1、手足口病标本采集 及检测技术方案,2014年版,目录,病原学,手足口病（hand, foot and month disease, HFMD）是由肠道病毒引起的急性传染病，多发于10岁以下婴幼儿，以手、足、口腔等部位皮肤黏膜的皮疹、疱疹、溃疡为典型表现，个别患者可出现心肌炎、肺水肿、无菌性脑脊髓膜炎、脑炎等并发症。手足口病并不是一种新发传染病，自1957年首次报道以来，曾在许多国家和地区多次流行。2006年世界卫生组织公布该病在须申报疾病的发病率中居第四位。该病全年皆可发生，我国以夏秋季多发，是可防、可治且预后较好的小儿常见传染病。中华人民共和国卫生部于2008年5月2日起，将该病列为丙类传染
2、病管理。,背景知识,病原学,引起手足口病（HFMD）的病毒属于小RNA病毒科肠道病毒属，包括：柯萨奇病毒A组（Coxasckievirus A, CVA）的 2、4、5、7、9、10、16 型等B组（Coxasckievirus B, CVB)的1、2、3、4、5 型等；肠道病毒71型（Human Enterovirus 71, EV71）；埃可病毒（Echovirus, ECHO）等。,背景知识,病原学,其中以EV71和CVA16为主要病原。近年来我国陆续出现这两种病原引起的HFMD季节性流行，局部呈强流行态势。由此，HFMD的有关研究日益受到人们的重视。目前对于HFMD感染尚没有特效的疫苗
3、和药物，主要采用对症和支持治疗，积极防止发生并发症，因此加强疾病及病原的监测、准确处置疫情、开展健康教育是控制的关键。,背景知识,国外流行概况,手足口病是一种全球性传染病，世界大部分国家和地区均有此病流行的报道。1957年首先发生于加拿大，并于同年在新西兰被最早加以描述和报告。1958年加拿大初步查出CVA16病毒为本病病原。澳大利亚、美国、瑞典是最早出现手足口病的国家之一。1959年英国伯明翰、美国加利福尼亚地区发生流行，并从患者疱疹液中分离出CVA16，并根据本病病变分布特点，被正式命名为“手足口病” 。,国外流行概况,1972年EV71病毒引起的手足口病在美国被首次确认，此后EV71感染
4、与CVA16感染交替出现，成为手足口病的主要病原体。日本是手足口病发病较多的国家，历史上发生过多次CVA16，EV71引起的大规模流行。,我国流行概况,1981年我国首次在上海市暴发手足口病。此后，北京、河北、天津、福建、吉林、山东、湖北、青海、广东和河南等省市陆续出现该病报道。1983年天津发生由CVA16引起的手足口病暴发流行，510月间发生病例7000余例，经过两年散发流行后，1986年出现了以托儿所及幼儿园为主的疫情暴发。1995年武汉病毒研究所从手足口患儿标本中分离到EV71。1998年深圳市防疫站同样分离到EV71。,我国流行概况,1998年我国台湾地区发生EV71感染引起的手足口
5、病和疱疹性咽峡炎流行，检测哨点共报告129106例患者，重症患者405例，死亡78例，多为五岁以下幼儿。2000年山东省招远市手足口病暴发，市人民医院共接诊患儿1698例，最小年龄5个月，最大14岁，3例合并心肌炎死亡。2008年安徽阜阳市发生较大规模手足口病疫情，共报告病例6606例，其中23例死亡 。,一、采集标本的种类、保存和运输,（一）粪便标本,采集病人发病3日内的粪便标本，用于病原检测。粪便标本采集量5-8g/份，采集后立即放入无菌采便管内，外表贴上带有唯一识别号码的标签，4暂存12小时内送达实验室；-20以下低温冷冻保藏；长期保存的标本存于-70冰箱。,一、采集标本的种类、保存和运
6、输,（二）咽拭子标本,采集病人发病3日内的咽拭子标本，用于病原检测。用专用采样棉签，适度用力拭抹咽后壁和两侧扁桃体部位，应避免触及舌部；迅速将棉签放入装有3-5ml保存液（含5%牛血清维持液或生理盐水，推荐使用维持液）的15ml外螺旋盖采样管中，在靠近顶端处折断棉签杆，旋紧管盖并密封，以防干燥，外表贴上带有唯一识别号码的标签。4暂存并在12小时内送达实验室，-20以下低温冷冻保藏，需长期保存的标本存于-70冰箱。,一、采集标本的种类、保存和运输,（三）血清标本,在手足口病流行年份中应采集EV71 和CVA16感染的手足口病患儿的双份血清。采集急性期（发病0-7d）和恢复期（发病14-30d）双
