1、转录,本章考点: 转录过程 转录酶学(聚合酶) 转录元件,1、已知双链DNA一条链碱基顺序为:5GCTTACGTAAG3,则转录后RNA碱基顺序为:( ),A. 5CGAATGCATTC3 B. 5CGAAUGCAUUC3 C. 5GCTTACGTAAG3 D. 5GCUUACGUAAG3,2、以下关于转录陈述哪些是正确的( ),A、RNA合成按3到5方向进行 B、RNA聚合酶按5到3方向沿DNA有义链移动 C、RNA聚合酶按5到3方向沿DNA模板链移动 D、转录所得的RNA与模板链互补 E、RNA聚合酶将核糖核苷酸添加到正在生长的RNA链的5端,3、下列关于大肠杆菌RNA聚合酶陈述错误的是(
2、 ),A. 全酶包括因子 B. 核心酶包括因子 C. 需要Mg2+才有活性 D. 需要Zn2+才有活性,A RNA聚合酶II对-鹅膏覃碱不敏感 B RNA聚合酶II存在于核质中 C RNA聚合酶III转录tRNA基因 D 真核细胞中含有除RNA聚合酶I、II、III之外的其他RNA聚合酶 E 每一种RNA聚合酶除含有与大肠杆菌RNA聚合酶同源的亚基外,还有每一种聚合酶特有的其他亚基,5、以下对真核生物DNA聚合酶I的陈述正确的是 ( ),A RNA聚合酶I为核糖体RNA转录该基因 B 18S,5.8S,28SrRNA是分开转录的 C RNA聚合酶I的转录发生在核质中 D RNA聚合酶I的转录发
3、生在胞质中,6、真核生物的RNA聚合酶识别的是( ),A启动子 B增强子 CTF-DNA复合体 DRF,二、名词解释,1、转录:是指以DNA为模板,在依赖于DNA的RNA聚和酶催化下,以4中rNTP为原料,合成RNA的过程。是基因表达最关键也是最核心的一步,2、内含子和外显子,真核细胞DNA分子中能转录到mRNA前体分子中但会在翻译前被切除的非编码区序列称内含子。而编码区称为外显子。,3、因子,RNA聚合酶的别构效应物,也可看作是聚合酶结构中的一个亚单位。可以极大的提高聚合酶对启动子的识别结合能力,在转录起始后从核心酶上脱落下来。是转录起始阶段不可缺少的辅助因子,4、启动子【已考试题】,DNA
4、模板上具有活化RNA聚合酶、启动转录起始功能的特殊序列。,5、封闭复合物和开放复合物,RNA聚合酶和启动子相结合形成转录起始复合物。若启动子序列是闭合的双链DNA则称为封闭复合物,若启动子序列上有一小段双链被解开而暴露内部碱基则称为开放复合物。,6、转录单元【已考试题】,指 RNA 聚合酶起始位点和终止位点间的距离,可能包括不止一个基因。,7、增强子【已考试题】,增强子是一种顺式作用序列,能够提高一些真核生物启动子的利用,并能够在启动子任何方向以及任何位置(上游或者下游)作用。,8、上游启动子元件,真核基因启动子TATA序列上游的保守序列,能起到调节转录水平的作用,9、mRNA丰度,指每个细胞
5、中 mRNA 分子的数目,10、帽子结构,通过倒扣GTP和特殊的甲基化修饰而加在真核mRNA5端的特殊结构,可保护mRNA的稳定,形似帽子而得名。,11、终止子,模板DNA上的具有终止转录功能的特殊序列。,12、编码链与模板链,编码链或有意义链:指与RNA序列相当的那条DNA链 模板链或称反义链:指据碱基互补原则指导mRNA合成的那条DNA链,问答:1、列出真核生物mRNA与原核生物mRNA的区别。,原核生物mRNA的半衰期短,多以多顺反子形式存在,5端无帽子结构,3端没有或有较短的polyA尾巴。单在原核生物起始密码上游具有能与核糖体16SrRNA3端反向互补的序列,称SD序列。原核生物mR
