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northern 说明书.doc

上传人:gnk289057 文档编号:6000566 上传时间:2019-03-23 格式:DOC 页数:11 大小:79.50KB
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资源描述

1、中文使用说明书North2South 生物素标记和化学发光检测试剂盒目录号: 17175 (17075,37549,37555,89880 ) 该试剂盒由探针标记,杂交洗膜和化学发光检测三部分组成17075(探针标记,纯化和定量)North2South生物素随机引物 Kit(该试剂盒含有足以完成 10 次标记反应的试剂,每次可合成至少 1ug 的生物素标记的探针)产品名称:货号 产品描述17075 North2South生物素随机引物Kit10次标记反应,每次可合成至少1ug的生物素标记的探针) Kit 组分 : Heptanucleotide mix (5X), 100 l dNTP mix

2、 (5X) (1 mM dATP, 1 mM dTTP, 1 mM dGTP, dCTP), 80 l Reaction Buffer (10X), 50 l DNA Polymerase, Klenow fragment (3-5 exo-),(10 units/l), 10 l Non-biotinylated control DNA*, (250 ng/l), 5 l EDTA, (500 mM, pH 8.0), 1 ml Nuclease-free water, 1 ml NH4OAc, (5 M), 1 ml Biotin-N4-dCTP, 20 l 储存条件: 所有试剂应该在无霜

3、冷冻20冰箱保存探针标记:操作步骤:将 20ul 生物素标记的 N4-dCTP 与 80ul 的 5XdNTP 混合物充分混合备用(总量 100ul)1. 稀释约 100ng 线性探针模板至 24ul 于离心管中 (模板 DNA 要定量和纯化)2. 加入 10ul 随机引物(Heptanucleotide mix)于上述离心管中,煮沸变性 5 分钟,迅速在冰水混合物退火 5 分钟3. 加入 10ul N4-dCTP 与 5XdNTP 的混合物,5ul 反应缓冲液,1ul Klenow 酶片断,混匀4. 37孵育 60 分钟5. 加入 2ul EDTA 以灭活 Klenow 酶活性探针纯化操作步

4、骤:1. 加入 5ulNH4OAC 于上述 50ul 反应离心管,吹打混匀2. 加入 110 ul 冰预冷的无水乙醇,充分混匀,冰或70放置 15 分钟3. 12000rpm 4离心 15 分钟4. 观察沉淀情况,小心吸取出上清,风干沉淀5. 用冰预冷的 70乙醇洗涤一次,12000rpm 4离心 15 分钟,观察沉淀情况,小心吸取出上清,风干沉淀6. 50ulTE 或 RNA 酶 free 的水溶解沉淀(20或70 长期保存)探针定量(17075 )操作步骤:1. 500ul 去离子水,260nm 调零2. 充分混匀 2.5ul 探针和 47.5ul 去离子水(即稀释 20 倍)分光光度计测

5、定 OD260值3. 定量计算公式:1 OD260 dsDNA = 50 g/ml; 样品浓度(g/ml)=OD 值 X50X 稀释倍数; 样品浓度 g/ul= OD260值 X50X20/1000样品浓度 ng/ul= OD260值 X50X20(注:如果稀释 20 倍,实际测定的 OD260值应该在 0.020.05 之间)Note:大多数情况下,由于各实验室用来测定核酸的仪器不同,检测灵敏度不同以及样品中的一些干扰物质,测出的 OD 值往往是 0 甚至是负值,如果出现这种情况,再进行核酸定量没有实际价值,因此,根据经验,保守估计,在每次至少合成 1ug 探针的前提下,在杂交时,探针的用量

6、按照每 ul 含有 20ng 探针来使用,即每毫升杂交液加入变性的纯化过的探针 1.5-2ul.杂交和洗膜产品名称:杂交缓冲液和严谨洗膜缓冲液货号 产品描述37549North2South Hybridization Buffer Component, 125 ml37555 North2South Hybridization Stringency wash Buffer(2X), 375 ml储存条件:4 点杂交;样品转膜(带正电尼龙膜) 使用前将所有试剂放到室温下,保证所有 buffer 溶解充分,没有颗粒。 调节烘箱和温箱至适当杂交温度(DNA 杂交 55 ,RNA:RNA 杂交 65)