7、份配对血清用于阐明和分析EV71和CVA16感染后IgG和IgM抗体的动态变化，评价血清学抗体试剂盒的敏感性和特异性。静脉采集3-5ml全血，置于真空无菌采血管中，自凝后，分离血清，将血清移到2ml外螺旋的血清保存管中，外表贴上带有唯一识别号码的标签。将血清置于-20以下冰箱中冷冻保存。,一、采集标本的种类、保存和运输,（四）疱疹液,在手足口病的实验室诊断中，从疱疹液中分离到病毒即可确诊该病毒为病因，可同时采集多个疱疹作为一份标本。先用75%的酒精对疱疹周围的皮肤进行消毒，然后用消毒针将疱疹挑破用棉签蘸取疱疹液，迅速将棉签放入内装有3-5ml保存液（含5%牛血清维持液或生理盐水，推荐使用维持液
8、）的采样管中，在靠近顶端处折断棉签杆，旋紧管盖并密封，采样管外表贴上带有唯一识别号码的标签。所采集标本4暂存立即（12h内）送达实验室，20以下低温冷冻保藏，需长期保存的标本存于70冰箱。,一、采集标本的种类、保存和运输,（五）肛拭子标本,采集病人发病3日内的肛拭子标本，用于病原检测。用专用采样棉签，从患儿肛门轻轻插入，适度用力弧型左右擦拭数下，拔出后,迅速将棉签放入装有35ml保存液（含5%牛血清细胞维持液）的15ml外螺旋的采样管中，在靠近顶端处折断棉签杆，旋紧管盖，并密封，以防干燥。采样管外表贴上带有唯一识别号码的标签。,一、采集标本的种类、保存和运输,（六）尸检标本,采集脑、肺和肠淋巴
9、结等重要组织标本，每一采集部位分别使用单独的消毒器械。每种组织应多部位取材，每部位应取2-3份约5-10g的组织，淋巴结2个，分别置于15ml-50ml无菌的有外螺旋盖的冻存管中，采样管外表贴上带有唯一识别号码的标签。,一、采集标本的种类、保存和运输,（七）脑脊液标本,出现神经系统症状的病例，可采集脑脊液标本，进行病毒分离或核酸检测。采集时间为出现神经系统症状后3天内，采集量为1.0-2.0ml。采集后立即装入无菌带垫圈的冻存管中，4暂存立即(12h内)送达实验室，20以下低温冷冻保藏，需长期保存的标本存于70冰箱。但EV71感染神经系统时，很难在脑脊液中检测到EV71病原。,一、采集标本的种
10、类、保存和运输,一、采集标本的种类、保存和运输,临床标本在运输和贮存过程中要避免反复冻融。标本采集后要全程冷藏或冷冻保存和运输，12小时内送达实验室。依照人间传染的病原微生物名录，肠道病毒或潜在含有肠道病毒的标本按B类包装，置于冷藏保存盒内运输，尽量缩短运输时间。可采用陆路或航空等多种运输方式，但在运输过程中应采取保护措施，避免强烈震动、重力挤压等现象。在送到省、地、市级CDC实验室时，包装盒内应带冰且包装完整。在上送标本的同时，需附带相关的手足口病病例临床标本采样登记表。,二、标本采集注意事项,在手足口病的实验室诊断中，从疱疹液或脑脊液中分离到病毒即可诊断该病毒为病因。,标本保存液的配置,三
11、、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,1.试剂配置 （1）细胞的生长液、维持液的配制见下表：,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,（2）粪便标本和肛拭子的处理液完全PBS液中加入P.S溶液，终浓度为青霉素100单位/ml，链霉素为100g/ ml。完全PBS液的配置：取以下1份B液和1份C液加到8份A液中即为完全PBS工作液。,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,用600800ml蒸馏水溶解以上盐类，加蒸馏水补至1000ml，10psi（70Kpa）15分钟高压灭菌，即为不完全PBS工作液（不含钙、镁离子）。,A液：,三、实验室检测操作流程,（一
12、）病毒分离,B液：,溶解于100ml蒸馏水中，10psi（70Kpa）15分钟高压灭菌。,C液：,溶解于100ml蒸馏水中，10psi（70Kpa）15分钟高压灭菌。,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,2病毒分离细胞系许多细胞系可支持人肠道病毒（如EV71、CVA16）生长。对于检测手足口病的病原来说，建议所有怀疑含EV71、CVA16等肠道病毒感染的标本均需接种到以下两种细胞系： RD细胞，来源于人横纹肌肉瘤细胞。 HEp-2细胞，来源于人喉癌上皮细胞。,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,3标本的处理 （1）粪便标本和肛拭子的处理 操作步骤：1）在离心管上标记标本号；2）每管中加