6、NA的起始密码子有AUG、GUG和UUG三种。转录和翻译在同一区域进行 真核生物mRNA半衰期相对较长,多以单顺反子形式村子,5端有GTP倒扣形成的帽子结构,3端有较长的polyA尾巴。只有AUG一种起始密码子。转录在核内和翻译在核外进行。,2、概括说明因子对启动子调节的辅助功能。,因子是RNA聚合酶的别构效应物,能增加聚合酶对启动子的亲和力,同时降低聚合酶对非启动子区的亲和力。由于同一个聚合酶可以和几种不同因子结合,故可利用选择不同的因子起始不同的基因转录。,3、列举原核生物同真核生物转录的差异。,1】 原核生物转录只有一种RNA聚合酶,真核生物转录根据转录产物不同而由多种RNA聚合酶。 2
7、】 原核生物的启动子具有极高的同源性,而真核生物的启动子差异较大 3 】原核生物的转录产物是多顺反子mRNA,而真核生物的转录产物是核不均一RNA,需转录后修饰加工。,4、概括典型原核生物启动子的结构和功能,并解释什么是保守序列,启动子是RNA聚合酶结合和转录起始的特殊序列。典型的原核生物启动子大约40个核苷酸,并由两个重要的序列: 10区,pribnow box,TATA,和35区TTGACA,是RNA聚合酶的结合位点。保守序列指所有启动子的该部位都有这一序列或十分相似的结构。,5、真核生物启动子的基本结构包括哪些部分?分别有何功能?,真核生物启动子包含核心启动子元件和上游启动子元件两部分。
8、核心启动子元件即TATA box,其功能是使转录精确的起始。上游启动子元件包括CAAT box 和GC box,其功能是控制转录起始的频率。,6、增强子是如何增强转录的?,通过影响染色质DNA蛋白质结构或改变超螺旋密度而改变模板的整体结构,从而使得RNA聚合酶更容易与模板DAN结合,起始基因转录。,7、添加PolyA尾巴的信号序列是什么?简述尾巴结构的生理意义,基因3末端转录终止位点上游1530bp处的保守序列AAUAAA 生理意义:保持mRNA的稳定性,防止被降解;与翻译起始有关,8、简述转录的常规特点,在依赖DNA的RNA聚合酶作用下进行转录AU、CG 合成RNA分子转录合成RNA链的方向
9、为53,模板单链DNA的极性方向为35, 而非模板单链的极性方向与RNA链相同,均为53。(书写) 基因转录方式为不对称转录(一条单链DNA 为模板,RNA聚合酶的结合),RNA酶促合成的基本特征,(1) 双链DNA分子以单链为模板; (2) 不需引物; (3) 底物是5-核苷三磷酸(NTP); (4) 前一个碱基的 3-OH和后一个碱基的 5-P反应,形成磷酸二酯键,RNA链延伸; (5) RNA碱基顺序由模板DNA顺序决定; (6) RNA合成方向是从53,新生RNA与模板DNA链呈反向平行;,9、简述因子依赖性终止子的作用机理,因子结合:最初结合到RNA终止子上游一个伸展的(约70个核苷
10、酸)单链区。 因子移动:结合到RNA上后,发挥ATP酶活性以提供在RNA上滑动的能量,直到它到达RNA-DNA杂合链区域(可能因子沿RNA移动比聚合酶沿DNA移动的速度快), 终止:因子发挥解旋酶活性,使双链体结构,10、比较真核生物与原核生物转录起始的第一步有什么不同。,细菌中,DNA指导的RNA聚合酶核心酶由四个亚基组成(两个亚基,一个亚基,一个亚基),核心酶与亚基结合产生全酶。核心酶可以催化NTP的聚合,但只有全酶能够引发转录的开始。主要的步骤是:具有特异识别能力的。亚基识别转录起,始点上游的启动子特异同源序列,这样可以使全酶与启动子序列结合力增加,形成封闭的二元复合物。关键的作用是RN
11、A聚合酶与DNA的相互作用。真核生物中,当含TBP的转录因子与DNA相互作用时,其他因子也结合上来,形成起始复合体,这一复合体再与RNA聚合酶结合,因此主要是RNA聚合酶与蛋白质之间的作用。,11、 转录涉及模板链和编码链的分离,解释在转录中单链DNA是怎样被保护的,转录过程中控板与编码链分离时,聚合酶覆盖了整个转录泡从解旋位点到螺旋重新形成位点,因此单链的DNA被保护起来。与复制不同,转录不需要单链结合蛋白的参与。,12、 概括说明因子对启动子调节的辅助功能,因子(除了RpoN)有识别启动子序列的结构域。作为游离的蛋白质;因子并不具备与DNA结合的构象。当因子与核心酶结合后构象发生改变,其N