7、 处理膜时只能用干净的镊子小心夹住膜的边角。我们建议在两个操作步骤间用乙醇清洗镊子并干燥待用。杂交和第一次洗膜之间改换洗膜容器和将使膜更干净。 杂交、洗膜和检测时不能让膜干燥。杂交具体操作步骤:1 平衡杂交液到室温2 预杂交:将转好的膜置于杂交管,点样面朝上,确保膜被杂交缓冲液均匀覆盖,杂交炉要缓慢转动以保证杂交液与膜能充分接触,(每平方厘米膜至少 0.1ml 杂交液。除了 RNA:RNA 杂交用 65外,其他的都用 55),50-100rpm 旋转,至少 30 分钟。3 热变性探针:煮沸变性 10 分钟,迅速在冰 /盐水混合物退火 5-10 分钟4 杂交:加入已经变性的 DNA 探针于杂交液

8、,充分混匀(探针加入到杂交液,不要加到膜上,要轻轻晃动,使探针均匀分散在杂交液中) ,探针浓度约 30ng/ml 杂交液, 50-100rpm 旋转,孵育过夜。严谨洗膜 配制 1X 严谨洗膜缓冲液(North2South Hybridization Stringency wash Buffer(2X)120ml(1:1 配比)1 平衡严谨洗膜缓冲液到室温(溶解充分) ,加等体积去离子水配制所需洗膜液(0.2ml/cm 2膜)2 将膜转移到一个新的容器中(杂交管) 。加入 1X 严谨洗膜液10 20ml,旋转洗膜 3 次(DNA 杂交 55,RNA:RNA 杂交65) ,每次 1520 分钟。(

9、化学发光检测):检测 1080cm2的杂交膜产品名称:化学发光核酸检测试剂盒货号 产品描述89880 Chemiluminescent Nucleic Acid Detection ModuleStabilized Streptavidin-Horseradish Peroxidase Conjugateed, 1.5mLNorth2South Luminol/Enhancer Solution, 80 mlNorth2South Stable Peroxide Solution, 80 mlNorth2South Blocking Buffer, 500mLNorth2South Wash

10、Buffer(4X), 500mLNorth2South Substrate Equilibration Buffer, 500mL储存条件:4检测步骤: 预先缓慢温育 blocking buffer(封闭液 )和 4X washing buffer(漂洗缓冲液) ( 3750溶解,此 2 种缓冲液可以在 RT-50使用),底物平衡液(substrate equilibration buffer)可以在 4-RT 使用,要保证所有缓冲液充分溶解,没有颗粒 配制 1X 漂洗缓冲液(washing buffer)120ml(1:3 配比)具体操作步骤(封闭,抗体孵育,洗膜,平衡,底物孵育,曝光)1

11、. 封闭:弃严谨洗膜液,加入足够封闭液 20ml(0.25ml/cm 2膜) ,37 50振荡洗膜封闭 15 分钟2. 抗体稀释液配制(1:300):66.7ul 稳定的链亲和素标记的HRP(SSHP) 20ml 封闭液3. 抗体孵育:弃封闭液,加入 20ml 抗体稀释液,室温轻柔振荡孵育15 分钟4. 洗膜:用 20ml 的 1X 漂洗缓冲液淋洗杂交膜,然后再用 20ml 漂洗缓冲液分别室温轻柔振荡漂洗 4 次,每次 5 分钟5. 平衡:将杂交膜转移到一新的干净容器,用 30ml 的底物平衡液室温轻柔振荡孵育 5 分钟6. 底物工作液配制:1:1 等体积混合 North2SouthTM Lu

12、minol/Enhanser 溶液和 North2SouthTM过氧化物酶稳定溶液作为化学发光的工作溶液。底物工作溶液需足够以完全覆盖杂交膜(约 0.1ml/cm2) 。注:该工作溶液在室温下至少能稳定 6 个小时。7. 底物孵育:把湿润的膜放在一个干净的塑料盘(平皿)里,与North2SouthTM底物工作溶液在室温下孵育 5 分钟(推荐在暗室中)。确保膜被底物溶液完全淹没或覆盖8. 把底物从膜表面清除掉(滤纸吸附) ,作好标记,并把湿润的膜转移到干净平整的保鲜膜上,再在上面覆盖一层保鲜膜,清除保鲜膜和杂交膜间的气泡和皱褶,吸干边缘的溶液。9. 曝光:把包好的杂交膜放在暗夹里,放上 X 光片