13、入10ml PBS、1g玻璃珠、1ml氯仿；3）在生物安全柜中将每一份粪便标本取大约2g加入标记好的离心管中（确保离心管上的标号与原始标本的标号一致）；肛拭子为2ml；4）剩余的原始标本最好留在原容器中，冻存于20；,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,5）确保拧紧离心管，用机械震荡器剧烈震荡20min；6）在确保离心机的盖子盖好和离心桶密封的情况下，用冷冻离心机在1500g条件下离心20min；7）在生物安全柜中将每1份标本的上清液分别吸入2个有外螺旋盖的冻存管中（如果上清液不清澈，应再用氯仿处理1次）；8） 1管粪便悬液冻存于20作为备份，另1管存于4-8以备接种。,三、实验室检测操作
14、流程,（一）病毒分离,（2）疱疹液标本的处理疱疹液标本通常直接用于RNA提取或病毒分离。 （3）脑脊液标本的处理脑脊液标本通常直接用于病毒分离。 （4）咽拭子标本的处理咽拭子要在标本运输（保存）液中充分搅动（至少40下），以洗下拭子上粘附的病毒及含有病毒的细胞等，用于病毒分离时，需要冻融一次（防止多次冻融），使细胞破裂，释放病毒颗粒。然后在4条件下，10000 rpm离心20min，用上清接种到细胞上或直接提取RNA。如果发现有细菌污染，须用滤器过滤除菌。,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,4接种和观察（病毒分离）（1）通常使用ml的斜面试管培养细胞，传细胞时，每管加细胞培养液1.5ml
15、。显微镜下观察单层细胞，以确保细胞是健康、无污染的。一个健康的单层细胞会在传代后48小时左右形成；（2）倒掉生长液（GM），换上1-1.2ml的维持液（MM）；（3）每一份标本需要同时接种2支RD细胞和2支HEp-2细胞，正确标记每支细胞培养管（包括标本的编号、日期、传代数）；（4）每一种细胞至少标记一管作为阴性对照；,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,（5）每支试管接种0.2ml的标本悬液，培养温度要求36。（或者使用吸附的方法接种病毒：接种标本前，倒掉生长液（GM），每支试管接种0.2ml的标本悬液，培养温度为36；吸附1小时后，换上1.5ml的维持液（MM）。同样每份标本需同时接种
16、2支RD细胞和2支HEp-2细胞）。 （6）使用倒置显微镜每天观察细胞培养管，以观察有特征性的肠道病毒致细胞病变效应（CPE）的出现（如细胞变圆，折光增强并脱离管壁等）；,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,（7）记录接种管和对照管细胞所发生的变化至少一周，记录CPE（1+4+）、提示细胞受毒性反应、老化或污染的影响而发生的变化（1+，25%; 2+, 25%-50%; 3+, 50%-75%; 4+, 75%-100%）； （8）如果有特征性的肠道病毒CPE出现，要如实记录，并观察直到75%的细胞发生变化（3+ CPE），然后储藏在20以备二次传代； （9）第一代培养见可疑细胞病变时应继
17、续传代，待细胞病变稳定出现后20或70冻存；,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,（10）一代阳性分离物再传二代，如果又有明显的CPE出现，将病毒保存在20冰箱（二代病毒）。因二代病毒滴度高于一代病毒，所以选用二代病毒进行鉴定； （11）如果7d之后没有CPE出现，那么盲传1代继续观察7d。（注意：同一病例标本的细胞培养物不能混在一起再传代，例如：不同细胞的培养物应单独传代）； （12）盲传两代后，仍然没有出现CPE的，则判定为阴性； （13）注意：如果接种后24h内出现CPE，很可能是标本中的非特异性成分导致的毒性反应。取,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,100l阳性分离物传二代
18、，继续观察；或者在接种标本吸咐1h后用维持液清洗细胞层，可能会降低毒性反应； （14）几个概念：A：毒性反应：如果在接种后1-2d内细胞快速凋亡，这可能是由于标本中含有毒性物质而导致的非特异性毒性反应。这些已接种标本的试管应在-20冻存，融化后取0.2ml接种到同一类型细胞中（此时是第二代）。如果又出现了毒性反应，那么应该取原始标本用PBS稀释10倍，再次接种到同种细胞中。这时应被认为是第一代。,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,B：微生物污染：由于细菌污染而造成培养液混浊或细胞死亡经常使病毒造成的CPE无法确定或根本无法出现。重新取原始标本，用氯仿或抗生素处理，按上述步骤重新接种到新鲜