12、末端游离出与DNA结合的结构域。因子的这一调节方式是为了防止游离的因子与启动子区结合,而阻碍了依赖于全酶的转录启动。另外,这样也可防止形成全酶的因子的浓度被稀释,因为每一个细胞中,大约每三个核心酶对应于一个因子。,13、为什么只有DNA双螺旋中的一条链能被正常的转录?,如果两条链都被转录,每个基因就能编码两个不同的多肽。,14、原核生物的核糖体RNA和DNA相对较稳定并且半衰期长,而mRNA却不稳定,很快被降解,请解释这种稳定性的差异,如果转录物的寿命很长,就不可能通过控制mRNA的合成速率来调节基因的活性。另一方面,如果tRNA和rRNA的寿命长的话,就更合算。,15、启动子有何作用特点,(
13、1)一个基因可同时拥有一个及以上启动子 (2)启动子位置不定,一般在转录起始点上游。 (3)可与增强子共同控制转录起始和强度。 (4)发挥功能时除需RNA聚合酶外,还需转录调控因子与启动子区各种调控元件相互作用,16、增强子有何作用特点, 可增强效应十分显著; 增强效应与其位置和取向无关; 大多为重复序列; 一般具有组织或细胞特异性; 无基因专一性; 许多增强子还受外部信号的调控,17、如何通过实验确定启动子与增强子边界及关键序列元件,边界序列确定:从一段特定的含有启动子的DNA片段入手,从DNA的两侧不断缩短长度直至短到停止产生活性的某一位置。 保守序列确定:A: 对已知启动子序列,可通过缺
14、失或突变确定哪些碱基为必需;B: 还可通过比较不同的启动子间的同源性,确定哪些序列为保守序列。,18、回答大肠杆菌RNA聚合酶各亚基生物学功能,和共同组成了酶的催化中心。它们的序列与真核生物RNA聚合酶的最大亚基相关。 亚基可能是酶和核苷酸底物结合的部位。 亚基是酶与DNA模板结合的主要成分。亚基的功能可能是识别其相应的启动子。原核生物因子的功能:帮助核心酶辨认启动子;解开DNA的双螺旋,1、mRNA的功能是( ),A.在蛋白质合成中起模板作用 B.与蛋白质结合构成核糖体 C.在蛋白质合成时起着携带活化氨基酸的作用 D.调节转录活性与速度,A,2、下列关于DNA与RNA结构差异错误的是( ),
15、A. DNA中含有的五碳糖为脱氧核糖,而RNA中位核糖 B. DNA碱基中有胸腺嘧啶,而RNA中位尿嘧啶。 C. 二者都不含稀有碱基 D. DNA一般为双链,而RNA一般为单股连,C,3、已知双链DNA一条链碱基顺序为:5GCTTACGTAAG3,则转录后RNA碱基顺序为:( ),A. 5CGAATGCATTC3 B. 5CGAAUGCAUUC3 C. 5GCTTACGTAAG3 D. 5GCUUACGUAAG3,D,4、以下关于转录陈述哪些是正确的( ),A、RNA合成按3到5方向进行 B、RNA聚合酶按5到3方向沿DNA有义链移动 C、RNA聚合酶按5到3方向沿DNA模板链移动 D、转录所
16、得的RNA与模板链互补 E、RNA聚合酶将核糖核苷酸添加到正在生长的RNA链的5端,BD,5、下列关于大肠杆菌RNA聚合酶陈述错误的是( ),A. 全酶包括因子 B. 核心酶包括因子 C. 需要Mg2+才有活性 D. 需要Zn2+才有活性,B,6、下列陈述不正确的是( ),A.大肠杆菌RNA聚合酶有两个亚基 B.大肠杆菌RNA聚合酶有一个亚基 C.大肠杆菌有一个因子 D.核心酶能在DNA模板上合成RNA,但不能在正确位置起始转录 E.因子仅能保证细菌RNA聚合酶稳定地结合到启动子上,C,7、下列关于大肠杆菌陈述正确的是( ),A -10序列通常正好位于转录起始点上游10bp处 B 起始核苷酸通