13、,曝光 15 分钟。曝光时间长短可以稍有变化以获得理想的信号。10. 从暗夹里取出 X 光片,按厂家的使用说明书显影和定影。 可与底片背景去除试剂配合使用,以获得更理想的实验结果附:对照 DNA 点杂交1.备用试剂:0.1N NaOH2.DNA 变性成单链( 对照 DNA,5l,250ng/l )在 1.5ml 无 DNAse/RNAse 的离心管里加入 0.8l(200ng)对照DNA(或样品,探针模板)和 20l 无核酸酶的水,得到浓度为10ng/l 的 DNA 溶液。煮沸变性 510 分钟,冰浴 5 分钟。3准备生物素标记的对照探针或阳性样品探针(见探针标记,纯化和定量)4.准备目标膜(

14、注意:推荐使用带正电尼龙膜,需带无粉手套并用乙醇净化的镊子拿膜。 )a. 用 45l 0.1N NaOH 稀释 5l 的变性 DNA 得到 1ng/l 产物,并用 0.1N NaOH(1 ,0.5 ,0.25,0.125,0.0625,0.0312 ,和0.015ng/l)进行梯度稀释。b. 在膜上每个浓度梯度点 1l 样品,每个样品点两点。点前最好把膜预洗一下,半干的时候点,但干点同样有用。c. 用 1X TE 轻轻漂洗膜(10 秒) ,微波炉高火加热 2 分钟,紫外交联(自动交联)或烘干固定。注:如果没有紫外交联仪,则可以将膜置于 80 度温箱烘烤 23 小时,可达到固定目的d. 交联固定

15、完,用 0.1SDS 预湿润膜,进入下面预杂交,杂交以及底物孵育和曝光5 杂交,严谨洗膜和封闭,抗体孵育,洗膜,平衡,底物孵育以及曝光见前所述 Trouble shooting guide问题 原因 解决方法出现斑块/点 1) 在酶、缓冲液、 1) 放到适当温度。离心或底物中有不溶颗粒2) 未稀释探针接触到了膜3) 手套上的粉尘4) 膜上的气泡或过滤去除颗粒。2) 注意不要把探针打到膜上3) 带不含粉末的手套4) 用缓冲液和底物均匀覆盖膜。高背景 1) 探针浓度过高2) 太多 HRP3) 未稀释的探针接触膜4) 错误的封闭液或杂交液5) 漂洗液溶解不完全6) 膜7) 预杂交不完全8) 印迹纸1

16、) 降低探针浓度2) 增加 HRP 稀释度3) 探针加到杂交液里4) 检查5) 预先拿出平衡6) 带正电的尼龙膜7) 增加预杂交时间8) 膜下面用合格的滤纸(即 3MM)无信号 1) 标记失败或探针降解2) 曝光时间太短3) 转膜失败,错误1) 检查2) 延长曝光时间3) 用 EtBr 染色确证转膜膜4) HRP 失活或浓度不适当5) 严谨洗膜不够6) 探针太少7) 探针变性不完全8) 靶 DNA/RNA 降解9) 靶 DNA/RNA 浓度太低10)靶 DNA/RNA 变性不完全11)靶 DNA/RNA 固定不恰当12)探针丢失在塑料品上13)膜干了14)漂洗液没有稀释4) 用底物检测探针活性5) 0.1X 或增加温度6) 增加探针浓度7) 10010 分钟,骤冷5 分钟8) 检查均一性9) 增加靶 DNA/RNA浓度,10)转膜前充分变性靶DNA/RNA11)固定前用 1X TE 或水轻轻漂洗膜12)使用低吸收率的塑料13)始终保持湿润14)稀释到 1 倍出现非特异性条带1) 探针过量2) 洗膜严谨度不够3) 杂交温度不正确4) 靶 DNA/RNA 降1) 降低探针浓度2) 0.1X 或增加温度3) 检查温度4) 降低靶 DNA/RNA解或过量5) EtBr 或胶污染妨碍杂交浓度5) 用 1X TE 或者 0.1 SDS 宽泛洗膜2007 年 8 月 8 日星期三

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