1、琼脂糖凝胶电泳注意事项及操作流程凝胶电泳操作注意事项:1. 缓冲系统:在没有离子存在时,电导率最小,DNA 不迁移,或迁移极慢,在高离子强度的缓冲液中,电导很高并产热,可能导致 DNA 变性,因此应注意缓冲液的使用是否正确。长时间高压电泳时,常更新缓冲液或在两槽间进行缓冲液的循环是可取的。2. 琼脂糖:不同厂家、不同批号的琼脂糖,其杂质含量不同,影响 DNA 的迁移及荧光背景的强度,应有选择地使用。3. 凝胶的制备:凝胶中所加缓冲液应与电泳槽中的相一致,溶解的凝胶应及时倒入板中,避免倒入前凝固结块。倒入板中的凝胶应避免出现气泡,影响电泳结果。4. 样品加入量:一般情况下,0.5cm 宽的梳子可
2、加 0.5ug 的 DNA 量,加样量的多少依据加样孔的大小及 DNA 中片段的数量和大小而定,过多的量会造成加样孔超载,从而导致拖尾和弥散,对于较大的 DNA 此现象更明显。5. 电泳系统的变化会影响 DNA 的迁移,加入 DNA 标准参照物进行判定是必要的。6. DNA 样品中盐浓度会影响 DNA 的迁移率,平行对照样品应使用同样的缓冲条件以消除这种影响。7. DNA 迁移率取决于琼脂糖凝胶的浓度,迁移分子的形状及大小。采用不同浓度的凝胶有可能分辨范围广泛的DNA 分子,制备琼脂糖凝胶可根据 DNA 分子的范围来决定凝胶的浓度。小片段的 DNA 电泳应采用聚丙烯酰胺凝胶电泳以提高分辨率。琼
3、脂糖加样时候注意事项:1、 用移液抢将样品加至点样孔。每孔点样的体积一般少于 25ul,因此吸取每一个样品时,操作要稳当且细心。2、 常加一定量的蔗糖来增加样品的浓度,以使每个样品停留在各自的点样孔中。3、 在样品中加入水溶性的阴离子追踪染料(如溴酚蓝),用以看出样品移动的距离。4、 在一个或几个孔中加入标准分子质量样品,电泳结束后,根据已知分子质量的带的相应位置可用来做出标准曲线。5、 电泳一般是在追踪染料泳动到胶的 80%部位时停止。注意电泳期间,电泳槽盖要安全盖好,以防止液体蒸发,又可以降低电击的可能性。6、 电泳结束后,将胶浸没在 1mg/L 的溴化乙锭(EB)中,5min 后即可看到
4、 DNA 带,EB 通过插入在双螺旋的配对核苷酸之间同 NDA 结合。另一种方法是电泳时,在胶中加入 EB。7、 在紫外灯下,由于 EB 发出强烈的橘红色的荧光,所以可以看到 DNA 带。利用这种方法检测的界限是每条带约 10ng DNA。带上塑料安全眼镜可防止紫外光对眼睛的伤害。可用尺子来测量每条带至点样孔的距离。同样,利用特制的照相机和调焦器,也可以对凝胶拍照。8、 如果要对某一条带(如质粒)进一步分析,可用小刀将含该带的凝胶切割下来,从带中回收 DNA。琼脂糖核酸电泳实验操作流程 1.用蒸馏水将制胶模具和梳子冲洗干净,放在制胶平板上,封闭模具边缘,架好梳子;2.根据欲分离 DNA 片段大
5、小用凝胶缓冲液配制适宜浓度的琼脂糖凝胶:准确称量琼脂糖干粉,加入到配胶用的三角烧瓶内,定量加入电泳缓冲液(一般 2030 ml);3.放入到微波炉内加热熔化。冷却片刻,加入一滴荧光染料,轻轻旋转以充分混匀凝胶溶液,倒入电泳槽中,待其凝固;4.室温下 3045 分钟后凝胶完全凝结,小心拔出梳子,将凝胶安放在电泳槽内;5.向电泳槽中倒入电泳缓冲液,其量以没过胶面 1mm 为宜,如样品孔内有气泡,应设法除去;6.在 DNA 样品中加入 10体积的载样缓冲液(loading buffer),混匀后,用枪将样品混合液缓慢加入被浸没的凝胶加样孔内;7.接通电源,红色为正极,黑色为负极,切记 DNA 样品由负极往正极泳动 (靠近加样孔的一端为负)。一般60100V 电压,电泳 2040min 即可;8. 根据指示剂泳动的位置,判断是否终止电泳;9.电泳完毕,关上电源,在凝胶成像仪上观察电泳带及其位置,并与核酸分子量标准 Marker 比较被扩增产物的大小。 琼脂糖凝胶浓度与线形 DNA 的最佳分辨范围 琼脂糖凝胶浓度线形 DNA 的最佳分辨范围(bp) 0.5%1,00030,000 0.7%80012,000 1.0%50010,000 1.2%4007,000 1.5%2003,000 2.0%502,000