17、常是G C -35和-10序列间的间隔区域是保守的 D 转录起始位点后的序列对于转录效率不重要 E -35和-10序列的距离对于转录效率非常重要,E,8、一下关于大肠杆菌转录的陈述哪一个是正确的 ( ),A RNA聚合酶的核心酶与DNA的结合使非特异的,不稳定的 B 因子大大提高了聚合酶对正确启动子位点的亲和力 C 几乎所有RNA起始位点都有一个嘌呤残基组成,而且A比G出现频率更高 D 所有启动子都被负超螺旋所抑制 E 终止子通常是A-U发夹结构,B,9、以下对真核生物DNA聚合酶IIIIII的陈述错误的是 ( ),A RNA聚合酶II对-鹅膏覃碱不敏感 B RNA聚合酶II存在于核质中 C
18、RNA聚合酶III转录tRNA基因 D 真核细胞中含有除RNA聚合酶I、II、III之外的其他RNA聚合酶 E 每一种RNA聚合酶除含有与大肠杆菌RNA聚合酶同源的亚基外,还有每一种聚合酶特有的其他亚基,A,10、以下对真核生物DNA聚合酶I的陈述正确的是 ( ),A RNA聚合酶I为核糖体RNA转录该基因 B 18S,5.8S,28SrRNA是分开转录的 C RNA聚合酶I的转录发生在核质中 D RNA聚合酶I的转录发生在胞质中,A,11、hnRNA是( ),A存在于细胞核内的tRNA前体 B. 存在于细胞核内的mRNA前体 C. 存在于细胞核内的rRNA前体 D.存在于细胞核内的snRNA
19、前体,B,12、以RNA为模板合成DNA的酶是( ),ADNA聚合酶 BDNA聚合酶 CRNA聚合酶 D反转录酶,D,13、RNA合成中链的延伸方向是( ),A5,3, B从N端到C端 C3,5, D从C端到N端,A,14、含稀有碱基最多的RNA是( ),AmRNA B、rRNA C5S-rRNA DtRNA,D,15、真核生物RNA聚合酶I催化转录的产物是( ),AmRNA B45S-rRNA C5S-rRNA DtRNA,B,16、真核生物的RNA聚合酶识别的是( ),A启动子 B增强子 CTF-DNA复合体 DRF,A,17、在类似RNA这样的单链核酸所表现出的“二级结构”中,发夹结构的
20、形成:( ),(a)基于各个片段间的互补,形成反向平行双螺旋(b)依赖于 A-U含量,因为形成的氢键越少则发生碱基配对所需的能量也越少(c)仅仅当两配对区段中所有的碱基均互补时才会发生(d)同样包括有像 G-U这样的不规则碱基配对(e)允许存在几个只有提供过量的自由能才能形成碱基对的碱基,AD,18、当一个基因具有活性时:( ) 【已考试题】,(a)启动子一般是不带有核小体的 (b)整个基因一般是不带有核小体的 (C)基因被核小体遮盖,但染色质结构已发生改变以致于整个基因对核酸酶降解更 加敏感 (d)基因活化发生在染色体复制间期,AC,19、原核细胞信使RNA含有几个其功能所必需的特征区段,它
21、们是:( ),(a)启动子,SD序列,起始密码子,终止密码子,茎环结构 (b)启动子,转录起始位点,前导序列,由顺反子间区序列隔开的SD序列和 ORF,尾部序列,茎环结构 (c)转录起始位点,尾部序列,由顺反子间区序列隔开的SD序列和ORF,茎环结构 (d)转录起始位点,前导序列,由顺反子间区序列隔开的SD序列和ORF,尾部序列,D,20、tRNA参与的反应有:( ) 【已考试题】,(a)转录(b)反转录(C)翻译(d)前体mRNA的剪接(e)复制,C,21、因子的结合依靠( ),(a)对启动子共有序列的长度和间隔的识别 (b)与核心酶的相互作用 (c)弥补启动子与共有序列部分偏差的反式作用因
