1、CAR-T scFv序列选择与检索,背景,1. scFv介绍,单抗结构,单链抗体结构,一般单抗VH序列以TVSS结尾(TVSA),VL序列以EIK结尾。scFv一般顺序是VH-linker-VL,背景,2. scFv选择,临床数据CAR-T、抗体药物亲和力Kd一般在nM级抗原位点尽量靠近细胞,检索思路,是否有CAR-T临床实验,查看临床实验申请者及申请单位,检索是否有专利信息,检索是否有临床数据文献,检索是否有文献发表,检索文献中所用的scFv序列名称,获取临床实验所用到序列,检索是否有抗体药物临床实验,是,是,是,是,否,否,否,否,查询抗体信息是否符合要求,检索是否有检测抗体专利,是,否,
2、克隆专利中可变区构建scFv,是,否,检测是否有天然受体,是,否,检索scFv名称相关抗体专利,并拷贝VH及VL合成scFv,常用网站,1. clinical trialhttps:/clinicaltrials.gov/,输入要检索信息,常用网站,1. clinical trialhttps:/clinicaltrials.gov/,常用网站,2. freepatentsonline http:/ 优点为方便关键词检索,常用网站,The Lens https:/www.lens.org/lens/bio 优点为部分专利可以直接拷贝序列,输入FPO中检索的序列号,带这个符号的代表这个专利可以直接拷贝序列,点击,常用网站,The Lens,Reverse translation http:/www.bioinformatics.org/sms2/rev_trans.html,常用网站,贴入氨基酸序列,贴入人源偏好密码子表(已拷贝),