1、文摘索引型数据库,李春英 图书馆信息咨询部 2012.12.7,内容提要,1.文摘索引型数据库概况及特点 2.外文文摘库 3.中文文摘库,生物医学领域中外文摘索引数据库,美国全科医学文献数据库(Medline) 荷兰医学文摘数据库(Embase) 美国生物学文摘数据库(Biosis Previews) 美国化学文摘数据库(CA on CD,SciFinder) 美国科学引文索引数据库（SCI） 中国生物医学文献数据库（CBM） 中文生物医学期刊文献数据库（CMCC）,文摘索引数据库特点,提供原文的摘要信息 摘要信息包括：题目、作者、刊名，或同论文相关信息 数据量大，文献类型多、信息量大 收录文
2、献回溯年代长 收录文献期刊种类多 出版形式多样,文摘索引数据库使用情况,文摘索引数据库掌握要领,1.数据库的概况 2.数据库的结构 3.数据库的检索界面 4.数据库的检索技巧与方法,Pubmed数据库,主要内容,1. 数据库概况 2. 数据库检索机制 3. 数据库的组成结构 4. 检索界面 5. 检索方法与技巧 6. 检索练习,PubMed概况,1.创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI) 2.类型：Web数据库 3.网址：http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed 4.特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可
3、在网上直接免费获得全文。 5. 学科范围：生物医学、生命科学、行为科学、生物工程、化学等学科。,PubMed数据来源,1.MEDLINE：包括OLDMEDLINE 2.In Process Citations：每天收录，尚未经规范处理的数据。 3.Publisher-Supplied Citations：由出版商提供的电子文献，每条记录标有PubMed-as supplied by Publisher。,PubMed检索机制,1自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping) 对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺序是：M
4、eSH表(MeSH translation table)、期刊刊名表(Journal translation table)、全体作者表(Full author translation table)、作者索引(Author Index)、全体调查者表(Full investigator translation table)、调查者索引(Investigator Index)。如果在以上6个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分开，以单个词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间是AND逻辑关系。 2短语检索(Phrase Searching) 也可称为强迫词组检索，即，如果要将短语作
5、为一个词组进行检索，可用双引号“ ”将其引起来。如：“drug therapy”作为词组进行检索的词，系统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。,1.逻辑运算符：逻辑与：AND，逻辑或：OR，逻辑非：NOT。当一个检索表达式中同时含有三个运算符时，运算顺序从左至右，括号可以改变运算顺序。 2.截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词符，chem*表示用词根进行检索。 Heart attack* 会关闭自动转换匹配检索词，myocardial infarction, myocardial stunning, shock等词 3.双引号：“ ”，表示对引号中的短语进行检索。 4
6、.检索字段标识符：tag，tag为字段名称。 ti，au，ta，so，la，pt。,PubMed检索运算符,常用字段组成,标识符 字段名称 TI Title AU Author AD Affiliation AB Abstract DP Publication Date EDAT Entrez Date SO Source TA Journal Title Abbreviation MH MeSH Terms PT Publication Type,检索界面,基本检索 高级检索 MeSH Database检索 引文匹配器(Citation Matcher) 临床查询(Clinical Quer
7、ies),PubMed检索方法,1.基本检索：在基本检索界面下完成的检索方法 2.高级检索：高级检索界面下进行的检索方法 3.MeSH Database检索：主题词检索Pubmed.gov,基本检索,基本检索,1.关键词、词(词组)或短语： 2.作者：Smith JS 或 Smithau 3.期刊刊名：GENE THERAPYTA，JAMATA 4.截词或通配符：CHEMO* 5.复杂表达式：CANCER AND THERAPY 6.#1 AND #2,高级检索,高级检索,MeSH Database检索,输入查找的主题词,主题词注释,树状结构表,款目词,主题词与自由词区别,主题词：又称叙词，在
8、标引和检索中用以表达文献主题的规范化的词或词组。主题词表示的是概念，概念由语词表达的，但是概念和语词之间并不是一一对应的。 自由词：关键词、文本词、款目词。表示的字面。,MeSH的特性,动态性 唯一性,MeSH Database检索步骤,1.输入查找的主题词 2.找到所需主题词，直接点击词的链接 3.选择与主题词对应的副主题词表（检索范围，参考树状结构表） 4.添加到检索框中 5.在PubMed中检索,检索步骤,#11 children AND asthma AND drug therapy 10813 #10 Add Search (childMeSH Terms) AND asthmaMe
9、SH Terms) AND drug therapyText Word 8573 01:38:37 #7 Add Search (“child“MeSH Terms OR “child“All Fields OR “children“All Fields) AND (“asthma“MeSH Terms OR “asthma“All Fields) AND (“drug therapy“Subheading OR “drug therapy“All Fields OR “drug therapy“MeSH Terms) 10531 01 #18AddSearch (“Child“Mesh) A
10、ND “Asthma/drug therapy“Mesh8117,PubMed几种检索方法的选择,基本检索 高级检索 MeSH Database检索,举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献,基本检索 1.检索表达式： children asthma drug therapy 2.直接输入检索框中，进行检索,检索过程（Search details）,(“child“MeSH Terms OR “child“All Fields OR “children“All Fields) AND (“asthma“MeSH Terms OR “asthma“All Fields) AND (“drug thera
11、py“Subheading OR (“drug“All Fields AND “therapy“All Fields) OR “drug therapy“All Fields OR “drug therapy“MeSH Terms OR (“drug“All Fields AND “therapy“All Fields) 修改检索式：childMeSH Terms AND asthmaMeSH Terms AND “drug therapy“Subheading,举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献,MeSH Database检索 1.确定主题词：child asthma drug therapy
12、(副主题词) 2.查找主题词,举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献,高级检索 1.确定检索词：child asthma drug therapy 2.选择检索字段 3.输入检索词,限定条件选择,1.限制检索或条件检索： (1)日期： (2)地址：单个词加标识符ad (3)带有摘要文献的检索 ：CANCER AND hasabstract (4)文献类型：article type (5)年龄、性别 2.限定检索结束后，及时取消限定条件,点击取消,Journals Databases,主题、刊名全称或缩写、ISSN,单篇文献匹配器,临床咨询,特殊专题咨询,检索结果,显示 保存 打印,显示格式选择,保存
13、文件,检索策略的存储和调用,使用My NCBI(Cubby) 首先要登记注册 保存检索策略 定期浏览新的检索结果,保存检索式,其它功能,全文链接 相关文献链接 相关数据库的链接 RSS阅读器的使用,检索练习,3. 眼结核(ocular tuberculosis)引起失明(blindness)的文献（比较基本检索和主题词检索的结果）,例2 微量元素缺乏与皮肤病关系方面的文献,主题检索,例3 眼结核引起失明的文献,例4 北京大学刘民教授发表的英文文献,例5 CANCER LETTERS期刊上查找有关基因治疗方面的文献,PubMed检索小结,1.任何一项研究主题都有多个检索途径，要比较多个检索途径的结果，那个更适合该项研究主题 2.Search Details描述检索过程 3.*检索，关闭自动转换匹配功能 4.限定检索条件要及时关闭，否则会影响后续的检索结果,谢谢！,