19、细胞上。C：盲传：有时一周之后传代细胞会老化，甚至细胞对照也出现了病变。这时已接种标本的试管应在-20冻存，融化后取0.2ml接种到同一类型的新鲜单层细胞中，再观察7-10d。如果盲传两代后仍然没有产生CPE，那么认为这个标本是阴性的。,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,5病毒分离结果解释RD细胞支持HFMD的主要病原体CVA16和EV71等多种肠道病毒的复制，CVA16和EV71均能在RD细胞培养中引起特殊的肠道病毒致细胞病变效应（CPE），表现为细胞圆缩、分散、胞浆内颗粒增加，最后细胞自管壁脱落。但相同滴度的CVA16和EV71在RD细胞中生长的速度不同，EV71的生长速度要快于CV
20、A16，表现为EV71感染RD细胞后出现CPE的时间比CVA16早，EV71接种细胞后出现CPE很快，但CVA16一般要经过2次以上传代才出现明显的CPE。,三、实验室检测操作流程,（一）病毒分离,若在使用RD细胞分离的同时再增加HEp-2细胞，可提高肠道病毒的分离率（分离出其他可能致HFMD的病原体，如一些柯萨奇B组病毒）。但CVA16和EV71在HEp-2细胞中均不繁殖。,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,比较患者急性期血清与恢复期血清中和抗体滴度，可作为肠道病毒感染的血清学诊断方法，最常用的是中
21、和实验，即用微量板法测定抗体滴度，是目前人肠道病毒抗体检测的最常用方法，该方法精确且具有型特异性。 作为肠道病毒感染的诊断方法之一，可以测定血清中肠道病毒中和抗体的滴度，通常用急性期血清与恢复期血清滴度进行比较，抗体滴度4倍或4倍以上增高证明病毒感染。但是，肠道病毒隐性感染也很常见，所以在评估检测结果时就要小心一些。在中和实验中，一般要用人肠道病毒参考毒株（即原型株，EV71原型株为BrCr株，,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,CVA16原型株为G-10株）或流行株，有时同时（或单独）使用临床分离株会有助于得到更准确的检测结果。使用对肠道病毒敏感的细胞，如RD细
22、胞。用病毒（血清）稀释液（下面液体配制中的C液，可用维持液代替）稀释血清和制备病毒悬液，因为是用病毒来确定血清中抗体的滴度，所以要使用参考病毒（原型株），但有时使用所分离到的毒株（临床分离株）有助于得到更准确的检测结果，但分离株的滴度（100 CCID50/0.05ml）要事先测定。,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,中和实验的检测原理：病毒感染敏感靶细胞后，引起细胞形态学变化，出现CPE，特异性中和抗体与病毒结合后，可使病毒颗粒失去感染性，抑制CPE的出现。1液体配制,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,三、实验室检测操作流程,（二）
23、测定人双份血清标本的中和抗体滴度,2攻击病毒CCID50滴定和滴度梯度制备（1）将增殖后的病毒悬液冻融3次，然后在4、12000rpm条件下离心10min，取上清液分装于10支冻存管中，每管1.5ml，一般每管应在一次试验中用完，有剩余应高压后废弃；（2）加Eagle液10倍系列稀释为10-1至10-8病毒液，各加入细胞板内，每孔50l，每稀释度4孔细胞；（3）每孔加细胞悬液50l，同时设细胞对照（50l稀释液+50l细胞悬液）， 36培养7d，观察细胞病变；（4）按Behrens-Krber公式计算出分离病毒株的CCID50；,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,
24、log CCID50 = L-d (S-0.5)，其中：L = 实验中使用的最低稀释度的对数值；d = 稀释梯度的对数值； S = 终判时阳性部分的总和（即出现CPE的细胞孔所占的比例之和）。（5）正式试验前应先滴定攻击病毒2-3次，取其平均值，求出每0.05ml中含100 CCID50的病毒载量；（6）按照计算好的稀释比例配制攻击病毒，求出试验所需的病毒总量（即100 CCID50/0.05ml）；,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,（7）取3支小试管，每只加病毒稀释液（液体配制中的C液）0.9ml；（8）用带滤芯的吸尖（ART吸尖）吸0.1ml已经稀释好的攻击
