1、进化树的建立过程1， 通过测序后，在 NCBI 中进行 BLAST 比对，看和哪个属中的种最近，从而确定进化树中需比较的菌种，然后可以在权威的 International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 杂志中看最近是否有你要建树的菌的图，从而更捷径的得到典型的建树对比菌株(一般上标为 T)2， 打开 MEGA 4 在 AlignmentQuery Databanks在空格处添加建树对比菌的登入号，然后直接点击上头的 Add to Alignment3 添加完对比的后，将自己测序菌株序列导入如果拿回来后的序列是文本文档，就
2、需要将它转化成 fasta 格式，其实也就是在文本文档上头加个“”号就可以，但是序列字母必须是大写的，如果是小写的，可以在DNAman 中转化成大写的(或者在 EditSeq 中的先全选择序列后在 edit 的 reverse case 中转变，后如下操作)，并且需每列中的数字去掉，保存为 fasta 格式后，在 MEGA 的 Editinsert sequences to file 将保存的 fasta 文件导入 MEMA 中，如果导入的序列是互补链的话，直接在添加的里面，点击导入链，右击后点击互补就行，选中所有的序列后，在 Alignment 选项中选中 Align by clustalw 让其自动分析后，在 Date 选项中输出格式选择为 MEGA 格式保存4 再一次启动软件将上一步保存的文件打开，然后在如上图操作就可以得出进化树，然后在上面直接修改