22、子的存在 (d)转录单位的长度 (e)翻译起始密码子的距离,A,22、下面哪一项是对三元转录复合物的正确描述:( ),(a)因子、核心酶和双链 DNA在启动子形成的复合物 (b)全酶、 TF和解链 DNA双链形成的复合物 (c)全酶、模板 DNA和新生RNA形成的复合物 (d)三个全酶在转录起始位点(tsp)形成的复合物 (e)因子、核心酶和促旋酶形成的复合物,C,23、因子和 DNA之间相互作用的最佳描述是:( ),(a)游离和与 DNA结合的因子的数量是一样的,而且因子合成得越多,转录起 始的机会越大(b)因子通常与 DNA结合,且沿着 DNA搜寻,直到在启动子碰到核心酶。它与DNA的结合
23、不需依靠核心酶(c)因子通常与 DNA结合,且沿着RNA搜寻,直到碰到启动子,在有核心酶存在的时候与之结合(d)因子是 DNA依赖的RNA聚合酶的固有组分,它识别启动子共有序列且与全酶结合(e)因子加入三元复合物而启动RNA合成,C,24、DNA依赖的RNA聚合酶的通读可以靠( ),(a)因子蛋白与核心酶的结合(b)抗终止蛋白与一个内在的因子终止位点结合,因而封闭了终止信号(c)抗终止蛋白以它的作用位点与核心酶结合,因而改变其构象,使终止信号不能被核心酶识别(d)NusA蛋白与核心酶的结合(e)聚合酶跨越抗终止子蛋白终止子复合物,C,25、因子专一性表现在:( ),(a)因子修饰酶(SME)催
24、化因子变构,使其成为可识别应激启动子的因子(b)不同基因编码识别不同启动子的因子(c)不同细菌产生可以互换的因子(d)因子参与起始依靠特定的核心酶(e)因子是一种非专一性蛋白,作为所有RNA聚合酶的辅助因子起作用,B,26、TATA框存在于( ),(a)聚合酶识别的所有启动子中(b)聚合酶识别的大部分启动子中(c)聚合酶识别的极少数启动子中(d)聚合酶识别的所有启动子中(e)聚合酶识别的大部分启动子中(f)聚合酶识别的极少数启动子中,BF,27、RNA聚合酶的C端结构域(CTD)的磷酸化与( )相关,(a)与起始前复合体的结合 (b)TFH的激酶活性 (c)TFD中特异 TAF蛋白的存在 (d
25、)从起始聚合酶到延伸聚合酶的转换 (e)起始因子TFA, TFB及 TFD的释放,BDE,28、选出所有有关 snRNA的正确叙述:( ),(a)snRNA只位于细胞核中(b)大多数snRNA是高丰度的(c)snRNA在进化的过程中是高度保守的(d)某些snRNA可以与内含子中的保守序列进行碱基配对(e)以上都正确,E,29、tRNA中的内含子( ),(a)通过两步转酯反应被切除(b)具有与反密码子互补的序列(c)都形成相似的二级结构(d)由蛋白酶(核酸内切酶和连接酶)切除(e)在5和3剪接位点的序列是保守的,BCD,30、在前体 mRNA上加多聚腺苷酸尾巴( ),(a)涉及两步转酯机制 (b
26、)需要保守的AAUAAA序列 (c)在 AAUAAA序列被转录后马上开始 (d)通过一个多组分复合物的逐步组装进行 (e)由依赖于摸板的RNA聚合酶催化,BD,31、下列哪些位点是原核RNA聚合酶与启动子的结合位点,能与因子相互识别( ),A、 -10区:TATA区 B、-35区:TTGACA区 C、 -25-35区含TATA序列(TATA box) D、-70-80区含CCAAT序列(CAAT box) E、在-80-110区含有GCCACCC或GGGCGGG序列(GC box),AB,二、名词解释,1、转录:是指以DNA为模板,在依赖于DNA的RNA聚和酶催化下,以4中rNTP为原料,合成
27、RNA的过程。是基因表达最关键也是最核心的一步,2、内含子和外显子,真核细胞DNA分子中能转录到mRNA前体分子中但会在翻译前被切除的非编码区序列称内含子。而编码区称为外显子。,3、因子,RNA聚合酶的别构效应物,也可看作是聚合酶结构中的一个亚单位。可以极大的提高聚合酶对启动子的识别结合能力,在转录起始后从核心酶上脱落下来。是转录起始阶段不可缺少的辅助因子,4、启动子【已考试题】,DNA模板上具有活化RNA聚合酶、启动转录起始功能的特殊序列。,5、封闭复合物和开放复合物,RNA聚合酶和启动子相结合形成转录起始复合物。若启动子序列是闭合的双链DNA则称为封闭复合物,若启动子序列上有一小段双链被解