25、病毒液（即100CCID50/0.05ml）到第一支小试管中，换另一支ART吸尖，轻轻并彻底地混匀，避免产生大量气溶胶，按照此方法依次稀释至1 CCID50/0.05ml和0.1 CCID50/0.05ml。,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,3稀释血清（1）发病1-3d内采取患者急性期血清，发病后2-4周采取恢复期血清，分别冻存在-20备检。（2）取无菌小试管若干支（每份血清使用一支）置试管架上，每管加血清处理液（上面液体配制中的A液）0.3ml，加待测血清0.1ml，盖紧塞子，震摇混匀，放4冰箱过夜，即为1：4稀释血清。次日56、30min灭活。（3）打开独立
26、无菌包装48孔组织培养板，纵向使用，每孔加血清稀释液（上面液体配制中的C液）0.3ml，每份血清使用一排，每排4孔。,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,使用移液器吸取处理过的血清0.1ml加入第一孔（即为1:16），吹吸8-10次，吸0.1ml加入第二孔（即为1:64），依次至1:1024，血清稀释的过程中不必更换吸尖。即每份血清标本进行4倍倍比稀释，即1:4、1:16、1:64、1:256、1:1024。（4）每份血清标本的每个稀释度都要平行做两孔。 4病毒中和抗体测定的操作步骤：（1）取一块96孔板横向使用，每块板可以做8份（4对）待测血清，版面设计如下图所示
27、。,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,A1-A2孔（B1-B2、C1-C2、D1-D2、E1-E2、F1-F2、G1-G2、H1-H2）中每孔加入1:1024稀释度的待测血清0.05ml，不必更换吸尖， 在A3-A4孔（B3-B4、C3-C4、D3-D4、E3-E4、F3-F4、G3-G4、H3-H4）中每孔加入1:256稀释度的待测血清0.05ml， A5-A6孔（B5-B6、C5-C6、D5-D6、E5-E6、F5-F6、G5-G6、H5-H6）中每孔加入1:64稀释度的待测血清0.05ml， A7-A8孔（B7-B8、C7-C8、D7-D8、E7-E8、F7
28、-F8、G17-G8、H7-H8）中每孔加入1:16稀释度的待测血清0.05ml，,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,A9-A10孔（B9-B10、C9-C10、D9-D10、E9-E10、F9-F10、G9-G10、H9-H10）中每孔加入1:4稀释度的待测血清0.05ml， A11-A12孔（B11-B12、C11-C12、D11-D12、E11-E12、F11-F12、G11-G12、H11-H12）为每份待测血清对照孔，每孔中补加稀释液0.05ml；（2）上述孔中分别加入病毒0.05ml（病毒滴度事先已经稀释为100 CCID50/0.05ml）；（3）盖
29、好盖子后用微量板混匀器混匀，放入36 CO2孵箱中孵育2h；,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,（4）另取一块96孔板纵向使用，做100 CCID50/0.05ml病毒滴度的核实（每次实验都必须做）。每孔先加病毒稀释液（试剂配制中的C液）0.05ml，然后从0.1 CCID50/0.05ml加起，每孔0.05ml，每个稀释度8孔，不必更换吸尖，一直加至100 CCID50/0.05ml；同时留出4孔做为细胞对照孔，每孔加入0.1ml病毒稀释液，然后放入4冰箱中暂存；,三、实验室检测操作流程,（二）测定
30、人双份血清标本的中和抗体滴度,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,（5）在孵育期间，用消化液消化细胞，准备细胞悬液，细胞悬液的浓度为2105个/ml，每块96孔板至少需要准备10ml； （6）孵育结束后每个待测血清孔、血清对照孔（待检标本板）和病毒回滴孔和细胞对照孔（病毒回滴板）分别加入0.1ml细胞悬液，然后用微量板混匀器混匀，放入36 CO2孵箱中孵育培养； （7）使用倒置显微镜每天观察CPE，并记录病毒滴定结果，以不产生细胞病变的血清最高稀释度的倒数为终点效价。当100 CCID50/0.05ml的病毒对照孔出现完全病变时，判定最终结果（约57d）； （8）注
