例:分类特征视图,该视图通过以递减概率显示属性来描述聚类事例的特征,32,这个聚类的成员喜欢早起,工作强度大等,然而这些信息还不能作为该类的标识,可能其它类也喜欢早起和工作强度大。,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,五、Microsoft SQL Server 2005实践聚类分析,点击分类对比选项卡,将分类1与它的补充进行了比较。,33,这里可以看到冠心病才是类1最重要的特征。,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案

13、例分析,五、Microsoft SQL Server 2005实践聚类分析,(3)确定一个聚类如何区别于相邻的聚类 这个聚类可能非常相似于其它的聚类,并且在这个时候所做的标识适用于所有这些聚类。 与聚类1相似的聚类强度都不大,相对来说,与类8和类10相似性大点。通过比较类1和8,可以看出这两个聚类的重要差异是劳动强度和是否早起;通过比较类1和10,可以看出这两个聚类的重要差异是是否养宠物。,34,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,五、Microsoft SQL Server 2005实践聚类分析,(4)验证判断是否正确 通过比较聚类与其相邻的聚类,并且对聚类进行改进的时候,

14、就有可能出现误导的情况: 两个聚类之间的差别可能是由一个属性引起的,该属性在这两个聚类中都不常见,但是在其中一个聚类中更少见。 通过对聚类1进行进一步验证,发现可以用“冠心病”标识“聚类1”,即聚类1的主要特征是有“冠心病”。,35,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,五、Microsoft SQL Server 2005实践聚类分析,(5)对聚类进行标识聚类1为“冠心病”,36,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,五、Microsoft SQL Server 2005实践聚类分析,结论: 冠心病高发人群有如下特点:高血脂,高血压,很少运动,经常熬夜,工作压

15、力大,有家族新血压或心脏病病史,都不养宠物。同时发现男性比例显著高于女性的发病率等。可以对这些因素进一步进行分析,对冠心病的预防、治疗及其医疗保健等有重要的指导作用。,37,五、Microsoft SQL Server 2005实践聚类分析,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,作业,根据图7-2中数据,修改EM算法的相关参数,看看结果有何不同,并分析原因。在针对图7-2进行聚类分析的基础上标识其它类。单击图7-6中的“挖掘模型”,单击右键选择“设置算法参数”,将CLUSTER COUNT 设置为8,然后处理并查看模型,试着对其进行解释。,38,医学数学挖掘SQL SERVER

16、 2005 案例分析,小结,聚类是一种强大的工具。聚类可用来理解数据,也可以用来做数据分析的关键步骤。聚类分析可以按相似性对数据进行分组,并且可以对数据进行深入的分析,获得其它方法不可能获得的信息。一旦数据聚类完之后,聚类的结果就可以应用于市场竞争、异常检测、趋势分析或者进一步分析等。本章7.4.2的案例分析中,可以对每一类进行标识,然后对感兴趣的类作进一步分析。比如类1,当发现冠心病高发人群具有的特点时,可以对“高血脂,高血压,很少运动,经常熬夜,工作压力大,有家族新血压或心脏病病史,都不养宠物”进行关联分析和回归分析,从而可进一步得出降低冠心病的预防策略。 本章详细的介绍了聚类分析的基本概念、工作原理和常用算法及其特点,重点介绍了k-means和EM算法。在学习本章后,读者将了解不同聚类算法的优缺点,学会k-means算法,掌握利用SQL Server 2005数据挖掘工具做聚类分析。通过对SQL Server 2005聚类分析模型查看器的详细介绍,不但让读者学会了利用Sql Server 2005做聚类分析,而且让读者进一步理解了EM算法的基本原理及其在医学领域的应用。,39,医学数学挖掘SQL SERVER 2005 案例分析,

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