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第十七章___RNA的合成与加工--王镜岩《生物化学》第三版笔记(完美打印版).doc

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1、祝大家 07 年生物考研取得好成绩! 学 子 272646652 98第十七章 RNA 的合成与加工第一节 DNA 转录生成 RNA 一、定义(一)转录单位(二)启动子(promoter )(三)终止子(terminator)二、RNA 聚合酶(一)酶的特性:以 4 种 NTP 为底物,需模板和镁离子,合成方向也是 53,但不需要引物。(二)酶的分类:1.噬菌体的 RNA 聚合酶结构简单,是单链蛋白,功能也简单。2.细菌则具有复杂的多亚基结构(450Kd),可 识别并转录超过 1000 个转录单位。3.真核生物的酶有多种,根据 a鹅膏蕈碱(环状 8肽,阻断 RNA 延伸 )的抑制作用可分为三

2、类:聚合酶 A 对它不敏感,分布于核仁,转录核糖体 RNA;聚合酶 B 对低浓度敏感,存在于核质,转录信使RNA;聚合酶 C 位于核 质, 对高浓度敏感,转录小分子量 RNA,如转 运 RNA、5SRNA 等。各种 RNA聚合酶都是由 10-15 种不同亚基组 成的多亚基复合物。4. 线粒体和叶绿体也有 RNA 聚合酶,结构简单,能合成所有种类 RNA。(三)酶的构成:大肠杆菌的全酶有 5 个亚基(2),含 2 个锌。 催化形成磷酸二酯键, 结合模板, 亚基称 为起始因子,可使 RNA 聚合酶稳定地结合到启动子上。 称为核心 酶。 亚基在不同菌种间变动较大,而核心 酶比较 恒定。 酶与不同启动

3、子的结合能力不同,不同启动 因子可识别不同的启动子。70 识别 启动子共有序列,32 识别热休克基因,60 在氮 饥饿时起作用。 通过随机移动起作用,不需解 链。(四)模板:以完整双链 DNA 为模板,其中仅一条链可转录。转录时局部解 链, 转录后 DNA 重新形成双螺旋结构,所以 DNA 是全保留的。三、转录过程分为起始、延长和 终止三个阶段。起始包括对双链DNA 特定部位的识别、局部(17bp)解链以及在最初两个核苷酸间形成磷酸二酯键。第一个核苷酸掺入的位置称为转录起点。起始后起始因子离开,核心酶构象改 变,沿模板移动,转录生成杂交双 链(12bp) ,随后 DNA 互补链取代 RNA 链

4、,恢复 DNA 双螺旋结构。延伸速度为50nt/s,酶移动 17nm。错误几率为 10-5。聚合酶到达终点时,在终止辅助因子的帮助下停止反应, 酶 和 RNA 链脱落, 转录结束。四、启动子和转录因子(一)定义:酶识别、结合、开始 转录 的一段 DNA 序列。强 启 动子 2 秒 钟启动一次转录 ,弱启 动子 10 分钟一次。(二)原核生物:大肠杆菌在起点上游约10 碱基对处有保守序列 TATAAT,称 为 pribnow box,有助于局部解链。在其上游 还有 TTGACA,称为35 序列,提供 RNA 聚合 酶识别的信号。(三)真核生物:复杂,差异较大。1.信使 RNA 的启动子通常有三个

5、保守区,25 到30 有 TATA 框,是解链位置,并决定转录起点;75 位置有 CAAT 框,与 RNA 聚合酶的结合有关;更上游还有 GC 框,某些 转录因子可结合。后两个称为上游因子,对转录 起始频率有 较大影响。2. 小 RNA 的启 动子在转录区内部,有一些辅助因子帮助 RNA 聚合酶识别。五、终止子和终止因子(一)定义(二)所有原核生物的终止子在终点之前都有一个回文结构,可使酶 减慢移动或暂停合成。大肠杆菌有两类终止子:1. 简单终止子,回文区有一段富含 GC 对的序列,回文后有寡聚尿苷。2.依赖 的终止子,必须在有 因子时才能发挥作用,不含 GC 对,也无寡聚尿苷。 因子是蛋白质