28、开而暴露内部碱基则称为开放复合物。,6、转录单元【已考试题】,指 RNA 聚合酶起始位点和终止位点间的距离,可能包括不止一个基因。,7、增强子【已考试题】,增强子是一种顺式作用序列,能够提高一些真核生物启动子的利用,并能够在启动子任何方向以及任何位置(上游或者下游)作用。,8、上游启动子元件,真核基因启动子TATA序列上游的保守序列,能起到调节转录水平的作用,9、mRNA丰度,指每个细胞中 mRNA 分子的数目,10、帽子结构,通过倒扣GTP和特殊的甲基化修饰而加在真核mRNA5端的特殊结构,可保护mRNA的稳定,形似帽子而得名。,11、终止子,模板DNA上的具有终止转录功能的特殊序列。,12
29、、编码链与模板链,编码链或有意义链:指与RNA序列相当的那条DNA链 模板链或称反义链:指据碱基互补原则指导mRNA合成的那条DNA链,问答:1、列出真核生物mRNA与原核生物mRNA的区别。,原核生物mRNA的半衰期短,多以多顺反子形式存在,5端无帽子结构,3端没有或有较短的polyA尾巴。单在原核生物起始密码上游具有能与核糖体16SrRNA3端反向互补的序列,称SD序列。原核生物mRNA的起始密码子有AUG、GUG和UUG三种。转录和翻译在同一区域进行 真核生物mRNA半衰期相对较长,多以单顺反子形式村子,5端有GTP倒扣形成的帽子结构,3端有较长的polyA尾巴。只有AUG一种起始密码子
30、。转录在核内和翻译在核外进行。,2、概括说明因子对启动子调节的辅助功能。,因子是RNA聚合酶的别构效应物,能增加聚合酶对启动子的亲和力,同时降低聚合酶对非启动子区的亲和力。由于同一个聚合酶可以和几种不同因子结合,故可利用选择不同的因子起始不同的基因转录。,3、列举原核生物同真核生物转录的差异。,1】 原核生物转录只有一种RNA聚合酶,真核生物转录根据转录产物不同而由多种RNA聚合酶。 2】 原核生物的启动子具有极高的同源性,而真核生物的启动子差异较大 3 】原核生物的转录产物是多顺反子mRNA,而真核生物的转录产物是核不均一RNA,需转录后修饰加工。,4、概括典型原核生物启动子的结构和功能,并
31、解释什么是保守序列,启动子是RNA聚合酶结合和转录起始的特殊序列。典型的原核生物启动子大约40个核苷酸,并由两个重要的序列: 10区,pribnow box,TATA,和35区TTGACA,是RNA聚合酶的结合位点。保守序列指所有启动子的该部位都有这一序列或十分相似的结构。,5、真核生物启动子的基本结构包括哪些部分?分别有何功能?,真核生物启动子包含核心启动子元件和上游启动子元件两部分。核心启动子元件即TATA box,其功能是使转录精确的起始。上游启动子元件包括CAAT box 和GC box,其功能是控制转录起始的频率。,6、增强子是如何增强转录的?,通过影响染色质DNA蛋白质结构或改变超
32、螺旋密度而改变模板的整体结构,从而使得RNA聚合酶更容易与模板DAN结合,起始基因转录。,7、添加PolyA尾巴的信号序列是什么?简述尾巴结构的生理意义,基因3末端转录终止位点上游1530bp处的保守序列AAUAAA 生理意义:保持mRNA的稳定性,防止被降解;与翻译起始有关,8、简述转录的常规特点,在依赖DNA的RNA聚合酶作用下进行转录AU、CG 合成RNA分子转录合成RNA链的方向为53,模板单链DNA的极性方向为35, 而非模板单链的极性方向与RNA链相同,均为53。(书写) 基因转录方式为不对称转录(一条单链DNA 为模板,RNA聚合酶的结合),RNA酶促合成的基本特征,(1) 双链