31、意：如果病毒对照结果（病毒回滴）不在32320 CCID50/0.05ml的范围内，实验无效，就要重复实验。,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,5结果判定 当最高稀释度血清的2孔中有1孔出现细胞病变，另一孔不出现细胞病变，该稀释度的倒数计即为该血清标本的中和抗体效价；当高稀释度2孔完全病变，相邻低稀释度2孔完全不病变，则两者平均稀释度的倒数即为该血清标本的中和抗体效价；当两个相邻稀释度血清均出现1孔细胞病变，另1孔不出现细胞病变，则两者平均稀释度的倒数即为该血清标本的中和抗体效价。,三、实验室检测操作流程,（二）测定人双份血清标本的中和抗体滴度,对于HFMD的双份
32、血清中和实验结果来说，如果恢复期血清较急性期血清EV71或CVA16中和抗体滴度出现4倍或4倍以上增高即可确诊；如果恢复期血清较急性期血清其它肠道病毒中和抗体滴度出现4倍或4倍以上增高可证实该肠道病毒感染，是否为病因需要其它相关实验证实；如果单份血清中和抗体滴度大于1:256也有诊断意义，血清中和抗体滴度为1:128判定为可疑阳性。,三、实验室检测操作流程,（三）逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,三、实验室检测操作流程,（三）逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,1RNA提取可使用多种商业化试剂盒来提取RNA，针对临床标本应选择质量较高的“用于临床标本病毒RNA提取的试剂盒”，也可使用全自
33、动RNA提取仪进行提取。针对病毒分离物，核酸提取比较容易，大部分商业化RNA提取试剂盒都可有效的提取到RNA。RNA提取依据使用的试剂不同，严格按说明书进行操作。,三、实验室检测操作流程,2逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,三、实验室检测操作流程,（三）逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,2逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）（1）引物序列合成国家脊灰实验室自行设计3对引物，分别为人肠道病毒通用引物、EV71特异性引物和CVA16特异性引物。各省CDC依据引物序列在质量有保证的公司合成,引物合成后,需要做预实验，保证引物合成没有质量问题后,分发给地市级CDC。,三、实验室检测操作流程,（
34、三）逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,1）人肠道病毒（包括EV71、CVA16）核酸检测通用引物序列： PE2（上游）：5- TCC GGC CCC TGA ATG CGG CTA ATC C -3 PE1（下游）：5- ACA CGG ACA CCC AAA GTA GTC GGT CC -3,三、实验室检测操作流程,（三）逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,2）EV71核酸检测引物序列： EV71-S（上游）：5- GCA GCC CAA AAG AAC TTC AC -3 EV71-A（下游）：5- ATT TCA GCA GCT TGG AGT GC -3,三、实验室检测操作流程
35、,（三）逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,3）CVA16核酸检测引物序列： CVA16-S（上游）：5-ATT GGT GCT CCC ACT ACA GC-3 CVA16-A（下游）；5-TCA GTG TTG GCA GCT GTA GG-3,三、实验室检测操作流程,（三）逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,（2）实验设计 1）在PCR记录纸（实验记录纸）上记录本次实验操作者姓名，实验日期，所鉴定标本的名称以及标本的顺序，与PCR仪排列的顺序一致。 2）标记好加标本和对照的PCR管（阳性对照，阴性对照和试剂对照）。 A：阳性对照：参比RNA，省级CDC提供（只是在初次使用，常规不建议