6、,可与酶作用, 释放 RNA,并使 酶脱离。(三)某些因子可使酶越过终止子继续转录,称为通读。常 见 于某些噬菌体的 时序控制,早期基因与晚期基因以终止子相隔,早期基因产 生抗终止因子,使发生通读以表达晚期基因。六、转录的调控(一)遗传信息的表达有时序调控和适应调控,转录水平的调控是关键环节,因为这是表达的第一步。转录调控主要发生在起始和终止阶段。(二)操纵子是细菌基因表达和调控的单位,有正调节和负调节因子。阻遏蛋白的作用属于 负调控。 环祝大家 07 年生物考研取得好成绩! 学 子 272646652 99腺苷酸通过其受体蛋白(CRP)促进转录,可促进许多诱导酶的合成。操 纵子可构成综 合

7、性调控网络,如 SOS 反 应等。对终止子也有调控作用,如衰减子。(三)真核生物不组成操纵子,而是通过激素、生 长因子等进行调控。某些 DNA 序列对转录起增强作用,称为 增强子。第二节 转录后加工 一、原核生物(一)核糖体 RNA:大肠杆菌共有 7 个核糖体 RNA的转录单位,每个 转录单位由 16S、23S、5SRNA 和若干转运 RNA 基因组成。16S 和 23S 之间常由转运 RNA 隔开。 转录产 物在 RNA 酶 III 的作用下裂解产生核糖体 RNA 的前体 P16 和 P23,再由相应成熟酶加工切除附加序列。前体加工 时还进行甲基化,产 生修 饰成分,特别是 a-甲基核苷。N

8、4,2-O 二甲基胞苷(m4Cm)是 16S 核糖体 RNA 特有成分。 5S核糖体 RNA 一般无修饰成分。(二)转运 RNA:有 60 个基因,其加工包括:1.内切酶在两端切断,大 肠杆菌 RNA 酶 P 是 5成熟酶2.外切酶从 3修剪,除去附加顺序。RNA 酶 D 是3成熟酶3.3端加上 CCAOH,由转运 RNA 核苷酰转移酶催化,某些转运 RNA 已有,切除附加序列后即露出。4.核苷的修饰:修饰成分包括甲基化碱基和假尿苷,修饰酶具有高度特异性。甲基化对 碱基和序列都有严格要求,一般以 S-腺苷甲硫氨酸为甲基供体。(三)信使 RNA:细菌多数不用加工,转录与翻译是偶联的。也有少数多

9、顺反子信使 RNA 必须由内切酶切成较小的单位,然后翻 译。如核糖体大亚基蛋白与 RNA 聚合酶的 b 亚基基因组成混合操纵子,转录后需经 RNA 酶 III 切开,各自翻译。因为 RNA聚合酶的合成水平低得多,切开有利于各自的翻译调控。 较长 的 RNA 会产生高级结构,不利于翻 译,切开可改变其结构,从而影响其功能。二、真核生物(一)核糖体 RNA:基因拷贝数多,在几十到几千之间。基因成簇排列在一起,由 RNA 聚合酶 I 转录生成一个较长的前体,哺乳 动物为 45S。核仁是其转录、加工和装配成核糖体的场所。RNA 酶 III 等核酸内切酶在加工中起重要作用。5SRNA 基因也是成簇排列的

10、,由 RNA 聚合酶 III 转录,经加工参与构成大亚基。核糖体 RNA 可被甲基化,主要在核苷 2羟基,比原核生物甲基化程度高。多数核糖体RNA 没有内含子,有些有内含子但不转录。(二)转运 RNA:由 RNA 聚合酶 III 转录,加工与原核相似,但 3端的 CCA 都是后加的,还有 2-O-甲基核糖。(三)信使 RNA:真核生物编码蛋白质的基因以单个基因为转录单位,但有内含子,需切除。信使 RNA的原初转录产物是分子量很大的前体,在核内加工时形成大小不等的中间物,称为核内不均一RNA(hnRNA)。其加工 过程包括:1.5端加帽子:在转录的早期或转录终 止前已经形成。首先从 5端脱去一个