33、DNA分子以单链为模板; (2) 不需引物; (3) 底物是5-核苷三磷酸(NTP); (4) 前一个碱基的 3-OH和后一个碱基的 5-P反应,形成磷酸二酯键,RNA链延伸; (5) RNA碱基顺序由模板DNA顺序决定; (6) RNA合成方向是从53,新生RNA与模板DNA链呈反向平行;,9、简述因子依赖性终止子的作用机理,因子结合:最初结合到RNA终止子上游一个伸展的(约70个核苷酸)单链区。 因子移动:结合到RNA上后,发挥ATP酶活性以提供在RNA上滑动的能量,直到它到达RNA-DNA杂合链区域(可能因子沿RNA移动比聚合酶沿DNA移动的速度快), 终止:因子发挥解旋酶活性,使双链体
34、结构,10、比较真核生物与原核生物转录起始的第一步有什么不同。,细菌中,DNA指导的RNA聚合酶核心酶由四个亚基组成(两个亚基,一个亚基,一个亚基),核心酶与亚基结合产生全酶。核心酶可以催化NTP的聚合,但只有全酶能够引发转录的开始。主要的步骤是:具有特异识别能力的。亚基识别转录起,始点上游的启动子特异同源序列,这样可以使全酶与启动子序列结合力增加,形成封闭的二元复合物。关键的作用是RNA聚合酶与DNA的相互作用。真核生物中,当含TBP的转录因子与DNA相互作用时,其他因子也结合上来,形成起始复合体,这一复合体再与RNA聚合酶结合,因此主要是RNA聚合酶与蛋白质之间的作用。,11、 转录涉及模
35、板链和编码链的分离,解释在转录中单链DNA是怎样被保护的,转录过程中控板与编码链分离时,聚合酶覆盖了整个转录泡从解旋位点到螺旋重新形成位点,因此单链的DNA被保护起来。与复制不同,转录不需要单链结合蛋白的参与。,12、 概括说明因子对启动子调节的辅助功能,因子(除了RpoN)有识别启动子序列的结构域。作为游离的蛋白质;因子并不具备与DNA结合的构象。当因子与核心酶结合后构象发生改变,其N末端游离出与DNA结合的结构域。因子的这一调节方式是为了防止游离的因子与启动子区结合,而阻碍了依赖于全酶的转录启动。另外,这样也可防止形成全酶的因子的浓度被稀释,因为每一个细胞中,大约每三个核心酶对应于一个因子
36、。,13、为什么只有DNA双螺旋中的一条链能被正常的转录?,如果两条链都被转录,每个基因就能编码两个不同的多肽。,14、原核生物的核糖体RNA和DNA相对较稳定并且半衰期长,而mRNA却不稳定,很快被降解,请解释这种稳定性的差异,如果转录物的寿命很长,就不可能通过控制mRNA的合成速率来调节基因的活性。另一方面,如果tRNA和rRNA的寿命长的话,就更合算。,15、启动子有何作用特点,(1)一个基因可同时拥有一个及以上启动子 (2)启动子位置不定,一般在转录起始点上游。 (3)可与增强子共同控制转录起始和强度。 (4)发挥功能时除需RNA聚合酶外,还需转录调控因子与启动子区各种调控元件相互作用
37、,16、增强子有何作用特点, 可增强效应十分显著; 增强效应与其位置和取向无关; 大多为重复序列; 一般具有组织或细胞特异性; 无基因专一性; 许多增强子还受外部信号的调控,17、如何通过实验确定启动子与增强子边界及关键序列元件,边界序列确定:从一段特定的含有启动子的DNA片段入手,从DNA的两侧不断缩短长度直至短到停止产生活性的某一位置。 保守序列确定:A: 对已知启动子序列,可通过缺失或突变确定哪些碱基为必需;B: 还可通过比较不同的启动子间的同源性,确定哪些序列为保守序列。,18、回答大肠杆菌RNA聚合酶各亚基生物学功能,和共同组成了酶的催化中心。它们的序列与真核生物RNA聚合酶的最大亚基相关。 亚基可能是酶和核苷酸底物结合的部位。 亚基是酶与DNA模板结合的主要成分。亚基的功能可能是识别其相应的启动子。原核生物因子的功能:帮助核心酶辨认启动子;解开DNA的双螺旋,