36、使用，以防污染）。,三、实验室检测操作流程,（三）逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,B：阴性对照：使用正常细胞RNA或临床标本肠道病毒阴性的RNA（每次实验要设立）。 C：试剂对照：用去离子水代替标本（试剂初次使用时必须做）。,三、实验室检测操作流程,（三）逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,（3）RT-PCR扩增反应和条件1）从临床标本或病毒中提取的RNA和各种RT-PCR试剂应该一直放在冰浴盒上；2）配下列试剂主溶液：10PCR Buffer5.0ldNTPs（2.5mM each）2.0l上游引物（0.1g/l）1.0l下游引物（0.1g/l）1.0lRNA酶抑制剂（RNasin,
37、40U/l）0.5lTaq DNA聚合酶（5U/l）0.5lAMV逆转录酶（10U/l）1.0l模板RNA3.0lRNase Free dH2O36.0l50.0l,三、实验室检测操作流程,（三）逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,3）在PCR仪上进行RT-PCR反应，反应步骤如下：,4245min 953min 9520s 4525s 32个循环 7230s 7210min4Soak,三、实验室检测操作流程,（三）逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,3电泳分析（1）将已经聚合的3%的琼脂糖凝胶放在电泳装置上；（2）在帕拉膜（Parafilm）上加上6 电泳载样缓冲液（每个反应需1l）。再
38、加上5l的PCR反应产物与之混合；（3）将电泳缓冲液倒在电泳装置中，用吸尖将样品与载样缓冲液的混合溶液加到孔中；（4）盖上盖子，接通电源，以10V/cm电压（恒定电压）电泳，大约35-40min，直到溴酚蓝跑到凝胶的底部的时候，停止电泳；,三、实验室检测操作流程,（三）逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,（5）将胶取出，并注意保持凝胶的方向；（6）在1g/ml的溴化乙锭溶液中染色15min；（注意：溴化乙锭溶液是有毒、致畸、并且致肿瘤的物质，操作时要加小心，并戴双层手套。如果储存在避光的容器中，溴化乙锭溶液可以重复使用。溴化乙锭废弃物按医疗废弃物中化学品的有关规定处理。）（7）在蒸馏水中涮一
39、下凝胶；（8）在紫外透射仪下观察PCR产物电泳结果，并照相作记录。有条件的实验室可以使用全自动电泳分析仪。,三、实验室检测操作流程,（三）逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）,4结果解释 使用全自动电泳分析仪的实验室可以通过仪器自动读取PCR产物大小，来判断结果。通过琼脂糖凝胶做PCR产物电泳的实验室，需要参照DNA分子量对照对照，比较标本的PCR产物与阳性对照的PCR产物在凝胶上的位置以及大小来解释结果。,三、实验室检测操作流程,RT-PCR实验结果解释表,三、实验室检测操作流程,(四) Real-time RT-PCR （rRT-PCR）,三、实验室检测操作流程,(四) Real-time
40、 RT-PCR （rRT-PCR）,1. 病毒核酸提取 参考常规RT-PCR病毒核酸提取步骤和注意事项。 2. Real-time RT-PCR （rRT-PCR） 依据不同厂家的试剂盒，严格按相应说明书操作和判断结果。有5种试剂盒，分别为One Step Real-time PCR法检测EV71病毒核酸（单通道检测）；One Step Real-time PCR法检测CVA16核酸（单通道检测）；One Step Real-time PCR法检测肠道病毒核酸（单通道检测）；,三、实验室检测操作流程,(四) Real-time RT-PCR （rRT-PCR）,One Step Real-ti