11、磷酸,再与 GTP 生成 5,5三磷酸相连的键,最后以 S-腺苷甲硫氨酸进行甲基化,形成帽子结 构。帽子 结构有多种,起识别和稳定作用。2. 3端加尾:在核内完成。先由 RNA 酶 III 在 3端切断,再由多聚腺苷酸聚合酶加尾。尾与通过核膜有关,还 可防止核酸外切 酶降解。3. 内部甲基化:主要是 6-甲基腺 嘌呤,在 hnRNA中已经存在。可能 对前体的加工起 识别作用。三、RNA 的拼接(一)转运 RNA 的拼接:由酶催化,酶识别共同的二级结构,而不是序列。通常内含子插入到靠近反密码子处,与反密码 子配对,取代反密码子环。第一步由内切酶切除插入序列,不需 ATP;第二步由RNA 连接酶连

12、接,需要 ATP。(二)四膜虫核糖体 RNA 的拼接:某些四膜虫 26S核糖体 RNA 基因中有一个内含子,其拼接只需一价和二价阳离子及鸟苷酸或鸟苷存在即可自发进行。其实质 是磷酸 酯的转移反应,鸟苷酸起辅助因子的作用,提供游离 3羟基。(三)信使 RNA:真核生物编码蛋白质的核基因的内含子属于第二类内含子,左端 为 GT,右端为 AG。先在左端切开,产 生的 5末端与 3端上游形成 5,2-磷酸二酯键,构成套索结构。然后内含子右端切开,两个外显子连 接起来。通 过不同的拼接方式,可形成不同的信使 RNA。第三节 RNA 的复制 一、噬菌体 QbRNA 的复制其 RNA 是单链,正链,侵入大

13、肠杆菌后立即翻译,产生复制酶的 b 亚基,与宿主的三个 亚基( 为核糖体蛋白, 、 均为肽链延长因子)构成复制酶, 进行祝大家 07 年生物考研取得好成绩! 学 子 272646652 100复制。先以正链为 模板合成负链,再根据负链合成正链。合成 负链时 需要宿主的两个蛋白因子,合成正链则不需要,所以可大量合成。病毒的蛋白质合成受 RNA 高级结构的调控。二、病毒 RNA 复制的主要方式(一)病毒含正链 RNA,先合成复制酶,复制后合成其他蛋白质进行装配。如噬菌体 Qb 及灰质炎病毒。(二)病毒含负链和复制酶,先合成正链,再合成病毒蛋白和复制病毒 RNA。如狂犬病毒。(三)病毒含双链 RN

14、A 和复制酶,如呼肠孤病毒。先复制正链,再翻译成病毒蛋白,最后合成负链,形成双链 RNA 分子。(四)致癌 RNA 病毒:如白血病病毒和肉瘤病毒,先逆转录生成 DNA 前病毒,再转录、翻译。第四节 RNA 生物合成的抑制剂 一、碱基类似物有些人工合成的碱基类似物能干扰和抑制核酸的合成。作用方式有以下两类:(一)作为代谢拮抗物,直接抑制核苷酸生物合成有关酶类。如 6-巯基嘌呤进入体内后可转变为巯基嘌呤核苷酸,抑制嘌 呤核苷酸的合成。可作为抗癌药物,治疗 急性白血病等。此 类物质 一般需转变为相应的核苷酸才能表现出抑制作用。(二)进入核酸分子,形成异常 RNA 或 DNA,影响核酸的功能并导致突变

15、。5-氟尿嘧啶类似尿嘧啶,可进入 RNA,与腺嘌呤配对或异构成烯醇式与鸟嘌呤配对,使 A-T 对转变为 G-C 对 。因为正常细胞可将其分解,而癌细胞不能,所以可选择性抑制癌细胞生长。二、DNA 模板功能抑制物(一)烷化剂:带有活性烷基,能使 DNA 烷基化。鸟嘌呤烷化后易脱落,双功能烷化剂 可造成双链交联,磷酸基烷化可导致 DNA 链断裂。通常有较大毒性,引起突变或致癌。(二)放线菌素类:可与 DNA 形成非共价复合物,抑制其模板功能。包括一些抗癌抗生素。(三)嵌入染料:含有扁平芳香族发色团,可插入双链 DNA 相邻碱基对之间。常含丫啶或菲啶环,与碱基大小类似,可在复制 时增加一个核苷酸,导致移码突变。如溴乙 啶。三、RNA 聚合酶抑制剂(一)利福霉素:抑制细菌 RNA 聚合酶活性。(二)利链菌素:与细菌 RNA 聚合酶 b 亚基结合,抑制 RNA 链的延长。a-鹅 膏蕈碱:抑制真核生物 RNA 聚合酶。

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