41、me PCR法同时检测EV71和CVA16核酸（双通道检测）；One Step Real-time PCR法同时检测EV71和肠道病毒核酸（双通道检测）。下面举2个例子来说明单通道检测和双通道检测的操作规程和注意事项。 （1） One Step Real-time PCR法检测EV71病毒核酸（单通道检测） 反应体系配置：反应体系共25l，模板量可根据样本情况自行决定（临床标本通常使用5l的RNA模板量），不够部分以水补足。如选用另外试剂盒，反应体系及条件随之变化。,三、实验室检测操作流程,(四) Real-time RT-PCR （rRT-PCR）,a.从试剂盒中取出相应的试剂，反应液在室温
42、融化后，瞬时离心，按n+1配置反应体系（n=样本数+1管阳性对照+1管阴性对照），每个测量反应体系配置如下表：,三、实验室检测操作流程,(四) Real-time RT-PCR （rRT-PCR）,b.将上述反应液混匀离心后，按照每管20L分装于各荧光PCR仪适用的PCR管中。 c.加样：将提取好的样本RNA，分别加入上述分装好的PCR反应管中，模板量可根据样本情况自行决定（临床标本通常使用5ul模板量），不够部分以水补足。总反应体积25L。,三、实验室检测操作流程,荧光RT-PCR循环条件设置,(四) Real-time RT-PCR （rRT-PCR）,三、实验室检测操作流程,(四) Re
43、al-time RT-PCR （rRT-PCR）,对照设置 阴性对照：核酸提取时以灭菌双蒸水代替标本，每次实验应设立。 阳性对照：由省级实验室提供EV71阳性核酸（只在评价试剂时使用） 结果分析条件设定和结果判断 阈值设定 原则以阈值线刚好超过正常阴性对照扩增曲线的最高点，结果显示阴性为准，或可根据仪器噪音情况进行调整。 Ct值35.0的样本为阳性。 38.0 Ct值35.0的样本为临界值。 Ct值38.0的样本或无数值的标本为阴性。,三、实验室检测操作流程,(四) Real-time RT-PCR （rRT-PCR）,（2） One Step Real-time PCR法同时检测EV71和C
44、VA16核酸（双通道检测） 双通道可以同时检测EV71和CVA16核酸,在提取核酸后短时间(2.5小时)内检测到标本中是否含EV71或CVA16核酸。 反应体系配置 反应体系共25l，模板量可根据样本情况自行决定（临床标本通常使用5l模板量），不够部分以水补足。如选用另外试剂盒，反应体系及条件随之变化。,三、实验室检测操作流程,(四) Real-time RT-PCR （rRT-PCR）,a.先将试剂解冻，从试剂盒中取出相应的试剂，反应液在室温融化后，瞬时离心，按n+1配置25l反应体系（n=样本数+1管阳性对照+1管阴性对照），每个测量反应体系配置如下表： b.将下述反应液混匀离心后，按照每
45、管20L分装于适用的PCR管中。,三、实验室检测操作流程,c.加样：将提取好的样本RNA，分别加入上述分装好的PCR反应管中，模板量可根据样本情况自行决定（临床标本通常使用5ul模板量），不够部分以水补足。总反应体积25L。荧光RT-PCR循环条件设置,(四) Real-time RT-PCR （rRT-PCR）,三、实验室检测操作流程,(四) Real-time RT-PCR （rRT-PCR）,结果分析条件设定和结果判断阴性对照：核酸提取时以灭菌双蒸水代替标本。阳性对照：提取好的阳性核酸作为模板RNA。阈值设定原则以阈值线刚好超过正常阴性对照扩增曲线的最高点，结果显示阴性为准，或可根据仪器
46、噪音情况进行调整。Ct值35.0的样本为阳性。Ct值无数值的标本和Ct值38.0的样本为阴性样本。,三、实验室检测操作流程,(四) Real-time RT-PCR （rRT-PCR）,38.0 Ct值35.0的样本为临界值。注：荧光PCR同时读取FAM和HEX，进行双通道检测，FAM荧光Ct值为CVA16的结果，HEX荧光 Ct值为EV71的结果。,三、实验室检测操作流程,四、生物安全,根据2006年1月11日卫生部制定的人间传染的病原微生物名录，柯萨奇病毒、埃可病毒、EV71型和目前分类未定的其他肠道病毒均属于危害程度第三类的病原微生物。因此在保证安全的前提下，对临床和现场的未知样本检测操作可在生物安全II级或以上防护级别的实验室进行，涉及病毒分离培养的操作，应加强个体防护和环境保护。操作粪便、脑脊液和血液等临床标本时要特别注意生物安全，要在II级生物安全柜中进行标本处理、病毒分离和病毒鉴定，无脊灰疫苗免疫史的人员要进行脊灰疫苗免疫。灭活后的血清抗体检测与PCR检测可在生物安全I级实验室进行。所有操作应遵守国家相关法律法规。,谢谢,
